Cardiotoxicity is a critical issue in drug development that poses serious health risks, including potentially fatal arrhythmias. The human ether-à-go-go related gene (hERG) potassium channel, as one of the primary targets of cardiotoxicity, has garnered widespread attention. Traditional cardiotoxicity testing methods are expensive and time-consuming, making computational virtual screening a suitable alternative. In this study, we employed machine learning techniques utilizing molecular fingerprints and descriptors to predict the cardiotoxicity of compounds, with the aim of improving prediction
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The rhizome of Dryopteris crassirhizoma (DC) Nakai has long been prescribed in Chinese and Korean medicine to treat parasitic infestations, colds, and hemorrhages. DC is rich in antioxidant phytochemicals that may enhance endothelial nitric oxide bioavailability, thereby promoting vasorelaxation; however, this potential has not been thoroughly investigated. Absorption, distribution, metabolism, excretion, and toxicity-screened DC constituents were retrieved from Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology and incorporated into herb-compound-target-disease and protein-protein interaction
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Recent discoveries have illustrated that Lin28A is an oncogene in various cancers, particularly acute myeloid leukemia (AML). The upregulation of Lin28A can actively contribute to tumorigenesis and migration processes in multiple organs. Hence, the inhibition of Lin28A can be achieved by applying phytochemical herbals and targeting Lin28A protein using a computer-aided drug design (CAAD) approach.
METHODS: In this study, we comprehensively applied several bioinformatics tools, including gene ontologies, gene enrichment analysis, and protein-protein interactions (PPI), to determine
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: The Omicron, Kappa, and Delta variants are different strains of the SARS-CoV-2 virus. Graphene oxide quantum dots (GOQDs) represent a burgeoning class of oxygen-enriched, zero-dimensional materials characterized by their sub-20-nm dimensions. Exhibiting pronounced quantum confinement and edge effects, GOQDs manifest exceptional physical-chemical attributes. This study delves into the potential of graphene oxide quantum dots, elucidating their inherent properties pertinent to the surface structures of SARS-CoV-2, employing an integrated computational approach for the repositioning of i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Anacyclus pyrethrum L. (Akarkara root), a valuable Ayurvedic remedy, is reported to exhibit various pharmacological activities. Akarkara root was subjected to bioassay-guided fractionation, to isolate its active constituents and discover their potential bioactivities, followed by computational analysis.
METHODS: The methanol extract and its fractions, methylene chloride, and butanol, were assessed for their antioxidant, anti-inflammatory, and anticholinergic potentials. The antioxidant activity was determined using DPPH, ABTS, FRAP, and ORAC assays. The in vitro anticholinergic ef
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Acute pancreatitis is inflammation of pancreatic parenchyma which is an emergency condition. It is classified as mild, moderately severe, and severe categories. In severe acute pancreatitis, mortality is up to 10%-30%. Pancreatic abscess increases the mortality to 40%, and infected pancreatitis carries 100% mortality without surgical drainage. Anti-coagulant, anti-inflammatory and anti-protease activities of low-molecular-weight heparin are involved in preventing pancreatic necrosis and curbing the adverse outcomes of acute pancreatitis.
AIM: To determine the effect of low-molec
Клиническое исследование III фазыСтатьяРандомизированное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacterial histidine kinases represent attractive yet underexplored targets for antibacterial drug discovery owing to their central roles in environmental sensing and adaptive signaling. Among these, the sporulation histidine kinase KinA regulates entry into the phosphorelay controlling sporulation initiation in Bacillus species. In this study, a pharmacophore-guided virtual screening strategy based on the structural features of the histidine kinase inhibitor waldiomycin was employed to identify structurally diverse candidate KinA-binding compounds. A library of 2500 compounds was screened and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Finding potential antiviral inhibitors has advanced significantly through computer-aided drug discovery.
METHODS: The Random Forest regression (RFR), PLS regression, NNKernel regression, and pcRegression models were compared and assessed using R². In the following step, molecular docking was conducted to assess binding affinities and protein-ligand interactions. The ligand with the highest ICM score was subjected to molecular dynamics simulations to analyze binding and mechanism. In the final step, network pharmacology was adopted to study the mechanism of action.
