AIM: The objective of this study was to develop a real-time PCR method to detect hepatitis C virus (HCV), human immunodeficiency virus-1 (HIV-1), and also recently discovered human hepegivirus-1 (HHpgV-1) through melting curve analysis using SYBR Green dye in a single reaction.
BACKGROUND: It is estimated that chronic viral infections affect millions of people worldwide, and a significant number of these individuals are unaware of their infection. In addition, infection with newly discovered and emerging viruses may put public health at potential risks. Precise and early detection is a primar
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Due to limitations in commercial diagnostic methods, this study aimed to develop a reliable real-time polymerase chain reaction (Rt-PCR) assay for early diagnosis of brucellosis. Optimization of the Rt-PCR method was performed on serum samples spiked by Brucella melitensis with different densities ranging from 101 to 108 colony-forming units (cfu)/mL; each density was prepared in ten samples. The limit of detection was investigated by using Thermo DNA extraction kit with Maxima SYBR Green Rt-PCR and two TaqMan probe-based Rt-PCR protocols performed by QuantiTect and TEMPase multiplex PCR maste
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study presents a novel multiplex assay based on capillary electrophoresis (CE) for the simultaneous detection of three Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC) genes: IS6110, rpoB, and HSP65. Unlike conventional molecular diagnostic methods that target only a single gene, which may lead to misdiagnosis or missed diagnosis, this CE-based multiplex approach provides comprehensive detection to reduce diagnostic errors. Specificity testing with 76 microorganisms representing common respiratory pathogens confirmed 100% analytical specificity with no cross-reactivity, while sensitivity analysi
СтатьяВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Septic arthritis (SA) is a destructive disease requiring urgent diagnosis and treatment. The low sensitivity of conventional culture methods necessitates rapid molecular diagnostic approaches. This study aimed to evaluate the diagnostic performance of the multiplex PCR-based BioFire® Joint Infection Panel (BJIP) compared with BACTEC liquid culture and solid media culture methods in a country with high rates of antibiotic use.
MATERIALS AND METHOD: Synovial fluid samples from 86 patients diagnosed with SA were retrospectively analyzed. Diagnostic performance was compared using sensi
СтатьяСравнительное исследованиеОценочное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Viral infections, particularly rhinoviruses (RVs) and respiratory syncytial virus (RSV), are major causes of pediatric acute asthma exacerbations. The FilmArray Respiratory Panel 2.1 (FARP2.1) is an automated multiplex PCR tool that is being increasingly used in clinical settings; however, its application in asthma exacerbations has not been studied yet. From April 2022 to March 2025, children aged between 6 months and 5 years who had been hospitalized for asthma exacerbations were enrolled ("asthma group," n = 67), alongside children with respiratory infections without wheezing within the sam
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Mycetoma is a neglected tropical disease that affects the subcutaneous tissue. The disease can be caused by over 90 different pathogens, including both bacteria (actinomycetoma) and fungi (eumycetoma). While diagnostic tools for eumycetoma causative agents are available, these are generally not well suited for use in endemic regions. This study aims to develop an isothermal based multiplex recombinase polymerase amplification reaction (RPA), that can be integrated in the diagnostic workflow of endemic regions.
METHODS: The RPA was designed targeting the Internal Transcribed Spacer (I
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
More than 90% suspected muscular dystrophy (MD) can be confirmed with multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) combined with targeted panel, although there are a few that cannot be identified. A total of 312 suspected MD patients were enrolled into the study. The MLPA combined with a targeted myopathy panel were performed. Patients with negative results were subjected to whole exome sequencing (WES), whole genome sequencing (WGS), and/or RNA sequencing (RNA-seq). A total of 275 cases were diagnosed as Duchenne/Becker muscular dystrophy (DMD/BMD) and 20 cases were other types of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cronobacter sakazakii is associated with the ingestion of contaminated reconstituted powdered infant formula (PIF), resulting in necrotizing enterocolitis, sepsis and meningitis in neonatal infants. Potential virulence determinants include the variable capsular polysaccharides; K-antigen and colanic acid (CA). Strains encoding for the capsule variant K2:CA2 have been strongly associated with neonatal meningitis cases. This study aimed to develop and apply a multiplex PCR assay to determine C. sakazakii K-antigen and colanic acid types. Twenty-six strains of C. sakazakii which had previously be
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The current conventional serotyping based on antigen-antisera agglutination could not provide a better understanding of the pote … solated from chicken cloacal swabs and raw chicken meat from 2017 to 2022 were studied. Two sets of multiplex polymerase chain reaction (PCR) were conducted to identify eight virulence genes associated with pathogenicity in Salmonella (invasion protein gene [invA], Salmonella invasion protein gene [sipB], Salmonella-induced filament gene [sifA], cytolethal-distending toxin B gene [c …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
121 bacterial samples isolated from wounds from both sexes and all age groups were collected from Salahadin General Hospital, Salahadin provenance, Iraq. Only 8 Staphylococcus sciuri (S. sciuri) isolates were identified. The bacterial isolation showed the highest sensitivity to Amoxicillin/Clavulanic acid, Cefotaxime, Methicillin, Streptomycin, and Vancomycin and resistance to all other antibiotics. The root exudates of black seeds were used for 10 and 20 days for both treatments with and without magnetized water, and the exudates were superior when using magnetized water for 20 days. Antibiot
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gaucher disease (GD) is an autosomal recessive lysosomal disorder due to beta-glucosidase gene (GBA) mutations. The molecular diagnosis of GD is complicated by the presence of recombinant alleles originating from a highly homologous pseudogene. Clinical exome sequencing (CES) is a rapid genetic approach for identifying disease-causing mutations. However, copy number variation and recombination events are poorly detected, and further investigations are required to avoid mis-genotyping. The aim of this work was to set-up an integrated strategy for GD patients genotyping using CES as a first-line
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Carbapenems are frequently used in the treatment of multidrug-resistant infections caused by Klebsiella pneumoniae. The aim of … BL) genes (blaCTX-M, blaSHV, blaTEM) which frequently detected in Turkey, have been investigated by multiplex polymerase chain reaction (PCR). Clonal relatedness was determined using Pulsed-field gel electrophoresis(PFGE).
RESULTS: Ninety five isolates carried at least one of the carbapenemase genes (81.05% blaOXA-48, 38.9% blaNDM, 9.47% blaKPC,1.05% blaVIM). One isolate was carrie …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Early appropriate antibiotic therapy reduces morbidity and mortality of severe pneumonia. However, the emergence of bacterial resistance requires the earliest use of antibiotics with the narrowest possible spectrum. The Unyvero Hospitalized Pneumonia (HPN, Curetis) test is a multiplex PCR (M-PCR) system detecting 21 bacteria and 19 resistance genes on respiratory samples within 5 h. We assessed the performance and the potential impact of the M-PCR on the antibiotic therapy of ICU patients.
METHODS: In this prospective study, we performed a M-PCR on bronchoalveolar lavage (BAL) or
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: This study was aimed to investigate the intestinal microbiota in racing pigeons with regard to Enterococcus species distribution, virulence factors and antibiotic susceptibility. Three methods (API, Multiplex sodA-PCR, 16S rRNA sequencing) were compared for Enterococcus species identification. Cloacal samples from 179 apparently healthy pigeons of 13 different flocks were tested.
RESULTS: Multiplex sodA-PCR and 16S rRNA gene sequencing showed almost perfect agreement in Enterococcus species identification. Isolates were identified as Enterococcus columbae (34.5%), Enterococcus hir
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pathogens including duck-origin avian influenza virus (AIV), duck-origin Newcastle disease virus (NDV) and duck Tembusu virus (DTMUV) posed great harm to ducks and caused great economic losses to the duck industry. In this study, we aim to develop a triplex real-time polymerase chain reaction (PCR) assay to detect these three viruses as early as possible in the suspicious duck flocks.
RESULTS: The detection limit of the triplex real-time PCR for AIV, NDV, and DTMUV was 1 × 101 copies/μL, which was at least 10 times higher than the conventional PCR. In addition, the triplex assay w
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The canine hookworms Ancylostoma braziliense, Ancylostoma ceylanicum, Ancylostoma caninum and Uncinaria stenocephala are not only capable of producing morbidity and mortality in dogs but are also neglected tropical zoonoses. Each hookworm species differs considerably in its geographical distribution, life cycle, biology, pathogenic impacts on both canine and human hosts, zoonotic potential, and response to treatment with anthelminthics. Here we describe the development and validation of two Taq-Man based multiplex PCR assays capable of detecting and differentiating all four canine hookworm spe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rabies and herpetic encephalitis are the main viral infections in bovines with neurological symptoms. Bovine rabies has a high prevalence in Central and South America, while bovine encephalitis associated with herpesvirus is especially important in South America. Viral isolation is the classical way to confirm herpesvirus infection, but molecular evidence of the presence of the virus in affected animals is gaining importance in the diagnosis of the disease in the laboratory. This study investigated the presence of herpesvirus type 1 and 5 (BoHV-1 and BoHV-5) in 182 encephalon of rabies-suspect
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Viral respiratory infections are one of the leading causes of morbidity and mortality, especially in children, elderly and immunocompromised patients. The inclusion of post-mortem studies to diagnose the infection causing mortality could be beneficial in specifying new pathogens and determining strategies for treatment and prevention. The aim of this study was to research viral etiology by applying multiplex real-time polymerase chain reaction (Rt-PCR) method in autopsy cases who have been considered to have a respiratory infection and to assess whether the viruses detected are the primary cau
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cytomegalovirus [CMV] is a causative agent of congenital infection worldwide and often leads to neurological deficits and hearing loss in newborns. Infants born with symptomatic congenital Cytomegalovirus infection [cCMV] are at significant high risk for developing adverse long-term outcomes. In this study, we look into the sequence variability of surface glycoprotein B [gB] encoding region in newborns with symptomatic CMV infection for the first time in Eastern region of India.
METHODS: 576 suspected newborns from seropositive mothers were subjected to the study and ELISA was use
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Tubercular lymphadenitis (TBLA) is one of the most common extrapulmonary manifestations of tuberculosis in patients with HIV. Wi … TBLA based on clinical suspicion, results of cytology, AFB smear, MGIT culture, GeneXpert MTB/RIF, multiplex polymerase chain reaction (MPCR) and subsequently clinical response to antitubercular therapy. These tests were also carried out in 26 control samples of lymph node FNAC from HIV-infected patients with non-tubercular lymphadenitis.
RESULTS: LAMP assay was positive in 19/24 …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования