AIM: A newly designed multiplex real-time PCR (rt-PCR) was validated to detect four clinically relevant Gram-negative bacteria (Escherichia coli, Acinetobacter baumannii, Klebsiella pneumoniae and Pseudomonas aeruginosa).
MATERIALS & METHODS: Serial dilutions of genomic DNA were used to determine the limit of detection. Colony PCR was performed with isolates of the four selected species and other species as negative controls. Isolates were characterized genotypically and phenotypically to evaluate the assay.
RESULTS: Specific signals of all target genes were detected with diluted templates c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Drug resistance in tuberculosis (TB) is the biggest global health challenge as it hinders the tuberculosis control program and makes the disease more worsen. Molecular methods interrupt the spread of drug resistance by facilitating the appropriate anti- tuberculosis therapy at correct time through rapid diagnosis of multi drug resistant (MDR) and extensively drug resistant tuberculosis (XDR-TB). In this study we standardized and evaluated the diagnostic utility of multiplex allele specific PCR (MAS-PCR) targeting gyrA D94G and rrs A1401G mutations for detection of resistance against two key dr
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The germ tube test (GTT) is inexpensive, easy, and well-defined test that differentiates Candida albicans (excluding Candida dubliniensis and Candida africana) from other species. The aim of this study was to evaluate various serums (i.e., human, rabbit, horse, and fetal bovine serum) used in the GTT and Mueller-Hinton agar (MHA).
MATERIALS AND METHODS: Fifty species isolated from various clinical samples that were defined as C. albicans by both conventional and DNA sequence analysis methods were included in the study. One to two colonies of C. albicans were mixed into 0.5-1 ml of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: CNS infections like meningitis and encephalitis pose enormous healthcare challenges due to mortality, sequelae and socioeconomic burden. In tertiary setting, clinical, microbiological, cytological and radiological investigations are not distinctive enough for diagnosing microbial etiology. Molecular diagnostics is filling this gap. We evaluated the clinical impact of a commercially available multiplex molecular diagnostic system - SES for diagnosing suspected CNS infections.
PATIENTS AND METHODS: This study was conducted in our tertiary level Neurology ICU. 110 patients admitted d
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Legionella pneumophila serogroups O1, O4, O6, O7, O10 and O13 are pathogenic strains associated with pneumonia. The surface O-antigen gene clusters of L. pneumophila serogroups O4, O6, O7, O10 and O13 were sequenced and analyzed, with the function annotated on the basis of homology to that of the genes of L. pneumophila serogroup O1 (L. pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1). The gene locus of the six L. pneumophila serogroups contains genes of yvfE, neuABCD, pseA-like for nucleotide sugar biosynthesis, wecA for sugar transfer, and wzm as well as wzt for O-antigen processing.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A new high-throughput GenomeLab Gene Expression Profiler (GeXP) analyser-based multiplex PCR assay was developed for the detection of eight reproductive and respiratory pathogens in swine. The reproductive and respiratory pathogens include North American porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV-NA), classical swine fever virus (CSFV), porcine circovirus 2 (PCV-2), swine influenza virus (SIV) (including H1 and H3 subtypes), porcine parvovirus (PPV), pseudorabies virus (PRV) and Japanese encephalitis virus (JEV). Nine pairs of specific chimeric primers were designed and used to
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Toxoplasma gondii is an intracellular protozoan parasite which imperils the health of almost all warm-blooded animals, including humans. The objective of this study was to determine genetic characterization of T. gondii in free-living Microtus fortis (reed vole) in Jilin province, northeastern China. A total of 104 DNA samples, 74 from Gongzhuling and 30 from Baicheng, were extracted from lung tissues of M. fortis , and 56 (53.8%) of them were positive for T. gondii by semi-nested polymerase chain reaction of the B1 gene. These positive DNA samples were typed at 10 genetic markers including SA
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: To characterise carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (CRE) isolated in Singapore.
METHODS: Carbapenemase genes and their flanking regions were amplified and sequenced by PCR. Isolates were typed by pulsed-field gel electrophoresis and multi-locus sequence typing. Plasmids bearing carbapenemase genes were sized by S1 nuclease digestion, Southern blotting, and DNA hybridisation with appropriate probes. Transfer of these plasmids was attempted by conjugation and transformation. Successfully transferred plasmids were characterised by polymerase chain reaction (PCR) replicon typing and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: When a triploid pregnancy is diagnosed prenatally, gynaecologists have traditionally relied on the histopathological examination of the tissue from the terminated pregnancy to determine if the pregnancy is molar. However, reproducibility is poor and variability is high when diagnosing hydatidiform moles. Triploid pregnancies can have either the chromosomal constitution of two maternal and one paternal set, or two paternal and one maternal set, but only the conceptuses with two paternal sets have the potential to cause maternal complications. Therefore, it would be beneficial to intr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: Pseudohypoparathyroidism type Ib (PHP-Ib) is a rare disorder resulting from genetic and epigenetic aberrations in the GNAS complex. PHP-Ib, usually defined by renal resistance to parathyroid hormone, is due to a maternal loss of GNAS exon A/B methylation and leads to decreased expression of the stimulatory G protein α (Gsα) in specific tissues.
OBJECTIVE: To clarify the usefulness of methylation-specific multiplex ligation-dependent probe amplification (MS-MLPA), we evaluated genetic and epigenetic changes of the GNAS locus in Japanese PHP-Ib patients.
