The aberrant aggregation of α‑synuclein (α‑syn) is a pathological hallmark of synucleinopathies, driving the need for small‑molecule inhibitors that block its oligomerization and fibrillization. In computer‑aided drug discovery, accurate affinity prediction remains critical for early‑stage screening. However, current deep learning models predominantly rely on 1D sequences or 2D topological graphs, failing to exploit stereochemical and geometric cues from 3D space. Moreover, dedicated high‑precision predictors for intrinsically disordered targets such as α‑syn are scarce. To bridge this gap, we
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The quantitative description of drug molecules through their molecular structures is central to computational studies of drugs. This paper presents a machine learning-driven quantitative structure-property relationship (QSPR) model linking graph-based structural descriptors to the physicochemical properties of anti-blood cancer drugs. A dataset of 13, anti-blood cancer drug molecules was characterized using six degree-based topological indices: the first Zagreb, second Zagreb, Sombor, reduced Sombor, harmonic, and Randić indices. These graph-derived descriptors were used as molecular features
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
IgA nephropathy (IgAN) is a common autoimmune kidney disease and a leading cause of chronic kidney disease (CKD), yet the immune cell-specific mechanisms underlying disease progression remain incompletely understood, particularly with respect to macrophage heterogeneity. We analyzed single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data from IgAN and CKD kidney samples to characterize macrophage subpopulations and identify differentially expressed genes. Mendelian randomization analyses using publicly available genome-wide association study data were performed as an exploratory approach to prioritize mac
СтатьяНаблюдательное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Diabetes mellitus is a critically important metabolic disease, causing persistent hyperglycemia. Blood glucose levels can be effectively maintained by inhibiting the activity of α-amylase. α-amylase inhibitors manage postprandial hyperglycemia by delaying carbohydrate digestion.
OBJECTIVES: Identification of a potent α-amylase inhibitor from 915 bioactive compounds of Madhumukthi Kudineer Chooranum (MKC) by combining siddha knowledge with computational and experimental methods.
MATERIALS AND METHODS: Molecular docking of bioactive compounds present in MKC with α-amylase was perfo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Angiotensin-converting enzyme (ACE) inhibitors are widely prescribed for cardiovascular disorders, yet their conventional chemical synthesis involves multiple steps, high energy consumption, and poor stereoselectivity. In this work, we present a fully insilico framework for the computational design and prediction of transaminase (TA) variants capable of catalyzing the asymmetric amination of ethyl 2-oxo-4-phenylbutanoate (OPBE) to yield L-homophenylalanine ethyl ester (L-HPE), a key chiral intermediate in ACE inhibitor synthesis. A homology model of the Silicibacter transaminase (62.7 % identi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The photophysical and photochemical behaviour of 2-methyl-5-((1-phenyl-1H-tetrazol-5-yl)thio)-1,3,4-thiadiazole (MeTDZ-PhTTZ) was investigated through a combined computational and experimental approach. This heterocyclic compound, containing both tetrazole and 1,3,4-thiadiazole moieties of recognized medicinal relevance, has shown biological activity, but its excited-state properties and photodegradation pathways remain unexplored. Density functional theory and time-dependent density functional theory calculations were performed. Solvent effects of acetonitrile and ethanol were included throug
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycobacterium tuberculosis, the etiological agent of tuberculosis (TB), remains a leading cause of mortality from infectious disease worldwide. The continued emergence of multidrug-resistant strains highlights the urgent need for new therapeutic agents with novel mechanisms of action. Here, we report the discovery and comprehensive characterization of DL25, a synthetic desloratadine-derived small molecule exhibiting potent antimycobacterial activity (minimum inhibitory concentration (MIC) 2-4 μg/mL against multiple mycobacterial species). Using a supra-inhibitory DL25 selection strategy, we is
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A previously overlooked class of protein entanglements, non-covalent lasso entanglements (NCLEs), has been found to play a role in widespread protein misfolding. However, understanding the influence NCLEs have on biological processes is hindered by the absence of dedicated algorithms and computational tools to detect and characterize these geometries in protein structures, molecular dynamics simulations, and in comparison to experimental data from limited proteolysis (LiP) and cross-linking (XL) mass spectrometry (MS). Here, we present EntDetect, a software tool designed to: (1) identify non-r
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycoplasma genitalium is increasingly recognized for its role in severe health conditions, including sexually transmitted infections, ovarian and prostate cancer. The adhesion protein plays a crucial role in the pathogen's ability to attach to and invade host cells, making it a key target for vaccine development. The need to develop a vaccine against M. genitalium stems from its rising antibiotic resistance, limited treatments and effectiveness. This study focuses on the design and computational evaluation of adhesion protein-based epitope vaccine. Through an immunoinformatic approach, multipl
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nanobodies or variable antigen-binding domains (VHH) derived from heavy chain-only antibodies (HcAb) occurring in the Camelidae family offer certain superior physicochemical characteristics like enhanced stability, solubility, and low immunogenicity compared to conventional antibodies. Their efficient antigen-binding capabilities make them a preferred choice for next-generation small biologics. In the present work, we design an anti-SARS-CoV-2 bi-paratopic nanobody drug conjugate by screening a nanobody database. SAbDab-nano database was screened based on the physicochemical properties and SAR
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aberrant activation of the Wnt/β-catenin signaling pathway, primarily driven by APC mutation and AXIN degradation via Tankyrase, contributes significantly to colorectal cancer (CRC) progression and metastasis. The accumulation of β-catenin, resulting from the dysregulated ubiquitination, underscores the need for alternative therapeutic strategies targeting Tankyrase and β-catenin. This present study explores microbial metabolites as a source of novel anti-cancer agents, leveraging their unique bioactivity and structural diversity, often exhibiting superior target specificity and lower toxicity
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The antivenom potential of Andrographis echioides (A. echioides), a traditional medicinal herb, was investigated using a comprehensive in silico approach to address the limitations of conventional antivenoms against Russell's viper envenomation. This study aimed to conduct virtual screening and molecular dynamics (MD) studies of flavonoid compounds from A. echioides to explore their potential as antivenom agents. Gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS) analysis identified 84 bioactive phytochemicals in the leaf extracts. The selected flavonoid constituents were evaluated for their predict
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Marine invertebrates are a rich source of structurally diverse secondary metabolites with broad biological activities, making them valuable for drug discovery. The genus Zoanthus is particularly noteworthy, producing numerous bioactive alkaloids, including the zoanthamines, which show promise in treating osteoporosis. Osteoporosis, a debilitating bone disease characterized by reduced bone mineral density and increased fracture risk, is linked to Wnt signaling pathway dysregulation. This highly conserved pathway maintains tissue homeostasis and is crucial for neurogenesis, synapse formation, an
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Monkeypox virus (MPXV) is emerging as a major concern in the field of infectious diseases. Current treatments are limited, highlighting the need for new therapeutic options. The use of computational methods, such as molecular docking and molecular dynamic (MD) simulations, is a valuable approach in identifying potential compounds that can target specific proteins of the virus, like the DNA polymerase and profilin-like protein profilin-like protein A42R (A42R) in this case, with the aim of controlling the disease. Our study focused on screening various libraries of compounds for predicted bindi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Homocysteine thiolactone (HTL), a toxic metabolite of homocysteine (Hcy) in hyperhomocysteinemia (HHcy), is known to modify protein structure and function, leading to protein damage through formation of N-Hcy-protein. HTL has been highly linked to HHcy-associated cardiovascular and neurodegenerative diseases. The protective role of HTL hydrolases against HTL-associated vascular toxicity and neurotoxicity have been reported. Although several endogeneous enzymes capable of hydrolyzing HTL have been identified, the primary enzyme responsible for its metabolism remains unclear. In this study, thre
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background & objectives The emergence of drug resistance in leishmaniasis has remained a concern. Even new drugs have been found to be less effective within a few years of their use. Coupled with their related side effects and cost-effectiveness, this has prompted the search for alternative therapeutic options. In this study, the Computer Aided Drug Design (CADD) approach was used to repurpose already existing drugs against Leishmania major. The enzyme lanosterol 14-alpha demethylase (CYP51), in L. major, was chosen as the drug target since it is a key enzyme involved in synthesizing ergostero
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The FIKK protein family, encompassing 21 serine-threonine protein kinases, is a distinctive cluster exclusive to the Apicomplexa phylum. Predominantly located in Plasmodium falciparum which is a malarial parasite, with a solitary gene identified in a distinct apicomplexan species, this family derives its nomenclature from - phenylalanine, isoleucine, lysine, lysine (FIKK), a conserved amino acid motif. Integral to the parasite's life cycle and consequential to malaria pathogenesis, the absence of orthologous proteins in eukaryotic organisms designates it as a promising antimalarial drug target
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Influenza poses a significant threat to global health, with the ability to cause severe epidemics and pandemics. The polymerase basic protein 2 (PB2) of the influenza virus plays a crucial role in the viral replication process, making the CAP-binding domain of PB2 an attractive target for antiviral drug development. This study aimed to identify and evaluate potential inhibitors of the influenza polymerase PB2 CAP-binding domain using computational drug discovery methods. We employed a comprehensive computational approach involving virtual screening, molecular docking, and 500 ns molecular dyna
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Prostate cancer is one of the most prevalent cancers in men, leading to the second most common cause of death in men. Despite the availability of multiple treatments, the prevalence of prostate cancer remains high. Steroidal antagonists are associated with poor bioavailability and side effects, while non-steroidal antagonists show serious side effects, such as gynecomastia. Therefore, there is a need for a potential candidate for the treatment of prostate cancer with better bioavailability, good therapeutic effects, and minimal side effects.
OBJECTIVE: This current research work f
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The purpose of this study was to investigate the protective effect of Beta vulgaris leaf extract (BVLE) on Fe2+-induced oxidative testicular damage via experimental and computational models. Oxidative testicular damage was induced via incubation of testicular tissue supernatant with 0.1 mM FeSO4 for 30 min at 37 °C. Treatment was achieved by incubating the testicular tissues with BVLE under the same conditions. The catalase (CAT), superoxide dismutase (SOD), glutathione (GSH), malondialdehyde (MDA), and nitric oxide (NO) levels, acetylcholinesterase (AChE), sodium-potassium adenosine triphosph
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.