Particulate matter 2.5 (PM2.5) is a major environmental pollutant linked to neurological disorders through poorly understood mechanisms. We investigated whether PM2.5 induces disulfidptosis, a novel form of regulated cell death characterized by NADPH depletion and disulfide stress, in neuronal cells. Combining bioinformatics analysis of a PM2.5-exposed human cohort (GSE60767, n = 466) with in vitro experiments in primary neurons and in vivo validation in rats, we identified a characteristic molecular signature featuring SLC3A2 upregulation and OXSM downregulation (p < 0.01). This imbalance was
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To explore the heterogeneity of tumor immune microenvironment (TIME) in colorectal cancer (CRC) and the resultant treatment resistance and develop a prognostic model for predicting the treatment outcomes of CRC.
METHODS: The multi-omics data including transcriptomic, somatic mutation and single-cell RNA sequencing data of a total of 1136 CRC samples from a TCGA cohort (n=568) and a GEO cohort (n=568) were integrated. The TCGA cohort was divided into Immunity_High and Immunity_Low subtypes by single-sample gene set enrichment analysis (ssGSEA) and t-SNE algorithm. A prognostic mode
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Periodontitis (PD) and ulcerative colitis (UC) are two common chronic inflammatory diseases increasingly connected via the "oral-gut axis," yet their shared molecular mechanisms remain unclear. Oxidative stress, driven by excessive reactive oxygen species (ROS), represents a key pathogenic mechanism common to both PD and UC. In this study, we integrated transcriptomic datasets from patients with PD and UC to identify oxidative stress-related genes underlying their comorbidity. By combining weighted gene co-expression network analysis (WGCNA), machine learning, and single-cell RNA sequencing, w
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pre-existing metabolic conditions may profoundly alter biological responses to environmental pollutants, yet this dimension remains underexplored in environmental health. This study examined whether pre-existing metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease (MASLD) is associated with altered biological responses to di-(2-ethylhexyl) phthalate (DEHP), a ubiquitous plasticizer. In a human cohort, fatty liver status was associated with altered urinary DEHP metabolite profiles, characterized by a higher proportion of the bioactive mono-(2-ethylhexyl) phthalate, suggesting disease-associ
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parkinson's disease (PD) is a progressive neurodegenerative disorder lacking established clinical biomarkers. We performed an exploratory multi‑omics analysis of transcriptome and proteome data from small PD and control cohorts at Huaihe Hospital of Henan University. Using two local datasets, we identified 124 differentially expressed genes (DEGs) and 28 proteins, then performed protein‑protein interaction (PPI) and gene set variation analysis (GSVA). After intersecting with 2,964 DEGs from Gene Expression Omnibus (GEO) Dataset 3, we obtained a 28‑gene panel. Potential markers were prioritized
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Diabetic foot ulcers (DFU) are severe complications with complex pathogenesis involving inflammation and impaired healing. Taurine, a key antioxidant amino acid, shows therapeutic potential in diabetes, but its role in DFU remains unclear and warrants investigation.
METHODS: This integrated multi-omics study analyzed DFU using GEO transcriptomics data (training: GSE68183/GSE80178; validation: GSE37265/GSE134431; scRNA-seq: GSE223964). Limma identified DEGs that intersected with taurine metabolism -related genes. Key modules (MCODE) and a LASSO-based diagnostic signature were estab
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Crohn's disease and ulcerative colitis are now treated with an expanding set of biologics and small molecules, yet treatment selection remains largely empirical. Primary non-response, secondary loss of response, incomplete mucosal healing, fibrostenosis, and fistulizing disease show that conventional clinical, endoscopic, and bulk molecular markers do not capture how disease is organized within tissue. This review argues that the inflamed intestine is better viewed as a set of spatially structured mucosal immune niches rather than as uniform inflammation, with epithelial, myeloid, lymphoid, st
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Silicosis is a work-related condition resulting from breathing in crystalline silica particles, marked by persistent inflammation and abnormal healing mechanisms in the lungs. Our previous studies demonstrated that inhibition of Cxcr4 with Plerixafor (AMD3100) markedly attenuates pulmonary fibrosis.
METHODS: By integrating single-cell RNA sequencing with spatial transcriptomics, we analysed lung tissues from a mouse model of pneumoconiosis. Using the Robust Cell Type Decomposition algorithm to deconvolve spatial transcriptomic data, we identified Cxcr4+ macrophages and Cxcl12+ fib
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bipolar disorder (BD) is a severe psychiatric disorder associated with substantial disability. Although genome-wide association studies have identified multiple BD-associated loci, the underlying genes and mechanisms remain incompletely understood.
METHODS: We integrated a European-ancestry BD genome-wide association dataset with cross-tissue and tissue-specific transcriptome-wide association studies (TWAS) and complementary gene-based analysis. Candidate genes were further evaluated using differential expression analysis, consensus clustering, immune infiltration analysis, machin
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pathological myopia complications are leading causes of irreversible blindness, yet the molecular mechanisms distinguishing them from simple myopia remain poorly understood. We aimed to compare the molecular profiles associated with pathological myopia complications and simple myopia using a multi-omics Mendelian randomisation (MR) framework.
METHODS: Using circulating protein quantitative trait loci data from the INTERVAL study, plasma metabolite genome-wide association study (GWAS) data from the Nightingale Health - UK Biobank initiative and outcome GWAS data for four complicati
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Medicinal-plant immunity and specialized metabolism are mechanistically linked, but rigorous receptor validation, causal multi-omics, and field trials are needed for reliable translational applications. Medicinal plants combine classical immune signaling with lineage-specific specialized metabolism. This review focuses on the immune systems of medicinal plants and on how pathogen perception reshapes the biosynthesis of pharmacologically valuable secondary metabolites. We synthesize evidence for pattern-triggered immunity (PTI) and effector-triggered immunity (ETI), emphasizing pattern-recognit
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lymph node metastasis is a critical determinant of poor prognosis in breast cancer, yet the functional heterogeneity of B cells and their roles during metastasis remain poorly understood. Through integrated single-cell RNA sequencing of paired primary tumors and metastatic lymph nodes in HR+/HER2- breast cancer, spatial transcriptomics, and in vivo functional models, we systematically mapped B cell states and interactions during metastatic progression. We found that IgA+ plasma cells, which promote tumor progression, were significantly expanded in metastatic lymph nodes, whereas immunostimulat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ongoing evolutionary struggle between crops and pathogens has highlighted the limitations of resistance gene (R gene)-based control, which often fails due to rapid pathogen adaptation. To address this, we must look beyond R genes and explore susceptibility genes (S genes) that pathogens take over during infection. Recent success stories suggest that S-gene manipulation can provide broad-spectrum resistance. However, moving this technology to the field requires careful balancing to ensure that plant fitness is not compromised. In this review, we focus on integrated multi-omics tools to iden
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Breast cancer's (BC) diverse nature and global impact demand tailored clinical strategies. Conventional screening methods often fall short in early detection and individualized risk assessment. By merging multi-omics technologies such as genomics, transcriptomics, proteomics, and metabolomics with artificial intelligence (AI), clinicians gain powerful tools to navigate this complexity. AI's ability to analyze vast, intricate multi-omics datasets enables precise risk stratification, early diagnosis, and the development of customized treatment plans. Applications range from refining mammographic
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: The microbiome is increasingly recognized as a key factor in health. Intestinal microbiota modulates gut homeostasis via a range of diverse metabolites. In particular, molecules such as short-chain fatty acids (SCFAs), the microbial fermentation products of dietary fiber, have been established to be reflective of microbiome and/or dietary shifts, and SCFAs alterations have been linked to multiple gastrointestinal disorders, from cancer to colitis. Despite their potential as biomarkers, technical challenges in stool collection have limited clinical translation. Here, we present Stoo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cold stress adversely affects cotton growth and development often causing morphological abnormalities during germination and seedling establishment. Nevertheless, the molecular and metabolic mechanisms conferring cold tolerance in cotton remain largely unclear. The study aimed to examine the morphological and physiological responses of two semi-wild Gossypium hirsutum accessions, the cold resistant Latifolium (CR-307) and cold susceptible Punctatum (CS-131) under cold stress. The experiment was conducted at two temperature regimes: 28-30 °C (control) and 4 °C for 96 h (cold stress). In compari
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Systemic AutoInflammatory Diseases (SAIDs) are rare conditions characterised by impaired control of inflammatory and innate immune responses. Precision medicine is already well established for monogenic SAIDs, while personalised approaches remain elusive for those conditions with not identified genetic cause, collectively named undifferentiated SAIDs (uSAIDs).The multi-omic approach integrates findings from various 'omics'" technologies (eg, genomics, transcriptomics, proteomics, epigenomics, immunomics), thus representing a potential way of identifying disease-specific biomarkers or complex m
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Proteomics provides key insights into systems regulating cell behavior and can elucidate key epigenetic states influencing biological functions in health and disease. Integrating different modalities of proteomics (total, phospho, epi) allows for a comprehensive understanding of how systems change in response to a stimulus. A current limitation is that these data are often captured individually with a limited scope of how systems regulating biological processes interact. Integrative analyses are essential to accurately depict biological states but often require custom, time-consuming bioinform
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pregnant women undergoing assisted reproductive technology (ART) have an increased risk of gestational diabetes mellitus (GDM), potentially linked to altered immune regulation, but the underlying circulating immune features remain unclear. Here we show an integrated single-cell transcriptomic, immune receptor repertoire, and plasma proteomic analysis of peripheral blood from 32 women with GDM and 31 normal pregnancies after ART. GDM is associated with increased proportions of CD8+ T cells and elevated plasma levels of CD6, CXCL5, MMP10, and 4E-BP1. Cytotoxic CD8+ T cell subsets display enhance
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
IgA nephropathy (IgAN) is the most prevalent primary glomerulonephritis worldwide. Although optimized supportive therapy is administered to these patients, a substantial proportion still progresses to end-stage kidney disease. The advancement of these noninvasive laboratory tools will complement renal biopsies. This review focuses on evaluating the multi-omics serum and urinary biomarkers that reflect the multi-hit pathogenesis of IgAN, such as abnormal O-glycosylation of immunoglobulin A1 (IgA1), autoantibody production, deposition of immune complexes in the mesangium, complement system activ
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.