DESIGN: Retrospective case ser
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Classical carriers of β-thalassaemia are identified by a raised HbA2 level. Earlier studies indicated that the Filipino β-deletion has high raised HbA2 levels. The introduction of automated high performance liquid chromatography (HPLC) for thalassaemia screening is an important advance in technology for haematology laboratories. The BioRad Variant II Hb analyser is a common instrument used to quantify HbA2 levels in thalassaemia screening. This study aimed to determine HbA2 levels in carriers of Filipino β-mutation using the BioRad Variant II Hb analyser.
METHODS: The Filipino β-deletio
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
It has been claimed that amoebic molecules such as amoebapore, galactose/N-acetyl galactosamine inhibitable lectin, and cysteine proteases a … al flora and Pavlova's modified medium. Lesions were verified at 1, 3 and 6 days after inoculation. Multiplex Polymerase Chain Reaction was performed to characterize each strain using EdP1/EdP2 and EhP1/EhP2 primers. The EGG and HM1:IMSS E. histolytica strains and 03C E. dispar were able to cause liver lesions. The EGG strain caused extensive hepatic abscesses, and trophozoites were …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To assess the value of multiplex PCR-denaturing high-performance liquid chromatography (PCR-DHPLC) method for screening large duplications or deletions in patients with Duchenne muscular dystrophy (DMD) and spinal muscular atrophy (SMA).
METHODS: DNA was extracted from peripheral venous blood samples from 35 DMD and 6 SMA patients. Large duplications or deletions were screened with multiplex PCR coupled with DHPLC method. The results were validated with testing of positive and negative controls.
RESULTS: Known duplications or deletions in all controls were reliably detected with m
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microduplications 22q11.2 have been recently characterized as a new genomic duplication syndrome showing an extremely variable phenotype ranging from normal or mild learning disability to multiple congenital defects and sharing some overlapping features with DiGeorge/velocardiofacial syndrome (DGS/VCFS), including heart defects, urogenital abnormalities and velopharyngeal insufficiency. We present an atypical and inherited 0.8-Mb duplication at 22q11.2, in the distal segment of the DGS/VCFS syndrome typically deleted region (TDR), in a 3-year-old boy with motor delay, language disorders and mi
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To identify disease-causing mutations within coding regions of 11 known NPHP genes (NPHP1-NPHP11) in a cohort of 192 patients diagnosed with a nephronophthisis-associated ciliopathy, at low cost.
METHODS: Mutation analysis was carried out using PCR-based 48.48 Access Array microfluidic technology (Fluidigm) with consecutive next-generation sequencing. We applied a 10-fold primer multiplexing approach allowing PCR-based amplification of 475 amplicons (251 exons) for 48 DNA samples simultaneously. After four rounds of amplification followed by indexing all of 192 patient-derived prod
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Urinary tract infections (UTIs) are among the most common bacterial infections and are responsible for significant morbidity and health care costs worldwide. The main bacterial cause of uncomplicated UTI is Escherichia coli, which possesses numerous virulence factors (VFs). Many studies of the pathogenesis of E. coli UTI have centered on VF genes. Hence, the development of better molecular assays to study VF genes would facilitate these studies. We developed a highly sensitive and specific multiplex PCR-based reverse line blot (mPCR/RLB) assay to simultaneously detect 22 VF genes of uropathoge
Оценочное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Collection of mosquitoes and testing for vector-borne viruses is a key surveillance activity that directly influences the vector control efforts of public health agencies, including determining when and where to apply insecticides. Vector control districts in California routinely monitor for three human pathogenic viruses including West Nile virus (WNV), Western equine encephalitis virus (WEEV), and St. Louis encephalitis virus (SLEV). Reverse transcription quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) offers highly sensitive and specific detection of these three viruses in a single multipl
СтатьяПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parasitic diseases pose significant threats to both human and veterinary health, causing morbidity, mortality, and economic losses. Effective diagnostics are critical, yet conventional methods such as microscopy, serology, and polymerase chain reaction (PCR) are limited by low sensitivity, cross-reactivity, or dependence on costly equipment and skilled personnel. Isothermal amplification techniques, such as loop-mediated isothermal amplification (LAMP) and recombinase polymerase amplification (RPA), have improved point-of-care (POC) applications but remain limited by nonspecific amplification
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) is characterized by myocardial hypertrophy of unknown etiology. Missense mutations of the cardiac beta-myosin-heavy-chain (beta-MHC) gene that may be responsible for cardiac hypertrophy have been detected in patients with HCM. On the other hand, gross structural abnormalities in the cardiac beta-MHC gene, ie, an alpha/beta hybrid gene and partial deletion of the gene, have also been reported. The direct correlation between gross abnormalities and development of HCM is not well understood.
METHODS AND RESULTS: We analyzed the structure of the cardi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae are common Extended-spectrum β-Lactamase (ESBL) producing bacteria that can potentially cause substantial challenges in both human and veterinary medicine. This study aimed to characterize the phenotypic and genotypic ESBL production in E. coli and K. pneumoniae isolates from community samples obtained from South Western Uganda. We conducted a cross-sectional study using laboratory methods among stored E. coli and K. pneumoniae isolates. Phenotypic detection of ESBL production was performed using double disk synergy test and the combination disk test,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.