Lineage plasticity and tumor heterogeneity limit the effectiveness of targeted therapies, yet the functional dependencies used to nominate therapeutic targets are often derived from homogeneous systems that fail to capture this complexity. Here, we establish a framework to resolve state-specific genetic vulnerabilities by integrating single-cell multiomics (RNA and ATAC) with pooled CRISPR-Cas9 screening across a large panel of patient-derived organoids (PDOs) from castrate-resistant prostate cancer (CRPC) and neuroendocrine prostate cancer (NEPC). We generate a single-cell multiome atlas span…
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Drug resistance and lack of predicting biomarkers are a major challenge for cancer therapy. The combination of a BRAF inhibitor … FRi. METHODS: Here, we established a living biobank of BRAFV600E colorectal cancer patients derived organoids (PDOs) and categorized them as sensitive or resistant to the combination of BRAFi and EGFRi using short term proliferation assays. To elucidate biomarkers of response, drug testing was integrated with genomic, transcriptomic, proteomic and single-ce …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vaccinia virus (VACV) encodes a heterodimeric mRNA capping enzyme consisting of the catalytic large subunit D1 and the stimulatory small sub … te and late gene expression. Furthermore, vΔD12 was unpermissive in rhesus macaque gastrointestinal organoids (enteroids), but remained permissive in human enteroids. These findings reveal differential requirements of D12 for VACV replication in host-specific cells and enteroids.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Respiratory ciliary motion is critical for airway hygiene, as its directional beating clears pathogens and debris. Dysfunctional cilia lead to mucus buildup, infections, and worsened respiratory diseases. However, studying ciliary dynamics remains challenging due to technical limitations in imaging and analysis. To address this, human airway organoids expressing specific biomarkers were cultured, and ciliary motility was captured using a charge-coupled device camera. Wavelet transform-based image processing reduced background noise and enhanced cilia contours, enabling color visualization and …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Three critically ill or fatal avian influenza A(H5N1) human infections have been reported in North America since November 2024. Notably, all were infected with genotype D1.1 instead of B3.13, the dominant genotype before November 2024. Here, we demonstrated that D1.1 could replicate to higher titers in human nasal and airway organoid-derived transwell monolayers from 6 donors. D1.1 exhibited a better binding to α2,3- and α2,6-linked sialic acid than B3.13. No significant differences in most inflammatory or antiviral cytokines/chemokines were observed. These observations suggest that D1.1 is be
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transmissible gastroenteritis virus (TGEV) is a porcine enteropathogenic coronavirus that causes severe intestinal inflammation and diarrhea in pigs, leading to substantial economic losses to the swine industry worldwide. Inflammation is a major cause of death in pigs infected with TGEV. However, the role of host-mediated inflammatory responses in TGEV pathogenesis remains poorly understood. Here, we report for the first time that the heat shock protein HSP40 (DNAJB6) is highly expressed in the jejunum and ileum of Wuzhishan pigs during TGEV infection, and that its transcription is activated b
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mucinous gastric cancer (MGC) is a rare subtype of gastric cancer (GC) characterized by distinct histological features and clinical behavior. However, the lack of specific in vitro models for MGC has hindered progress in understanding its carcinogenic mechanisms and developing effective therapeutic strategies.
METHODS: Patient-derived MGC organoids were established from paired primary tumor (MGC-T) and synchronous peritoneal metastatic nodule (MGC-ND) tissues obtained from a patient with MGC. To validate the generalizability of the findings, two additional independent MGC organoid…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The thymus is a critical organ for T cell generation. It is composed of distinct layers of thymic epithelial cells (TECs) that coordinate a … growth rate and carrying capacity of different printing configurations, and validated manufactured organoids in vivo by generating functional murine T cell populations in athymic nude mice after decapsulation and construction with a decellularized thymus scaffold.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatic osteodystrophy (HOD) is a frequent complication of chronic liver disease, marked by impaired osteogenesis and elevated fracture risk, particularly under sustained alcohol exposure. Bone morphogenetic proteins (BMPs), which play a crucial role in maintaining bone homeostasis, are dysregulated in alcoholic liver disease. Specifically, decreased BMP2 and increased BMP13 have been linked to impaired osteogenesis and cartilage-like shifts in bone progenitors. A human in vitro system that recapitulates this hepatic BMP imbalance is needed to dissect mechanisms and identify targets. To addres
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The 3D brain organoids have been widely used as a tool to study human brain development and disorders. Although angiogenesis and blood vascular endothelial cells play important roles in brain development and pathogenesis in neurological disorders, most 3D brain organoids lack inherent endothelial cells and need either the addition of differentiated endothelial cells or to be transplanted to animals to reconstitute such vascular structures. However, these approaches could miss the developmental interactions between angiogenesis and neurogenesis in the human brain. To reconstitute a 3D organoid …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Organoids serve as three-dimensional structures that offer spatial support and mimic cellular niches for experimental studies. The spatial and temporal association of fetal bovine adipose tissue-derived mesenchymal stem/stromal cells (AT-MSCs) with the expression of germ cell (GC) markers was evaluated in testicular organoids (TOs+AT-MSCs) under the effect of retinoic acid and testosterone (0.2, 2 and 20 µM). TOs+AT-MSCs were developed by the co-culture of Leydig, Sertoli, and peritubular myoid cells and PKH26+AT-MSCs and were analyzed for the expression of DAZL, STRA8 and UCHL1. TOs+AT-MSCs t…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-cell nucleosome, methylome, and transcriptome (scNMT) sequencing is a recently developed method that allows multiomics profiling of single cells. In this scNMT protocol, we describe profiling of cells from mouse brain and pancreatic organoids, using liquid handling platforms to increase throughput from 96-well to 384-well plate format. Our approach miniaturizes reaction volumes and incorporates the latest Smart-seq3 protocol to obtain higher numbers of detected genes and genomic DNA (gDNA) CpGs per cell. We outline normalization steps to optimally distribute per-cell sequencing depth. F…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Here, we present a protocol for the rapid functional screening of gene editing and addition strategies in patient-derived organoids using the deep-learning-based tool DETECTOR (detection of targeted editing of cystic fibrosis transmembrane conductance regulator [CFTR] in organoids). We describe steps for wet-lab experiments, image acquisition, and CFTR function analysis by DETECTOR. We also detail procedures for applying pre-trained models and training custom models on new customized datasets. For complete details on the use and execution of this protocol, refer to Bulcaen et al.1.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gallbladder mucocele (GBM) is one of the most common gallbladder disorders in dogs. Recent studies have suggested a potential association between GBM development and reduced expression of anion channel-related molecules in gallbladder epithelial cells. However, further investigation has been limited due to the lack of an effective in vitro culture system to validate the functions of the molecules. This study aimed to establish gallbladder cholangiocyte organoids (GCOs) from canine gallbladders and evaluate anion channel functions. GCOs were generated from gallbladders of three clinically healt…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
3D brain organoids have been widely used as a tool to study human brain development and disorders. Although endothelial cells play important roles in the brain development and pathogenesis in neurological disorders, most 3D brain organoids lack inherent endothelial cells and need either the addition of endothelial cells or to be transplanted to animals to reconstitute such vascular structures, likely missing the developmental interactions of endothelial cells and other cells in the human brain. In order to reconstitute a 3D organoid mimicking the in vivo neural and endothelial cells developmen…
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's Disease (AD) is the most common cause of dementia, afflicting 55 million individuals worldwide, with limited treatment available … ted that brain extracts from individuals with sAD can effectively induce multiple AD pathologies in organoids four weeks post-exposure, including amyloid beta (Aβ) plaque-like aggregates, tau tangle-like aggregates, neuroinflammation, elevated microglial synaptic pruning, synapse/neuronal loss, and impaired neural network activity. Proteomics analysis also …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The biliary system is crucial for liver function, regulating bile production, secretion, and transport. Dysfunctions within this system can lead to various diseases, such as cholangiopathies and biliary fibrosis, which may progress from benign to malignant states like cholangiocarcinoma. While liver organoid research is well-established and technologically advanced, bile duct organoids (BDOs) offer significant potential. BDOs can accurately simulate the physiological structure and function of bile ducts, making them valuable tools for in-vitro biliary disease research. Here, we review the deve…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Maternal consumption of folic acid (FA)-containing multivitamins/minerals (MVM) are recommended to reduce the risk for neural tube defects (NTDs). However, comparison between MVM supplementation and FA alone relative to NTD risk and possible mechanisms remain unclear. The studies demonstrate MVM can decrease NTD incidence in mouse genetic models with FA-resistant or FA-detrimental responses. To evaluate cellular and metabolic impacts, human iPSC-derived neuroectoderm organoids are generated with an elliptical shape resembling the human neural tube and cranial to upper spinal identity. Upon pha…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cerebral cavernous malformations (CCMs) are clusters of thin-walled enlarged blood vessels in the central nervous system that are prone to recurrent hemorrhage and can occur in both sporadic and familial forms. The familial form results from loss-of-function variants in the CCM1, CCM2, or CCM3 gene. Despite a better understanding of CCM pathogenesis in recent years, it is still unclear why CCM3 mutations often lead to a more aggressive phenotype than CCM1 or CCM2 variants. By combining high-throughput differentiation of blood vessel organoids from human induced pluripotent stem cells (hiPSCs) …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gestational diabetes mellitus (GDM) poses significant risks to both maternal and child health, and its rising incidence necessitates explora … re significantly elevated in GDM patients compared to healthy controls. By establishing human liver organoids model and high-content imaging method, we demonstrated that MEHP and MBP (2, 10, and 50 μM) enhanced glucose uptake and lipid accumulation in a dose-dependent manner, promoted glycolysis, and altered key metabolic pathways related to insulin resista …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования