Parallel Accumulation with Mobility-Aligned Fragmentation (PAMAF) achieves near-complete ion utilization and high spectral specificity by fragmenting all mobility-separated precursors without quadrupole isolation. Leveraging the ultrahigh mobility resolution of SLIM, this quadrupole-free strategy maximizes ion utilization efficiency and offers a promising approach in mass spectrometry-based proteomics, particularly for low-abundance peptides or low-input samples. However, the unique data structure of PAMAF where precursor-fragment relationships are encoded along the mobility dimension renders
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The fragments that result from the inactivation of C3b have not been completely characterized. Initial inactivation is catalyzed by the protease factor I, which, in the presence of its cofactor (factor H), cleaves two peptide bonds in the alpha'-chain of C3b. This results in the release of a small peptide (C3f, Mr 3000) from iC3b, which consists of the C3 beta chain covalently bonded to two alpha'-chain-derived peptides (Mr 68,000 and Mr 43,000). Surface-bound iC3b is cleaved at a third site by factor I to produce C3c and C3d,g (or alpha 2D). The factor I cofactor for this cleavage is the C3b
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aggregation of Islet Amyloid Polypeptide (IAPP) has been implicated in the development of type II diabetes. Because IAPP is a highly amyloidogenic peptide, it has been suggested that the formation of IAPP amyloid fibers causes disruption of the cellular membrane and is responsible for the death of beta-cells during type II diabetes. Previous studies have shown that the N-terminal 1-19 region, rather than the amyloidogenic 20-29 region, is primarily responsible for the interaction of the IAPP peptide with membranes. Liposome leakage experiments presented in this study confirm that the pathologi
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fmoc solid-phase peptide synthesis (SPPS) is the most common approach used to synthesize natural and unnatural peptides. However, the synthesis of sequences longer than 30-60 amino acids is associated with a drastic reduction in peptide quality. Thus, large and complex peptides are normally synthesized as fragments, which are then conjugated together. Here, we describe the synthesis of a large, branched peptide, a multi-epitope vaccine candidate against Group A Streptococcus, with the help of microwave-assisted Fmoc-SPPS, thiol-maleimide conjugation, and copper(I)-catalyzed alkyne-azide cycloa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The opioid peptide beta h-endorphin 1-31 inhibited the plaque-forming cell (PFC) response to sheep red blood cells when rat splenocytes, immunized in vivo, were cultured in vitro with the peptide. The opioid antagonist naloxone failed to reverse the beta h-endorphin 1-31 suppression of the PFC response. Peptide fragments of beta h-endorphin 1-31, other opioid peptides, and alkaloids had no effect on the response. These data indicate that beta h-endorphin 1-31 suppresses antibody production or secretion by a specific, non-opioid receptor on the rat splenocytes.
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ammodytoxins (Atxs) are presynaptically neurotoxic phospholipases present in Vipera ammodytes ammodytes snake venom. Atxs show a high sequence homology and contain 14 cysteines which form seven biologically relevant disulfide bridges-connecting non-neighboring cysteines. Formic acid cleavage was performed to confirm protein sequences by MALDI RTOF MS and resulted in 95.6% sequence coverage exhibiting only few formylations. Cysteine-containing peptides showed adjacent signals 2 and/or 4 Da lower (according to the number of cysteines present in the peptide) than the theoretical molecular weight
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human islet amyloid polypeptide (hIAPP) accumulates as pancreatic amyloid in type 2 diabetes and readily forms fibrils in vitro. Investigati … been identified recently. We have extended these observations by examining a series of overlapping peptide fragments from the human and rodent sequences. Using protein spectroscopy (CD/FTIR), electron microscopy and X-ray diffraction, a previously unrecognised amyloidogenic domain was localised within residues 8 to 20. Synthetic peptides corresponding to this regi …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Elcatonin is a synthetic peptide of 32 amino acid residues, that differs from natural peptide hormone (eel calcitonin) in that the 1 and 7 c … by proteolytic digestion followed by high performance liquid chromatographic (HPLC) analysis of the peptide fragments. Capillary electrophoresis and fast-atom bombardment have also been employed. This work describes the results obtained when a liquid chromatograph, coupled to mass spectrometer using electrospray ionization (LC/ESI-MS) was applied to elcatonin analy …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The tetanus toxin C-fragment is a non-toxic peptide that can be transported from peripheral axons into spinal motoneurons. In in vitro experiments it has been shown that this peptide activates signaling pathways associated with Trk receptors, leading to cellular survival. Because motoneuron degeneration is the main pathological hallmark in motoneuron diseases, and excitotoxicity is an important mechanism of neuronal death in this type of disorders, in this work we tested whether the tetanus toxin C-fragment is able to protect MN in the spinal cord in vivo. For this purpose, we administered the
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Due to the high degree of sequence identity between Orthopoxvirus species, the specific B and T cell responses raised against these viruses are largely cross-reactive and poorly selective. We therefore searched for CD4 T cell epitopes present in the conserved parts of the Vaccinia genome (VACV) but absent from Variola viruses (VARV), with a view to identifying immunogenic sequences selective for VACV. We identified three long peptide fragments from the B7R, B10R and E7R proteins by in silico comparisons of the poxvirus genomes, and evaluated the recognition of these fragments by VACV-specific …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The proteolytic enzyme, thermolysin, degraded the external segment of the membrane glycoprotein of intact vesicular stomatitis (VS) virions but left behind a small nonglycosylated fragment, presumably embedded in the virion membrane. Other proteases generated membrane-associated glycoprotein fragments differing somewhat in molecular weight. The thermolysin-resistant, virion-associated fragment, which can be selectively solubilized by either Triton X-100 or chloroform/methanol, has a molecular weight of 5,200. Amino acid analysis of the glycoprotein fragment reveals a preponderance of hydrophob
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biomarkers for various diseases have been extensively searched for the past 5 years. Nevertheless, most efforts were focused on the search for protein biomarkers from serum samples. In this work, we tried to look for peptide biomarkers from gastric juice samples with MALDI-TOF-MS. More than 200 gastric juice samples from healthy people, gastric ulcer patients, duodenal ulcer patients, and cancer patients were examined. There were clear pattern differences of mass spectra among samples from healthy people and patients with different gastric diseases. We found five peptides for gastric cancer di
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Proteolytic processing of precursor proteins liberates bioactive fragments, yet the systematic discovery of such peptides remains challenging. Here, we establish a fragment-mining strategy that combines in silico prediction with chemical tailoring to generate self-assembling antimicrobial peptides directly from protein sequences, including previously unannotated proteins. Self-assembly proved integral to activity: amphiphilic modification promoted nanonet formation and efficient bacterial membrane disruption, while rational glycosylation reprogrammed physicochemical properties to confer select
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parathyroid hormone (PTH), an 84 amino acid peptide hormone, is an important regulator of calcium homeostasis. Quantitation of PTH in serum is useful for the diagnosis of primary hyperparathyroidism, hypoparathyroidism, and for monitoring osteodystrophy in patients with renal failure. The biological activity of PTH arises from binding of PTH (N terminus) to its target receptor (D'Amour et al., Kidney Int 68: 998-1007, 2005). Several C-terminal and N-terminal fragments circulate in normal subjects. Recent studies have demonstrated that accurate quantitation of PTH fragments may be of clinical v
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A previous study by our group showed that a 44-amino-acid fragment of pigment epithelium-derived factor (PEDF) facilitated corneal epithelia … ological analysis confirmed faster epithelial cell coverage of open wounds. Treatment with the PEDF peptide fragments also contributed to granulation, tissue formation by increasing the fibroblast population and enhancing collagen deposition in the dermis. Wounds treated with PEDF peptide fragments contained more basal cells proliferated in the epithelium. Moreover …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Insulin-like growth factors (IGF-I and IGF-II) in biological fluids bind to high-affinity binding proteins (IGFBP-1 to -6), which transport them and regulate their activities. Limited proteolysis of certain IGFBPs plays a major role in this regulation. IGFBP-3 is proteolysed in vivo and in several cell lines by serine proteases, including plasmin. In earlier studies we reproduced this proteolysis in vitro using recombinant human non-glycosylated IGFBP-3. Two major fragments were obtained, the larger retaining weak affinity for IGF-I and weakly inhibiting IGF I mitogenic effects. The smaller fr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Besides the neurotoxins active on mammals, a new excitatory insect selective toxin with a mice analgesic activity was found and purified from the venom of the scorpion Buthus martensi Karsch (BmK) (Ji, Y.H., Mansuelle, P., Terakawa, S., Kopeyan, C., Yanaihara, N., Hsu, K., Rochat, H., 1996. Toxicon 34, 987; Luo, M.J., Xiong, Y.M., Wang, M., Wang, D.C., Chi, C.W., 1997. Toxicon 35, 723.). This peptide (designated as BmK IT-AP) is composed of 72 amino acid residues. Its primary structure was determined by automated Edman degradation of the N-terminal part of the reduced and S-carboxamidemethylat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intestinal ischemia results in mucosal injury, including paracellular barrier loss due to disruption of tight junctions. Larazotide acetate … tro enzyme degradation assay using the brush border enzyme aminopeptidase M, revealed generation of peptide fragments. Western blot analysis of total protein isolated from uninjured and ischemia-injured porcine intestine showed aminopeptidase M enzyme presence in both tissue types, and mass spectrometry analysis of samples collected during ex vivo analysis confirme …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alveolar echinococcosis is a life-threatening zoonotic parasitic disease caused by infection of Echinococcus multilocularis larvae. To survive within the host's immune milieu, E. multilocularis has evolved sophisticated immune evasion strategies, including the expression of immunomodulatory proteins that regulate the host immune response. Our previous studies have demonstrated that E. multilocularis calreticulin (EmCRT) possessed strong binding ability to human complement component C1q to inhibit C1q-initiated complement activation and biological functions. To further elucidate the mechanism b
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SEM1(68-107) is a peptide corresponding to the region of semenogelin 1 protein from 68 to 107 amino acid position. SEM1(68-107) is an abunda … mobility of peptides. The complementary approach based on the geometric restrictions of individual peptide fragments and molecular modeling was used for the determination of the spatial structure of SEM1(68-107). The N- (SEM1(68-85)) and C-terminuses (SEM1(86-107)) of SEM1(68-107) were chosen as two individual peptide fragments. SEM1(68-85) and SEM1(86-107) struct …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования