Feces are increasingly valued as practical samples for molecular diagnosis of infectious disease. However, extraction of polymerase chain reaction (PCR) quality DNA from fecal samples can be challenging because of coextraction of PCR inhibitors. Because the type and quantity of PCR inhibitors is influenced by diet, endogenous flora, and concurrent disease, it is unlikely that extraction method performance with human feces can be directly extrapolated to that of domestic cats. In the present study, 4 commercially available DNA extraction methods were examined for their influence on the sensitiv…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A novel real-time quantitative polymerase chain reaction (Q-PCR) assay was developed for rapid and accurate detection of Listeria monocytogenes. In this Q-PCR assay, a computational DNA random shuffling method was used to design an internal amplification control (IAC) sequence, which was the same in length and G + C content to the hly amplicon. This IAC sequence was inserted into the genome of L. monocytogenes to create a mutant strain named L. monocytogenes-IAC. The LM-IAC was used as an internal control during the PCR assay and produced accurate quantification of L. monocytogenes due to simi…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study evaluated the performance of a real-time polymerase chain reaction (PCR) assay in comparison with Gram staining and culture of cerebrospinal fluid for the diagnosis of meningococcal and pneumococcal meningitis in patients with suspected bacterial meningitis. The sensitivity for detection of Neisseria meningitidis in cerebrospinal fluid was 87% (20/23) for the PCR assay, 27% (6/22) for Gram staining, and 17% (4/23) for culture. The sensitivity for detection of Streptococcus pneumoniae in cerebrospinal fluid was 100% (14/14) for the PCR assay, 62% (8/13) for Gram staining, and 36% (5/…
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, PCR and thin blood smear-based diagnostic methods were used to assess the frequency of Babesia infection in small ruminants. A total of 300 sheep and 100 goats from 37 randomly selected herds located in eight locations of eastern Turkey were examined for the presence of Babesia infection and any tick species on the body of the animals. Of 400 blood samples examined, 6 (1.5%) were positive for Babesia spp. piroplasms upon microscopic examination, whereas 33 (8.25%) were positive for the presence of B. ovis by PCR. The prevalence of babesiosis in small ruminants detected by PCR wa
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Honey can be used for the treatment of wounds, sores and skin bums, but it might be contaminated with Clostridium botulinum spores. In order to evaluate Costa Rican raw honey samples, the detection of neurotoxin gene sequences (corresponding to the bacterium) C. botulinum A, B, E and F was done with the polymerase chain reaction. A total of 64 raw honey samples, coming from different Costa Rican sites were analyzed. Reference C. botulinum strains type A (ATCC 19397), type B (ATCC 7949), type E (ATCC 17786) and type F (ATCC 25764) were used as templates for testing the effectivity of the method…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
STUDY OBJECTIVE: To compare the relative yield and diagnostic utility of the polymerase chain reaction (PCR) analysis for Pneumocystis jirovecii DNA in oropharyngeal washings using transbronchial biopsy (TBBx) and BAL as "gold standards."
DESIGN: Prospective study.
SETTING: Academic tertiary center.
PATIENTS: Oropharyngeal washes were obtained in 50 consecutive patients with clinical pneumocystis pneumonia (PCP). Because of varying clinical severity, not all patients tolerated bronchoscopy. Thirty-five patients underwent TBBx, and 48 patients underwent BAL.
METHODS: DNA extracted from orop…
Сравнительное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The simultaneous detection of Neisseria meningitidis, Haemophilus influenzae, and Streptococcus sp. was assessed by polymerase chain reaction (PCR) for the diagnosis of bacterial meningitis, as well as the applicability of PCR as a routine test. A cohort study was carried out with 182 children (2 months to 12 years of age) with suspicion of bacterial meningitis. Routine tests identified the etiologic agent in 65/84 children whose clinical status and laboratory findings suggested the presence of bacterial meningitis. Bacterial meningitis was ruled out in 98 children. In 19 children, the etiolog…
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND PURPOSE: All studies reporting high numbers of Chlamydia pneumoniae DNA positives in stroke patients published to date have used polymerase chain reaction (PCR) techniques highly prone to generate false-positive results. The aim of this study was to analyze the prevalence of C. pneumoniae DNA in plaques of the carotid artery as well as in peripheral blood by means of a new, closed, real-time PCR system.
METHODS: Carotid endarterectomy specimens and preoperative peripheral blood mononuclear cells (PBMC) of 75 individuals with severe cerebrovascular atherosclerosis were analyzed …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The international journal of tuberculosis and lung disease : the official journal of the International Union against Tuberculosis and Lung Disease2004eng
SETTING: Rapid diagnosis of tuberculosis (TB) in AIDS is critical for optimal treatment to reduce mycobacterial dissemination, HIV-1 replication and mortality. The inadequate sensitivity of Ziehl-Neelsen staining and its inability to distinguish atypical mycobacteria delays accurate diagnosis.
OBJECTIVE: To evaluate the polymerase chain reaction (PCR) for diagnosis of TB in bronchoalveolar lavage (BAL), blood and extra-pulmonary samples from patients with AIDS and pulmonary infiltrates.
DESIGN: Specimens from 103 HIV-1-infected patients were prospectively analysed using bacteriological metho…
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Helicobacter pylori infection is presumed to be the major causal agent of chronic active gastritis in humans. The persistent infection with this pathogen would be an important factor in the pathogenesis of peptic ulcer and also gastric cancer.
METHODS: We investigated relationship between H. pylori characteristics in 42 patients with normal mucosa or gastritis with minor changes and 40 patients with mild and severe gastritis. Detection and typing of vacA and cagA genes were performed using a polymerase chain reaction method.
RESULTS: The analysis of vacA prevalence and the type (…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Domestic dogs (Canis familiaris) are firmly incriminated as reservoir hosts of zoonotic visceral leishmaniasis. As an increasing number of s … ection. We report results from the first large-scale study to measure ACL infection rates using the polymerase chain reaction (PCR). A high prevalence of ACL was detected in blood and bone marrow of dogs surveyed in an area of Peru endemic for Leishmania braziliensis and L. peruviana, providing further evidence for their suspected role as ACL reservoir hosts. However, the …
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A quantitative real-time reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) method based on TaqMan technology was developed to determine the presence and amount of enterovirus RNA. In order to prevent false-negative results, a one-step multiplex RT-PCR was optimized. It contains two dual-labelled fluorogenic probes to quantify the 5' noncoding region of enterovirus and detect an internal positive control. In the present study, 104 cerebrospinal fluid samples collected during an outbreak of enteroviral meningitis were analyzed using this method. Amplification of the internal positive cont…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: Meningococcal infection has a high public profile because of its dramatic presentation, high fatality rate, and propensity to occur in outbreaks and clusters of cases. Use of a diagnostic polymerase chain reaction (PCR) assay could enhance laboratory confirmation of cases and guide the public health response in North America.
OBJECTIVE: To assess the performance of a PCR assay for the diagnosis of meningococcal disease after its implementation in a North American setting and to evaluate sensitivity and specificity of the assay for the detection of prevalent bacterial isolates.
DESIG…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We investigated the distribution of genital human papillomaviruses (HPVs) among 171 consenting men of which four were involved twice in this study. The DNA was obtained from 7 normal tissues and 168 genital lesions of which 115 were diagnosed as condylomata acuminata, 17 as condylomata plana and 36 as HPV-associated lesions (papules, lichen-like lesions, etc.). The DNA samples were analysed for the presence and type of HPV DNA (HPV type 6, 11, 16, 18, 31 or 33) by means of polymerase chain reaction (PCR). Out of 175 specimens tested, 140 (80%) were HPV positive and 35 (20%) HPV negative. There…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pemphigus is an autoimmune disease where both endogenous (genetic) and exogenous (environmental) factors play a part. Viral infections, in particular herpesvirus infections, have been identified as a possible triggering factor for pemphigus. In this study, using the polymerase chain reaction, we studied peripheral blood mononuclear cells (PBMC) and skin biopsies from patients with pemphigus, and in some of these were able to demonstrate the presence of DNA sequences of herpes simplex virus 1/2 (50% in PBMC and 71% in skin biopsies), Epstein-Barr virus (15% in PBMC and 5% in skin biopsies) and …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: To compare the diagnosis utility of a reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) for detection of enteroviral RNA in cerebrospinal fluid (CSF) in comparison to viral culture for central nervous system infections in pediatric population and to know the clinic epidemiological characteristics of this infection.
METHODS: From June to December of 1997, 116 CSF samples of children were included in the study. The samples were inoculated in MRC-5 and HEP-2 and the enterovirus RNA was detected with AMPLICOR-Enterovirus (Roche Diagnostic System). The virus were typed by neutra…
Сравнительное исследованиеАннотация на английскомСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A novel multiplex nested PCR (nPCR) method was developed for detecting and differentiating simultaneously the DNA of polyomaviruses JC, BK and SV40 in a single tube. In the first amplification step the same set of primers were used to amplify a conserved DNA region of the large T antigen gene of JCV, BKV and SV40. The second round of multiplex nPCR was carried out using a set of primers designed to render products of different size for each related virus. The thermocycling parameters and concentration of each reaction component were optimised systematically to achieve optimal specificity and s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To evaluate polymerase chain reaction (PCR) and enzyme-linked immunosorbant assay (ELISA) on detection human cytomegalovirus (HCMV) infection in preghnant women and fetuses.
METHODS: ELISA was used to screen for serum HCMV-IgM in 1881 pregnant women. Blood HCMV DNA was examined by PCR in 656 of them simultaneously. 99 fetuses or newborns of HCMV infected mothers and 47 of uninfected ones were detected by both methods.
RESULTS: The positive rate of serum HCMV-IgM in pregnant women was 2.4%, and that of HCMV DNA was 12.0%, 17.2% of fetuses or newborns from infected mothers had eithe…
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study the use of the polymerase chain reaction (PCR) to detect monoclonality in B-cell lymphoid proliferations in archival formalin-fixed paraffin-embedded tissue was assessed. Using consensus primers against the framework 3 (FR 3) region of the immunoglobulin heavy chain gene (IgH), PCR analysis was performed on 29 low grade B-cell non-Hodgkin's lymphomas. Cases of benign lymphoid hyperplasia served as polyclonal controls. Sequenced cases of acute lymphoblastic leukaemia served as positive controls. In the lymphomas, monoclonality could be demonstrated in 18 of 29 (62%) cases. Only fi…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A nested polymerase chain reaction (PCR) assay was developed to detect both rat- and human-derived Pneumocystis carinii DNA. The nested PCR product was 125 bp long and was representative of part of the gene coding for the large subunit of mitochondrial ribosomal RNA. Twenty serial blood samples and 24 tissues from six immunosuppressed Sprague-Dawley rats were examined by nested PCR. All lung samples were positive by PCR and Toluidine blue O staining. Buffy coat samples and all the other tissues were PCR-negative during up to 6 weeks of immunosuppression. Thirty-five clinical bronchoalveolar la…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования