MOTIVATION: Accurate Drug-Target Interaction (DTI) prediction is critical for drug discovery. While deep learning advances this field, the fundamental lack of verified negative interactions inevitably causes biased risk estimation. Although formulating DTI prediction as a Positive-Unlabeled (PU) learning problem is theoretically sound, directly applying PU learning to deep models suffers from early-stage optimization instability and decision boundary ambiguity.
RESULTS: We propose ProDTI, a prior-guided PU learning framework integrating domain knowledge into the PU objective. We construct a h
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Drug-target affinity prediction under cold-start set tings suffers from distribution shifts between training and testing data. This leads to poor generalization for unseen drugs or targets. To address this issue, we propose a conditional inter action modulation framework. The model explicitly captures pair-specific interaction contexts. It integrates molecular graph representations with contextual protein embeddings from ESM-2. A conditional response vector is constructed to guide interaction modeling. This vector modulates the network through hierarchical interaction modulation, including att
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Predicting drug-disease interactions (DSI) is a pivotal task in computational drug discovery, aiming to identify potential therapeutic or adverse effects between drugs and diseases. Current methodologies primarily model on two levels of features: the macroscopic level, utilizing network topology, and the mesoscopic level, leveraging molecular-level features. While valuable, these approaches share a common shortcoming: they frequently fail to capture fine-grained, mechanistic interactions. This refers to the specific interplay between drug functional groups and disease symptoms that underpins p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Drug-target interaction (DTI) prediction is central to drug discovery, target identification, and drug repurposing. With the rapid growth of biomedical data and advances in artificial intelligence (AI), DTI prediction has shifted from docking, similarity-based inference, and hand-crafted features toward data-driven representation learning and interaction modeling. This review examines AI-driven DTI prediction methodologies, covering binding theories, task formulations, data representation, model design, translational applications, and unresolved challenges. First, we introduce classical molecu
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the current study, we have designed three hitherto unreported, aldimine-based zinc complexes, used as precursors to prepare the corresponding zinc oxide nanomaterials. The complexes are further assessed for binding propensity with BSA and human serum albumin (HSA), the homologous proteins. The interactions with plasma proteins indicate the drug-like behaviour of the complexes and play a significant role in drug design and pharmacology research. Both proteins possess typical physicochemical properties and functions, acting as drug carriers in plasma. UV absorption titration and fluorescence
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Accurately predicting drug-target interactions (DTIs) is crucial for accelerating drug discovery and repurposing. Despite recent advances in deep learning-based methods, challenges remain in effectively capturing the complex relationships between drugs and targets while incorporating prior biological knowledge.
METHODS: We introduce a novel framework that combines graph neural networks with knowledge integration for DTI prediction. Our approach learns representations from molecular structures and protein sequences through a customized graph-based message passing scheme. We integ
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Drug-target interaction (DTI) refers to the specific mechanisms by which drug molecules interact with biological targets within a biological system. Computational methods are widely employed for DTI prediction, as they are time-efficient and resource-saving compared to experimental approaches. Although numerous DTI prediction methods have achieved promising results, accurately modeling DTIs remains challenging due to three key issues: noisy interaction labels, ineffective multi-view fusion, and incomplete structural modeling.
RESULTS: We propose a novel method termed DTI-RME. The
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PROPOSE: The co-treatment of ulcerative colitis with berberine hydrochloride (BBR), the Janus kinase(JAK) inhibitor Tofacitinib (TOFA), and Fligotinib (FIGA) is feasible and sophisticated in terms of mechanism. However, no studies have yet explored their interactions. This study aimed to establish a highly sensitive, specific, and reproducible HPLC-MS/MS method for investigating the pharmacokinetic interactions between BBR-TOFA and BBR-FIGA in rats.
METHODS: The analytes and internal standards were extracted from rat plasma using a mixed solvent of dichloromethane and ether (3:2 ratio). The m
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Topical drug delivery offers a cost-effective and non-invasive alternative to systemic drug administration but faces challenges due to the skin's barrier properties and the complex rheology of semisolid formulations. This necessitates a deeper understanding of the interplay between formulation components and their impact on drug release and therapeutic efficacy. Emulsifying two-component polymer system, supplied as ready-to-use liquid dispersions of oil and surfactant, is increasingly used to simplify manufacturing processes. However, their interaction with active pharmaceutical ingredients (A
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lower back pain is among the top ten reasons patients visit the emergency department (ED). Tizanidine, a centrally acting alpha-2 adrenergic receptor agonist, is commonly prescribed for managing spasticity in patients with cerebral or spinal injuries. It is also used as an effective treatment for nonspecific lower back pain. One of the most critical and life-threatening causes of lower back pain is abdominal aortic dissection, particularly in patients with hypertension. Nifedipine, a 1,4-dihydropyridine calcium channel blocker (CCB), is a widely used oral antihypertensive and antianginal agent
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Transthyretin cardiac amyloidosis (ATTR-CM) is a progressive cardiomyopathy treated with tafamidis, a transthyretin stabilizer that improves survival and quality of life. Tafamidis inhibits the breast cancer resistance protein (BCRP), raising concern for drug-drug interactions, particularly with rosuvastatin.
OBJECTIVE: To evaluate the potential interaction between tafamidis and statins in patients with ATTR-CM.
METHODS: We conducted a retrospective study of 103 patients with confirmed ATTR-CM receiving both tafamidis and statin therapy at Columbia University Irving Medical Cente…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The pharmacokinetics of drugs significantly affects their efficacy and adverse effects. Clarifying and predicting individual pharmacokinetic differences is crucial for the appropriate use of pharmaceuticals. Recent studies have suggested that the metabolic potential of intestinal bacteria may influence individual differences in pharmacokinetics. The consumption of probiotics, including supplements and fermented foods, has increased as a recent health trend. However, probiotics may also influence drug pharmacokinetics. In this study, we focused on the immunosuppressive drugs tacrolimus, everoli
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Ruxolitinib is used to treat myelofibrosis, polycythemia vera, and steroid-refractory graft-versus-host disease following allogeneic stem cell transplantation. This study aimed to determine the association between ruxolitinib and adverse events by evaluating case reports published between January 2014 and March 2024 in the Japanese Adverse Drug Event Report database.
METHODS: The signals for the ruxolitinib-adverse event association were identified using propensity score-adjusted reporting odds ratio analysis. Data obtained from the drug-gene interaction, drug signature, search to
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
P-glycoprotein (P-gp)-mediated herb-drug interactions (HDIs) may impact drug efficacy and safety. Tenacissoside G (Tsd-G), a major active component of Marsdenia tenacissima, exhibits anticancer activity. To analyze the effect of Tsd-G on the pharmacokinetics of paclitaxel (PTX), researchers selected 30 Sprague-Dawley (SD) rats, randomized into a solvent control group, a verapamil positive control group, and 20, 40, and 60 mg/kg Tsd-G groups. After seven consecutive days of intraperitoneal injection of verapamil or Tsd-G, a single dose of 6 mg/kg PTX was injected intravenously. Plasma samples w…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The utilization of BRAF and MEK inhibitors in combination therapy has demonstrated superior outcomes in the treatment of melanoma as compared to monotherapy. In the present scenario, the combination therapy of Encorafenib (ENC), a BRAF inhibitor, and Binimetinib (BINI), a MEK inhibitor, has been identified as one of the most efficacious treatment modalities for this malignancy. Investigations of protein binding, particularly with human serum albumin (HSA), are essential to understand drug performance and enhance therapeutic outcomes. The investigation of the interplay between small molecule dr
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Social behavior is a complex term which involves different interactions between various individuals of a community. It is controlled by different neurotransmitter systems in a sexually dimorphic way. Certain environmental factors, like stress, cause various neurological disorders with associated social abnormalities in a sexually dimorphic way. Multiple drugs are used in clinical settings to treat behavioral disorders. However, the sexually dimorphic effects of these drugs, particularly on social behavior, still need to be studied. The present study was designed to investigate the sex-dependen
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The dried roots and rhizomes of Glycyrrhiza species (G. glabra, G. uralensis and G. inflata), commonly known as licorice, have long been used in traditional medicine. In addition, two other species, G. echinata and G. lepidota are also considered "licorice" in select markets. Currently, licorice is an integral part of several botanical drugs and dietary supplements. To probe the botanicals' safety, herb-drug interaction potential of the hydroethanolic extracts of five Glycyrrhiza species and their key constituents was investigated by determining their effects on pregnane X receptor, aryl hydro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Peptide drugs, which are mainly used for the treatment of AIDS, myeloma, and breast cancer, have evolved rapidly owing to their high efficacy and low side effects. The interaction mechanisms of two peptide drugs with two biological macromolecules (protein and DNA), which are of great significance in disease prevention and drug design, were investigated using molecular docking, fluorescence spectroscopy, circular dichroism (CD) spectroscopy, UV-visible spectroscopy and viscosity measurements. The interaction between a series of common drugs and ovalbumin (OVA) was simulated by molecular docking
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human African trypanosomiasis is a neglected parasitic disease for which the current treatment options are quite limited. Trypanosomes are not able to synthesize purines de novo and thus solely depend on purine salvage from the host environment. This characteristic makes players of the purine salvage pathway putative drug targets. The activity of known nucleoside analogues such as tubercidin and cordycepin led to the development of a series of C7-substituted nucleoside analogues. Here, we use RNA interference (RNAi) libraries to gain insight into the mode-of-action of these novel nucleoside an
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sugammadex binds progesterone with high affinity and may interfere with hormonal contraceptive effectiveness. The clinical, econ … ing findings highlight the need for education regarding residual neuromuscular block versus adverse drug interactions, collaboration among providers involved in patient counseling, and intentional mindfulness of reproductive justice when caring for women of childbearing potential.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования