Rosa rugosa is an economically significant ornamental species with limited understanding of its molecular cold adaptation mechanisms. This study utilized transcriptome sequencing to elucidate the temporal dynamics and organ-specific regulatory mechanisms underlying cold stress (4°C) responses in the leaves and one-year-old stem of R. rugosa. Differential gene expression analysis revealed distinct organ-specific and time-dependent transcriptional reprogramming. A core set of 1,479 and 1,872 genes were consistently differentially expressed from early to late stages (4-24 h) in leaves and stems,
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiple myeloma (MM) is the second most common blood cancer in the world, yet its genetic pathology is not fully understood and MM cells have highly heterogeneous regulatory mechanisms. Single-cell RNA-Sequencing (scRNA-Seq) technologies provide an unprecedented opportunity to investigate cell heterogeneity and understand regulatory mechanisms at the single-cell level. Four MM scRNA-Seq datasets were retrieved from the public domain containing 597, 172, 477, and 51,840 cells, respectively. First, they were integrated and jointly analyzed to accurately identify 24 MM cell clusters, using a nor
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cardiovascular disease progression is characterised by the dysregulation of lipid metabolism and pro-atherogenic effects of adipose tissue signalling. Recent findings from the analysis of transcriptomic data in bulk tissue has enabled these insights and revealed important changes in gene expression. However, few studies have explored these molecular mechanisms before the onset of cardiovascular disease. We explore associations between future lipid-regulating drug use and cardiometabolic traits (n = 103), including DXA scans of body composition at baseline and follow-up 5-10 years later, in a c
СтатьяTwin StudyПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The hypothalamic neuropeptide system of orexin (hypocretin) neurons provides projections throughout the neuraxis and has been linked to sleep regulation, feeding and motivation for salient rewards including drugs of abuse. However, relatively little has been done to examine genes associated with orexin signaling and specific behavioral phenotypes in humans. Here, we tested for association of twenty-seven genes involved in orexin signaling with behavioral phenotypes in humans. We tested the full gene set, functional subsets, and individual genes involved in orexin signaling. Our primary phenoty
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ethanol rapidly produces widespread neuronal apoptosis during early development, but this susceptibility declines as the brain matures. In previous research, we found Myt1l (a proneuronal transcription factor) mutations can cause precocious differentiation, neuronal immaturity, and transcriptomic alterations, including many in apoptotic regulators. Therefore, we used a recently developed Myt1l haploinsufficient mouse model to examine this gene's effects on ethanol-induced apoptosis across different developmental stages. We discovered that haploinsufficiency can moderately influence vulnerabili
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anti-retroviral therapy (ART) has decreased human immunodeficiency virus (HIV)-1-associated morbidity. However, despite ART, immune cells remain latently infected, leading to chronic inflammation and HIV-1-associated comorbidities. New strategies are needed to target viral proteins and inflammation. We found activation of Notch3 in renal cells of the HIV-1 transgenic mouse model (HIV-Tg26) and in patients with HIV-associated nephropathy. We hypothesized that targeting NOTCH3 activation constitutes an effective therapy for HIV-related chronic kidney disease. We generated HIV-Tg26 mice with Notc
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Planarian muscle produces key wound signal patterning whole-body regeneration. Within muscle, generic induction of wnt1 promotes tail regeneration, while polarized expression of the Wnt inhibitor notum at anterior-facing wounds drives head regeneration. Classic experiments indicate that microtubules are also involved in blastema fating, but the cell biology of planarian muscle is still poorly understood. We raised an antibody to muscle-expressed TUBA-2 and found that planarian muscle possesses a microtubule network linking contractile fibers with their mononucleated cell bodies. Microtubules w
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
How developing organisms respond to a changing environment is a fundamental question. Pollutants and temperature are major environmental factors. Using the bristle patterning of Drosophila as a model system, we observed that cold temperature and methotrexate, a medical drug that contaminates wastewaters, increase dorsocentral (DC) bristle number, a trait normally robust. The patterning of bristles is well understood and involves the achaete-scute (ac-sc) proneural genes. Modular enhancers activate ac-sc expression in groups of cells, called proneural clusters, from which bristle precursors are
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Premature ovarian insufficiency (POI) is affecting approximately 1% of females and increasingly contributing to female infertility. The etiology of POI is heterogeneous. CHEK1, a critical component of the DNA damage and replication stress response, has recently been linked to female reproductive biology.
RESULTS: We identified a CHEK1 variant c.77C > G; p.A26G in a POI patient through whole-exome sequencing. Protein structure prediction and pathogenicity analysis suggested that the CHEK1 A26G variant may affect protein stability. RNA sequencing results of 293FT cells overexpressin
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diabetes disrupts spermatogenesis and leads to low-quality sperm by causing oxidative stress, inducing apoptosis and reducing testosterone level. Myoinositol has antiglycemic, antioxidant, anti-apoptotic, and testosterone-regulating properties. This study aimed to evaluate the potential of myoinositol in improving sperm production and sperm quality in diabetic rats. Eighteen rats were divided into three groups (n = 6 per group): control, diabetic (Streptozotocin + Nicotinamide), and diabetic + myoinositol supplementation (300 mg/kg, for 56 days). Sperm parameters, including count, total motili
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Most plant transformation protocols include the use of a selectable marker gene to enable efficient selection of transformed cells for transgenic regeneration. While the marker gene facilitates the transformation process, it is not needed once transgenic plants have been identified and is removed during commercial development. Autoexcision is a marker removal process, in which a Cre-lox system is used to remove both the selectable marker gene and the Cre gene itself in the T0 generation. One challenge for autoexcision is achieving efficient marker removal while preserving the recov
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of this study was to investigate the mechanisms of in situ-synthesized iron sulfide nanoparticles (bio-FeS NPs) on the dissemination of antibiotic resistance genes (ARGs) in anaerobic microbial consortia. The absolute abundance of plasmid RP4-associated extracellular ARGs (eARGs) decreased by more than 103 copies/ng DNA in the anaerobic consortia containing in situ-formed bio-FeS NPs (AnBR-FeS NPs). Mechanistic analysis revealed that the inhibitory effect was related to the absence of a significant correlation between functional bacteria such as Nitratidesulfovibrio in AnBR-FeS NPs and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa) is responsible for complicated urinary tract infections (UTI) acquired from different transmission routes. Quorum sensing (QS) plays an important role in the regulation of virulence factors in P. aeruginosa and is dependent on the nutritional conditions. Under pathological conditions, urine contains elevated levels of metabolites such as glucose, creatinine, albumin and haem that may alter the QS behavior in P. aeruginosa. Hence, we investigated the role of the QS system in P. aeruginosa on growth and the expression of virulence genes under altered urinar
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background:Marantodes pumilum var. alata (MPva) has been reported to promote fracture repair. This study investigates the role of MPva leaf extract on biochemical markers and bone-repair genes in a postmenopausal rat model to understand its fracture-healing properties. Methods: Thirty female Sprague Dawley rats were grouped into sham-operated (Sham), ovariectomized control (OVXC), estrogen treatment (ERT), and plant treatment (MPv20 and MPv100) groups. After ovariectomy, the right tibiae of rats were fractured. The ERT group was treated with 64.5 μg/kg/day of estrogen, while the MPv20 and MPv1
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
It has been known that Epstein-Barr virus (EBV) can latently infect immune cells after the initial infection, and epidemiological studies have suggested its association with the onset of immune-mediated diseases (IMDs). However, the specific impact of EBV infection on IMDs pathology remains unclear. We quantified EBV load of B cell subsets (Naïve B cells, Unswitched memory B cells, Switched memory B cells, Double negative B cells, and Plasmablasts) in IMD patients as well as healthy control (HC) using bulk RNA sequencing data of 504 donors. The EBV load was clearly higher in IMD patients compa
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Adolescent idiopathic scoliosis (AIS) is a complex spinal deformity with an unclear etiology. Recent studies suggest that chromatin regulators (CRs) and the immune microenvironment may be involved in AIS pathogenesis. This study identifies differentially expressed CRs between AIS patients and healthy controls and explores their functional enrichment, immune associations, and potential therapeutic targets. Transcriptome data from the GSE110359 dataset (12 AIS and 5 control BM-MSC samples) were analyzed using bioinformatics approaches, including differential expression analysis, functional enric
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Nasopharyngeal carcinoma (NPC), highly prevalent in southern China, often leads to treatment failure in advanced stages due to recurrence or metastasis. While METTL14 plays a crucial role in cancer, its regulation of immune- and inflammation-related genes remains poorly understood. This study aims to investigate whether METTL14 is involved in regulating the expression of genes associated with tumor necrosis factor (TNF), interferon (IFN), interleukin (IL), and MHC class I in NPC cells.
METHODS: Quantitative real-time polymerase chain reaction (qRT-PCR) and Western blotting were us
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mechanism by which chondrocytes respond to mechanical stress in joints significantly affects the balance and function of cartilage. This study aims to characterize osteoarthritis-associated chondrocyte subpopulations and key gene targets for regulatory drugs. To begin, single-cell and transcriptome datasets were obtained from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. Cell communication and pseudo-temporal analysis, as well as High-dimensional Weighted Gene Co-expression Network Analysis (hdWGCNA), were conducted on the single-cell data to identify key chondrocyte subtypes and module gene
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Eggs represent an accessible and nutrient-dense source of high-quality animal protein, and decades of selective breeding have markedly elevated reproductive output in commercial laying hens. However, sustaining elevated productivity while improving eggshell integrity presents a critical challenge, as the molecular mechanisms of eggshell strength remain unclear. In this study, phenotypic assessment of eggshell strength was combined with single-cell transcriptomic profiling of the uterus from high- and low-strength groups, transcriptomic analysis of multiple tissues, and quantitative proteomic a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HIV-1 viral core transport to the nucleus, an early infection event, triggers the redistribution of cleavage and polyadenylation specificity factors (CPSF) 5 and CPSF6 to nuclear speckles, forming puncta-like structures. CPSF5 and CPSF6 regulate alternative polyadenylation (APA), which governs approximately 70% of gene expression. APA alters the lengths of mRNA 3'-untranslated regions (3'-UTRs), which contain regulatory signals influencing RNA stability, localization, and function. We investigated whether HIV-1 infection-induced changes in CPSF5 and CPSF6 subcellular localization are accompani
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.