Injury to the meninges is not uncommon after traumatic brain injury (TBI), yet minimal research has been directed toward understanding the relevant biology. After a concussive event, the meninges are observed to abnormally enhance on post-contrast magnetic resonance imaging (MRI) in some patients, but not all. The aim of this work is to identify genes differentially expressed in patients with meningeal injury. Patients presenting to the emergency room with suspected TBI received a standard research MRI and blood draw within 48 h of injury. Two groups of patients were included: those with and w
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tuberculosis is among the oldest and most devastating infectious diseases worldwide. Nearly one third of the world's population has active or latent disease, resulting in 1.5 million deaths annually. Central nervous system involvement, while rare, is the most severe form of tuberculosis. Manifestations include tuberculoma and tuberculous meningitis, with the majority of cases occurring in children and immunocompromised patients. Despite advancements in imaging and laboratory diagnostics, tuberculomas of the central nervous system remain a diagnostic challenge due to their insidious nature and
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Accurate reference genomes are fundamental to understanding biological evolution, biodiversity, hereditary phenomena and diseases. However, many assembled nuclear chromosomes are often contaminated by organelle genomes, which will mislead bioinformatic analysis, and genomic and transcriptomic data interpretation.
METHODS: To address this issue, we developed a tool named Chlomito, aiming at precise identification and elimination of organelle genome contamination from nuclear genome assembly. Compared to conventional approaches, Chlomito utilized new metrics, alignment length cove
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Identifying genetic risk factors underpinning different aspects of Alzheimer's disease has the potential to provide important insights into pathogenesis. Moving away from simple case-control definitions, there is considerable interest in using quantitative endophenotypes, such as those derived from imaging as outcome measures. Previous genome-wide association studies of imaging-derived biomarkers in sporadic late-onset Alzheimer's disease focused only on phenotypes derived from single imaging modalities. In contrast, we computed a novel multi-modal neuroimaging phenotype comprising cortical am
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Large repetitive elements and complex chromosomal organization continue to challenge accurate assembly of eukaryotic genomes. Optical genome mapping (OGM) provides long-range genomic information by imaging individual DNA molecules. While most OGM protocols rely on sparse enzymatic labeling that restricts resolution in poorly labeled or structurally complex regions, dense labeling strategies generate continuous fluorescence intensity profiles that offer a complementary representation of genome structure. Here we extend our Dense Optical Genome Mapping Assembly (DOGMA) pipeline, previously used
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A main limitation of single-molecule fluorescence (SMF) measurements is the 'high concentration barrier', describing the maximum concentration of fluorescent species tolerable for sufficient signal-to-noise ratio. To address this barrier in several SMF applications, we design fluorogenic probes based on short single-stranded DNAs, fluorescing only upon hybridizing to their complementary target sequence. We engineer the quenching efficiency and fluorescence enhancement upon duplex formation through screening several fluorophore-quencher combinations, label lengths, and sequence motifs, which we
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Prognostic biomarkers are needed to guide the management of early-stage non-small cell lung cancer (NSCLC). This work aims to develop an image-based prognostic signature and assess its complementary value to existing biomarkers.
METHODS AND MATERIALS: We retrospectively analyzed data of stage I NSCLC in 8 cohorts. On the basis of an analysis of 39 computed tomography (CT) features characterizing tumor and its relation to neighboring pleura, we developed a prognostic signature in an institutional cohort (n = 117) and tested it in an external cohort (n = 88). A third cohort of 89 patie
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genomic multiplication of the alpha-synuclein gene (SNCA) locus is one cause of familial Parkinson disease (PD). We performed detailed genomic, SNCA expression level, clinical, neuropsychological and functional imaging analyses of a parkinsonian kindred with a known duplication of the SNCA locus. We demonstrated that the duplication spanned 4.928 Mb (encompassing 31 known and putative genes) and was the largest to have been described at this locus. The presence of several repetitive long interspersed nuclear elements (LINEs) flanking the potential break area suggested that the duplication resu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromosome organization is crucial for genome function. Here, we present a method for visualizing chromosomal DNA at super-resolution and then integrating Hi-C data to produce three-dimensional models of chromosome organization. Using the super-resolution microscopy methods of OligoSTORM and OligoDNA-PAINT, we trace 8 megabases of human chromosome 19, visualizing structures ranging in size from a few kilobases to over a megabase. Focusing on chromosomal regions that contribute to compartments, we discover distinct structures that, in spite of considerable variability, can predict whether such
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The study sought to establish a radiogenomic signature to evaluate the transcriptional heterogeneity that reflects the prognosis and tumour-related biological functions of patients with glioblastoma.
METHODS: Transcriptional subclones were identified via fully unsupervised deconvolution of RNA sequencing. A genomic prognostic risk score was developed from transcriptional subclone proportions in the development dataset (n = 532) and independently verified in the testing dataset (n = 225). Multimodal magnetic resonance imaging (MRI) analysis involved feature extraction from three di
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: 10%-30% of patients with lung adenocarcinoma (LUAD) and leptomeningeal metastasis (LM) respond poorly to conventional and targeted therapy. The relationship between genetic subtypes and both MRI features and survival outcomes remains poorly understood in this patient population.
PURPOSE: To explore the genetic phenotypes among LUAD-LM patients who respond poorly to conventional and targeted therapy, and to compare the MRI characteristics and survival outcomes among these genetic phenotypes: STUDY TYPE: Retrospective.
POPULATION: 110 LUAD-LM patients (LU confirmed by histology, LM
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objectives: Radiogenomics integrates quantitative imaging features with genomic and molecular data to better characterize tumor biology and support precision oncology. While extensively investigated in solid tumors, its application to hematologic malignancies remains relatively unexplored despite the widespread use of advanced imaging in lymphoma and multiple myeloma. Methods: A systematic review was conducted following PRISMA 2020 guidelines. PubMed, Scopus, and Web of Science were searched up to December 2025 for studies investigating radiogenomic associations in hematologic malig
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Successful generation of high-quality spatial transcriptomics data from murine musculoskeletal tissues has been impeded by the challenge of preserving RNA integrity through the harsh tissue processing steps required for histological sectioning. In particular, the need to thoroughly fix and decalcify mineralized tissues has proven problematic. We detail a comprehensive sample processing pipeline for three common murine musculoskeletal tissue samples, enabling high-quality transcript detection via imaging-based spatial transcriptomics using the Xenium Prime 5K platform from 10x Genom
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
While genetic screens have identified many genes essential for neurite outgrowth, they have been limited in their ability to identify neural genes that also have earlier critical roles in the gastrula, or neural genes for which maternally contributed RNA compensates for gene mutations in the zygote. To address this, we developed methods to screen the Drosophila genome using RNA-interference (RNAi) on primary neural cells and present the results of the first full-genome RNAi screen in neurons. We used live-cell imaging and quantitative image analysis to characterize the morphological phenotypes
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Reporting of diagnostic nuclear images in clinical cancer management is generally qualitative. Theranostic treatment with 177Lu radioligands for prostate cancer and neuroendocrine tumors is routinely given as the same arbitrary fixed administered activity to every patient. Nuclear oncology, as currently practiced with 177Lu-prostate-specific membrane antigen and 177Lu peptide receptor radionuclide therapy, cannot, therefore, be characterized as personalized precision medicine. The evolution of artificial intelligence (AI) could change this "one-size-fits-all" approach to theranostics, through
Редакционная статьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human immunodeficiency virus-associated distal sensory polyneuropathy (HIV-DSP) affects up to 50% of people with HIV and is associated with depression, unemployment, and generally worsened quality of life. Previous work on the cortical mechanism of HIV neuropathy found decreased gray matter volume in the bilateral midbrain, thalamus, and posterior cingulate cortex, but structural connectivity in this context remains under-studied. Here we examine alterations in white matter microstructure using diffusion imaging, hypothesizing that cortical white matter degeneration would be observed in contin
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Incoming adenoviruses seize control of cytosolic transport mechanisms to relocate their genome from the cell periphery to specialized sites in the nucleoplasm. The nucleus is the site for viral gene expression, genome replication, and the production of progeny for the next round of infection. By taking control of the cell, adenoviruses also suppress cell-autonomous immunity responses. To succeed in their production cycle, adenoviruses rely on well-coordinated steps, facilitated by interactions between viral proteins and cellular factors. Interactions between virus and host can impose remarkabl
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prostate cancer (PCa) is the second most common malignancy in men worldwide, with rising mortality linked to late-stage diagnoses. While current diagnostic strategies rely heavily on biomarker detection, their limitations highlight the need for comprehensive and integrative biomarker discovery. This review consolidates recent advances in PCa biomarkers, encompassing genetic, proteomic, liquid biopsy, and imaging-based approaches. Genetic mutations inform disease prognosis and therapy selection, while proteomic biomarkers elucidate molecular mechanisms and therapeutic targets. Blood- and urine-
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Precision oncology in urology increasingly depends on integrating heterogeneous data, including multiparametric imaging, histopathology, genomics, and clinical variables. Multimodal artificial intelligence (AI) offers a unified framework to manage this complexity, supporting refined risk stratification, personalized treatment decisions, and informed patient counseling. This narrative review examines applications of multimodal AI in prostate, bladder, and kidney cancers. Beyond listing individual tools, we emphasize how synergistic data fusion enhances the validation of diagnostic and prognosti
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: This study aims to integrate CT (Computed Tomography) radiomic features, gene expression profiles, and clinical data to identify radiogenomic biomarkers and improve overall survival prediction in gastric cancer (GC) patients.
PROCEDURES: Quantitative radiomic analysis was performed on 37 GC CT images, alongside gene expression and clinical data, to identify biomarkers associated with overall survival. Tumor segmentation and radiomic feature extraction were followed by Pearson correlation for feature selection. Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) identified pathways linking gene expre
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования