Egg yolk flavor is a critical factor influencing consumer purchasing decisions and eating experiences, and it is gradually becoming an important dimension in the egg quality evaluation system. To investigate the functional molecules regulating egg yolk flavor change, we conducted flavoromics and multi-omics analyses on egg yolks from Bashang Long-tail Chickens (BL), White Leghorn Chickens (WL), and their hybrid offspring (WB). Six key volatile organic compounds (VOCs) were identified as significantly contributing to egg yolk flavor. Metabolic profiling revealed that lipids and lipid-like molec
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The evolutionary dynamics of multigene families are central to shaping host-parasite interactions and immune outcomes. In parasitic protists, expansion and diversification of surface-associated gene families enable immune evasion and host modulation, yet these mechanisms remain poorly understood in marine ciliates. Philasterides dicentrarchi, the causative agent of scuticociliatosis, provides a relevant model to investigate how gene family evolution contributes to parasite virulence and immune interaction.
METHODS: We performed an integrated multi-omics analysis combining genome
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Exogenous chemical exposure is closely associated with allergic rhinitis (AR). Methyl 4-hydroxybenzoate (MeP), a widely used preservative, poses risks of long-term human exposure. This study aimed to explore the potential association between MeP and AR as well as its underlying molecular characteristics.
METHODS: Integrating toxicological assessment, bioinformatics analysis, and machine learning approaches, this study identified overlapping targets between MeP and AR using transcriptomic data from AR patients (GSE118243, GSE43523) in the GEO database through multi-platform prediction
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Urothelial carcinoma (UC) is a biologically heterogeneous disease, and current molecular classifications have limited integration into clinical decision-making. To further pursue precision oncology efforts in UC, we developed a molecular classification framework applicable to transcriptomic and proteomic data from non-muscle-invasive bladder cancer (NMIBC), muscle-invasive bladder cancer (MIBC) and urothelial cancer cell lines.
METHODS: Using a whole-transcriptome self-organised map and regularised semi-supervised clustering of 4439 bulk NMIBC and MIBC transcriptomes and proteomes
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteoarthritis (OA) is a complex degenerative disorder characterized by progressive joint deterioration and synovial dysfunction. Emerging evidence implicates autophagy as a key regulatory process in OA development; however, its molecular signatures, diagnostic value, and interaction with the synovial microenvironment remain incompletely defined. This study aimed to delineate autophagy-associated molecular signatures in OA and characterize their biological relevance across bulk and single-cell transcriptomic landscapes. An integrative analytical framework was applied to four synovial bulk tran
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Osteoarthritis (OA) is characterized by chronic inflammation, cellular senescence, and progressive cartilage remodeling, yet effective disease-modifying therapeutic targets remain limited. Caspase-8 has classically been regarded as a key initiator of the extrinsic apoptotic pathway; however, accumulating evidence suggests that it exerts broad non-apoptotic regulatory functions in a highly context- and cellular state-dependent manner. Here, we systematically investigated the role of caspase-8 in OA pathogenesis and its therapeutic potential.
METHODS: We integrated bulk RNAseq, sing
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The surge in single-cell omics data exposes limitations in traditional, manually defined analysis workflows. AI agents offer a paradigm shift, enabling adaptive planning, executable code generation, traceable decisions, and real-time knowledge fusion. However, the lack of a comprehensive benchmark critically hinders progress.
RESULTS: We introduce a novel benchmarking evaluation system to rigorously assess agent capabilities in single-cell omics analysis. This system comprises: a unified platform compatible with diverse agent frameworks and LLMs; multidimensional metrics assessing
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
With the widespread application of lithium-ion batteries (LIBs) globally, lithium nickel cobalt manganese oxide (LiNi0.5Co0.2Mn0.3O2, NCM523) has emerged, as a core cathode material, raising growing concerns over its prominent risk of respiratory exposure throughout its entire life cycle. This study established a mouse exposure model via intratracheal instillation to systematically explore the pulmonary toxicity and underlying molecular mechanisms of NCM523 by combining spatial metabolomics, single-cell RNA sequencing (scRNA-seq), and other complementary techniques. The results demonstrated th
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leukemia comprises a group of hematologic malignancies characterized by pronounced molecular heterogeneity, cellular-state plasticity, and highly variable clinical outcomes. With the rapid development of high-throughput sequencing, single-cell and spatial omics, molecular measurable residual disease monitoring, and immune-engineering technologies, the diagnostic and therapeutic paradigm of leukemia is shifting from conventional morphology- and cytogenetics-based stratification toward dynamic precision medicine driven by multi-omics data. Using acute myeloid leukemia as the core model, this rev
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to clarify the molecular mechanisms of muscle growth/development in Liaoning cashmere goats and intestinal flora's regulatory role to improve meat production. Muscle tissues (intercostal, hindlimb biceps femoris, longissimus dorsi) and digestive contents (rumen, small intestine, cecum, feces) from goats at 6, 12, 18 months were analyzed via transcriptomics, proteomics, metabolomics, 16S rRNA sequencing, and multi-omics integration. Results: hindlimb biceps femoris optimally developed at 12 months (significantly associated with jejunal g_Lachnospiraceae_NK3A20_group, HOXC10, MY
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Residual feed intake (RFI) is a key indicator of feed efficiency in poultry. Although regulatory links such as the hypothalamus-gut and gut-liver axes have been implicated, most studies remain restricted to single axes or fragmented analyses, and systematic multi-organ integration is lacking. Here, we measured feed efficiency in 1,000 Nonghua ducks and selected 12 individuals with divergent RFI for transcriptomic profiling of the hypothalamus, pituitary, liver, duodenum, jejunum, ileum, and cecum, combined with serum metabolomics. We identified 769 differentially expressed genes (DEGs), with t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Female reproductive aging has systemic health implications, yet tissue-level dynamics remain poorly understood. Here we integrate deep learning analysis of 1,112 histology images with RNA sequencing from 659 samples across seven female reproductive organs in donors aged 20-70 years. We uncover asynchronous trajectories: the ovary ages gradually, whereas the uterus shows an abrupt molecular and morphological shift around menopause. This uterine transition is independently supported by plasma proteomics data from a large population cohort, indicating that organ-linked aging signatures are detect
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Aortic dissection (AD) is a life-threatening cardiovascular emergency characterized by high acute mortality. While immune dysregulation is known to drive AD pathogenesis, the specific involvement of T-cell exhaustion-related genes (TEXRGs) remains largely elusive.
METHODS: Differentially expressed TEXRGs (DETEXRGs) between AD and control samples were identified using transcriptomic datasets. Functional enrichment and Mendelian randomization (MR) analyses were performed to investigate potential causal associations with AD risk. Key diagnostic biomarkers were selected through integr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Triclosan (TCS) is a synthetic antimicrobial extensively used in personal care products and dermatological formulations, leading to frequent human dermal exposure. Despite its bioaccumulative potential and efficient skin penetration, the mechanisms underlying TCS-induced cutaneous toxicity remain poorly understood. Here, we employed an integrative toxicological framework combining network toxicology, transcriptomics, and untargeted metabolomics to systematically investigate TCS-induced cutaneous injury. Network analysis revealed that TCS-associated targets were significantly enriched in immune
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alcohol-associated liver disease (ALD) and exposure to per- and polyfluoroalkyl substances (PFAS) share key mechanisms of hepatotoxicity, yet their combined effects remain poorly characterized. We evaluated the impact of concurrent ethanol and perfluorooctanesulfonic acid (PFOS) exposure using a murine Lieber-DeCarli model characterized via multi-omic, spatial lipidomic, and metagenomic analyses. Exposure to PFOS resulted in rapid weight loss, while co-exposure led to decreased survival and pronounced hepatomegaly exceeding the effects of either exposure alone despite reduced cumulative ethano
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The parathyroid gland, a pivotal organ regulating calcium and phosphorus homeostasis, harbors two primary cell types: chief cells and the enigmatic oxyphil cells. While scarce in healthy individuals, oxyphil cells undergo pronounced proliferation in uremic secondary hyperparathyroidism (SHPT), and their abundance is strongly associated with resistance to first-line therapies like calcitriol and calcimimetics. This correlation underscores a critical clinical challenge, yet the origin, functional role, and mechanisms driving oxyphil cell proliferation have remained poorly understood. Integrated
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gastric intestinal metaplasia (GIM) is a precancerous lesion closely associated with gastric cancer (GC) risk. A systematic characterization of the molecular profiles across distinct cell types during GIM progression is crucial for devising new intervention strategies and enabling early prevention for GC. METHODS: This study integrates single-cell transcriptomics and proteomics data from gastric tissues of patients with mild chronic non-atrophic gastritis (CNAG) and moderate-to-severe GIM. RESULTS: We identified differentially expressed genes (DEGs) and proteins (DEPs) that show co
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Rett Syndrome (RTT) is a neurodevelopmental disorder primarily caused by mutations in the MECP2 gene. Despite its monogenic nature, the molecular events contributing to RTT pathogenesis are not fully elucidated. METHODS: We applied a multi-omics approach to comprehensively analyse the spatiotemporal gene and protein expression patterns in MeCP2-mutant (RTT) and isogenic control (IC) forebrain organoids. Dorsal and ventral forebrain organoids were cultured for 75 days using patient-derived RTT and IC hiPSC lines. Transcriptomics and proteomics profiles were characterized at days 0,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: M1‑like macrophage dysregulation is a central driver of inflammation and plaque formation in atherosclerosis (AS). However, specific diagnostic and therapeutic targets for carotid atherosclerotic plaque remain incomplete.
OBJECTIVE: This study aims to identify M1‑like macrophage‑associated diagnostic biomarkers and potential therapeutic compounds for carotid atherosclerotic plaque using an integrative multi‑omics framework.
METHODS: Carotid atheromatous plaque of AS patients bulk profiles datasets(GSE163154, GSE43292 and GSE111782) were downloaded from GEO database. GSE163154 was
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The intensification of Cannabis sativa cultivation has increased the need for effective and sustainable plant-health strategies. Pathogen control is particularly challenging because pesticide residues may compromise product safety and quality, while repeated chemical treatments can favour the emergence of fungicide-resistant populations. Microbial biological control agents (BCAs) represent a promising component of integrated disease management, although their discovery and validation remain largely empirical. This narrative review examines the current literature on the biological control of fu
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.