Sodium-glucose cotransporter 2 inhibitors, efficacious antidiabetic agents that have cardiovascular and renal benefits, can promote pancreatic β-cell regeneration in type 2 diabetic mice. However, the underlying mechanism remains unclear. In this study, we aimed to use multiomics to identify the mediators involved in β-cell regeneration induced by dapagliflozin. We showed that dapagliflozin lowered blood glucose level, upregulated plasma insulin level, and increased islet area in db/db mice. Dapagliflozin reshaped gut microbiota and modulated microbiotic and plasmatic metabolites related to tr…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Human Proteome Project (HPP), the flagship initiative of the Human Proteome Organization (HUPO), has pursued two goals: (1) to credibly identify at least one isoform of every protein-coding gene and (2) to make proteomics an integral part of multiomics studies of human health and disease. The past year has seen major transitions for the HPP. neXtProt was retired as the official HPP knowledge base, UniProtKB became the reference proteome knowledge base, and Ensembl-GENCODE provides the reference protein target list. A function evidence FE1-5 scoring system has been developed for functional …
СтатьяОбзорПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mineralocorticoid excess commonly leads to hypertension (HTN) and kidney disease. In our study, we used single-cell expression and chromatin … rat kidneys. This gene signature also showed a potential for classifying human kidney samples. Our multiomics approach provides fresh insights into the possible mechanisms underlying HTN-associated kidney disease, the target cell types, the protective effects of steroidal and nonsteroidal MRAs, and amiloride.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Clinical treatment of acute myeloid leukemia (AML) largely relies on intensive chemotherapy. However, the application of chemotherapy is oft … ransmembrane Notch1 cleavage and release of the Notch1 intracellular domain into the nucleus. Using multiomics, we identified AGTR1-Notch1 signaling downstream genes and found decreased binding between these gene sequences with Notch1 and chromatin enhancers, as well as increased binding with silencers. These findings describe an AML/CVD association that may …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ageratina adenophora (A. adenophora), one of the prominent invasive plants in the Asian continent has shown toxicity in animals. However, studies examining the gene expression and metabolic profiles of animals that ingest A. adenophora have not yet been reported in the literature. Therefore, considering the wide distribution of A. adenophora, it is necessary to elucidate the toxic mechanisms of A. adenophora via multiomics approach. In this study, we identified and evaluated the toxic mechanisms of action associated with bioactive compounds in A. adenophora by using network toxicology studies …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Venetoclax is an effective treatment for certain blood cancers, such as chronic lymphocytic leukemia (CLL) and acute myeloid leukemia (AML). … lso analyzed PB from patients with breast cancer receiving venetoclax long-term using a single-cell multiomics approach (cellular indexing of transcriptomes and epitopes by sequencing) and functional assays. We found significant depletion of B-cell populations with low expression of MCL-1 relative to other immune cells, attended by extensive transcriptomic c …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons2023eng
The classical lytic infection theory along with large T antigen-mediated oncogenesis cannot explain the BK polyomavirus (BKPyV)-associated t … n, and host PARP-1 and POLQ gene expression levels increased with disease progression. Furthermore, multiomics analysis was performed on BKPyV-associated urothelial carcinoma tissues, identifying tandem-like structures of BKPyV integration using long-read genome sequencing. The carcinogenicity of BKPyV integration was proven to disturb host gene expression a …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The emergence of technologies that can support high-throughput profiling of single cell transcriptomes offers to revolutionize the study of brain tissue from persons with and without Alzheimer's disease (AD). Integration of these data with additional complementary multiomics data such as genetics, proteomics and clinical data provides powerful opportunities to link observed cell subpopulations and molecular network features within a broader disease-relevant context. We report here single nucleus RNA sequencing (snRNA-seq) profiles generated from superior frontal gyrus cortical tissue samples f…
ПрепринтСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Monoclonal B-cell lymphocytosis, monoclonal gammopathy of undetermined significance, and T-cell clones of uncertain significance are three p … sibly, intervention. Single-cell technologies and recent progress in high-throughput sequencing and multiomics approaches have contributed to a better definition of the pathophysiological mechanisms of these premalignant conditions, moving our knowledge in the field forward. In this Viewpoint, we analyse the seemingly shared biological trajectories in these …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MOTIVATION: Computer inference of biological mechanisms is increasingly approachable due to dynamically rich data sources such as single-cel … es that give rise to wide fluctuations in the performance of alternative approaches. On single-cell multiomics data of multiple phenotype acute leukemia, we found that the T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain may causally mediate specific genes in the viral carcinogenesis pathway. Using the causality-by-functionality principle, AdpFunChisq offers a vi …
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Constipation is very pervasive all over the world. It is a common multifactorial gastrointestinal disease, and its etiology and pathomechani … in constipation. To explore the relationship between intestinal flora and host, the combination of multiomics technology has become the powerful and effective method. Furthermore, the homeostasis restoration of intestinal flora also provides a new strategy for the treatment of constipation. This review aims to explore the interaction between intestinal flor …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: Chronic glucocorticoid (GC) overexposure, resulting from endogenous Cushing's syndrome (CS) or exogenous GC therapy, causes several adverse outcomes, including persistent central fat accumulation associated with a low-grade inflammation. However, no previous multiomics studies in visceral adipose tissue (VAT) from patients exposed to high levels of unsuppressed GC during active CS or after remission are available yet.
