If the genome contains outlier sequences extraordinarily sensitive to environmental agents, these would be sentinels for monitoring personal carcinogen exposure and might drive direct changes in cell physiology rather than acting through rare mutations. New methods, adductSeq and freqSeq, provided statistical resolution to quantify rare lesions at single-base resolution across the genome. Primary human melanocytes, but not fibroblasts, carried spontaneous apurinic sites and TG sequence lesions more frequent than ultraviolet (UV)-induced cyclobutane pyrimidine dimers (CPDs). UV exposure reveale
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This introduction to the special issue of AJMG Part C: Overgrowth Syndromes updates the current understanding of overgrowth syndromes. We clarify the terminology associated with overgrowth, review some common pathways to overgrowth and present a preliminary classification based on currently known genomic and epigenetic mechanisms. We introduce the articles of this issue-new research and reviews of well-established and recently described overgrowth syndromes of the brain, body or both.
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The in-depth study of viral genomes is of great help in many aspects, especially in the treatment of human diseases caused by viral infections. With the rapid accumulation of viral sequencing data, improved, or alternative gene-finding systems have become necessary to process and mine these data. In this article, we present Vgas, a system combining an ab initio method and a similarity-based method to automatically find viral genes and perform gene function annotation. Vgas was compared with existing programs, such as Prodigal, GeneMarkS, and Glimmer. Through testing 5,705 virus genomes downloa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Of the ten human-restricted Neisseria species two, Neisseria meningitidis, and Neisseria gonorrhoeae, cause invasive disease: the other eight are carried asymptomatically in the pharynx, possibly modulating meningococcal and gonococcal infections. Consequently, characterizing their diversity is important for understanding the microbiome in health and disease. Whole genome sequences from 181 Neisseria isolates were examined, including those of three well-defined species (N. meningitidis; N. gonorrhoeae; and Neisseria polysaccharea) and genomes of isolates unassigned to any species (Nspp). Seque
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genome editing has been well established as a genome engineering tool that enables researchers to establish causal linkages between genetic mutation and biological phenotypes, providing further understanding of the genetic manifestation of many debilitating diseases. More recently, the paradigm of genome editing technologies has evolved to include the correction of mutations that cause diseases via the use of nucleases such as zinc-finger nucleases (ZFN), transcription activator-like effector nucleases (TALENs), and more recently, Cas9 nuclease. With the aim of reversing disease phenotypes, wh
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Congenital microcephaly (CM) is an important birth defect with long term neurological sequelae. We aimed to perform detailed phenotypic and genomic analysis of patients with Mendelian forms of CM.
METHODS: Clinical phenotyping, targeted or exome sequencing, and autozygome analysis.
RESULTS: We describe 150 patients (104 families) with 56 Mendelian forms of CM. Our data show little overlap with the genetic causes of postnatal microcephaly. We also show that a broad definition of primary microcephaly -as an autosomal recessive form of nonsyndromic CM with severe postnatal deceleration
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genome rearrangements underlie different human diseases including many cancers. Determining the rates at which genome rearrangements arise and isolating unique, independent genome rearrangements is critical to understanding the genes and pathways that prevent or promote genome rearrangements. Here, we describe quantitative S. cerevisiae genetic assays for measuring the rates of accumulating genome rearrangements including deletions, translocations, and broken chromosomes healed by de novo telomere addition that result in the deletion of two counter-selectable genes, CAN1 and URA3, placed in th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oesophageal cancers are prominent worldwide; however, there are few targeted therapies and survival rates for these cancers remain dismal. Here we performed a comprehensive molecular analysis of 164 carcinomas of the oesophagus derived from Western and Eastern populations. Beyond known histopathological and epidemiologic distinctions, molecular features differentiated oesophageal squamous cell carcinomas from oesophageal adenocarcinomas. Oesophageal squamous cell carcinomas resembled squamous carcinomas of other organs more than they did oesophageal adenocarcinomas. Our analyses identified thr
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human T-lymphotropic virus type-1 (HTLV-1) is the causative agent of adult T-cell leukaemia/lymphoma (ATL), an aggressive CD4+ T-cell malignancy. The mechanisms of leukaemogenesis in ATL are incompletely understood. Insertional mutagenesis has not previously been thought to contribute to the pathogenesis of ATL. However, the recent discovery that HTLV-1 binds the key chromatin architectural protein CTCF raises the hypothesis that HTLV-1 deregulates host gene expression by causing abnormal chromatin looping, bringing the strong HTLV-1 promoter-enhancer near to host genes that lie up to 2Mb from
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Iron, as an essential nutrient, and the DNA, as the carrier of genetic information which is physically compacted into chromosomes, are both needed for normal life and well-being. Therefore, it is not surprising that close interactions exist between iron and the genome. On the one hand, iron, especially when present in excess, may alter genome stability through oxidative stress, and may favor cell cycle abnormalities and the development of malignant diseases. The genome also receives a feedback signal from the systemic iron status, leading to promotion of expression of genes that regulate iron
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tuberous sclerosis complex (TSC) is a rare genetic disease causing multisystem growth of benign tumours and other hamartomatous lesions, which leads to diverse and debilitating clinical symptoms. Patients are born with TSC1 or TSC2 mutations, and somatic inactivation of wild-type alleles drives MTOR activation; however, second hits to TSC1/TSC2 are not always observed. Here, we present the genomic landscape of TSC hamartomas. We determine that TSC lesions contain a low somatic mutational burden relative to carcinomas, a subset feature large-scale chromosomal aberrations, and highly conserved m
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
IMPORTANCE: Small-bowel adenocarcinomas (SBAs) are rare cancers with a significantly lower incidence, later stage at diagnosis, and worse overall survival than other intestinal-derived cancers. To date, comprehensive genomic analysis of SBA is lacking.
OBJECTIVE: To perform in-depth genomic characterization of a large series of SBAs and other gastrointestinal tumors to draw comparisons and identify potentially clinically actionable alterations.
DESIGN, SETTING, AND PARTICIPANTS: Prospective analysis was performed of clinical samples from patients with SBA (n = 317), colorectal cancer (n = 63
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nobody doubts that infections have imposed specialisations on the mammalian genome. However sufficient information is usually missing to attribute a specific genomic modification to pressure from a specific pathogen. Recent studies on mechanisms of mammalian resistance against the ubiquitous protozoan parasite, Toxoplasma gondii, have shown that the small rodents presumed to be largely responsible for transmission of the parasite to its definitive host, the domestic cat, possess distinctive recognition proteins, and interferon-inducible effector proteins (IRG proteins) that limit the potential
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Keratoconus (KTCN) is a degenerative disorder of the eye characterized by the conical shape and thinning of the cornea. The abnormal structure of KTCN-affected cornea results in loss of visual acuity. While many studies examine how environmental factors influence disease development, finding the genetic triggers has been a major emphasis of KTCN research. This paper focuses on genomic strategies that were implemented for finding candidate genes, including linkage and association studies, and presents different approaches of mutation screening. The advantages and limitations of particular tools
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Viruses have evolved to traverse cellular barriers and travel to the nucleus by mechanisms that involve active transport through the cytoplasm and viral quirks to resist cellular restriction factors and innate immune responses. Virus-derived vector systems exploit the capacity of viruses to ferry genetic information into cells, and now - more than three decades after the discovery of HIV - lentiviral vectors based on HIV-1 have become instrumental in biomedical research and gene therapies that require genomic insertion of transgenes. By now, the efficacy of lentiviral gene delivery to stem cel
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The current epidemic of artemisinin resistant Plasmodium falciparum in Southeast Asia is the result of a soft selective sweep involving at least 20 independent kelch13 mutations. In a large global survey, we find that kelch13 mutations which cause resistance in Southeast Asia are present at low frequency in Africa. We show that African kelch13 mutations have originated locally, and that kelch13 shows a normal variation pattern relative to other genes in Africa, whereas in Southeast Asia there is a great excess of non-synonymous mutations, many of which cause radical amino-acid changes. Thus, k
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования