PURPOSE OF REVIEW: In addition to having genetic causes, cancer can also be considered an epigenetic disease. The main epigenetic modification is DNA methylation, and patterns of aberrant DNA methylation are now recognized to be a common hallmark of human tumors. One of the most characteristic features is the inactivation of tumor-suppressor genes by CpG-island hypermethylation of the CpG islands located in their promoter regions. These sites, among others, are the targets of DNA-demethylating agents, the promising chemotherapeutic drugs that are the focus of this article.
RECENT FINDINGS: Fo…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study aims to explore the role and the mechanism of Parkin protein in cardiac function and ventricular remodeling in myocardial infarction (MI) rats, and to provide a new sight for the treatment of myocardial infarction.
MATERIALS AND METHODS: Fifty Sprague- Dawley (SD) male rats were randomly divided into 5 groups: sham operation group (Sham group), model group (MI group), low-dose Parkin group (L-Parkin group), middle-dose Parkin group (M-Parkin group) and high-dose Parkin group (H-Parkin group). The rat model of myocardial infarction was established by ligation of the anter
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In EBV-immortalized lymphoblastoid cell lines (LCLs) a small number of "latent" proteins are expressed. These are the EBV nuclear antigens, EBNAs 1-6, and a latent membrane protein, LMP. We have investigated the expression of these proteins in a variety of EBV-associated tumours and cell lines. Whereas transplant and B-cell lymphomas from cotton-top tamarins appear to express the full range of antigens found in LCLs, we and others have found that in Burkitt's lymphomas (BL) and a nasopharyngeal carcinoma (NPC) isolate, EBNA expression is restricted to EBNA-I. (In NPC, but not in BL, LMP may al
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Poly-ADP-Ribose Polymerase 1 (PARP1) is a potent regulator of DNA damage response signaling through the recruitment of DNA damage repair proteins to damage sites, and its catalytic function of converting Nicotinamide adenine dinucleotide (NAD+) into poly-ADP-ribose (PAR) which covalently modifies hundreds of protein substrates in a process known as PARylation. However, PARP1's role in the recognition, processing, and intracellular signaling downstream of DNA damage in cells remains incompletely understood, especially in a replication-independent context. Here, we show that cells exposed to hig
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The number of chronic kidney disease (CKD) patients is increasing worldwide, and it is necessary to diagnose CKD patients in earlier stages to improve their prognosis. Previously, in a study using human samples, we reported that DNA methylation and DNA damage in podocytes are potential markers for kidney function decline in IgA nephropathy; however, these candidate markers have not been adequately investigated in other glomerular diseases. Here, we report that the association of podocyte DNA damage and DNA methylation with eGFR decline and proteinuria differs depending on the type of glomerula…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In Ausimmune, an Australian multicenter incident case-control study, Epstein-Barr virus (EBV)-related measures, including anti-EBNA antibodies and infectious mononucleosis, show multiple sclerosis (MS) associations mediated by DNA methylation (DNAm). Human herpesvirus-6 (HHV-6) DNA has also been linked to increased MS onset risk, though its mechanisms remain unknown. Therefore, we examined an expanded set of human herpesvirus indices including HHV-6 indices. We first tested associations with MS-associated DNAm modules, then assessed whether HHV-6 DNA contributes to MS onset through DNAm pathwa…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Placental DNA methylation varies across gestation and is associated with obstetrical complications. Cell-free DNA (cfDNA) from maternal plasma could provide a noninvasive approach to study placental DNA methylation in ongoing pregnancies. However, research on maternal cfDNA methylation is limited and technologically challenging. Therefore, we aimed to investigate DNA methylation in maternal cfDNA and placental tissues across gestation using the innovative methylation DNA sequencing (MeD-seq) technology. Secondly, we explored the origins of methylation differences in maternal cfDNA across gesta…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sperm DNA integrity is considered essential for successful transmission of the paternal genome, fertilization and normal embryo … evels were examined for protamine deficiency, thiol profile and disulphide bonds. Additionally, the DNA methylation profiles of the samples were determined by reduced representation bisulphite sequencing (RRBS).
RESULTS: In this study, different traits related to sperm DNA integrity were investigated (n = 18 ejaculates). Upon liquid storage, the levels of total …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Altered DNA methylation plays an important role in the onset and progression of kidney disease. However, little is known about how the changes arise in disease states. Here, we report that KAT5-mediated DNA damage repair is essential for the maintenance of kidney podocytes and is associated with DNA methylation status. Podocyte-specific KAT5-knockout mice develop severe albuminuria with increased DNA double-strand breaks (DSBs), increased DNA methylation of the nephrin promoter region, and decreased nephrin expression. Podocyte KAT5 expression is decreased, whereas DNA DSBs and DNA methylation…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transcriptional silencing mediated by DNA methylation is a critical component of epigenetic regulation during early embryonic development in animals. However, the requirement for DNA methylation during activation and differentiation of mature CD8+ T cells into effector and memory cells is not clear. Using cre-mediated deletion of DNA methyltransferase 1 (Dnmt1) at the time of CD8+ T cell activation, we investigated the obligation for maintaining patterns of DNA methylation during the generation of Ag-specific effector and memory CD8+ T cells in response to acute viral infection of mice with ly…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Allele-specific methylation (ASM) is an epigenetic modification whereby one parental allele becomes methylated and the other unmethylated at a specific locus. ASM is most often driven by the presence of nearby heterozygous variants that influence methylation, but also occurs somatically in the context of genomic imprinting. In this study, we investigate ASM using publicly available single-cell reduced representation bisulfite sequencing (scRRBS) data on 608 B cells sampled from six healthy B cell samples and 1,230 cells from 11 chronic lymphocytic leukemia (CLL) samples. We developed a likelih
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Expression quantitative trait methylation (eQTM) analysis identifies DNA CpG sites at which methylation is associated with gene expression. The present study describes an eQTM resource of CpG-transcript pairs derived from whole blood DNA methylation and RNA sequencing gene expression data in 2115 Framingham Heart Study participants. We identified 70,047 significant cis CpG-transcript pairs at p < 1E-7 where the top most significant eGenes (i.e., gene transcripts associated with a CpG) were enriched in biological pathways related to cell signaling, and for 1208 clinical traits (enrichment false…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Aberrant promoter methylation of selective tumor suppressor genes has been detected in squamous intraepithelial lesions (SIL) an … genes in combination can better distinguish HSIL from combined NILM/LSIL samples. Although aberrant DNA methylation has the potential to function as a molecular biomarker of HSIL in liquid-based Pap tests, additional genes that are selectively methylated in HSIL are needed to improve the clinical performance.
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Aberrant DNA methylation can lead to the onset of pathological phenotypes and is increasingly being implicated in age-related metabolic diseases. In our preceding study we show that the heterozygous ablation of Pcyt2, the rate limiting enzyme in phosphatidylethanolamine (PE) synthesis, causes an age-dependent development of non-alcoholic steatohepatitis (NASH), and that treatment with the Pcyt2 substrate phosphonoethylamine (PEA) can attenuate phenotypic NASH pathologies. Here, we hypothesize that abnormal DNA methylation patterns underly the development of Pcyt2 + /- NASH. In this…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: There are challenging reports in the public health sphere regarding associations between oral contraceptive (OC) use and cancer risk. Methods: To evaluate possible effects of OCs on cancer susceptibility, we quantified of global 5-methyl cytosine (5-mC) levels and assessed methylation patterns of CpG islands of two key tumor suppressor genes, APC1 and ESR1, in serum of users by enzyme-linked immunosorbent assay and methylation specific PCR methods, respectively. Results: Our results indicated that OCs significantly decrease the level of global DNA methylation in users relative to c…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
With the widespread adoption of wide- and whole-genome massively parallel sequencing methods, the capabilities of molecular genetic diagnostics of hereditary diseases have expanded significantly. However, the challenge of increasing the detection rate of certain nosologies remains relevant. In recent decades, the use of DNA methylation as a biomarker for pathological conditions, including damage to the epigenetic machinery, has been extensively explored and discussed. Thus, DNA methylation can act as an indicator of damage to the epigenetic machinery. The analysis of the genome methylation pat…
СтатьяОбзорАннотация на английскомПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Untreated fresh cardiac tissue is the optimal tissue material for investigating DNA methylation patterns of cardiac biology and diseases. However, fresh tissue is difficult to obtain. Therefore, tissue stored as frozen or formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) is widely used for DNA methylation studies. It is unknown whether storage conditions alter the DNA methylation in cardiac tissue. In this study, we compared the DNA methylation patterns of fresh, frozen, and FFPE cardiac tissue to investigate if the storage method affected the DNA methylation results. We used the Infinium MethylationEP…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Surveillance after primary melanoma treatment aims to detect early signs of low-volume systemic disease. The current standard of care, surveillance imaging, is costly and difficult to access. We therefore sought to develop methylated DNA markers (MDMs) as promising alternatives for disease surveillance.
METHODS: We used reduced representation bisulfite sequencing (RRBS) to identify MDMs in DNA samples obtained from metastatic melanoma, benign nevi, and normal skin tissues. The identified MDMs underwent validation in an independent cohort of tissue and buffy coat DNA samples. Subseque
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methylated DNA immunoprecipitation (MeDIP) is one of the most widely used methods to evaluate DNA methylation on a whole genome scale, and involves the capture of the methylated fraction of the DNA by an antibody specific to methyl-cytosine. MeDIP was initially coupled with microarray hybridization to detect local DNA methylation enrichments along the genome. More recently, MeDIP has been coupled with next generation sequencing, which highlights its current and future applicability. In previous studies in which MeDIP was applied, the protocol took around 3 days to be performed. Given the impor…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования