AIM: To characterize the influence of location, species and treatment upon RNA degradation in tissue samples from the gastrointestinal tract.
METHODS: The intestinal samples were stored in different medium for different times under varying conditions: different species (human and rat), varying temperature (storage on crushed ice or room temperature), time point of dissection of the submucous-mucous layer from the smooth muscle (before or after storage), different rinsing methods (rinsing with Medium, PBS, RNALater or without rinsing at all) and different regions of the gut (proximal and dista
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The stability of 2'-deoxy-2'-fluoroarabinonucleic acid (2'F-ANA) to hydrolysis under acidic and basic conditions was compared to that of DNA, RNA and 2'F-RNA. In enzyme-free simulated gastric fluid (pH approximately 1.2), 2'F-ANA was found to have dramatically increased stability (virtually no cleavage observed after 2 days) with respect to both DNA (t(1/2) approximately 2 min) and RNA (t(1/2) approximately 3 h (PO) or 3 days (PS)). These results were observed for both phosphodiester and phosphorothioate backbones and with multiple mixed-base sequences. Under basic conditions, 2'F-ANA also sho
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Syntheses of the novel oligodiaminosaccharides, α-(1→4)-linked-2,6-diamino-2,6-dideoxy-D-glucopyranose oligomers, and their interactions with nucleic acid duplexes DNA-DNA, RNA-RNA, and DNA-RNA are described. Monomers to tetramers of oligodiaminoglucose derivatives having α-glycosyl bonds were successfully synthesized using a chain elongation cycle including glycosylation reactions of a 6-phthalimide glycosyl donor. UV melting experiments for a variety of nucleic acid duplexes in the absence and presence of the oligodiaminosaccharides were performed. The synthesized oligodiaminosaccharides exh
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
High-resolution structure determination of RNA remains a major challenge due to its conformational flexibility, intrinsic heterogeneity, and susceptibility to degradation. Although RNA plays central roles in gene regulation, viral replication, and cellular homeostasis, RNA-only structures represent a small fraction of entries in the Protein Data Bank. Overcoming the limitations associated with RNA has therefore required the development of innovative engineering strategies to stabilize defined conformations and facilitate structural analysis. In this review, we describe RNA engineering approach
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spray-freeze drying (SFD) is a promising drying technique for stabilizing RNA lipid nanoparticles (RNA-LNPs) by converting them into solid-state formulations. This study examined the impact of the SFD process and the widely utilized stabilizing disaccharides, such as sucrose and trehalose, on the major properties (e.g. particle size, encapsulation efficiency) of RNA-LNPs post drying. Various process parameters, such as atomization, freezing, and drying temperature, were systematically evaluated, along with the impact of incorporating annealing post freezing step. Surface area measurements, sol
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Approximately 80 percent of the total RNA in cells is ribosomal RNA (rRNA), making it an abundant and inexpensive natural source of long, single-stranded nucleic acid, which could be used as raw material for the fabrication of molecular origami. In this study, we demonstrate efficient and robust construction of 2D and 3D origami nanostructures utilizing cellular rRNA as a scaffold and DNA oligonucleotide staples. We present calibrated protocols for the robust folding of contiguous shapes from one or two rRNA subunits that are efficient to allow folding using crude extracts of total RNA. We als
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antisense oligonucleotides have been used for a variety of purposes in microRNA (miRNA) research including functional evaluation, target recognition, and gene studies. Although several (99m)Tc-radiolabeled oligonucleotides have been reported in antisense imaging, none of those were related to miRNA tracing. Moreover, separation after labeling was always required to achieve acceptable radiochemical purity. In this study, we prepared a (99m)Tc-radiolabeled oligonucleotide under optimized conditions for the purpose of tracing miRNA. A 22mer anti-miRNA oligonucleotide (AMO) was designed completely
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Long noncoding RNAs (lncRNAs) play important regulatory roles in a variety of pathological processes involving cancer. However, the exact molecular mechanisms of lncRNA regulation in endometrial carcinoma (EC) remain poorly defined. The aim of this study was to illustrate the mechanism of LINC00958 in regulating the function of IGF2BP3, an RNA binding protein involved in mRNA stability, and their clinical implications in EC. First, we investigated the clinical role of IGF2BP3 in EC and demonstrated its prognostic value. Loss-of-function and gain-of-function studies showed that IGF2BP3 promoted…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Flavivirus gene expression is modulated by RNA secondary structure elements at the terminal ends of the viral RNA molecule. For tick-borne encephalitis virus (TBEV), four stem-loop (SL) elements have been predicted in the first 180 nucleotides of the viral genome: 5'-SL1, 5'-SL2, 5'-SL3 and 5'-SL4. The last three of these appear to be unique to tick-borne flaviviruses. Here, we report their characterization by mutagenesis in a TBEV luciferase reporter system. By manipulating their thermodynamic properties, we found that an optimal stability of the 5'-SL2 is required for efficient RNA replicati
