Chronic Lymphocytic Leukemia (CLL) is clinically divided into IGHV mutated (M-CLL) and IGHV unmutated (U-CLL) subtypes, which are thought to arise from distinct cells of origin along the B-cell differentiation pathway. We measured genome-scale DNA methylation in purified CLL samples ( n = 89) and utilized reference-based cell deconvolution techniques to develop a continuous metric of epigenetic similarity across a B-naive-like to B-memory-like scale (B-Index). B-Index accurately classifies CLL into clinical subtypes (98.8%), has a stronger epigenetic signal than IGHV gene percent identity, and…
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The recurrent t(1;22) translocation in acute megakaryoblastic leukemia (AMKL) encodes the RBM15-MKL1 fusion protein. Dysregulation of the N6-methyladenosine (m6A) modification affects RNA fate and is linked to oncogenesis. Because RBM15 is critical for bringing the m6A writer complex to specific RNAs, we hypothesized that RM disrupts the m6A modification, thereby altering the RNA fate to drive leukemogenesis in RM-AMKL. Using a multiomics approach, we showed for the first time, to our knowledge, that RM retains the RNA-binding and m6A-modifying functions of RBM15 while also selectively regulat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Patients with stage II-III colorectal cancer (CRC) often receive fluoropyrimidine-based chemotherapy, usually combined with other regimens, of which ∼50% experience severe chemotherapy-induced toxicities. The B-vitamin folate has been associated with toxicity risk, possibly through effects on DNA methylation. Here, we examined the potential role of folate-associated DNA methylation in the context of chemotherapy-induced toxicities. Systematic literature searches were conducted to identify studies investigating either DNA methylation profiles associated with folate status/intake or with toxicit…
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: We studied the influence of the European HIV-1 subtype B (most common in the Western and Central Europe) and subtype A6 (prevalent in Eastern Europe including Ukraine and Russia) on host methylome during infection progression and in virus-subtype-specific manner.
RESULTS: Our results show that regardless of virus subtype, in the initial phase of the infection, HIV-related methylation changes more frequently affect parts of the genome with low expression activity including heterochromatin and quiescent regions. But, at stage four of the infection regions of the genome harboring HIV…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Age-at-death estimation is critical in forensic investigations, particularly for skeletal and dental remains. Accurate age estimation is essential for constructing biological profiles in forensic investigations. DNA methylation, particularly in age-related genes such as FHL2, has emerged as a promising epigenetic marker for this purpose. While previous studies have applied methylation assays to the entire tooth, these methods often result in the destruction of the dental structures. In this study, we assessed whether FHL2 methylation levels measured using methylation-sensitive high-resolution …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Structural genomic variants leading to anaplastic lymphoma kinase (ALK) gene fusions and aberrant expression of the ALK tyrosine kinase are the hallmark of subtypes of T- and B-lineage neoplasms, namely ALK-positive anaplastic large lymphoma (ALCL) and ALK-positive large B-cell lymphoma (LBCL). The latter is a rare aggressive lymphoma, which has been initially identified as a variant of diffuse LBCL (DLBCL) with plasmablastic features. Here, we performed comparative DNA methylation profiling of human and murine ALK-positive B-cell neoplasms. Array-based DNA methylation data from ALK-positive L…
СтатьяСравнительное исследованиеПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aging is the strongest risk factor for Alzheimer's disease (AD), yet the molecular mechanisms linking aging to AD remain poorly understood. DNA methylation (DNAm) is an epigenetic modification that plays a critical role in gene regulation and has been implicated in both aging and AD. In this study, we performed a meta-analysis of DNAm profiles in the prefrontal cortex using two large, independent postmortem brain cohorts, the Religious Orders Study and Memory and Aging Project (ROSMAP) and Brains for Dementia Research (BDR), to identify DNAm differences associated with aging in late life. We i…
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: While DNA methylation (DNAm)-based algorithms of aging show promise for predicting age-related diseases, their comparative utility for incident cardiovascular disease (CVD) remains underexplored. We aimed to systematically compare 13 DNAm algorithms in relation to CVD risk in older adults.
METHODS: This prospective cohort study included 2112 participants from the US HRS (Health and Retirement Study) with baseline DNAm data (2016) and 6-year follow-up. DNAm profiling was performed using the Infinium MethylationEPIC BeadChip kit (EPIC, Illumina, San Diego, CA). Thirteen widely used …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The bystander phenomenon can be described as the detection of effects in non-exposed cells/individuals when these come in contact with expos … nder (not previously exposed) organisms in blank medium for further assessment of gene-specific DNA methylation changes in both groups. In exposed organisms, methylation changes mostly occurred in genes involved in general stress responses and in the offset metal toxicity and oxidative stress. DNA methylation changes were also detected in bystander organisms …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Endometriosis (EMS) is a chronic inflammatory disease frequently associated with infertility. N6-methyladenosine (m6A) methylation, the most common form of methylation in eukaryotic mRNAs, has gained attention in the study of female reproductive diseases, including EMS and infertility. This study aimed to investigate the role of m6A regulators in EMS-related infertility. To begin, specific m6A regulators were identified by analyzing the GSE120103 dataset, followed by receiver operating characteristic (ROC) curve analysis. A nomogram model was then constructed, and unsupervised clustering of m6…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To investigate the correlation between the pace of aging in granulosa cells, as measured by the DunedinPACE clock, and ovarian reserve; and examine the relationship between ovarian reserve and the predicted risk of cardiovascular (CVD) and metabolic diseases through methylation risk scores (MRS). Epigenetic biomarkers have been used to characterize biological age and predict future health outcomes.
DESIGN: Cross-sectional study.
SUBJECTS: Seventy women undergoing either in vitro fertilization or elective oocyte cryopreservation.
EXPOSURE: Ovarian reserve was assessed using antimü…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Self-reported smoking during pregnancy is subject to measurement error, bringing into question previously reported associations with offspring caries experience. We evaluated whether a previously identified prenatal smoking-associated DNA methylation (DNAm) signature, and separately gestational smoking indexed through self-report and plasma cotinine, was associated with offspring caries. The Growing Up in Singapore Towards healthy Outcomes (GUSTO) cohort (n = 577 mother-child dyads, recruited from June 2009-September 2010) ascertained gestational smoking exposure (by questionnaires and plasma …
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Migraine is a highly disabling neurovascular disorder, yet its underlying molecular mechanisms remain incompletely understood. Emerging evidence implicates epigenetic modifications, particularly DNA methylation, in migraine pathophysiology, but whether these changes play a causal role has not been established.
METHODS: We integrated large-scale brain and blood methylation quantitative trait loci (mQTL) datasets with genome-wide association study (GWAS) data to investigate the causal role of DNA methylation in migraine and its subtypes. Two-sample Mendelian randomization (MR) was a…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Fragile X Messenger Ribonucleoprotein (FMRP) is a selective RNA-binding protein that localizes to the cytoplasm and the nucleus. The loss of FMRP results in Fragile X Syndrome (FXS), an autism spectrum disorder. FMRP interacts with ribosomes and regulates the translation of mRNAs essential for neuronal development and synaptic plasticity. However, the biochemical nature of this translation regulation is unknown. Here, we report that a potential feature of FMRP-mediated translation regulation during neuronal differentiation is the modulation of 2'-O-methylation of ribosomal RNA. 2'O-methyla…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Smith-Magenis syndrome (SMS) and Potocki-Lupski syndrome (PTLS) are reciprocal genomic disorders caused by deletions and duplications of the 17p11.2 chromosomal region, respectively. This study aimed to identify and validate DNA methylation episignatures specific to SMS and PTLS, and to investigate their reciprocal relationship and shared molecular features with other neurodevelopmental disorders. Genome-wide DNA methylation was analyzed in individuals with an SMS (n = 26) or PTLS (n = 27) phenotype associated with copy number variation, and SMS patients with RAI1 sequence variants using the I…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Kawasaki disease (KD) is classified as an acute febrile illness characterized primarily by systemic vasculitis. While the involvement of N6- … in endothelial cells (HUVECs). Mechanistically, METTL3 promoted the stability of NLRC4 mRNA via m6A methylation. Furthermore, NLRC4 overexpression promoted pyroptosis in KD-treated HUVECs. Finally, METTL3 inhibition attenuated coronary arteritis and pyroptosis in a KD mouse model. In summary, this study concluded that METTL3-mediated m6A methylation modificat …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thyroid cancer is the most prevalent endocrine malignancy, and its timely and accurate diagnostic and prognostic assessments are crucial for enhancing patient survival rates. As an important epigenetic modification, DNA methylation plays a key role in the regulation of gene expression and tumorigenesis. Recent studies increasingly indicate that abnormal DNA methylation patterns are closely associated with the onset and progression of thyroid cancer. This review discusses the role of DNA methylation in diagnosing thyroid adenocarcinoma, its impact on prognosis, and its potential utility in canc…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Impacts of dam construction on mercury (Hg) sources, biogeochemical cycling, and bioaccumulation were investigated along the west coast of K … t the downstream estuary. Dam/weir constructions have significant effects on Hg bioavailability and methylation, by enhancing the proportion of dissolved Hg delivered by precipitation and those subject to efficient assimilation by marine algae and microbial utilization. This is evident by the negative δ202Hg shifts in the sediment cores at the depths of MeHg …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cardiocerebrovascular disease (CCD) is a condition related to the heart and blood vessels affecting the cardiovascular system. The disease is caused by various pathogenic factors that damage the heart and brain tissues. CCD significantly threatens human health due to the increased incidence, disability, and mortality, but effective treatment options remain lacking. As precision medicine has taken center stage in recent years, the relationship between epigenetics and CCD has been increasingly studied. N6-methyladenosine (m6A) represents a dynamic and reversible methylation occurring on the sixt…
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mercury sulfide nanoparticles (HgSNPs) represent an important source of bioavailable mercury (Hg) for microbial methylation in paddy systems, depending on their size and crystalline phases. However, little is known about the phase compositions of HgSNPs in Hg-contaminated paddy fields with dynamically changed redox conditions, their transformation, and methylation potential. Applying transmission electron microscopy (TEM) and synchrotron radiation X-ray absorption spectroscopy (SR-XAS), we found β-HgSNPs as the predominant Hg species in newly contaminated areas, whereas α-HgSNPs dominated in p…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования