Single stranded RNA (ssRNA) and single stranded DNA (ssDNA) bacteriophages represent a key component of the global virome, yet the host genetic networks supporting their infection cycles remain poorly understood. Here, we present a comprehensive, genome-wide mapping of the genetic landscape regulating infection cycles for F pilus-dependent ssRNA and ssDNA phages in Escherichia coli. Genetic screens across ssRNA phages spanning all four genogroups of the Leviviricetes revealed a highly conserved network of host dependencies, with the notable exception of the F plasmid gene traD. While primary s
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: X-linked retinoschisis is a recessive disease characterized by progressive macular degeneration and vision loss due to pathogenic variation in RS1.
METHODS: We administered a single subretinal injection of an AAV8 vector containing human RS1 complementary DNA (scAAV8-hRS1) into one eye of patients 5 to 18 years of age who had X-linked retinoschisis. The primary end point was safety during the 52-week period after injection. Secondary end points included the change from baseline to week 52 in the best corrected visual acuity (BCVA), retinal structure (assessed with swept-source opt
СтатьяКлиническое исследование I фазыПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Surveillance and prediction of antibiotic resistance in Escherichia coli relies on curated databases of genes and mutations. We aimed to quantify the effect of acquiring specific genetic elements on minimum inhibitory concentrations (MICs) for particular antibiotic-species combinations, addressing the current scarcity of such data in existing databases.
METHODS: For this observational study, we evaluated a collection of E coli isolates with linked whole-genome sequencing and MIC data, originating from human urinary or bloodstream infections obtained from the Oxford University Hosp
СтатьяНаблюдательное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: BRCA1 and BRCA2 mutations explain approximately one-fifth of the inherited susceptibility in high-risk Finnish hereditary breast and ovarian cancer (HBOC) families. EMSY is located in the breast cancer-associated chromosomal region 11q13. The EMSY gene encodes a BRCA2-interacting protein that has been implicated in DNA damage repair and genomic instability. We analysed the role of germline EMSY variation in breast/ovarian cancer predisposition. The present study describes the first EMSY screening in patients with high familial risk for this disease.
METHODS: Index individuals from
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tabular foundation models are used as off-the-shelf predictors for heterogeneous tabular tasks, but it remains unclear how they will perform on real genotype-to-phenotype tabular datasets, which carry unique challenges. One such challenge is ancestry-dependent non-stationarity in allele effect sizes (the effects of genetic variation on disease risk): the predictive contribution of a given genetic variant may change significantly across the ancestry spectrum. This is especially consequential for patients from ancestry groups that are underrepresented in existing datasets, because models that ar
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To perform a genetic analysis of a rare complex chimeric fetus with a 45,X/46,X,dic r(Y; Y)/46,X,r(Y) karyotype, indicated by NIPT as having sex chromosome abnormalities but with normal ultrasound findings. This study underscores the critical role of integrating multiple molecular cytogenetic techniques in deciphering such complex cases, which is essential for accurate prognosis and personalized genetic counseling. The findings aim to deepen the understanding of genotype-phenotype correlations in rare chromosomal mosaicism and to guide clinical management.
METHOD: Amniotic fluid wa
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genetic stability of every living organism depends on accurate DNA replication and repair systems. Here, we investigated the Aspergillus fumigatusMSH2 mismatch repair (MMR) gene MshA and how it impacts virulence and the evolution of azole resistance. We examined mshA gene variation in 62 environmental and clinical A. fumigatus strains. We have observed 12 strains with variants (18.2%), and 8 strains among them showed missense variants. We demonstrated that A. fumigatusmshA null mutants are haploid and have conserved karyotypes with discrete gross chromosomal rearrangements. The ΔmshA strai
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To determine the disease expression in X-linked retinitis pigmentosa (XLRP) caused by a putative null mutation in the RPGR (retinitis pigmentosa GTPase regulator) gene.
METHODS: In a family with XLRP, haplotype analysis was performed with polymorphic microsatellite markers from the Xp chromosomal region, and genomic polymerase chain reaction sequencing was used to identify sequence variations in the RPGR gene. Hemizygotes and heterozygotes were evaluated clinically and with visual function tests. Optical coherence tomography (OCT) was performed on heterozygotes. Postmortem donor reti
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To explore the clinical phenotype and genetic etiology of a child with Ehlers-Danlos syndrome, spondylodysplastic type 2 (EDSSPD2).
METHODS: A child who was admitted to the Children's Medical Center of the Affiliated Hospital of Guangdong Medical University in July 2024 for "delayed motor development for 1 and a half year" was selected as the study subject. Clinical data of the child was collected, including medical history, family history, and results of auxiliary examinations. Peripheral venous blood samples were collected from the child and his two brothers and both parents. Gen
СтатьяКлинический случайАннотация на английскомПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/OBJECTIVE: Theileria orientalis is a non-transforming Theileria species infecting cattle and water buffaloes. Several outbreaks of oriental theileriosis accompanied by considerable economic loss were documented in Asia, Australia, and New Zealand. The major piroplasm surface protein (MPSP) gene has frequently been used to molecularly characterize T. orientalis isolates worldwide. Various MPSP genotypes were detected with significant virulence variations. The present study provides the first in silico analysis for all globally published T. orientalis MPSP isolates to evaluate their p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colorectal cancer (CC) arises from a complex interplay between genetic and epigenetic alterations within the colorectal mucosa, resulting in unchecked cellular proliferation and tumor development. This complexity results in diverse clinical presentations and varying responses to treatment, highlighting the critical need for personalized therapeutic approaches. The epithelial-mesenchymal transition (EMT) plays a pivotal role in CC progression, but its molecular complexity and therapeutic vulnerabilities remain poorly defined at single-cell resolution. Here, we analyzed single-cell RNA-seq (scRN
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The causal relationship between variations in thyroid dysfunction and brain structure remains elusive. We intended to probe into this causal connection using a Mendelian randomization (MR) approach.
METHODS: Aggregated statistics from the genome-wide Association Study (GWAS) on Autoimmune thyroid dysfunction were obtained from the FinnGen database, including autoimmune hyperthyroidism (N = 2,190) and autoimmune hypothyroidism (N = 49,055). Aggregate statistics on cortical area and thickness for GWAS were obtained from the Enhancing NeuroImaging Genetics through Meta-Analysis (ENIG
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Prostate cancer (PCa) is the second most common malignancy in men worldwide. Although radical prostatectomy effectively controls tumor progression, it often causes complications such as urinary incontinence and sexual dysfunction. Irreversible electroporation (IRE), a non-thermal ablation technique that preserves neurovascular structures, has emerged as a promising focal therapy and may induce systemic antitumor immunity through immunogenic cell death. However, the mechanisms and temporal dynamics of systemic immune responses to IRE in humans remain unclear.
METHODS: This prospect
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Salmonella enterica serovar Infantis is one of the emerging multidrug-resistant serovars causing foodborne illness to humans. Here, we analyzed the genome sequences of 16,157 S. Infantis isolated globally to illustrate the population dynamics, risk of antimicrobial resistance, and pESI megaplasmid carriage rates. The population structure revealed that, irrespective of the source and location of isolation, greater than 95% of isolates were ST-32. S. Infantis from ST-32 was further analyzed using the ResFinder and PlasmidFinder databases in the Abricate platform. Population dynamics
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Osteoporosis (OP), marked by reduced bone density and structural decay, poses a heightened risk of fractures. Our study formulates a predictive diagnostic model for OP by analyzing differential gene expression, thereby improving early diagnosis and therapeutic approaches.
METHODS: Using GSE62402, GSE56815, and GSE35958 datasets from the Gene Expression Omnibus (GEO) database, we identified differentially expressed genes (DEGs) via R packages, and evaluated the underlying molecular mechanisms by network analysis. Immune checkpoint and drug sensitivity were analyzed to construct and
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Macroautophagy (hereafter referred to as autophagy) is a finely tuned process of programmed degradation and recycling of proteins and cellular components, which is crucial in neuronal function and synaptic integrity. Mounting evidence implicates chromatin remodeling in fine-tuning autophagy pathways. However, this epigenetic regulation is poorly understood in neurons. Here, we investigate the role in autophagy of KANSL1, a member of the nonspecific lethal complex, which acetylates histone H4 on lysine 16 (H4K16ac) to facilitate transcriptional activation. Loss-of-function of KANSL1 is strongly
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Forests store the largest terrestrial pools of carbon (C), helping to stabilize the global climate system, yet are threatened by climate change (CC) and associated air pollution (AP, highlighting ozone (O3) and nitrogen oxides (NOx)). We adopt the perspective that CC-AP drivers and physiological impacts are universal, resulting in consistent stress responses of forest ecosystems across zonobiomes. Evidence supporting this viewpoint is presented from the literature on ecosystem gross/net primary productivity and water cycling. Responses to CC-AP are compared across evergreen/deciduous foliage t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Catechol-O-methyltransferase (COMT) catalyzes catecholamine O-methylation and contributes to dopamine turnover, potentially influencing levodopa requirements in Parkinson's disease (PD). We evaluated whether the Gothelf COMT haplotype-and its constituent variants rs2075507, rs4680 (Val158Met), and rs165599-differ in frequency between PD cases and controls. We then tested associations between these variants and clinical phenotypes, with a prespecified focus on levodopa equivalent daily dose (LEDD). Finally, we examined whether haplotype structure and allele-specific context (e.g., b
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective: To analyze the clinical and genetic characteristics of children diagnosed with Noonan-syndrome associated with loose anagen hair(NS-LAH). Methods: A retrospective analysis was conducted on the clinical data of 5 children diagnosed with NS-LAH by the Endocrinology Department of the Capital Institute of Pediatrics from January 2018 to June 2024. This analysis encompassed the patients' demographic information, clinical manifestations, distinguishing features, treatment regimens, and prognostic outcomes to elucidate their clinical characteristics. Additionally, whole-exome sequencing an
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Osteoporosis is a prevalent metabolic bone disorder with complex molecular underpinnings. Emerging evidence implicates endoplasmic reticulum stress (ERS) in its pathogenesis; however, systematic exploration of ERS-related genes (ERSRGs) remains limited. This study aimed to identify ERS-related differentially expressed genes (ERSRDEGs) in osteoporosis, construct a diagnostic model, and elucidate associated molecular mechanisms. Methods: Three osteoporosis datasets (GSE56815, GSE230665, and GSE7429) were integrated after batch effect correction and normalization. ERSRGs were curated
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.