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA helicase DHX9 is a multi-functional protein governing transcriptional modulation, RNA processing, R-loop balance, and genome stability. SUMOylation is a post-translational modification that adds a critical regulatory layer to protein function by diversifying subcellular localization, stability, enzymatic activity, and protein-protein interactions. This protocol describes a basic but detailed approach for the analysis of DHX9 SUMOylation. We demonstrate that accurate site identification, specifically at Lysine 120 (K120), is the prerequisite for defining the molecular mechanism of this modi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Messenger RNA (mRNA) vaccines represent a paradigm shift in rapid vaccine development and pandemic preparedness, enabling unprecedented speed in antigen design and scalable, cell-free manufacturing. Despite proven clinical efficacy, widespread mRNA vaccine deployment remains critically constrained by fundamental molecular instability requiring ultra-cold chain storage. The chemical lability of the RNA phosphodiester backbone, 2'-hydroxyl-mediated transesterification, oxidative nucleobase damage, and lipid nanoparticle (LNP) structural vulnerabilities collectively limit long-term stability and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transcriptional adaptation (TA) is a genetic robustness mechanism through which mutant messenger RNA (mRNA) decay induces sequence-dependent up-regulation of so-called adapting genes. How cytoplasmically generated mRNA fragments affect nuclear transcription remains poorly understood. Using genome-wide CRISPR screens, we uncover ILF3 as an RNA binding protein connecting cytoplasmic mRNA decay and transcription during TA and show that it is required for a range of TA substrates. ILF3 is enriched at adapting genes' RNAs, and its artificial recruitment through dCas13 promotes gene expression. Usin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MicroRNAs are small noncoding RNAs that regulate gene expression within cells through the translational repression or degradation of targeted mRNA. miRNAs undergo a multiphase synthesis that includes conformational changes mediated by Drosha, Dicer, and Argonaute to integrate mature miRNA into the RNA-induced silencing complex to target messenger (m)RNA. miRNAs have been characterized through their transcription and biogenesis; however, the mechanism regarding miRNA turnover is less comprehensible because of the stability of each miRNA. Target-directed miRNA degradation (TDMD) is dependent on
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Flaviviruses such as Yellow fever, Dengue, West Nile, and Zika generate disease-linked viral noncoding RNAs called subgenomic flavivirus RNAs. Subgenomic flavivirus RNAs result when the 5'-3' progression of cellular exoribonuclease Xrn1 is blocked by RNA elements called Xrn1-resistant RNAs located within the viral genome's 3'-untranslated region that operate without protein co-factors. Here, we show that Xrn1-resistant RNAs can halt diverse exoribonucleases, revealing a mechanism in which they act as general mechanical blocks that 'brace' against an enzyme's surface, presenting an unfolding pr
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The importance of tightly controlled alternative pre-mRNA splicing in the heart is emerging. The RNA binding protein Rbm24 has recently been identified as a pivotal cardiac splice factor, which governs sarcomerogenesis in the heart by controlling the expression of alternative protein isoforms. Rbm38, a homolog of Rbm24, has also been implicated in RNA processes such as RNA splicing, RNA stability and RNA translation, but its function in the heart is currently unknown. Here, we investigated the role of Rbm38 in the healthy and diseased adult mouse heart. In contrast to the heart- and skeletal m…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The success of COVID-19 mRNA vaccines has made the in-solution stability optimization of mRNAs a key objective. However, we still lack a complete understanding of sequence metrics that influence mRNA in-solution stability. RNA secondary structure plays a critical role in protecting against hydrolysis, the primary degradation pathway under storage conditions. Yet, the structural metrics that best guide stability-focused mRNA design remain incompletely defined. Global metrics like minimum free energy and average unpaired probability have improved mRNA stability but fail to capture local structur…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Type I interferons are essential for antiviral immunity1 but must be tightly regulated2. The conserved transcriptional repressor SP140 inhibits interferon-β (Ifnb1) expression through an unknown mechanism3,4. Here we report that SP140 does not directly repress Ifnb1 transcription. Instead, SP140 negatively regulates Ifnb1 mRNA stability by directly repressing the expression of a previously uncharacterized regulator that we call RESIST (regulated stimulator of interferon via stabilization of transcript; previously annotated as annexin 2 receptor). RESIST promotes Ifnb1 mRNA stability by counter…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cardiovascular diseases remain a growing global health burden, with myocardial infarction (MI) persisting as the leading cause of cardiovascular mortality worldwide. Zinc finger NFX1-type containing 1 (ZNFX1), an RNA helicase family member, remains relatively understudied in molecular biology and its role in cardiovascular diseases remains unclear. This study aims to explore the involvement of ZNFX1 in MI and uncover its mechanisms. This research found ZNFX1 was decreased in MI myocardium and hypoxia-treated cardiomyocyte. Overexpression of ZNFX1 significantly attenuated myocardial dysfunction
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The endoplasmic reticulum (ER) mitigates stress typically through unfolded protein response (UPR) and ER-associated degradation (ERAD) pathw … gulator of ER-linked RNA surveillance, establishing an organelle-specific mechanism that integrates RNA stability, protein homeostasis and antiviral defence.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Myotonic dystrophy is the most common muscular dystrophy in adults. It consists of two forms: type 1 (DM1) and type 2 (DM2). DM1 is associated with a trinucleotide repeat expansion mutation, which is transcribed but not translated into protein. The mutant RNA remains in the nucleus, which leads to a series of downstream abnormalities. DM1 is widely considered to be an RNA-based disorder. Thus, we consider three areas of the RNA pathway that may offer targeting opportunities to disrupt the production, stability, and degradation of the mutant RNA.
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования