Prions are self-templating protein conformers that are naturally transmitted between individuals and promote phenotypic change. In yeast, prion-encoded phenotypes can be beneficial, neutral or deleterious depending upon genetic background and environmental conditions. A distinctive and portable 'prion domain' enriched in asparagine, glutamine, tyrosine and glycine residues unifies the majority of yeast prion proteins. Deletion of this domain precludes prionogenesis and appending this domain to reporter proteins can confer prionogenicity. An algorithm designed to detect prion domains has succes
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PUF60 encodes a nucleic acid-binding protein, a component of multimeric complexes regulating RNA splicing and transcription. In 2013, patients with microdeletions of chromosome 8q24.3 including PUF60 were found to have developmental delay, microcephaly, craniofacial, renal and cardiac defects. Very similar phenotypes have been described in six patients with variants in PUF60, suggesting that it underlies the syndrome. We report 12 additional patients with PUF60 variants who were ascertained using exome sequencing: six through the Deciphering Developmental Disorders Study and six through simila
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND & AIMS: Stress granules (SGs) represent membrane-free cytoplasmic structures rapidly aggregating during cellular stress responses arguably useful as markers of molecular inflammation. To provide an automated, reproducible, and unbiased analytic workflow, we used the open-source software CellProfiler to quantify SGs in distinct cell types in inflammatory bowel disease.
METHODS: The EpiCellProfiler (ECP) and PropiCellProfiler (PCP) pipelines enable segmentation within intestinal epithelial cells and lamina propria cells, respectively. The SG marker Ras GTPase-activating protein-bindi
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prostate cancer (PCa) is the second most prevalent malignancy (7.3 %) and fifth leading cause of cancer death (4.1 %) in men globally. While lung cancer remains the predominant cancer in both incidence and mortality among all cancers, PCa exhibits geographically heterogeneous rising trends. Stress granules (SGs) are membraneless organelles formed through liquid-liquid phase separation (LLPS), playing a pivotal role in cellular stress responses, and are closely associated with various cancers, including PCa. Studies have shown that the expression of key SG-nucleating proteins, such as Ras-GTPas
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Chikungunya virus (CHIKV) poses a severe threat to global public health. The interaction between CHIKV nsP3 and host G3BP1 is critical for viral replication. However, the exact structural mechanism of the nsP3-G3BP1 interaction is scarce. Here, we report a cryo-electron microscopy structure of an octameric-heterotrimer formed by CHIKV nsP3 peptide (designated as CHIKV-43) in complex with the nuclear translocation factor 2-like (NTF2L) domain of G3BP1. The overall structure presents a double-layer ring scaffold. Two FGDF motifs and two alpha helices of CHIKV-43 are essential to bind
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recognition of intracellular nucleic acids is a vital step for host to mount prompt immune responses against microbial pathogens. However, inappropriate response to self-nucleic acids leads to sustained type I interferon (IFN) production, which is implicated in the development of several autoimmune diseases, such as Aicardi-Goutières syndrome (AGS). Therefore, effective confinement of intracellular nucleic acid-induced IFN expression is a potential strategy for the treatment of such autoimmune diseases. In this study, we found that rosmarinic acid (RA), a natural compound isolated from rosemar
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polyglutamine diseases are a group of neurodegenerative disorders caused by an abnormal expansion of CAG repeat tracts in the codifying regions of nine, otherwise unrelated, genes. While the protein products of these genes are suggested to play diverse cellular roles, the pathogenic mutant proteins bearing an expanded polyglutamine sequence share a tendency to self-assemble, aggregate and engage in abnormal molecular interactions. Understanding the shared paths that link polyglutamine protein expansion to the nervous system dysfunction and the degeneration that takes place in these disorders i
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic cellular stress associated with neurodegenerative disease can result in the persistence of stress granule (SG) structures, membraneless organelles that form in response to cellular stress. In Huntington's disease (HD), chronic expression of mutant huntingtin generates various forms of cellular stress, including activation of the unfolded protein response and oxidative stress. However, it has yet to be determined whether SGs are a feature of HD neuropathology. We examined the miRNA composition of extracellular vesicles (EVs) present in the cerebrospinal fluid (CSF) of patients with HD a
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cigarette smoking was known to accelerate the occurrence and development of bladder cancer by regulating RNA modification. However, the association between the combination of cigarette smoking and RNA modification-related single nucleotide polymorphisms (RNAm-SNPs) and bladder cancer risk remains unclear. In this study, 1681 participants, including 580 cases and 1101 controls, were recruited for genetic association analysis. In total, 1 287 990 RNAm-SNPs involving nine RNA modifications (m6A, m1A, m6Am, 2'-O-Me, m5C, m7G, A-to-I, m5U, and pseudouridine modification) were obtained from the RMVa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA binding proteins associated with amyotrophic lateral sclerosis (ALS) and muscle myopathy possess sequence elements that are low in complexity, or bear resemblance to yeast prion domains. These sequence elements appear to mediate phase separation into liquid-like membraneless organelles. Using fusion proteins of matrin 3 (MATR3) to yellow fluorescent protein (YFP), we recently observed that deletion of the second RNA recognition motif (RRM2) caused the protein to phase separate and form intranuclear liquid-like droplets. Here, we use fusion constructs of MATR3, TARDBP43 (TDP43) and FUS with
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Age-related hearing loss (ARHL) is a degenerative change in the auditory system, but its underlying mechanism remains unclear. In this study, using RNA sequencing technology, we analysed the expression profiles of mRNAs in the cochlear tissues of ARHL-susceptible C57BL/6J (C57) mice and relatively resistant CBA/CaJ (CBA) mice. We found that the mRNA related to stress granules (SGs) was significantly increased in the cochlear tissues of ARHL mice. Combined with current research on the pyroptosis of cochlear hair cells, we constructed an aging model of House Ear Institute-Organ of Corti 1 (HEI-O
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Stress granules (SGs) are non-membrane-bound RNA-protein granules that assemble through phase separation in response to cellular stress. Disturbances in SG dynamics have been implicated as a primary driver of neurodegenerative diseases, including amyotrophic lateral sclerosis (ALS) and frontotemporal dementia (FTD), suggesting the hypothesis that these diseases reflect an underlying disturbance in the dynamics and material properties of SGs. However, this concept has remained largely untestable in available models of SG assembly, which require the confounding variable of exogenous
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Short-lived mRNAs harbor AU-rich elements (AREs) in their 3' untranslated regions (3'UTRs) that are tightly regulated by ARE-binding proteins. While the Hu family stabilizes target mRNAs, our understanding is largely confined to HuR due to its ubiquitous expression. Other Hu members, long considered neuron-specific, remain incompletely characterized in non-neuronal cells. Notably, HuB is markedly upregulated in various tumors and under cellular stress, but the molecular mechanisms and functional significance underlying its upregulation remain elusive. Here, we show that inflammatory stimulatio
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The CUG-BP and Elav-like (CELF) family of RNA-binding proteins are key regulators of post-transcriptional gene expression, coordinating alternative splicing, mRNA stability, and translation. Although individual members, particularly CELF1 and CELF2, have been extensively characterized, a systematic, paralog-resolved integration of structural determinants, regulatory mechanisms, and disease relevance across all six CELF proteins remains limited. Here, we establish an integrative framework linking conserved RNA recognition motifs and divergent linker domains to context-dependent regulatory outpu
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Stage-specific activator protein (SSAP) is a 43-kDa polypeptide that binds to an enhancer element of the sea urchin late histone H1 gene. This enhancer element mediates the transcriptional activation of the late histone H1 gene in a temporally specific manner at the mid-blastula stage of embryogenesis. We have cloned cDNAs encoding SSAP by using polyclonal antibodies raised against purified SSAP to screen expression libraries. SSAP is unrelated to previously characterized transcription factors; however, it exhibits striking homology to a large family of proteins involved in RNA processing. The
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glycan-mediated processes can be critical determinants of viral attachment and entry, yet for enveloped RNA viruses, including SARS-CoV-2, their mechanistic roles remain incompletely defined. This review synthesizes current structural and functional evidence for glycan engagement during SARS-CoV-2 attachment and entry. We describe the general viral entry pathways and their reliance on glycan recognition, followed by the interactions of the SARS-CoV-2 spike glycoprotein with host glycans, including ABO(H) blood group antigens, sialylated glycans, and endogenous lectins. Based on structural biol
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Metastasis is the key cause of death in ovarian cancer patients. To figure out the biological nature of cancer metastasis is essential for developing effective targeted therapy. Here we investigate how long non-coding RNA (lncRNA) SPOCD1-AS from ovarian cancer extracellular vesicles (EVs) remodel mesothelial cells through a mesothelial-to-mesenchymal transition (MMT) manner and facilitate peritoneal metastasis.
METHODS: EVs purified from ovarian cancer cells and ascites of patients were applied to mesothelial cells. The MMT process of mesothelial cells was assessed by morphology o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Much attention on the pathophysiology of nasal polyp (NP) has focused on eosinophils. Interleukin (IL)-4 and eotaxin-3 (C-C motif chemokine ligand 26, or CCL26) levels have been reported to be increased in eosinophilic nasal polyps. The aim of this study was to characterize CCL26 posttranscriptional regulation by the RNA-binding protein HuR in primary human nasal polyp-derived epithelial cells (hNPDECs) challenged with IL-4.
METHODS: A prospective, observational study was conducted. Nasal polyp tissues were obtained from eosinophilic (n = 12) and non-eosinophilic (n = 10) NP patie
СтатьяНаблюдательное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic intestinal pseudo-obstruction (CIPO) is a rare but life-threatening disease characterized by severe intestinal dysmotility. Histopathologic studies in CIPO patients have identified several different mechanisms that appear to be involved in the dysmotility, including defects in neurons, smooth muscle, or interstitial cells of Cajal. Currently there are few mouse models of the various forms of CIPO. We generated a mouse with a point mutation in the RNA recognition motif of the Nup35 gene, which encodes a component of the nuclear pore complex. Nup35 mutants developed a severe megacolon an
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNAs have diverse structures that are important for biological function. These structures include bulges and internal loops that can form tertiary contacts or serve as ligand binding sites. The most commonly exploited RNA drug target for small molecule intervention is the bacterial ribosome, more specifically the rRNA aminoacyl-tRNA site (rRNA A-site) which is a major target for the aminoglycoside class of antibiotics. The bacterial A-site is composed of a 1 x 1 nucleotide all-U internal loop and a 2 x 1 nucleotide all-A internal loop separated by a single GC base pair. Therefore, we probed th
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования