The standard for diagnosing meningoencephalitis includes cerebrospinal fluid (CSF) culture and viral polymerase chain reaction (PCR). Approval of the FilmArray® BioFire® Meningitis/Encephalitis (ME) panel has reduced time to detection of several pathogens and improved diagnostic sensitivity. The objective of this study was to determine the impact on intravenous (IV) acyclovir duration of the ME panel compared to previously utilized CSF studies within a large health system with a central laboratory. A multicenter quasi-experimental cohort study of adult and pediatric patients was conducted (n =
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ascarid Larva Migrans Syndrome (ascarid LMS) is a clinical syndrome in humans, caused by the migration of animal roundworm larvae such as Toxocara canis, Toxocara cati and Ascaris suum. Humans may acquire infection by ingesting embryonated eggs, or infective larvae of these parasites in contaminated meat and organ meats. To detect these pathogenic contaminations, a novel nested multiplex PCR system was developed. Our novel nested multiplex PCR assay showed specific amplification of T. canis, T. cati and Ascaris spp. Detection limit of the nested multiplex PCR was tested with serial dilution of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Global polio eradication efforts rely in part on molecular methods of detecting polioviruses, both wild and vaccine strains, from human and environmental samples. Previous assays used for detection of Sabin oral polio vaccine (OPV) in fecal samples have been labor and time intensive and vary in their sensitivity and specificity.
METHODS: We developed a high-throughput, multiplex reverse-transcription quantitative polymerase chain reaction assay able to detect all 3 OPV strains in fecal samples. The assay used a KingFisher Duo Prime system for viral RNA isolation and extraction. Po
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Approximately 15% of couples are infertile with the male factor explaining approximately 50% of the cases. One of the main genet … 40 non-obstructive infertile men, 20 males from couples with RPL and 20 fertile males as controls. Multiplex polymerase chain reaction was used to amplify 19 sequence tagged sites (STS) to detect AZF microdeletions. Differences between the case and control groups were evaluated by two-tailed unpaired t test. P<0.05 were considered statistically significant.
RESULTS: Only one subje …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Brucellosis has emerged as a disease of concern in marine mammals in the last 2 decades. Molecular detection techniques have the potential to address limitations of other methods for detecting infection with Brucella in these species. Presented herein is a real-time polymerase chain reaction (PCR) method targeting the Brucella genus-specific bcsp31 gene. The method also includes a target to a conserved region of the eukaryotic mitochondrial 16S ribosomal RNA gene to assess suitability of extracted DNA and a plasmid-based internal control to detect failure of PCR due to inhibition. This method
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Translocations t(14;18)(q32;q21) and t(11;14)(q13;q32) are recurrent findings in follicular lymphoma (FL) and mantle cell lymphoma (MCL), respectively. However, the molecular counterparts of these translocations can only be detected in up to 75% of FL and 50% of MCL cases using routine techniques. To improve the efficiency of detection, we first devised a single-tube multiplex-polymerase chain reaction (PCR) assay with primers located within a conserved immunoglobulin heavy chain (IGH) sequence and 5' to the main breakpoint cluster regions of BCL2 and CCND1. Using this assay in 17 FL and 11 MC
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Transmission of HIV-1 and diagnosis of infection in hospitals and public health settings remains a worldwide concern. HIV-1 detection is sometimes not possible using current commercial assays, probably due to mismatches between the selected primers and probes.
METHODS: By screening primers and probes, we developed a dual-specificity probe real-time reverse transcriptase-polymerase chain reaction (DSPrtRT-PCR) assay using dual-specific armored RNA as the internal control. The specificity and sensitivity were compared between the monospecificity probe real-time and DSPrtRT-PCR techni
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVE: Pneumocystis jirovecii pneumonia (PjP) remains an important cause of morbimortality worldwide, and differentiating Pneumocystis jirovecii (P. jirovecii) infection from P. jirovecii colonization (PjC) is crucial for guiding treatment strategies. Multiplex polymerase chain reaction-based targeted next-generation sequencing (mp-tNGS) is a promising tool for identifying lower respiratory tract infections, with a detectable pathogen spectrum that covers more than 95% of clinical infectious cases. This study evaluated mp-tNGS for P. jirovecii identification in bronchoalveol…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: With the advent of multiplex polymerase chain reaction (PCR) using samples from a positive blood culture, the time required to identify a pathogen has significantly shortened to a few hours. It can help us select appropriate antimicrobial agents more quickly. The present study aimed to assess the impact of using a multiplex PCR blood culture panel on the appropriate administration of antimicrobial agents.
METHODS: Patients aged <16 years with culture-confirmed bacteremia at Tokyo Metropolitan Children's Medical Center were enrolled. A pre-intervention period (period I: December 20…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The mosquito Aedes aegypti is an urban vector of dengue and other arboviruses. During epidemics of these viruses, pyrethroid insecticides are used for the control of adult mosquitoes. The worldwide resistance of Ae. aegypti to these insecticides is a cause of failure of vector control campaigns. The primary target of pyrethroids is the voltage-gated sodium channel. Point mutations in the gene coding for this channel, called knockdown resistance (kdr) mutations, are associated with pyrethroid resistance. Two kdr mutations, V1016I and F1534C, have increased in frequency in natural po
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The rapid identification of bacteria causing meningitis is crucial as delays in the treatment increase mortality rate. Though considered as the gold standard for the laboratory diagnosis of bacterial meningitis, culture might give false negative results in a case of patients under antibiotics prior to lumbar puncture. This study aimed to detect Streptococcus pneumoniae, Neisseria meningitidis and Haemophilus influenzae by a multiplex polymerase chain reaction (PCR) in culture-negative cerebrospinal fluid samples collected from clinically suspected meningitis cases attending different hospitals…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Zika virus (ZIKV), dengue virus (DENV), chikungunya virus (CHIKV) and yellow fever virus (YFV) share the same mosquito vectors and have similar clinical manifestations early stage of infection. Therefore, simultaneously differentiating these viruses from each other is necessary. We developed a multiplex real-time reverse-transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) assay for the differentiation of these four viruses in a single tube. The linear range was established by regression analysis, and the R2 value for each virus was ≥0.98, and the 95% lower limit of detection for each virus was as
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Resistance to metronidazole (Mtz) in Helicobacter pylori is a major problem worldwide, especially in developing countries. Alterations in Mtz nitroreductase enzymes, such as oxygen-insensitive NADPH nitroreductase (RdxA) and NADPH flavin oxidoreductase (FrxA), are the major contributing factors for this resistance. In this study, rdxA and frxA were amplified, sequenced, and analyzed in 34 Mtz-resistant H. pylori isolates (MIC ≥ 8 μg/mL) using multiple allele-specific polymerase chain reaction (MAS-PCR); this method was developed to target the most common genotypes of rdxA in H. pylori. In this
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Three mosquito-borne human encephalitis viruses (eastern equine encephalitis virus [EEE], St. Louis encephalitis virus [SLE], and La Crosse encephalitis virus [LAC]) are sympatric in the southeastern United States. However, little is known concerning the temporal and spatial pattern of the distribution of these viruses in this area. As part of surveillance activities to detect the transmission of these 3 viruses in the Tennessee Valley area, we developed a single-tube multiplex reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) assay capable of detecting these 3 mosquito-borne viruses in
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To determine the etiology of genital ulcer disease (GUD) among patients attending sexually transmitted disease (STD) clinics in Pune, India, and to examine the relationship to HIV infection and compare the clinical diagnosis of GUD with the results of a multiplex polymerase chain reaction (M-PCR) assay for Treponema pallidum, herpes simplex virus (HSV), and Hemophilus ducreyi infection.
METHODS: Between June 20, 1994, and September 26, 1994, 302 patients with a genital ulcer were evaluated. Clinical etiology of GUD was based on physical appearance and microbiologic evaluations whi…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM OF STUDY: We used a triplex real-time polymerase chain reaction (PCR) to classify our common variable immunodeficiency (CVID) patients into distinct groups according to the amount of their T-cell receptor excision circles (TRECs) and κ-deleting recombination excision circles (KRECs).
MATERIALS AND METHODS: TREC and KREC analysis was performed using a multiplex real-time PCR assay. The T- and B-lymphocyte subsets were measured by flow cytometry.
RESULTS: The copy number of TRECs and KRECs was significantly reduced in CVID patients compared to healthy controls. The TREC copy number was inv
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Molecular detection and serotyping are rapid, sensitive and accurate techniques for early diagnosis of paediatric dengue. The present study evaluates multiplex real-time polymerase chain reaction (PCR) for diagnosis of dengue virus in children hospitalised with severe dengue (SD) and attempts to establish an association of clinical severity with specific serotypes.
METHODS: Four hundred and eighty-five samples were received from hospitalised paediatric patients with suspected dengue from March 2019 to February 2020. Multiplex real time PCR was employed for diagnosis. An in-house re
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background Detection of disease-associated mutations in patients with familial hypercholesterolaemia is crucial for early interventions to r … -UK small cohort of 58 patients screened in parallel with other mutation-targeting methods, such as multiplex polymerase chain reaction (Elucigene FH20), oligonucleotide arrays (Randox familial hypercholesterolaemia array) or the Illumina next-generation sequencing platform. Results In this small cohort, the next-generation sequencing method achieved excellent analytical performance …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To reduce high mortality and morbidity rates, timely and proper treatment of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) bloodstream infection is required. A multiplex polymerase reaction (mPCR)-based DNA lateral flow assay (MBDLFA) was developed as a point-of-care diagnostic for simultaneous identification of S. aureus, methicillin resistance, and vancomycin resistance directly from blood or blood cultures. A mPCR was developed to detect nuc, mecA, and vanA/B; its sensitivity, specificity, and limit of detection (LOD) were determined. The developed reaction was further modified for use
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования