Electrophoretic mobility shift assays (EMSAs) are commonly used to analyze nucleic acid-protein interactions. When nucleic acid is bound by protein, its mobility during gel electrophoresis is reduced. Similarly, the final position of protein within a complex is shifted when compared to its free state. Here we provide a protocol for a simple approach that uses these mobility differences to identify nucleic acid-binding proteins. Following EMSA, denaturing gel electrophoresis is implemented to provide a second dimension of separation. Protein that binds a specific nucleic acid is identified as a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
High-throughput surface plasmon resonance (SPR) biosensor for rapid and parallelized detection of nucleic acids identifying specific bacterial pathogens is reported. The biosensor consists of a high-performance SPR imaging sensor with polarization contrast and internal referencing (refractive index resolution 2 x 10(-7) RIU) and an array of DNA probes microspotted on the surface of the SPR sensor. It is demonstrated that short sequences of nucleic acids (20-23 bases) characteristic for bacterial pathogens such as Brucella abortus, Escherichia coli, and Staphylococcus aureus can be detected at …
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In situ hybridization (ISH) is a powerful technique for detecting viral nucleic acids (viral RNA or DNA) within individual cells in tissue sections, allowing for the meaningful interpretation of the anatomical and histological localization of the target nucleic acids and providing relevant spatial context. The advent of novel ISH methods such as those utilizing a unique branched DNA "Z probe" coupled with an oligo-based signal amplification mechanism to amplify the signal from the RNA target (i.e., RNAscope™), have increased their sensitivity, as well as improved their reproducibility, allowin…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Clinical identification and fundamental study of viruses rely on the detection of viral proteins or viral nucleic acids. Yet, amplification-based and antigen-based methods are not able to provide precise compositional information of individual virions due to small particle size and low-abundance chemical contents (e.g., ~ 5000 proteins in a vesicular stomatitis virus). Here, we report a widefield interferometric defocus-enhanced mid-infrared photothermal (WIDE-MIP) microscope for high-throughput fingerprinting of single viruses. With the identification of feature absorption peaks, WIDE-MIP rev…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nucleic acids belong to the most important molecules and therefore the understanding of their properties, function and behavior is crucial. Even though a range of analytical and biochemical methods have been developed for this purpose, one common step is essential for all of them - isolation of the nucleic acid from the from complex sample matrix. The use of magnetic particles for the separation of nucleic acids has many advantages over other isolation methods. In this study, an isolation procedure for extraction of DNA was optimized. Each step of the isolation process including washing, immob…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The sensitivity of the scrapie agent to u.v. inactivation was found to be related to the purity of the tissue preparation. Scrapie infectivi … e, a phenthiazine antipsychotic which penetrates lipid bilayers and induces single-strand breaks in nucleic acids under irradiation. Chlorpromazine without irradiation, and a semiquinone protein-binding radical of chlorpromazine, failed to decrease scrapie infectivity by themselves. A closely related phenthiazine antipsychotic, trifluoperazine, which does not b …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There is growing interest in recovering analytes other than DNA from evidentiary samples. mRNA markers can help identify body fluids, link b … ace sample recovery method which uses paramagnetic beads conjugated with salmon protamine that bind nucleic acids with very high efficiency under buffer conditions which keep proteins intact. After performing a mild lysis step, nucleic acids are bound to the beads, unbound proteins are collected in the supernatant, and bound nucleic acids are then eluted separa …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Systemic sclerosis (SSc) is an autoimmune disease characterized by specific autoantibodies, vasculopathy and fibrosis of the skin and internal organs. In SSc, chronic activation of the immune system is largely sustained by endogenous inflammatory mediators that act as damage-associated molecular patterns (DAMPs), which activate Toll-like receptors (TLRs). Major autoantigens are nucleic acids or molecules that are able to bind nucleic acids. It is important to identify solid and predictive biomarkers of both disease activity and disease subtype. CXCL4 has been regarded as a new biomarker for ea…
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacterial infections resistant to antimicrobial treatments, particularly those caused by Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa), frequently lead to elevated mortality rates. Tackling this resistance using therapeutic combinations with varied mechanisms has shown considerable promise. In this study, a bioinspired nanocarrier is successfully designed and engineered for targeted antibiotic delivery and toxin/bacteria clearance. This is achieved by encapsulating antibiotic-loaded framework nucleic acids with hybrid cell membranes acquired from neutrophils and platelets. By coating the hybrid membr…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To elucidate mechanisms that govern functions of nucleic acids, it is essential to understand their structure and dynamics. Electron paramagnetic resonance (EPR) spectroscopy is a valuable technique that is routinely used to study those aspects of nucleic acids. A prerequisite for most EPR studies of nucleic acids is incorporation of spin labels at specific sites, known as site-directed spin labeling (SDSL). There are two main strategies for SDSL through formation of covalent bonds, i.e., the phosphoramidite approach and postsynthetic spin-labeling. After describing briefly the advantages and …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
It is shown that L-thyroxin applied to rats has induced in them development of pronounced cardiac hypertrophy accompanied by an increase in the total amount of nucleic acids in the myocardium (per organ) and enhancement of the RNA synthesis rate. It is confirmed by a considerable rise of the intensity of the labelled uridine incorporation into RNA without alteration of the specific radioactivity in a pool of free nucleotides and by the growth of the RNA-polymerase I activity. When L-thyroxin toxicosis lasts for four weeks and heart weight has not already increased the content of nucleic acids …
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиОригинал на русском
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Helicases are ubiquitous enzymes that are vital to all living organisms. They are motor proteins that move in a specific direction along the nucleic acid and unwind the nucleic acid (DNA and RNA). ATP hydrolysis provides energy for helicase translocation and unwinding. The unwinding process provides ssDNA intermediates necessary for replication, recombination, and repair. Mutations in specific DNA helicases can lead to disruption in DNA metabolism. For example, mutations in helicases genes resulted in diseases such as xeroderma pigmentosum, cockayne's syndrome, Bloom's syndrome, and Werner's s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To prepare a binary formulation delivering miRNA-146 and evaluate a nucleic acid nasal delivery system by investigating its pharmacodynamic … ly, the effects of the gel/NPs/miR-146a binary formulation were evaluated for the nasal delivery of nucleic acids in rhinitis therapy. The prepared binary formulation quickly formed a gel in the nasal cavity at a temperature of 34 °C with good mucosal adhesion, which delivered nucleic acids into the nasal mucosa stably and continuously. Gel/NPs/miR-146a was abl …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antisense oligonucleotide-mediated splicing modulation is an attractive strategy for treating genetic disorders. In 2016, two splice-switching oligonucleotides (SSOs) were approved by the FDA. To date, various types of novel artificial nucleic acids have been developed, and their potential for splicing modulations has been demonstrated. To apply these novel chemistries to SSOs, it is necessary to determine the appropriate design for each artificial nucleic acid, such as the length of the SSO and number of modifications. In this protocol, we focus on SSOs modified with 2'-O,4'-methylene-bridged…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Red blood cell (RBC) interaction with phagocytes in the spleen and liver may trigger or attenuate inflammatory responses that could influence innate and adaptive immune responses to RBC antigens. Such interactions are particularly relevant in patients with sickle cell disease (SCD), who have elevated rates of auto- and alloimmunity against RBC antigens. Many phagocyte-expressed pattern recognition receptors (PRRs) are intracellular and recognize nucleic acids. Reticulocytes and recently described mature RBCs abnormally retaining mitochondria have nucleic acids and, upon erythrophagocytosis, ca…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Applications of nucleic acid testing in most areas of the clinical laboratory have increased rapidly. The advantages of nucleic acid testing include enhanced specificity and sensitivity, ease of sample procurement, and more rapid turnaround time compared to conventional laboratory testing methods. However, the cost of testing is usually higher due to the need for additional laboratory space, specialized equipment, safety apparel, and the need for highly trained personnel. Most nucleic acid techniques currently used in a clinical setting can be categorized as either hybridization or amplificati
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Wastewater-based surveillance (WBS) can provide a wealth of information regarding the health status of communities from measurements of nucleic acids found in wastewater. Processing workflows for WBS typically include sample collection, a primary concentration step, and lysis of the microbes to release nucleic acids, followed by nucleic acid purification and molecular-based quantification. This manuscript provides workflows from beginning to end with an emphasis on filtration-based concentration approaches coupled with specific lysis and nucleic acid extraction processes. Here, two WBS process…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The aim of this study was to compare the performance of direct amplification of viral nucleic acid from transport medium to extracted nucleic acid for polymerase chain reaction (PCR), sequencing, and genotyping applications.
METHODS: XpressAmp lysate and extracted total nucleic acid from viral transport medium containing nasopharyngeal specimens were evaluated across different molecular applications to determine performance characteristics.
RESULTS: SARS-CoV-2 quantitative PCR and angiotensin-converting enzyme (ACE) genotyping assays worked well with XpressAmp lysate, almost equal
СтатьяОценочное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bioassays for cellular differentiation and tissue morphogenesis were used to design methods for isolation of bioactive redox- and metalloregulated nucleic acids and copper ion complexes with proteins from extracellular, circulating, wound, and supernatant fluids of cultured cells. In extracellular biospheres, diversities of nucleic acids were found to be secreted by cells upon activation. They may reflect nucleic acid biolibraries with molecular imprints of cellular history. After removal of protein components, eRNA prototypes exuded by activated cells were sequenced. They are small, endogenou…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.