OBJECTIVE: To determine the persistent VAT transcriptomic alterations and epigenetic fingerprints induced by chronic hypercortisolism.
METHODS: We employed a translati…
СтатьяНаблюдательное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The long view on living with COVID-19 as an endemic disease calls for expanding the planetary health intervention toolbox. We will need a ba … data on oral antiviral drugs for COVID-19. This would remedy the current lag in clinically relevant multiomics theranostics for oral antivirals in the battle against COVID-19.
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatocellular carcinoma (HCC) is one of the most commonly diagnosed malignancy globally with a pessimistic prognosis. Previous studies have demonstrated that abnormal expression of genes in the lysine-specific histone demethylase 3 (KDM3) family with epigenetic changes and dysregulation of enzymes promotes cancer progression. In this study, multiomics analyses were utilized to analyze differential expression, prognostic value, genetic alteration, protein-protein interaction, associated biological pathways and immune cell infiltration of KDM3s in patients with HCC. KDM3A-C were significantly u…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Maneb is a typical dithiocarbamate fungicide that has been extensively used worldwide. Epidemiological evidence shows that exposure to maneb … rst study to investigate the molecular mechanisms underlying maneb-induced PD-like phenotypes using multiomics analysis, which identified novel therapeutic targets for PD associated with pesticides and other environmental pollutants.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Newborn screening (NBS) for inborn errors of metabolism (IEMs) represents one of the most successful public health initiatives of the past century. Originating with the simple bacterial inhibition assay for phenylketonuria, the field was revolutionized by tandem mass spectrometry (MS/MS). Today, we stand at the precipice of a second, more profound revolution driven by the convergence of high-throughput genomics, next-generation metabolomics, and advanced data science. This review articulates this paradigm shift, detailing how MS/MS is being augmented by targeted DNA analysis and how whole geno
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gastric cancer is a biologically heterogeneous disease. The advent of high-throughput multi-omic technologies has revolutionized our understanding of gastric cancer by deconstructing this heterogeneous entity into distinct and more homogeneous molecular subtypes. Early classifications based on gene expression, methylation, and histology have laid the groundwork for multi-omic frameworks proposed by The Cancer Genome Atlas and Asian Cancer Research Group, which established the foundation of modern molecular taxonomy. Subsequent integrative efforts, particularly the Consensus Genomic Subtypes (S
СтатьяОбзорПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The low-Fermentable Oligosaccharides, Disaccharides, Monosaccharides and Polyols (FODMAP) diet is widely used for irritable bowel syndrome (IBS), but response varies markedly across patients. This heterogeneity has shifted the field from testing average efficacy toward forecasting individual benefit and translating microbiome science into practical precision-nutrition tools.
METHODS: We present a conceptual analysis grounded in evidence mapping from human IBS studies that paired dietary interventions (primarily low-FODMAP pathways) with baseline microbiome and/or multi-omics measu
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gastric cancer (GC) remains a major global health burden, with its unfavorable prognosis primarily driven by extensive tumor heterogeneity. Traditional bulk omics, while informative, are inherently limited by the averaging effect of diverse cell populations and fail to capture the critical spatial molecular disparities within the tumor and its microenvironment (TME). Single-cell omics can capture cellular heterogeneity but lack spatial context. Therefore, there is an urgent clinical need for spatial multi-omics to provide a high-definition dissection of GC heterogeneity and to optimize therape
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neuroinflammation is a major determinant of secondary injury after intracerebral hemorrhage (ICH), but the microglial states that drive this process and their upstream regulators remain incompletely resolved. We integrated public single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing datasets with experimental validation to define inflammatory microglial programs after ICH. Re-clustering of microglia identified an acute MG3 subpopulation enriched for cytokine, NF-κB, and TNF signaling pathways. Integrative analysis with weighted gene co-expression network analysis prioritized thrombospondin-1 (THB
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.