The gut microbiomes of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) reared at 16° and 22 °C were determined using formalin-fixed paraffin-embedded tissues (FFPE) and compared to fresh frozen tissue. The data revealed microbiomes could be successfully determined using FFPE tissue opening a new horizon in studying intestinal microbiota using archived histological samples.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissues are promising biological resources for genetic research. Recent improvements in DNA extraction from FFPE samples allowed the use of these tissues for multiple sequencing methods. However, fundamental research addressing the application of FFPE-derived DNA for targeted-bisulfite sequencing (TB-seq) is lacking. Here, we evaluated the suitability of FFPE-derived DNA for TB-seq. We conducted TB-seq using FFPE-derived DNA and corresponding fresh frozen (FF) tissues of patients with kidney cancer and compared the quality of DNA, libraries, and TB-seq s…
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mass spectrometry imaging (MSI) has provided many results with translational character, which still have to be proven robust in large patient cohorts and across different centers. Although formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) specimens are most common in clinical practice, no MSI multicenter study has been reported for FFPE samples. Here, we report the results of the first round robin MSI study on FFPE tissues with the goal to investigate the consequences of inter- and intracenter technical variation on masking biological effects. A total of four centers were involved with similar MSI instr…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Renal biopsy interpretation requires histopathology, direct immunofluorescence (DIF) and electron microscopy. Formalin-fixed, paraffin-embedded tissue (FFPE) sent for light microscopy can be used for DIF after antigen retrieval. However, complement staining has not been satisfactory. We standardized DIF using proteinase-K for antigen retrieval in FFPE renal biopsies. A pilot study was conducted on known cases of membranous glomerulonephritis (MGN), membranoproliferative type-1 (MPGN-1), immunoglobulin A nephropathy (IgAN), and anti-glomerular basement disease (anti-GBM). Immunofluorescence pan…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Occupational exposure to paraffin is an infrequent cause of lipoid pneumonia (LP) and related data are scare. We investigated the possible relationship between three rare cases of chronic LP and occupational exposure to paraffin aerosol in an iron foundry.
METHODS: The three cases of LP and their workplaces were investigated using data from field investigations, air monitoring, pulmonary radiological examinations, cell staining, and lung biopsies.
RESULTS: The patients had long-term occupational exposure to paraffin. X-ray diffraction testing revealed that the raw material from t…
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Focal segmental glomerulosclerosis (FSGS) is a common form of idiopathic nephrotic syndrome defined by the characteristic lesions of focal glomerular sclerosis and foot process effacement; however, its etiology and pathogenesis are unknown. We used mRNA isolated from laser-captured glomeruli from archived formalin-fixed, paraffin-embedded renal biopsies, until recently considered an unsuitable source of mRNA for microarray analysis, to investigate the glomerular gene expression profiles of patients with primary classic FSGS, collapsing FSGS (COLL), minimal change disease (MCD), and normal cont…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Since its original description, there has been a substantial output of publications related to the FOXP3 gene. The FOXP3 protein, a member o … t describes the experience of using two commonly used monoclonal FOXP3 antibodies on formalin-fixed paraffin-embedded sections of different organs, including the cervix and vulva. The antibodies targeting different FOXP3 epitopes unexpectedly resulted in significantly different staining patterns. This phenomenon has not been previously reported and is like …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bismuth iodoform paraffin paste (BIPP) is used for the packing of wound and surgical cavities. Features of both bismuth and iodoform toxicities have been associated with the use of BIPP, but there are no previous reports of 2,3-dimercaptopropane-1-sulphonate (DMPS) chelation therapy for bismuth poisoning secondary to its use.
CASE REPORT: A 67-year-old man presented with a pelvic tumor requiring extensive surgical resection. BIPP packing was required post-operatively for surgical wound breakdown. A few days after insertion, the patient developed neurological features of bismuth to…
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Although nucleic acid derangements are the hallmark of melanocytic dysplasia, the gold standard for its diagnosis remains the microscopic evaluation of haematoxylin and eosin stained slides. However, light microscopy is subjective and crucial genomic changes do not always show as changes in histology.
AIMS: To introduce the nucleic acid index (NAI) as a means of analysing nucleic acid derangements in histological sections at the level of the individual cell and within the context of its microenvironment.
METHODS: Confocal laser scanning microscopy was performed on melanocytic les
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To examine 3 types of pathogens in dead fetus with congenital defects for exploring the pathogenesis.
METHODS: The paraffin embeded brain and liver tissues from 39 fetal autopsies with congenital defects were examined for toxoplasma, cytomegalovirus, and herpes simplex II by polymerase chain reaction. Among them 16 placentae were examined as well.
RESULTS: Pathogens were detected in 25 of 39 cases, a positive rate of 64%. Nine out of the 13 fetuses with urogenital defects were positive for the shove pathogens, while 8 from the 12 with neural tube defects were positive as well.
CO…
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hydatidiform moles can be subclassified based on their ploidy. In general, complete moles are diploid, and partial moles are triploid. The standard method for the determination of DNA content is flow cytometric analysis. In this study, the authors investigated whether static cytometric analysis with the CAS 200 Image Analyzer (Cell Analysis Systems, Inc., Elmhurst, IL) with a software program designed for quantitation of nuclear DNA content in tissue sections can be used to classify moles. Tissue sections from 17 moles were analyzed with this system, and the results were compared with those ob
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The cytofluorometric nuclear DNA ploidy analysis was performed in gallbladder (GB) epithelium of eight patients of chronic cholecystitis to make a comparison between fresh and paraffin embedded tissue analysis, to make an ideal single cellular suspension, to evaluate the ploidy pattern affected by inflammation and to assess the histological correlations. Six (75%) fresh specimens and eight (100%) paraffin embedded specimens showed diploidy pattern of histogram. Two (25%) fresh specimens showed low ploidy pattern of histogram. There was a good correlation between histological findings and the p…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The differential diagnosis of complete (CM) and partial (PM) hydatidiform moles and hydropic abortions (HA) can be difficult when based on histology alone. Therefore, a more objective approach of chromosome ploidy analysis as detected by in situ hybridization (ISH) was performed on 6 microns paraffin sections of seven cases, originally classified as three CM, two PM, and two HA with a histologic pattern suggestive of triploidy. Probes for repetitive DNA targets in the (peri)centromeric region of chromosomes 1 and X and in the q arm of chromosome Y were used to determine chromosome ploidy and s…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Using a monoclonal antibody specific to the Lewis X antigen (anti-Lex), the authors studied 103 cases of Hodgkin's disease (HD) in compariso … s reactive conditions of LN. In conclusion, Lewis X staining is useful as a marker for R-S cells in paraffin sections with staining results superior to those of Leu-M1. Lewis X staining also detects subcapsular clustering of altered-appearing Langerhans'-like cells in PGL, which has not been described previously and warrants additional study.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The accuracy of immunohistochemical techniques depends critically on the preservation of antigenic integrity in tissue samples. Although formalin-fixed paraffin-embedded tissues are commonly used for long-term storage, several studies reported signal degradation over time. However, the extent of this degradation and the influence of storage conditions on a wide range of markers remain poorly characterized. In this study, tissue blocks collected over an 8-year period and tissue sections stored under different conditions (room temperature [RT], 4 °C, -20 °C, and -80 °C) were analyzed. Twenty-fiv…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The molecular pathogenesis of infectious diseases and cancer is orchestrated by nanoscale of host and microbial RNA transcripts within the tissue microenvironment. Nevertheless, spatially resolving the comprehensive transcriptional landscape within complex clinical tissues, like formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) specimens, still poses a formidable challenge. Here, we present spRandom-seq, a random primer-based spatial total RNA sequencing technology designed to spatially resolve complete transcriptomes from host, bacteria, and even nanoscale viruses in FFPE tissues. Capitalizing on the r…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Toxoplasma gondii and human papillomavirus (HPV) can cause spontaneous abortus. This study aimed to investigate the prevalence of these pathogens in formalin-fixed, paraffin-embedded placenta samples from women diagnosed with spontaneous abortus.
METHODS: A total of 288 formalin-fixed, paraffin-embedded placenta tissue blocks stored in the archives of Etlik City Hospital Pathology Laboratory were included in the study between October 1, 2022, and June 23, 2023. The presence of T gondii and HPV in formalin-fixed, paraffin-embedded placenta samples was investigated using real-time po…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic expanding hematoma (CEH) is a late complication of extraperiosteal paraffin plombage. Various late complications have been reported with this historical procedure, including expanding hematoma, paraffinoma, blood specimens complicating chronic empyema, and malignant tumors. A 75-year-old male presented with left-sided lateral chest pain. Fifty years prior, he had undergone a left upper lobectomy with extraperiosteal paraffin plombage for pulmonary tuberculosis. Three years before the current presentation, he had been admitted to another hospital with fever. At that time, a chest comput…
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования