Uveal melanoma (UM) is a malignant tumor that arises in the melanocytes of the uveal tract. It is the most frequent eye cancer, and despite new therapeutic approaches, prognosis is still poor, with up to 50% of patients developing metastasis with no efficient treatment options available. In contrast to cutaneous melanoma, UM is considered an "immune-cold" tumor due to the low mutational burden and the unique immunosuppressive microenvironment. To gain insight into the role of the UM microenvironment in regard to prognosis and metastatic progression, we have performed a pool analysis characteri
СтатьяМетаанализПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cholesteryl ester storage disease (CESD) results from loss-of-function mutations in LIPA, the gene that encodes lysosomal acid lipase (LAL). Hepatomegaly and deposition of esterified cholesterol (EC) in multiple organs ensue. The present studies quantitated rates of synthesis, absorption, and disposition of cholesterol, and whole body cholesterol pool size in a mouse model of CESD. In 50-day-old lal(-/-) and matching lal(+/+) mice fed a low-cholesterol diet, whole animal cholesterol content equalled 210 and 50 mg, respectively, indicating that since birth the lal(-/-) mice sequestered choleste
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although the existence of a humoral response against tumor-associated antigens is well appreciated, a systematic analysis of its possible induction by the tumor remains missing. We compared the specific IgG response of Stage IV melanoma patients during vaccination. Patients had been treated within 2 clinical trials with autologous tumor cells gene-modified for IL-7 or IL-12. A panel of 27 tumor-associated antigens (HD-MM-01 to HD-MM-27) was isolated by a SEREX screening of a testis cDNA library using a pool of 5 sera from patients after vaccination. All antigens were retested with individual s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Fleas transmit a variety of zoonotic agents whose epidemiology and public health risk remains poorly understood in sub-Saharan Africa, including Uganda particularly outside plague-endemic areas. Common flea-borne zoonotic agents include Rickettsia felis and Yersinia pestis.. Objectives: The study aimed at detecting and characterising flea-borne pathogens in peridomestic environments in Uganda. Methods: We collected fleas from domestic animals, chickens, rodents, and homestead environments; pooled them by species, collection time, and host species. A total of 172 pools were analyzed
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To maintain the length of reproductive life in a woman, it is essential that most of her ovarian primordial follicles are maintained in a quiescent state to provide a continuous supply of oocytes. However, our understanding of the molecular mechanisms that control the quiescence and activation of primordial follicles is still in its infancy. In this study, we provide some genetic evidence to show that the tumor suppressor tuberous sclerosis complex 2 (Tsc2), which negatively regulates mammalian target of rapamycin complex 1 (mTORC1), functions in oocytes to maintain the dormancy of primordial
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Environmental surveillance of antimicrobial resistance (AMR) in wildlife remains limited, despite increasing recognition that resistance determinants can circulate across human, livestock, and natural ecosystems. Migratory waterbirds move long distances and aggregate at shared stopover and wintering sites, potentially facilitating the acquisition and redistribution of antimicrobial resistance genes (ARGs) across regions. However, nationwide evidence describing the breadth of ARGs carried by winter migratory birds in Japan is scarce. We assessed the diversity and distribution of ARG
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thirty pools from 900 (540 females and 360 males) Phlebotomus perfiliewi sandflies collected during the summer of 2012 in the Fermo area (Marche Region, central Italy) were tested for the presence of Phleboviruses. A nested polymerase chain reaction was performed using degenerated primers amplifying a fragment of the polymerase gene (large segment) and a fragment of the nucleoprotein gene (small segment) of the genus Phlebovirus. One pool was positive for Toscana virus, as expected from results of studies in the area, and six pools were positive for a putative novel Phlebovirus. Virus isolatio
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Dyslipidemia, a core component of metabolic syndrome, is mechanistically linked to gut-liver axis dysfunction, in which the Farnesoid X receptor (FXR) is a master regulator. However, the initiating role of hepatocyte-derived FXR signaling in this process remains poorly defined.
METHODS: To investigate this, we employed an adeno-associated virus serotype 8 (AAV8)-CRISPR-CasRx system to achieve hepatocyte-specific Fxr knockdown in mice subjected to a 16-week high-fat diet. Systemic metabolic phenotypes, hepatic steatosis, and intestinal barrier integrity were comprehensively evaluat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The COVID-19 pandemic has placed unprecedented global demand on laboratory supplies required for testing. Sample pooling has been investigated by laboratories as a strategy to preserve testing capacity. We evaluate the performance of Cepheid Xpert® Xpress SARS-CoV-2 RT-PCR assay for testing samples in pools of 4 and 6. Clinical samples containing SARS-CoV-2, and confirmed negative clinical samples were used to create sample pools. Clinical samples had 'neat' Xpert® E gene cycle threshold values ranging between 20 and 28 and all were detected qualitatively when contained in pools of 4 or 6 samp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Detection of Orientia tsutsugamushi DNA in a trombiculid mite chigger species suggests that it might be a potential vector of scrub typhus in an endemic area. Over a period of 20 mo, 85 rats were trapped, 57 had chiggers that were identified by standard morphometric techniques. The chigger pools were assessed by performing PCR assays targeting fragments of the single-copy genes 56 kDa type-specific antigen gene (TSA56) by nested PCR and the 47 kDa (htrA) quantitative real-time PCR (qPCR). The novel traD SYBR green assay that detects a multicopy gene was also performed. In total, 27 chigger poo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The periodontium is a complex tissue with epithelial components and a complex set of mesodermal derived alveolar bone, cellular and a cellular cementum, and tendon like ligaments (PDL). The current evidence demonstrates that the major pool of periodontal stem cells is derived from a population of micro vascular associated aSMA-positive stem/progenitor (PSC) cells that by lineage tracing form all three major mesodermal derived components of the periodontium. With in vitro aSMA+ stem cells, transcriptome and chip- seq experiments, the gene network and enhancer maps were determined at several dif
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BAFF receptor (BAFF-R/BR3/TNFRSF13C) is a recently identified molecule that specifically binds BLyS, a protein belonging to the tumor necrosis factor (TNF) family, and is involved in survival and maturation of B cells. Recent studies have demonstrated that mice defective in BAFF-R gene exhibit an altered profile of the B cell pool, a phenotype observed in BLyS knockout mice as well. These features suggest that mutations in this gene may result in humoral immunodeficiency. To test this hypothesis, we sequenced the BAFF-R gene in 48 patients with common variable immunodeficiency (CVID) along wit
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Animal studies are typically utilized to understand the complex mechanisms associated with toxicant-induced hepatotoxicity. Among the alternative approaches to animal studies, in vitro pooled human hepatocytes have the potential to capture population variability. Here, we examined the effect of the hepatotoxicant thioacetamide on pooled human hepatocytes, divided into five lots, obtained from forty diverse donors. For 24 h, pooled human hepatocytes were exposed to vehicle, 1.33 mM (low dose), and 12 mM (high dose) thioacetamide, followed by RNA-seq analysis. We assessed gene expression variabi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Rapid emergence and proliferation of extended spectrum beta-lactamase producing Klebsiella pneumoniae (ESBL-KP) constitute a serious health problem globally.
OBJECTIVES: The aim of this study was to evaluate the pooled prevalence of ESBL-KP and ESBL genes in Nigeria.
METHODS: A quantitative method (Meta-analysis) design was used to summarize pooled results of primary studies. Different databases [Google Scholar, PubMed, and African Journal Online (AJOL)] were searched for relevant studies. Meta-analysis was done using random-effects model. I2 and Egger test was used to ascertain
СтатьяСистематический обзорМетаанализПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cell growth and fitness shape mammalian biomanufacturing performance, but subtle genetic effects are difficult to resolve with conventional growth assays. We developed a high-throughput competitive co-culture CRISPR array in Chinese hamster ovary (CHO) suspension cells that pairs a CRISPR-competent population with a CRISPR-inactive green fluorescent protein (GFP) reference pool and tracks GFP-ratio dynamics by flow cytometry. Guided by a prior genome-wide CRISPR screen, we tested 235 single-gene knockouts and 155 multiplex gene sets across seven batches and >100 days of cultivation. The assay
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
X-linked hypophosphatemia (XLH) is the most common form of familial hypophosphatemic rickets and it is caused by loss-of-function mutations in the PHEX gene. Recently, a wide variety of PHEX gene defects in XLH have been revealed; these include missense mutations, nonsense mutations, splice site mutations, insertions, and deletions. Recently, we encountered a 2-year-9-month-old female with sporadic hypophosphatemic rickets. She underwent osteotomy, dental abscess was evident, and there was severe bowing of the legs. A low serum phosphorus level in combination with elevated serum alkaline phosp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The emergence of multidrug-resistant bacteria is a phenomenon of concern to the clinician and the pharmaceutical industry, as it is the major cause of failure in the treatment of infectious diseases. The most common mechanism of resistance in pathogenic bacteria to antibiotics of the aminoglycoside, beta-lactam (penicillins and cephalosporins), and chloramphenicol types involves the enzymic inactivation of the antibiotic by hydrolysis or by formation of inactive derivatives. Such resistance determinants most probably were acquired by pathogenic bacteria from a pool of resistance genes in other
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Intrauterine growth restriction (IUGR) is a frequent complication of pregnancy defined as a restriction of fetal growth. The objective of this work was to improve the knowledge on the pathophysiology of IUGR using a genome-wide method of expression analysis.
METHODS: We analyzed differentially expressed genes in pooled placental tissues from vascular IUGR (four pools of three placentas) and normal pregnancies (four pools of three placentas) using a long nucleotide microarray platform (Nimblegen). We first did a global bioinformatics analysis based only on P value without any a pri
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genomic diversity of Helicobacter pylori from the vast Indian subcontinent is largely unknown. We compared the genomes of 10 H. pylori s … hisms revealed that Ladakhi strains share features of the Indo-European, as well as the East Asian, gene pools. However, the contribution of genetic features from the Indo-European gene pool was more prominent.
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dilated cardiomyopathy (DCM) is a heart disease characterized by left ventricular dilatation and systolic dysfunction. In 30% of cases, pathogenic variants, essentially private to each patient, are identified in at least one of almost 50 reported genes. Thus, while costly, exons capture-based Next Generation Sequencing (NGS) of a targeted gene panel appears as the best strategy to genetically diagnose DCM. Here, we report a NGS strategy applied to pools of 8 DNAs from DCM patients and validate its robustness for rare variants detection at 4-fold reduced cost. Our pipeline uses Freebayes to det
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.