Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) is a powerful tool for characterising the immune landscape. Multiple technologies are available, each with distinct specificities and inherent biases. Here, we focus on two technologies-10X Genomics and Parse Biosciences-for the paired profiling of TCR and whole-transcriptome in T cells using matched patient samples. Both platforms generated high-quality data and captured comparable TCR clonal landscapes, with strong concordance for dominant clones. More genes were captured with Parse, including a broader range of non-coding genes and pseudogenes. Althoug…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two actinomycete strains, designated SSUT88AT and SSUT88R, were isolated from distinct soil samples in Nakhon Ratchasima, Thailand. While both belong the genus Streptomyces, they exhibited phenotypic divergence; strain SSUT88AT produced yellowish-white mycelia with potent antimicrobial activity against methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA), whereas SSUT88R produced red colonies with limited inhibitory effects. Genomic analyses confirmed the isolates are conspecific, sharing high ANI (99.99%) and dDDH (99.6%) values, yet exhibiting genomic divergence; the 11.2 Mb genome of SSUT88AT
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Facioscapulohumeral muscular dystrophy (FSHD) is genetically associated with reduction of the D4Z4 macrosatellite array at 4q35 on a permissive 4qA haplotype, a configuration that enables the stable expression of the DUX4 transcription factor. Current diagnostic and mechanistic models, however, rely heavily on the incomplete GRCh38/hg38 reference and assume that D4Z4 repeats are predominantly confined to 4q35 and 10q26 loci. Here we present a systematic re-analysis of the configuration of D4Z4-like repeats in the human genome using the Telomere-to-Telomere human genome assembly (T2T-CHM13 v2.0
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Electronic Medical Records and Genomics (eMERGE) Network developed and implemented a genome-informed risk assessment (GIRA) to communicate genomic (polygenic risk scores [PRSs], integrated risk scores [IRSs], and monogenic results), clinical, and family history-based risk for 11 chronic diseases and provide recommended healthcare recommendations. GIRA reports have now been returned to 23,840 participants and their providers in a large prospective cohort study. We present here the study design and analysis framework for assessing the attributable impact of GIRA return. Pre-specified outcome…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Foodborne diseases and microbial spoilage remain major threats to food safety and shelf life. This study systematically evaluated Lactiplantibacillus plantarum C-35 for antimicrobial activity, mechanisms, genomic safety, metabolite profile, and application in bread. Among 27 lactic acid bacterial strains, L. plantarum C-35 showed strong broad-spectrum inhibition against Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Aspergillus niger, and Penicillium solitum, significantly outperforming L. plantarum ATCC 8014 (p < 0.05). Neutralization reduced residual activity to approximately 35%-55%, whereas prot
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Fludarabine, cytarabine, and G-CSF-based therapy (FLAG) yields approximately 60% 5-year overall survival (OS) in core-binding fa … th. In CBF-AML, FLAG-based therapy possibly attenuates the prognostic impact of concurrent baseline genomics.
SIGNIFICANCE: In CBF-AML treated with conventional intensive chemotherapy, usually 7 + 3, baseline mutations in KIT, chromatin modulators, cohesin complex, etc., garner suboptimal MRD clearance and survival. In our analysis, FLAG-based therapy abr …
СтатьяКлиническое исследование II фазыПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
High impulsivity-a hallmark of various adverse life outcomes such as substance abuse, impulsive buying, violence, and crime-has typically been considered as a failure of self-control. However, is impulsivity simply a failure of self-control? To address this issue, we employed multi-omics combined with brain imaging approach in a large-scale sample (Nbrain imaging=1524, Ngenomics=835, Nmetabolomics=946) to elucidate the relationship between impulsivity and self-control. Mendelian randomization showed a bidirectional association between impulsivity and self-control, suggesting that they influenc…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Traumatic optic nerve and retinal injuries can lead to severe visual impairment, with undetermined underlying molecular mechanism and few reliable molecular biomarkers. This study aims to identify dysregulated genes and signaling pathways potentially involved in these injuries.
METHODS: We first identified differentially expressed genes (DEGs) and their enriched functions using two time-course gene expression profile datasets after retinal injury of rats. The hub genes were then obtained from DEGs by protein-protein interaction network, and then assessed by receiver operating char
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer therapies are typically effective in subsets of patients, reflecting the molecular diversity of cancers and motivating the need for predictive biomarkers of response. Biomarker-guided therapy is increasingly useful in oncology, yet biomarker discovery remains complicated by the large number of molecular features that make it difficult to distinguish causal determinants from spurious associations. To address this challenge, we combined functional genomic screening, proteomics, and drug sensitivity profiling to discover response biomarkers for a number of therapies used in the treatment o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer Disease and Related Dementias (ADRD) affect more than 125,000 individuals in South Carolina, yet equitable representation in population genomics initiatives remains a concern. We conducted a cross-sectional descriptive analysis of 247 In Our DNA SC participants aged 50 to 89 years with at least 1 ADRD-related diagnosis, identified using ICD-10 codes, to characterize demographic and clinical features and to compare the cohort with statewide ADRD estimates. Most participants were aged 65 years or older (82.2%), female (52.2%), and White (93.1%), while only 5.3% identified as Black. Nea…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genus Goussia Labbé 1896 represents a polyphyletic assemblage of piscine coccidia whose systematics remain poorly resolved due to morphological convergence and limited genomic data. Here we describe Goussia sairae n. sp. from the liver of Pacific saury (Cololabis saira) in the Northwestern Pacific, characterized through integrated morphological, histopathological, and molecular analyses. Long-read amplicon sequencing of single-oocyst isolates enabled the first complete mitochondrial genome assembly for a marine Goussia species, revealing two co-existing mitogenome genotypes (99.3% identity
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Medical image computing and computer-assisted intervention : MICCAI ... International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention2025eng
During the process of brain aging, the changes of white matter structural connectivity are closely correlated with the cognitive traits and brain function. Genes have strong controls over this transition of structural connectivity-altering, which influences brain health and may lead to severe dementia disease, e.g., Alzheimer's disease. In this work, we introduce a novel deep-learning diagram, an oblique genomics mixture of experts(OG-MoE), designed to address the prediction of brain disease diagnosis, with awareness of the structural connectivity changes over time, and coupled with the genomi…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Riemerella anatipestifer (R. anatipestifer) is a major pathogen in poultry worldwide, with multidrug resistance (MDR) and diverse serotypes … otal roles in serotype variation. This study provides the first integrative framework combining pan-genomics and machine learning to elucidate the genomic basis of serotype diversity and antimicrobial resistance in R. anatipestifer, offering new insights into its adaptive evolution and informing precision vaccine and diagnostic development.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Immune checkpoint inhibitors and molecular-targeted therapies have dominated recent cancer treatment. However, these treatments face challen … health insurance has covered comprehensive genomic profiling since 2019, and the Center for Cancer Genomics and Advanced Therapeutics (C-CAT) has accumulated genetic abnormalities along with clinical data of patients with various cancers. These data are crucial for advancing cancer research and drug development. This review discusses the genetic abnormali …
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study conducted a comparative genomic investigation of 40 strains of Lentilactobacillus buchneri isolated from various environments-including fermented foods, silage, cattle rumen, and the nasopharynx-to identify species-level diversity and assess their CRISPR immunity. An average genome size of 2.55 ± 0.07 Mb, a GC content of 44.18 ± 0.15%, and 2444 ± 83 coding sequences were identified. Prophages were found in all strains except for two, while 17 strains contained plasmids. No genes associated with bacteriocins were identified. CRISPR analysis revealed the presence of 42 Type II-A and 4
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Clonal complex 180 (CC180) is currently the major clone of serotype 3 Streptococcus pneumoniae (Spn) causing disease among child … pain. We tested this hypothesis further utilizing a dataset from Portugal to conduct our population genomics and molecular epidemiology comparative study.
METHODS: We performed whole-genome sequencing (WGS) of 501 serotype 3 strains from Portugal isolated from patients with pneumococcal infections between 1999 and 2020. The draft genomes underwent phyloge …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Huntington's disease (HD) is an inherited neurodegenerative condition that typically appears later in life, marked by progressive motor impairments, cognitive deterioration, and a range of psychiatric disturbances. Crucial to HD pathogenesis is the aberrant activation of caspase-6 (CASP6), which leads to the cleavage of mutant huntingtin (mHTT) protein, generating a toxic N-terminal fragment. CASP6 activity is elevated in human HD brains and is associated with the progression of neuropathology. This study aims to investigate the impact of deleterious mutations in CASP6 on the catalytic activit
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Burkholderia pseudomallei, the causative agent of melioidosis, is a neglected tropical pathogen that has been increasingly encountered in Europe through travel-related infections. Clinical manifestations range from localized abscesses to life-threatening sepsis, posing diagnostic challenges in non-endemic regions.
METHODS: We report two travel-associated melioidosis cases confirmed in Hungary between 2008 and 2024. Whole-genome sequencing (WGS), multilocus sequence typing (MLST), and core-genome MLST (cgMLST) were performed for molecular characterization. In parallel, a systematic
СтатьяКлинический случайСистематический обзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Comprehensive information on genetic alterations in salivary gland cancer (SGC) is limited. This study aimed to elucidate the genetic and clinical characteristics of patients with SGC using the Center for Cancer Genomics and Advanced Therapeutics (C-CAT) database, a Japanese national genomic database. We analyzed data of 776 patients with SGC registered in the C-CAT database between June 1, 2019, and June 30, 2023. Adenoid cystic carcinoma was the most common histologic type, followed by salivary duct carcinoma (SDC) and adenocarcinoma not otherwise specified. Genetic data of 681 patients rece…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parasitic diseases, particularly malaria (caused by Plasmodium falciparum) and theileriosis (caused by Theileria spp.), profoundly impact global health and the socioeconomic well-being of lower-income countries. Despite recent advances, identifying host metabolic proteins essential for these auxotrophic pathogens remains challenging. Here, we generate a novel metabolic model of human hepatocytes infected with P. falciparum and integrate it with a genome-wide CRISPR knockout screen targeting Theileria-infected cells to pinpoint shared vulnerabilities. We identify key host metabolic enzymes crit
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования