OBJECTIVE: To assess concordance of tumor BRCA1/BRCA2 variant detection across four sequencing workflows benchmarked against the Myriad myChoice companion diagnostic in newly diagnosed ovarian cancer.
METHODS: Within the MITO16A/MaNGO-OV2 trial, 100 formalin-fixed paraffin-embedded ovarian cancer samples were analyzed across four workflows in the Italian network: one academic modular workflow (Agilent OneSeq/VarDict) and three commercial platforms (Oncomine Comprehensive Assay Plus/Ion Reporter, SOPHiA DDM, and TruSight Oncology 500/DRAGEN). BRCA1/BRCA2 calls were compared with myChoice as th…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Kidney injury molecule 1 (KIM-1) has emerged as a critical biomarker for renal injury, playing a pivotal role in disease diagnosis and thera … 7 exhibited a better affinity than the S4. Furthermore, imaging of human clinical renal membranitis paraffin tissues, chronic kidney disease paraffin tissues of rats and acute nephrotoxic frozen tissues of mice, aptamer S7 exhibited a specific recognition of KIM-1. We also demonstrated the feasibility of S7 aptamer targeting KIM-1 in lung cancer A549 and l …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hematoxylin and eosin (H&E) staining has long been a cornerstone of histopathology, typically applied to formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tissue sections to ensure stable and consistent sample preparation. However, the chemical staining procedure is inherently irreversible, making stained tissue unsuitable for subsequent analysis. Moreover, it is time-consuming, requires chemical handling, and incurs significant costs. While label-free microscopy, combined with deep learning, has been explored as an alternative, its clinical adoption remains limited due to slow imaging speeds, single-s…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Breast cancer is the most prevalent malignancy among women. In recent years, it has been suggested that various pathogens such as Toxoplasma gondii (T. gondii) and human papillomavirus (HPV) may play a potential role in the development of breast cancer. This study aimed to determine the prevalence of T. gondii and HPV infections in formalin-fixed paraffin-embedded tissue samples of breast cancer patients using real-time PCR.
METHODS: The study included 136 paraffin-embedded biopsy samples with w confirmed malignant breast tumor diagnosis and 50 breast tissue samples diagnosed as be…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To report the outcome of SLN staging in the SENTIX international prospective trial of SLN biopsy in patients with cervical cancer … ction. SLNs were examined intraoperatively and processed by an intensive protocol for ultrastaging (paraffin blocks sectioned completely in 150-μm intervals/levels). SLNs from each site were submitted for central quality control.
RESULTS: In the SENTIX SLN study, 647 out of 733 enrolled patients underwent SLN ultrastaging, identifying 12.5% (81/647) with …
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Slaughterhouse inspections play a crucial role in the sanitary control of zoonoses and foodborne diseases. This study aimed to identify and … samples. Histopathology was more sensitive than other ancillary tests for diagnosing tuberculosis. Paraffin-embedded tissues from lymphoma cases were subjected to immunophenotyping using anti-CD3 and anti-CD79a immunohistochemistry. Frozen and/or paraffin-embedded tissues from lymphoma cases were used to identify the enzootic bovine leukosis (EBL) retrovi …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Targeted next-generation sequencing (NGS) panels, which identify genomic alterations, are the stronghold of molecular oncology laboratories. In spite of technological advances, the quantity and quality of DNA from formalin-fixed paraffin-embedded tissue and paucicellular specimens are barriers to successful sequencing. Here, we describe an NGS assay employing single tube stem-loop inhibition mediated amplification technology that delivers highly accurate results with low input DNA. Rigorous quality metrics, regular monitoring and in-depth validation make the test attractive for clinical …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Microarray transcript analysis of human renal transplantation biopsies has successfully identified the many patterns of graft rejection. To evaluate an alternative, this report tests whether gene expression from the Banff Human Organ Transplant (B-HOT) probe set panel, derived from validated microarrays, can identify the relevant allograft diagnoses directly from archival human renal transplant formalin-fixed paraffin-embedded biopsies. To test this hypothesis, principal components (PCs) of gene expressions were used to identify allograft diagnoses, to classify diagnoses, and to de…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Various cytologic specimens have been used to diagnose epidermal growth factor receptor (EGFR) gene mutations in non-small cel … xtraction and diagnosis was validated in 8 patients with pleural effusion smears and formalin-fixed paraffin-embedded cell blocks, and another with 2 smears. Smear samples with <5% tumor cells were collected, and visible particles were selected for DNA extraction after centrifugation. Qiagen formalin-fixed paraffin-embedded DNA extraction kit (Qiagen) was …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fluorescence imitating brightfield imaging (FIBI) is a novel microscopy method that allows for real-time, nondestructive, slide-free tissue imaging of fresh, formalin-fixed, or paraffin-embedded tissue. The nondestructive nature of the technology permits tissue preservation for downstream analyses. The objective of this observational study was to assess the utility of FIBI compared with conventional hematoxylin and eosin (H&E)-stained histology slides in feline gastrointestinal histopathology. Formalin-fixed paraffin-embedded full-thickness small intestinal tissue specimens from 50 cases of fe…
Наблюдательное исследованиеObservational Study, VeterinaryСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Oral infection has been implicated in the possible etiology of Alzheimer's disease.
