LncRNAs and miRNAs are the two most important non-coding RNAs, which have been identified to be associated with cancer progression or prevention. The dysregulation of lncRNAs conducts tumorigenesis and metastasis in different ways. One of the mechanisms is that lncRNAs interact with miRNAs to regulate distinct cellular and genomic processes and cancer progression. LncRNA SNHG7 as an oncogene sponges miRNAs and develops lncRNA-miRNA-mRNA axes, leading to the regulation of several signaling pathways such as Wnt/β-Catenin, PI3K/AKT/mTOR, SIRT1, and Snail-EMT. Therefore, in this article, after a b
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
EN1 is well known as a transcription factor in other tumours, but its role in NPC is unclear. In this study, we first used bioinformatics to analyse GEO data to obtain the differentially expressed gene EN1, and subsequently verified that EN1 was highly expressed in nasopharyngeal carcinoma cells by tissue microarrays as well as cell lines. Further, we down-regulated the expression of EN1 in cells for RNA sequencing. The analysis of sequencing results using KEGG and GO revealed significant changes in cell proliferation and cycle function after downregulation of EN1. Meanwhile, we found that cel
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Ferroptosis is a novel iron-dependent form of cell death, which is implicated in various diseases including cancers. However, the influence of ferroptosis-related genes on the prognosis of breast cancer remains unclear.
METHODS: RNA sequencing data of 1053 breast cancer tissue samples and 111 normal tissue samples from The Cancer Genome Atlas (TCGA) were analyzed. Expression levels of 259 ferroptosis-related genes were compared. Gene Ontology (GO) and the Kyoto Gene and Genomic Encyclopedia (KEGG) analyses were conducted on differentially expressed genes. Cox univariate analysis w
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nasopharyngeal carcinoma (NPC), although not very common in many parts of the world, is a major concern in some countries, including Iran. Molecular studies are very helpful to provide essential information regarding underlying carcinogenetic mechanisms. Here, considering NPC proteomic approaches, established biomarkers were designated for protein-protein interaction network construction and analysis with corresponding plug-ins. A network of reported protein markers was constructed and topological and biological process features were investigated. Centrality analysis showed that JUN, CALM1, HS
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bioactive peptides existing in vivo have been considered as an important class of natural medicines for the treatment of diseases. Peptidome analysis of tissues and biofluids had provided important information about the differentially expressed bioactive peptides in vivo.
METHODS: Here, we analyzed the peptidome of serous ovarian cancer tissue samples and normal ovarian epithelial tissue samples by mass spectrometry and further investigated the possible bioactive peptides that were differentially expressed.
RESULTS: We identified 634 differentially expressed peptides, 508 of thes
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer cells have abnormal gene expression profiles; however, to what degree these are chaotic or driven by structured gene regulatory networks is often not known. Here we studied a model of Ras-driven invasive tumorigenesis in Drosophila epithelial tissues and combined in vivo genetics with next-generation sequencing and computational modeling to decipher the regulatory logic of tumor cells. Surprisingly, we discovered that the bulk of the tumor-specific gene expression is controlled by an ectopic network of a few transcription factors that are overexpressed and/or hyperactivated in tumor cel
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: To examine by means of immunohistochemistry the expression of the tumor suppressing gene p53 and gene p21 in cells of malignant melanoma of the uvea from formalin-paraffin material from patients, who were during the period 2000 - 2006 surgically treated due to malignant melanoma of the uvea at the Department of Ophthalmology in the University Hospital in Brno (Brunn), Czech Republic, E.U., and to correlate the results of the immunohistochemical detection with clinical signs of the tumor of each patient.
METHODS: Twenty-nine malignant melanomas of the uvea were examined by means of monocl
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacillus Calmette-Guerin intravesical therapy is the standard treatment of superficial bladder tumors at high risk of recurrence and progression to muscle-invasion disease. To date, there is no well established predictive factor of response to Bacillus Calmette-Guerin intravesical therapy. The prognostic value of p53 overexpression in bladder tumors is controversial. Most investigators have found no correlation between p53 status assessed before Bacillus Calmette-Guerin intravesical therapy and patient outcome. On the other hand, it is acknowledged that the persistence of p53 overexpression af
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hydatidiform moles result from abnormal fertilization and have been divided into partial and complete forms based on morphologic, cytogenetic, and clinical features. Little is known about their pathogenesis or malignant transformation. We applied an immunohistochemical marker for the p53 tumor suppressor gene product to placentas with hydropic change and hydatidiform moles to determine whether abnormal p53 gene product accumulation occurs in molar gestations. Ploidy of these placentas was determined by flow cytometry and fluorescence in situ hybridization. The mean percentages of p53-positive
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Studies have shown an increased risk for breast cancer in the mothers of children suffering from retinoblastoma and osteosarcoma, suggesting a role for the retinoblastoma susceptibility (Rb) gene product in breast cancer. We now show that estradiol decreases the expression of Rb at the level of protein and messenger RNA (mRNA) in estrogen-dependent breast cancer cell lines. Treatment of MCF-7 cells with 10(-9) M estradiol for 48 h resulted in a 70% decrease in the level of Rb protein. Ribonuclease protection assays showed a 50% decrease in the steady state levels of Rb mRNA by 12 h and a 70% d
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Reactive oxygen species (ROS) are critical regulators of tumor development and progression, yet their clinical significance and cellular mechanisms remain poorly defined in hepatocellular carcinoma (HCC).
METHODS: A comprehensive computational approach was employed to investigate ROS-related heterogeneity in HCC and to develop a prognostic model. Transcriptomic analyses at the bulk and single-cell levels were integrated to assess cellular differentiation, metabolic activity, and intercellular signaling. Machine learning techniques were applied to construct a clinically interpretab
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Breast cancer (BC) progression is driven by a complex tumor microenvironment (TME), where heterogeneous cancer-associated fibroblasts (CAFs) play pivotal roles in metastasis and therapy resistance. To decipher CAF diversity and spatial interactions, this study integrated single-cell RNA sequencing data from 24 BC samples with spatial transcriptomics. Intercellular networks were mapped using CellChat, spatial single-cell maps were reconstructed with Seurat, CAF developmental origins were traced through Monocle2-based trajectory analysis, and key spatial interactions were validated via immunohis
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVE: Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) frameworks lack explainable approaches for identifying cell subpopulations harboring strong pairwise monotonic gene-module relationships between a gene of interest (GOI) and its co-expressed genes. In this study, CEP-IP is introduced as a novel explainable machine learning framework to address this gap.
METHODS: Prostate cancer (PCa) scRNA-seq dataset was used as the initial dataset, whereby TRPM4 served as the GOI and its co-expressed ribosomal genes (Ribo) were identified via Spearman-Kendall dual-filter (i.e., dual-filtered g
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Triple-negative breast cancer (TNBC), lacking expression of the estrogen receptor (ER), progesterone receptor (PR), and human epidermal growth factor receptor 2 (HER2), has clinical features that include high invasiveness, limited response to current immunotherapies, heightened risk of recurrence, and poorer overall prognosis. Central to these adverse clinical outcomes is the tumor microenvironment (TME), where the presence of immature natural killer (NK) cells with lower cytotoxic capacity has been associated with disease progression. Through a comprehensive analysis of publicly available sin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Disulfidptosis as a novel non-apoptotic cell death mode has exhibited considerable potential for clinical application in anti-tumor treatments. However, the precise molecular mechanism underlying disulfidptosis in cutaneous melanoma and its potential clinical value remain poorly characterized. The present study validated the sensitivity of melanoma cells to glucose deprivation-induced disulfidptosis in vitro. Subsequently, single-cell sequencing data from four cutaneous melanoma patients were analyzed to identify disulfidptosis-associated differentially expressed genes (DEGs) in melanoma. Next
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metastasis is a major determinant of treatment failure and mortality in thyroid cancer, yet the interplay between malignant evolution and the immune microenvironment remains poorly characterized. Immunotherapy offers promise, but its efficacy requires a deeper understanding of tumor-associated immune infiltration and checkpoint regulation. In this study, we constructed a high-resolution transcriptomic atlas of the thyroid cancer ecosystem by analyzing 55,005 single cells from paired primary tumors and lymph node metastases. By integrating chromosomal copy number variation (CNV) inference with
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Multiple myeloma (MM) is a highly lethal hematologic malignancy. Myeloid-derived suppressor cells (MDSCs) exert vital effects on myeloma cells in the bone marrow microenvironment. Macrophage migration inhibitory factor (MIF) is a chemokine-like inflammatory cytokine that can not only prevent the free movement of macrophages but also regulate innate and adaptive immune responses. This study intends to explore the relationship between MIF and MDSCs in the bone marrow microenvironment.
METHODS: Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) analysis was performed based on the GSE124310 dat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Immune checkpoint inhibitors have significantly advanced research in oncology and are used to successfully treat patients with bladder cancer (BC). However, as the benefits of programmed death-1/ programmed death-ligand-1 blockade immunotherapy do not extend to all patients with BC, biomarkers are required to improve prognostic stratification. This study aims to identify reliable biomarkers to enhance the prediction of treatment outcomes. Bulk RNA expression data from a BC cohort (GSE176307) receiving ICI and single-cell sequencing data from patients with BC (GSE135337) were collected. We iden
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To examine gene expression differences between pre- and post-neoadjuvant systemic therapy (NST) specimens of breast cancers and identify biologic changers that may lead to new therapeutic insights.
METHODS: Gene expression data from prechemotherapy fine needle aspiration specimens were compared with resected residual cancers in 21 patients after 4 to 6 months of NST. We removed stroma-associated genes to minimize confounding effects. PAM50 was used to assign molecular class. Paired t test and gene set analysis were used to identify differentially expressed genes and pathways.
RESULT
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования