BACKGROUND: Bladder cancer (BCa) is a tumor associated with high morbidity and mortality and its incidence is increasing worldwide. However, the pathogenesis of bladder cancer is not well understood.
OBJECTIVE: To further illustrate the molecular mechanisms involved in the pathogenesis of BCa and identify potential therapeutic targets, we combined the transcriptomic analysis with RNA sequencing and tandem mass tags (TMT)-based proteomic methods to quantitatively screen the differentially expressed genes and proteins between bladder cancer tissues (BC) and adjacent normal tissues (AN).
RESULT
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cytoplasmic linker protein 170 (CLIP170) is a CAP-Gly domain-containing protein that is associated with the plus end of growing microtubules and implicated in various cellular processes, including the regulation of microtubule dynamics, cell migration, and intracellular transport. Our studies revealed a previously unrecognized property and role of CLIP170. We identified CLIP170 as one of the interacting partners of Brucella effector protein TcpB that negatively regulates TLR2 and TLR4 signaling. In this study, we demonstrate that CLIP170 interacts with the TLR2 and TLR4 adaptor protein TIRAP.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Controlling infestations of copepodid ectoparasites in the salmon industry is increasingly problematic given higher instances of drug resistance or loss of sensitivity. Despite the importance of this issue, the molecular mechanisms and genes implicated in resistance/susceptibility are only scarcely understood. The objective of the present study was to identify and evaluate the expression levels of candidate genes associated with delousing drug response in the sea louse Caligus rogercresseyi. From RNA-seq data obtained for adult male and female sea lice, 62.48 M reads were assembled in 70,349 h
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cyanobacteria are emerging as promising hosts for production of advanced biofuels such as n-butanol and alkanes. However, cyanobacteria suffer from the same product inhibition problems as those that plague other microbial biofuel hosts. High concentrations of butanol severely reduce growth, and even small amounts can negatively affect metabolic processes. An understanding of how cyanobacteria are affected by their biofuel product can enable identification of engineering strategies for improving their tolerance. Here we used transcriptome sequencing (RNA-Seq) to assess the transcriptome respons
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Budesonide treatment of chronic inflammatory bowel disease commonly leads to non-response or adverse reactions, possibly because of alterations in efflux transport mediated by the ABCB1 gene product P-glycoprotein or metabolism by CYP3A isoenzymes. Two groups, each consisting of nine healthy volunteers, one with the CYP3A5(*)1/(*)3 genotype (expressors) and the other with the CYP3A5(*)3/(*)3 genotype (non-expressors), were given a single oral dose of 9 mg budesonide. Plasma and urine concentrations of budesonide and its major metabolites were determined using liquid chromatography-tandem mass
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIMS: In sepsis-associated cholestasis, expression of many genes involved in bile acid transport, including Ntcp, is suppressed by cytokines. Kupffer cells (KC) are an important source of cytokines in sepsis. To assess the consequences of KC depletion on hepatic Ntcp expression in endotoxemic rats.
METHODS: Sprague-Dawley rats received liposomal clodronate (CLO) or vehicle (PBS) to deplete KC prior to lipopolysaccharide (LPS) exposure. Plasma and liver samples were taken 1 and 16 h after LPS exposure.
RESULTS: Complete CLO-depletion of KC by was demonstrated by immunohistochemistr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To investigate the molecular pathways disrupted by dominant spastin mutations in apparently unaffected skeletal muscle from patients with motor neuron disease (SPG4).
METHODS: The authors studied muscle of three individuals from two unrelated families affected by spastic paraplegia caused by spastin mutations. The authors compared RNA expression profiles to 7 normal and 13 pathologic muscle U95A profiles (Duchenne dystrophy, acute quadriplegic myopathy, and spinal muscular atrophy). Data were validated with U133A arrays with seven different control specimens. mRNA and protein confi
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The MAL proteolipid, an integral membrane protein expressed in T lymphocytes, polarized epithelial MDCK cells, and myelin-forming cells, has been identified as a component of internal glycolipid-enriched membrane (GEM) microdomains. On the basis of its ability to induce vesicle formation by ectopic expression, MAL has been recently proposed as a component of the machinery for GEM vesiculation. Taking into account the proposed role of GEMs in polarized transport, we have investigated the expression of the MAL gene in thyroid cells. Interestingly, MAL messenger RNA species were detected in the h
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aquaporin (AQP) 5 gene was recently isolated from salivary gland and identified as a member of the AQP family. The mRNA expression and localization have been examined in several organs. The present study was focused on elucidation of AQP5 expression and localization in the eye, salivary gland, and lung in rat. RNase protection assay confirmed intense expression of AQP5 mRNA in these organs but negligible expression in other organs. To examine the mRNA expression sites in the eye, several portions were microdissected for total RNA isolation. AQP5 mRNA was enriched in cornea but not in other por
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Huntington's disease (HD) is an inherited neurodegenerative disease caused by a polyglutamine repeat expansion in the huntingtin protein. Immunohistochemical studies using the 1C2 antibody for polyglutamine expansion have detected characteristic intranuclear inclusions (INIs) in affected neurons in HD. Further, in vitro and mouse models of HD have shown that the INIs recruit several proteins relating to RNA splicing and translation. In the present study, we immunohistochemically investigated the association of INIs with various heterogeneous nuclear ribonucleoproteins in the cerebral cortex of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: White matter hyperintensities (WMHs) are a hallmark imaging sign of cerebral small vessel disease (CSVD) and are closely linked to motor and cognitive deficits. Using voxel‑based morphometry (VBM) together with spatial transcriptomics, this study explored the altered molecular pathways underlying the reduction in gray matter volume (GMV) associated with WMHs. METHODS: We included 25 patients with WMHs and 26 healthy controls. The VBM analysis was used to identify brain regions with reduced GMV. Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway enrichment
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biliary tree stem cells (BTSCs) have the potential of hepatobiliary-pancreatic differentiation and are ideal for repairing bile duct damage. Previously, we established a BTSC Expansion Hydrogel (BEX-gel) system for expansion of BTSC organoids, and developed a patch grafting strategy to deliver BTSC organoids for liver injury and diabetes treatment. In this study, we focused on the ability of the expanded BTSC organoids to give rise to functional cholangiocyte organoids, as well as their capacity of rescuing bile duct injury. A cholangiocyte differentiation system, composed of matrix plus serum
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Circadian clocks strongly influence adipocyte biology. Studying adipocyte circadian regulation in the absence of organismal cues isolates cell-autonomous clock control, providing insight into mechanisms relevant to metabolic disease. To resolve circadian core biological programs, we deeply sequenced bulk RNA from inguinal-derived, in vitro-differentiated adipocytes (IVDAs) over a 2.5-day circadian time-course and compared clock-controlled genes (CCGs) with existing mouse supraclavicular brown adipose tissue (BAT) and epididymal white adipose tissue (eWAT) circadian time-course datasets. Using
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacterial microcompartments (BMCs) and biomolecular condensates are two different forms of protein compartmentalization with different aims and functional advantages, representing specific designs of sequestering enzymes or segments of metabolic pathways. BMCs represent special proteinaceous organelles that are entirely composed of protein and are typically characterized by polyhedral shapes. By encapsulating and organizing metabolic enzymes with their substrates and cofactors BMCs act as specialized compartments within bacterial cells that promote and enhance specific biochemical pathways. Th
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic cadmium exposure is linked to esophageal squamous cell carcinoma (ESCC) progression, treatment resistance, and poor prognosis, but its molecular mechanisms remain unclear. Based on whole-transcriptome sequencing (RNA-seq) on chronic cadmium-treated (CCT) and untreated human EC109 ESCC cells, we performed lncRNA-mRNA co-expression and protein-protein interaction (PPI) network analyses to screen the hub genes related to cadmium exposure. Then, Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway enrichment analyses depicted that these genes were mainly enriched i
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Changes in modern lifestyles have led to an increase in obesity rates. Excessive lipid accumulation leads to abnormal cholesterol metabolism, and maintaining a balanced cholesterol metabolism is essential for the normal functioning of cells and the body. Rutin belongs to the group of flavonoids with hypolipidemic, anti-inflammatory and antioxidant effects. The aim of this study was to investigate the role of rutin in cholesterol metabolism disorders induced by a high cholesterol diet in zebrafish larvae. The trial was divided into five groups: Normal diet (ND), 5 % high cholesterol diet (HCD),
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Alanine glyoxylate aminotransferase (AGXT) family members are crucial in cancer processes, but their role in hepatocellular carcinoma (HCC) metabolism is unclear. This study investigates AGXT2's function in HCC.
PATIENTS AND METHODS: AGTX2 expression was studied using bioinformatics, real-time reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-qPCR), Western blot, and Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). A lentivirus-induced AGTX2 overexpression cell model was analyzed with RNA sequencing (RNA-seq) and liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS). Cholesterol levels were co
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Enterovirus A71 (EV-A71), as a neurotropic virus, mainly affects infants and young children under the age of 5. EV-A71 infection … e-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 2 (Stau2), an important member involved in neuronal mRNA transport, potentially interacts with 3C.
METHODS: We used coimmunoprecipitation (Co-IP) and immunofluorescence assay (IFA) to confirm that EV-A71 3C interacts with Stau2. By constructing the mutant of Stau2, we found the specific site where the 3C protease …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease (AD) is a progressive neurodegenerative disorder and leading cause of dementia, characterized by neuronal and synapse loss, amyloid-β and tau protein aggregates, and a multifactorial pathology involving neuroinflammation, vascular dysfunction, and disrupted metabolism. Additionally, there is growing evidence of imbalance between neuronal excitation and inhibition in the AD brain secondary to dysfunction of parvalbumin (PV)- and somatostatin (SST)-positive interneurons, which differentially modulate neuronal activity. Importantly, impaired interneuron activity in AD may occu
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: It has been shown that small intestine development in low birth weight (LBW) piglets is impaired. Glutamine (Gln) has been reported to improve piglet health and intestinal function in weaned piglets, but data is scarce in suckling piglets. This study was conducted to investigate the effects of oral Gln supplementation compared to Alanine (Ala) on jejunal development and function in 5 and 12 d old male LBW and normal birth weight (NBW) suckling piglets.
RESULTS: Gln had no effect on the jejunal morphology, development, tissue and digesta amino acid profiles and mRNA abundance of ge
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.