OBJECTIVE: To detect amyloid-β (Aβ) within microbial biofilms.
METHODS: Freshly extracted teeth (N = 87) with periodontal disease were separated into Group A (N = 11), with primary root canal infection and Group B (N = 21) with failed endodontic treatment identified by the presence of, gutta percha root filling. Biofilm characteristics were observed by scanning electron microscopy (SEM). Demineralized paraffin wax embedded tooth sections and mineralized calculus biofilm were immunostained with the…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Organising pneumonia (OP) is reported in patients with haematologic malignancy suspected of having invasive mould disease, yet little is known about this relationship.
OBJECTIVE: To investigate molecular evidence of invasive mould pneumonia in paraffin-embedded lung tissues from histologically diagnosed OP patients with suspected invasive mould pneumonia.
PATIENTS/METHODS: Patients with haematologic malignancy suspected to have invasive pulmonary mould disease who underwent lung biopsy at a tertiary hospital, Seoul, South Korea, between 2008 and 2020, were retrospectively reviewe…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Predictive criteria to determine the absence of node metastases from thyroid specimens are scarce for sporadic medullary thyroid cancer.
METHODS: Histopathologic stratification of patients with unifocal sporadic medullary thyroid cancer ≤25 mm with ≥10 neck nodes at thyroidectomy to evaluate the suitability of desmoplasia (7 increments) and tumor capsule integrity (5 decrements) for intraoperative prediction of node metastasis in unifocal sporadic medullary thyroid cancer.
RESULTS: Paraffin-embedded thyroid specimens were available for 139 eligible patients. Significant (P < .001…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
European journal of surgical oncology : the journal of the European Society of Surgical Oncology and the British Association of Surgical Oncology2020eng
BACKGROUND: There has been an ongoing debate concerning the predictors of contralateral paratracheal lymph nodes metastasis (LNM) in unilate … d 14.05%, respectively. Only pretracheal-laryngeal LNM, regardless of whether detected in frozen or paraffin sections, were independent risk factors for contralateral paratracheal LNM (OR = 2.707; 95% CI 1.062-6.902; P = 0.037 in frozen section; OR = 3.072; 95% CI 1.248-7.560; P = 0.015 in paraffin section). The sensitivity, specificity, false-negative rat …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Refractory celiac disease (RCD) is a rare condition, usually managed at specialized centers. However, gastroenterologists and pathologists in general practices are often the first to consider a diagnosis of RCD in celiac patients with persistent symptoms. The distinction between type I and type II RCD is crucial as patients with RCD II have a shortened life expectancy. The diagnosis of RCD II requires the demonstration of abnormal intraepithelial lymphocytes and/or monoclonal T-cell populations in duodenal biopsies, typically assessed in formalin-fixed paraffin-embedded tissue. We investigated…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: Pleomorphic adenoma is the most common benign tumor of the parotid gland and is classically treated with superficial or total parotidectomy. Less radical surgeries have been proposed to minimize the risk of facial nerve injury. The oncological safety of these procedures remains controversial. We conducted this study to evaluate the safety of superficial hemi-lobectomy (quadrantectomy).
PATIENTS AND METHODS: Retrospective analysis was conducted on the paraffin sections of archived superficial parotidectomy specimens from 11 male and 6 female patients (median age 33 years). The microscopic…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cluster of differentiation (CD) markers is a classification system for monoclonal antibodies against cell surface molecules on leukocytes and antigens from other cells.
AIMS: The aim of this study is to evaluate immunohistochemical markers in patients with discoid lupus erythematosus (DLE) and lichen planus (LP) and correlation of these markers in two groups and with the normal group in the West of Iran.
SETTINGS AND DESIGN: Analytical cross-sectional study.
MATERIALS AND METHODS: This study was performed on paraffin blocks of DLE and LP patients with normal group (21, 21 and 16…
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: Various natural products, including oils, have been utilized as penetration enhancers due to their "safety profiles". These oils contain fatty acids promoting skin permeability through lipid fluidization within the stratum corneum; and might therefore be able to effectively enhance transdermal drug delivery.
OBJECTIVE: We investigated possible penetration enhancing properties of selected oils, utilizing flurbiprofen as marker compound in emulgel formulations. The formulations were compared to a liquid paraffin emulgel and a hydrogel to establish any significant penetration enhancing …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intestinal neuronal dysplasia type B (IND) denotes an increased proportion of hyperplastic submucosal ganglia, as resolved histochemically in 15-μm-thick frozen sections. IND has been reported proximal to the aganglionic segment in patients with Hirschsprung disease (HSCR) and is putatively associated with a higher rate of postsurgical dysmotility. We developed and validated histological criteria to diagnose IND-like submucosal ganglion cell hyperplasia (IND-SH) in paraffin sections and used the approach to study the incidence and clinical and/or genetic associations of IND-SH at the proximal …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Somatic mutation analysis is standard of practice for solid tumors in order to identify therapeutic sensitizing and resistance m … ing DNA from well-characterized cell lines, genetically engineered cell lines fixed and embedded in paraffin, and previously tested mutation positive or negative, formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tissues. Normal kidney, tonsil and colon FFPE tissues were used as controls.
RESULTS: Accuracy studies showed 100% concordance in each patient sample bet …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования