Enterovirus 2B is a highly conserved, functionally versatile, nonstructural protein. The classic viroporin model, which restricts its role to ion channel formation, cannot account for its interactions with host factors such as Bcl-2-associated X protein, interleukin enhancer-binding factor 2, and karyopherin subunit alpha 1, nor its functional divergence among enteroviruses. We propose a novel, testable membrane stress sensor hypothesis: the transmembrane helices of 2B sense lipid composition and pH changes, and through conformational dynamics, spatiotemporally coordinate calcium signaling, ce
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Proteins of the cryptochrome/DNA photolyase family (CPF) are phylogenetically related and structurally conserved flavoproteins that perform various functions. DNA photolyases repair DNA damage caused by UV-B radiation by exposure to UV-A/blue light simultaneously or subsequently. Cryptochromes are photoreceptor proteins regulating circadian clock, morphogenesis, phototaxis, and other responses to UV and blue light in various organisms. The review describes the structure and functions of CPF proteins, their evolutionary relationship, and possible functions of the CPF ancestor protein.
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Malaria is a global health concern, and research efforts are ongoing to develop a superior vaccine to RTS,S/AS01. To guide immunogen design, we seek a comprehensive understanding of the protective humoral response against Plasmodium falciparum (Pf) circumsporozoite protein (PfCSP). In contrast to the well-studied responses to the repeat region and the C-terminus, the antibody response against the N-terminal domain of PfCSP (N-CSP) remains obscure. Here, we characterized the molecular recognition and functional efficacy of the N-CSP-specific monoclonal antibody 5D5. The crystal structure at 1.8
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oculocutaneous albinism type 1 is a genetic disorder caused by the disruption of tyrosinase activity in the melanogenesis pathway. The tyrosinase's intramelanosomal domain can be subdivided into the catalytic and Cys-rich subdomains, integral for protein stability and catalytic activity. To understand the motions in the tyrosinase intra-melanosomal subdomains and their link to its catalytic activity, we perform essential dynamics on homology models for tyrosinase and the mutant variants R217Q, R402Q, and R217Q/R402Q. Dimensional reduction techniques, such as Principal Component Analysis (PCA),
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oculocutaneous albinism type 1 is a genetic disorder caused by the disruption of tyrosinase activity in the melanogenesis pathway. The tyrosinase's intramelanosomal domain can be subdivided into the catalytic and Cys-rich subdomains, integral for protein stability and catalytic activity. To understand the movement in the tyrosinase intra-melanosomal subdomains and their link to its catalytic activity, we perform essential dynamics on homology models for tyrosinase and the mutant variants R217Q, R402Q, and R217Q/R402Q. Dimensional reduction techniques, such as principal component analysis (PCA)
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have demonstrated earlier that protein microenvironments were conserved around disulfide-bridged cystine motifs with similar functions, irrespective of diversity in protein sequences. Here, cysteine thiol modifications were characterized based on protein microenvironments, secondary structures and specific protein functions. Protein microenvironment around an amino acid was defined as the summation of hydrophobic contributions from the surrounding protein fragments and the solvent molecules present within its first contact shell. Cysteine functions (modifications) were grouped into enzymati
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Positive-strand RNA viruses universally remodel host intracellular membranes to form membrane-bound viral replication complexes, where viral offspring RNAs are synthesized. In the majority of cases, viral replication proteins are targeted to and play critical roles in the modulation of the designated organelle membranes. Many viral replication proteins do not have transmembrane domains, but contain single or multiple amphipathic alpha-helices. It has been conventionally recognized that these helices serve as an anchor for viral replication protein to be associated with membranes. We report her
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The HIV-1 capsid, composed of capsid (CA) proteins arranged into a conical surface lattice, serves as a critical platform for host-pathogen interactions. Many host cofactors regulate HIV-1 infection by selectively recognizing the higher-order CA lattice rather than individual monomers or capsomers. Among these, Myxovirus resistance protein B (MxB) is a key cellular restriction factor that binds the capsid via its N-terminal fragment containing an arginine-rich motif (RRR), blocking HIV-1 infection at early infection stages. However, the structural basis of this interaction has remained elusive
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The C-terminal domain of SARS-CoV main protease (Mpro-C) can form 3D domain-swapped dimer by exchanging the α1-helices fully buried inside the protein hydrophobic core, under non-denaturing conditions. Here, we report that Mpro-C can also form amyloid fibrils under the 3D domain-swappable conditions in vitro, and the fibrils are not formed through runaway/propagated domain swapping. It is found that there are positive correlations between the rates of domain swapping dimerization and amyloid fibrillation at different temperatures, and for different mutants. However, some Mpro-C mutants incapab
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycobacterium tuberculosis Acr is an important protein expressed in latent tuberculosis which is active as an oligomer in preventing misfolding of cellular proteins. In this study, Mycobacterium alpha crystallin (acr) gene was cloned and expressed in Escherichia coli (E. coli). The recombinant Acr protein was purified by Nickel-NTA resin. The oligomeric state of Acr was confirmed by gel filtration chromatography using Sephacryl S-200 and Native-PAGE. Studies of chaperone activity were performed with insulin as a substrate at different mole ratios of Acr with 2 types of samples, His tag elutes
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in the common gamma chain of the interleukin 2 receptor (IL2RG) or the associated downstream signaling enzyme Janus kinase 3 (JAK3) genes are typically characterized by a T cell-negative, B cell-positive, natural killer (NK) cell-negative (T-B+NK-) severe combined immunodeficiency (SCID) immune phenotype. We report clinical course, immunological, genetic and proteomic work-up of two patients with different novel mutations in the IL-2-JAK3 pathway with a rare atypical presentation of T-B+NK- SCID. Lymphocyte subpopulation revealed significant T cells lymphopenia, normal B cells, and N
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dense phase carbon dioxide (DPCD) sterilization is a non-thermal sterilization technology used to process heat-sensitive foods. Although nutritional and sensorial quality of food is preserved while unwanted microbial activity is reduced during DPCD sterilization, the effect on protein structure remains unclear. In this work, the effect of DPCD on the higher order structure and fluorescence properties of Hemoglobin (Hb) was investigated. The different conditions assessed during DPCD processing included variation in pressure, pH and heating conditions. Results from this study showed an inversely
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite strong antimicrobial activity, high haemolytic/cytotoxic properties, associated with its non-cell-selective membrane-lytic property and its large size prohibits considering bee-venom, α-helical, 26-residue, melittin as a lead molecule for antimicrobial-drug development. Herein, we have explored the design of shorter non-haemolytic/non-cytotoxic antimicrobial peptides with low hydrophobic/amphipathic property and β-sheet secondary structure by using a 5-mer carboxy-terminus melittin segment, "WIKRK", which contains hydrophobic and polar-cationic residues at its two ends. Three peptides,
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Malaria parasites import essential nutrients from plasma into their host erythrocytes through the plasmodial surface anion channel (PSAC), a conserved ion and nutrient channel on the infected cell surface. A parasite-encoded ternary complex consisting of CLAG3, RhopH2, and RhopH3 determines PSAC activity, but the precise contributions of each member to formation of the nutrient uptake pore remains uncertain. Methods: Here, we devised a two-step CRIPSR transfection strategy to examine an amphipathic CLAG3 helix, termed α-helix 44 (α-H44), as a candidate pore-lining domain. Results:
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in either polycystin-1 (PC1 or PKD1) or polycystin-2 (PC2, PKD2 or TRPP1) cause autosomal-dominant polycystic kidney disease (ADPKD) through unknown mechanisms. Here we present the structure of human PC2 in a closed conformation, solved by electron cryomicroscopy at 4.2-Å resolution. The structure reveals a novel polycystin-specific 'tetragonal opening for polycystins' (TOP) domain tightly bound to the top of a classic transient receptor potential (TRP) channel structure. The TOP domain is formed from two extensions to the voltage-sensor-like domain (VSLD); it covers the channel's en
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The phosphoenolpyruvate transferase system (PTS) is the major pathway by which bacteria import hexose sugars across the plasma membrane. The PTS transfers a phosphoryl group sequentially via several components from the glycolytic intermediate phosphoenolpyruvate (PEP) to the translocated sugar. It is comprised of the two general proteins enzyme I and HPr, and a sugar-specific enzyme II complex. Sugar translocation is through the membrane domain of the enzyme II complex. The enzyme II complex can belong to one of six families based upon sequence similarity, with the sorbose transporter from Kle
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The protein ataxin-3 contains a polyglutamine region; increasing the number of glutamines beyond 55 in this region gives rise to the neurodegenerative disease spinocerebellar ataxia type 3. This disease and other polyglutamine expansion diseases are characterized by large intranuclear protein aggregates (nuclear inclusions). By using full-length human ataxin-3, we have investigated the changes in secondary structure, aggregation behavior, and fibril formation associated with an increase from the normal length of 27 glutamines (Q27 ataxin-3) to a pathogenic length of 78 glutamines (Q78 ataxin-3
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Yersinia pestis, the causative agent of bubonic plague, evades the immune response of the infected organism by using a type III (contact-dependent) secretion system to deliver effector proteins into the cytosol of mammalian cells, where they interfere with signaling pathways that regulate inflammation and cytoskeleton dynamics. The cytotoxic effector YopE functions as a potent GTPase-activating protein (GAP) for Rho family GTP-binding proteins, including RhoA, Rac1, and Cdc42. Down-regulation of these molecular switches results in the loss of cell motility and inhibition of phagocytosis, enabl
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We analysed the conformational states of free, tet operator-bound and anhydrotetracycline-bound Tet repressor employing a Trp-scanning approach. The two wild-type Trp residues in Tet repressor were replaced by Tyr or Phe and single Trp residues were introduced at each of the positions 162-173, representing part of an unstructured loop and the N-terminal six residues of alpha-helix 9. All mutants retained in vivo inducibility, but anhydrotetracycline-binding constants were decreased up to 7.5-fold when Trp was in positions 169, 170 and 173. Helical positions (168-173) differed from those in the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intermediate filament (IF) assembly is remarkable, in that it appears to be self-driven by the primary sequence of IF proteins, a family (40-220 kd) with diverse sequences, but similar secondary structures. Each IF polypeptide has a central 310 amino acid residue alpha-helical rod domain, involved in coiled-coil dinner formation. Two short (approximately 10 amino acid residue) stretches at the ends of this rod are more highly conserved than the rest, although the molecular basis for this is unknown. In addition, the rod is segmented by three short nonhelical linkers of conserved location, but
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.