An important variable in the epidemiology of arthropodborne diseases is the intensity of transmission, which is a function of host-vector contact and the prevalence of infection in the vector population. This latter value is often difficult to estimate. It is possible to envision the application of polymerase chain reaction (PCR) assays to this problem. To accomplish this, the assay must detect a single infected vector in a pool containing a large number of uninfected individuals. It must also be possible to calculate the prevalence of infection from the number of positive pools. A PCR assay f…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Animal studies have shown that malignant cells are shed into the blood stream during surgical resection of a primary tumor and that this may enhance the development of metastases. The evidence for tumor cell dissemination during surgical manipulation of human cancer is unclear. We have applied the technique of reverse transcription and polymerase chain reaction to detect circulating tumor cells in peripheral venous blood of patients with breast cancer perioperatively.
METHODS: To target breast-specific gene transcription complementary DNA was prepared by reverse transcription of b…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The nucleotide sequences of the SH gene and its F gene flanking region were determined over a range of 322 nucleotides for two live vaccines, two vaccine-associated isolates, six wild mumps viruses, and an attenuated mumps virus and compared to other sequences already published. Comparison revealed that the vaccine strains were clearly different from each other and the postvaccination isolates were different from the vaccines used. The viruses were assigned to three known cocirculating viral lineages. The attenuated mumps virus possesses nucleotide sequences identical to those of its progenito
Сравнительное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A new, rapid, and simple method for the isolation of either RNA or DNA from cerebrospinal fluid samples for subsequent amplification by specific polymerase chain reaction (PCR) assays is described. The technique involves a single extraction with a guanidinium thiocyanate acid (GuSCN) buffer, and does not require the use of organic solvents. Applied to the recovery of enteroviral RNA, herpes simplex virus (HSV) and Varicella-zoster virus (VZV) DNAs the method has proved to be of equivalent or better efficiency than established methods of nucleic acid separation but is less laborious and time co…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The polymerase chain reaction (PCR) technique for amplification of genomic fragments of spotted fever group (SFG) rickettsiae directly from field samples of ticks, tick ova, tick larvae, tick faeces and organs of wild mice was employed for the first time in P.R. of China. Ticks and rodents were collected in Beijing and Heilongjiang, Hainan and Hebei Provinces. The PCR primers were designed from the DNA sequence encoding the 190 K protein of R. rickettsii for a 532 bp long product. Seven of ten tick samples, three of four tick ovum samples, one of two tick larva samples, four of seven tick faec…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amplification of the CDR3-region of the immunoglobulin (Ig) heavy chain gene rearrangement by means of the PCR yielded clonal products in the tumor DNA of 12 high or low grade gastric B-cell lymphomas of MALT-type. In four cases, additional clonal bands were found in different areas of tumor free mucosa diagnosed as chronic gastritis associated with Helicobacter pylori (HP). Most of these small clonal populations were found to share identical DNA sequences in their clone specific CDR3-regions with the main lymphoma in each patient; a finding consistent with the multifocal character of the dise
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To approximate the contributions of in utero, intrapartum, and postnatal transmission of human immunodeficiency virus type-1 (HIV-1) and to evaluate polymerase chain reaction (PCR) as a diagnostic tool for pediatric HIV infection, blood was collected at birth (cord blood), and at 3, 6-12, and 13-24 months in 218 children born to HIV-1-seropositive mothers in Kigali, Rwanda. Proviral DNA was detected by a double PCR using two sets of three primers (gag, pol, and env). Pediatric HIV-1 infection was defined according to serological and clinical criteria. The probability of having a positive PCR a…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The polymerase chain reaction (PCR) was applied for the detection of human papilloma virus (HPV) infection, in samples obtained from the uterine cervices of 202 asymptomatic women with normal cytology in Northern Greece. About 41.8% of the women with microscopically and cytologically normal cervices were found to be infected with HPV. Typing of HPV revealed that 6.9% and 1.5% of the women were infected with HPV16 and HPV18, respectively.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The use of chelating resin in a simple, rapid and efficient pre-treatment protocol to process formalin-fixed, paraffin-embedded specimens for the polymerase chain reaction (PCR) is described and compared to other pre-treatment techniques. With this modified PCR protocol, a variety of human autopsy and biopsy specimens were investigated for presence of DNA of human papilomaviruses, cytomegalovirus or Epstein-Barr virus. These viruses were detected in a productive or non-/low-productive state. Amplimers generated ranged from 88 to 450 base pairs length. Under the specified technical conditions, …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Detection of Measles virus (MeV) RNA is an important method for confirming infection. This study described the clinical validation of a qualitative real-time reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) assay for MeV detection.
METHODS: A real-time RT-PCR assay was developed and validated using primers and probes previously reported in the literature. The assay was evaluated using reference materials, cultured virus, and previously tested clinical throat swab samples. An automated workflow was established for RNA extraction, RT-PCR amplification, and result reporting…
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cell line stability of mammalian cell lines is an important concern for manufacturing of biopharmaceuticals. Characterization of the master cell bank (MCB) for monoclonal antibody A (Mab A) via multiplex fluorescence in situ hybridization (M-FISH) analysis identified two distinct karyotypic cell populations. As a result, a regulatory agency requested additional analysis to support a single clonal lineage of the MCB and demonstrate control of the two cell populations in subsequently derived cell banks. Next Generation Sequencing (NGS) revealed 11 transgene integration site sequences. A multiple
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Chikungunya virus (CHIKV) is an arbovirus that causes an acute febrile illness with intense muscle and joint pain, with the possibility of progressing to a chronic or neurological stage. We conducted a systematic review and meta-analysis with the aim of evaluating the accuracy of real-time reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-qPCR) protocols for detecting CHIKV during the acute phase of symptoms.
METHODS: We searched the literature until December 5, 2024, including English, Portuguese, and Spanish, with no time restriction in PubMed, LILACS, and Web of Science. Stud…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: New insights into community-acquired pleural infection microbiology may enable development of more rapid and accessible diagnostics that can streamline treatment. This study systematically compared molecular approaches for pathogen detection in pleural fluid from patients with such infections. Considering the need for rapid results with minimum hands-on time and test complexity, off-label use of the cassette-based, random-access BIOFIRE Joint Infection Panel (BF-JIP, bioMérieux) with and without supplementary in-house polymerase chain reaction (PCR) assays was evaluated.
METHODS: …
СтатьяОценочное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Filter paper blood samples (i.e., dry blood spots [DBSs]) have been widely used for pathogen detection, especially in malaria control and elimination. Dried blood spot-based polymerase chain reaction (PCR) testing has also been increasingly used for diagnosis and gene monitoring. The current method of DNA extraction from DBSs is limited in practical application because of its low efficiency, time-consuming procedure, and high cost. Accordingly, a hemolysis preservation (HP) method was developed and compared with the most commonly used Tween-Chelex method and spin-column method kit (QIAamp DNA …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The objective of this study was to compare 4 different fecal diagnostic methods for detection and recovery of Echinococcus multilocularis eggs. Four methods were compared: passive fecal float, centrifugal fecal float, mini-FLOTAC, and the KeyScreen GI PCR Parasite panel (Antech Diagnostics). Domestic dog feces were spiked with 8 egg concentrations (0, 10, 25, 50, 60, 100, 200, and 500 eggs/g). Each concentration had 10 replicates. Detection frequency (ability to detect ≥ 1 egg) and mean egg recovery were assessed. The centrifugal method had the lowest detection limit, detecting eggs at 10 eggs
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The xerophilic fungal genus Wallemia is an important cause of fungal contamination in bread manufacturing environments, but its detection by conventional culture-based methods is often difficult because of slow growth and competitive overgrowth by other fungi. Here, we report the development of a genus-specific TaqMan real-time polymerase chain reaction assay targeting the internal transcribed spacer (ITS) region for rapid detection of Wallemia. Primer and probe sequences were designed based on comparative ITS analysis of all nine recognized Wallemia species and non-target fungi commonly encou…
СтатьяОценочное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Fine-needle aspiration (FNA) is critical in the initial diagnosis of many high-risk human papillomavirus (HR-HPV)-associated, metastatic oropharyngeal squamous cell carcinomas. Updated guidelines recommend HR-HPV-specific polymerase chain reaction (PCR) analysis over p16 immunohistochemistry on FNA specimens because p16 performs poorly on cytology material. PCR-based assays on liquid cytology material have demonstrated excellent analytic performance; however, the diagnostic utility of a positive HR-HPV PCR result in specimens with indeterminate cytomorphology remains uncharacterize…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Severe fever with thrombocytopenia syndrome (SFTS) is a highly fatal disease. Droplet digital polymerase chain reaction (ddPCR) presents unparalleled sensitivity and enables absolute quantification of viral load. In this prospective study, we enrolled 111 patients with SFTS and collected 259 continuous samples. Our findings unveil a robust reverse transcription (RT)-ddPCR method for SFTS with a limit of detection of 2.46 copies/µL (95% CI, 1.50-11.05), surpassing the sensitivity of RT-quantitative polymerase chain reaction at 103.29 copies/µL (95% CI, 79.69-216.35). Longitudinal cohort analysi…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.