RESULTS: The
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein recognition mimicry is of great interest in the field of molecular bioengineering and rational design, with mutagenesis frequently employed to analyze the effects of altering amino acids involved in molecular recognition. The conformational and energetic effects of such alterations can be investigated in detail with the help of molecular dynamics (MD) methodologies. While existing MD-based computational tools can be used to explore a particular set of mutations at a time, suitable for small-scale studies, high-throughput (HTP) exploration of protein recognition for engineering purposes
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Benzo[a]pyrene (B[a]P), a ubiquitous environmental pollutant, is prevalent in emissions, food products, and tobacco. Although B[a]P’s carcinogenicity is well-established, the common molecular mechanisms underlying its pan-cancer carcinogenesis remain incompletely understood. This study systematically investigated B[a]P’s shared pathogenic mechanisms in 10 common solid tumors: bladder, breast, cervical, colorectal, esophageal, gastric, liver, lung, prostatic, and thyroid cancer. METHODS: Computational tools assessed B[a]P toxicity and identified targets. Disease targets for each can
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Elucidating the interactions between the azo dye Allura Red (AR) and meat-derived proteins is crucial for understanding its safe application in complex food systems. This study investigated the interactions between AR and actin (AC), glutamate dehydrogenase (GDH), and myosin (MS) using molecular docking and molecular dynamics simulations. Molecular docking results revealed that AR primarily binds to the central hydrophobic cavities of AC/GDH and the hydrophobic side-chain regions of MS. MM-PBSA calculations demonstrated binding strengths in the order GDH (-14.50 kJ/mol) > MS (-12.67 kJ/mol) >
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer progression is driven by dysregulation of cyclin-dependent kinase 2 (CDK2), a critical cell cycle regulator. This study employed an integrated computational approach combining Density Functional Theory (DFT), molecular docking, molecular dynamics (MD) simulations, and MM-PBSA calculations to evaluate 2-thiohydantoin derivatives as CDK2 inhibitors. DFT calculations revealed compounds 2b-e narrowest lowest unoccupied molecular orbital (LUMO)- highest occupied molecular orbital (HOMO) gaps (3.02-3.26 eV in DMSO) and highest electrophilicity indices (> 3.20 eV), indicating enhanced reactivi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Vascular endothelial growth factor receptor 2 (VEGFR2) is a critical therapeutic target in hepatocellular carcinoma (HCC) due to its role in angiogenesis and tumor progression. While several inhibitors are currently used, clinical utility is often limited by resistance and adverse effects, necessitating the discovery of novel therapeutic agents. The aim of this study was to identify and characterize novel, highly effective VEGFR2 inhibitors using an integrated computational pipeline to advance the development of new HCC treatments.
METHODS: A comprehensive dataset from the ChEMBL
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cadmium (Cd) is a widespread environmental contaminant that has a detrimental impact on male reproductive toxicity (MRT) due to oxidative stress, endocrine imbalance, inflammation and cell death processes. Despite the known potential of melatonin (MLT) to ameliorate the adverse effects of Cd on MRT, the exact molecular mechanisms of such multistep action are still obscure. In this work, an integrated computational approach based on network pharmacology, protein-protein interaction (PPI) network analysis, molecular docking, MM-GBSA binding energy calculation, molecular dynamics (MD) simulation,
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ischemic stroke (IS) is a major global cause of mortality and long-term disability and is closely associated with cardiovascular disease (CVD). Its pathogenesis overlaps with cardiovascular disorders, particularly atherosclerosis and immune-inflammatory dysregulation. Shexiang Baoxin Pill (SBP), a traditional Chinese medicine used for coronary heart disease and angina pectoris, has been reported to improve microcirculation and alleviate inflammation; however, the mechanisms of SBP against IS remain unclear. Here, an integrated strategy combining network pharmacology, machine learning, molecula
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gallbladder carcinoma (GBC) is an aggressive malignancy characterized by late-stage presentation, poor prognosis, and limited therapeutic options. Gallstones (GS) represent a major risk factor and are implicated in the majority of GBC cases; however, the molecular distinctions between GS-associated GBC (GBCGS) and GS-independent/de novo GBC (dnGBC) remain poorly defined. To date, no GBC subtype-specific molecular biomarkers have been established. In this study, we employed an integrative transcriptomic and systems biology framework to delineate coding and non-coding RNA signatures underlying G
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The interaction between small molecules and biological macromolecules is a crucial area of research with significant implications across various scientific disciplines. Tafamidis is a clinically approved drug for transthyretin-mediated amyloidosis, yet its molecular interactions with biological macromolecules such as DNA remain unexplored. Investigating such interactions is crucial for understanding its broader pharmacodynamic profile and potential off-target effects. In this study, the binding interaction between tafamidis and calf thymus DNA (ct-DNA) was investigated, for the first time, usi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Capsid assembly modulators (CAMs) are a novel class of antiviral agents in clinical development for the treatment of chronic hepatitis B. CAMs inhibit hepatitis B virus (HBV) replication by binding to a hydrophobic pocket, i.e., HAP pocket, between HBV capsid protein (Cp) dimer-dimer interfaces to misdirect its assembly into empty capsids or aberrant structures and designated as CAM-E and CAM-A, respectively. Because the emergence of CAM-resistant variants results in the failure of antiviral therapy, it is important to rationally design CAMs with a high barrier of resistance for development. T
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The infection of a severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) started form Wuhan, Chinais a devastating and the incidence rate has increased worldwide. Due to the lack of effective treatment against SARS-CoV-2, various strategies are being tested in China and throughout the world, including drug repurposing. To identify the potent clinical antiretroviral drug candidate against pandemic nCov-19 through computational tools. In this study, we used molecular modelling tool (molecular modelling and molecular dynamics) to identify commercially available drugs that could act on prot
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The diagnosis of Alzheimer's disease (AD) and its related disorders rely on clinical criteria. There is, however, a large clinical overlap between the different neurodegenerative diseases affecting cognition and, frequently, there are diagnostic uncertainties with atypical clinical presentations. Current clinical practices can now regularly use positron emission tomography (PET) and single-photon emission computed tomography (SPECT) molecular imaging to help resolve such uncertainties. The Neurology Group of the French Society of Nuclear Medicine and Federations of Memory, Resour
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования