OBJECTIVES: The purpose of this study was to evaluate the diagnostic performance of an endotracheal aspirate (ETA) real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) assay for the diagnosis of Pneumocystis jirovecii pneumonia in intensive care unit (ICU) patients with suspected pneumonia.
METHODS: We conducted a retrospective analysis of a prospective cohort in a 28-bed medical ICU. Adult patients who underwent both ETA and bronchoalveolar lavage (BAL) sampling for P. jirovecii real-time PCR within 48 hours between October 2018 and December 2024 were included. Diagnostic performance metrics of the …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: To evaluate the additional effect of a single session of antimicrobial photodynamic therapy (aPDT) on the tongue as an adjunct to scaling and root planing (SRP) on most common volatile sulfur-producing microbes such as Porphyromonas gingivalis (Pg), Treponema denticola (Td) and Fusobacterium nucleatum (Fn) on 3rd, 7th and 14th day postoperatively using RT-PCR analysis.
METHOD AND MATERIALS: Twenty-four patients of either sex, presented with moderate to severe malodor, detected by a portable breath checker (Tanita®) were considered for the study and assigned to group A & B. Scaling and ro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anthrax, caused by the Gram-positive, spore forming bacterium Bacillus anthracis, is a disease with naturally occurring outbreaks in many pa … rt using two massively parallel sequencing (MPS) approaches and compare with previous results using real-time polymerase chain reaction (qPCR). Samples were collected daily for seven days each month from August 2011-July 2012 targeting movement of people, luggage and freight into and out of the Canberra Airport. Extracted DNA was analysed using qPCR specific for B. anthracis. A subs …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leptospirosis has a major impact on health in Sri Lanka but is probably grossly under-recognized due to difficulties in clinical diagnosis and lack of diagnostic laboratory services. The objective of this study was to establish and evaluate a SYBR Green-based real-time Polymerase Chain Reaction (rt-PCR) assay for early, rapid and definitive laboratory diagnosis of leptospirosis in Sri Lanka. The rt-PCR assay was established and analytical specificity and sensitivity were determined using reference DNA samples. Evaluation of the assay for diagnosis of clinical samples was performed using two pa…
Клиническое исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to evaluate the use of conventional polymerase chain reaction (cPCR) and real-time quantitative PCR (qPCR) in the diagnosis of human strongyloidiasis from stool samples in tropical areas. Stool samples were collected from individuals and were determined to be positive for Strongyloides stercoralis (group I), negative for S. stercoralis (group II) and positive for other enteroparasite species (group III). DNA specific to S. stercoralis was found in 76.7% of group I samples by cPCR and in 90% of group I samples by qPCR. The results show that molecular methods can be used as alte
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Since the introduction of the Haemophilus influenzae serotype b vaccine, invasive H. influenzae disease has become dominated by nontypeable (NT) strains. Several widely used molecular diagnostic methods have been shown to lack sensitivity or specificity in the detection of some of these strains. Novel real-time assays targeting the fucK, licA, and ompP2 genes were developed and evaluated. The fucK assay detected all strains of H. influenzae tested (n = 116) and had an analytical sensitivity of 10 genome copies/polymerase chain reaction (PCR). This assay detected both serotype b and NT H. influ
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Conventional techniques for diagnosing influenza based on viral cell culture or disease serology have limitations, and molecular assays, such as real-time polymerase chain reaction (rtPCR) are increasingly used.
OBJECTIVES: To evaluate the use of rtPCR as a diagnostic tool for the determination of influenza virus infection.
STUDY DESIGN: This prospective, double-blind, placebo-controlled, randomised efficacy study was conducted in persons aged 18-64 years. Cases of influenza-like-illness (ILI), defined as at least one systemic symptom [fever ≥37.8°C and/or myalgia] and at least o…
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To compare the results of real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) for detection of Leishmania DNA in Giemsa-stained skin scraping slides with direct microscopic evaluation of Giemsa-stained skin scrapings and to estimate the sensitivity and specificity of RT-PCR.
STUDY DESIGN: We used 30 samples from cases diagnosed with cutaneous leishmaniasis (CL), 16 from clinically suspected individuals but negative in direct microscopic evaluation and 50 normal individuals from nonendemic dry type CL areas.
RESULTS: All samples of CL positive and 8 of suspected cases were positive for RT…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND OBJECTIVES: Accurate diagnosis is crucial for early malaria treatment and for preventing its transmission. However, efforts to el … using 150 Pf-positive samples and 50 malaria-negative samples, which were analysed by quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR). Sensitivity, Specificity, positive predictive value, negative 2 predictive value, and the area under the receiver operating characteristic (ROC) curve (AUC) were calculated for each gene, using a threshold cycle value of ≤37 as the cutoff. …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVES: Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus (MERS-CoV) is commonly detected in pneumonia patients who travel from the Middle East regions. Besides MERS-CoV, many other pathogenic agents cause pneumonia. Detection of such organisms must be done swiftly, especially in case of the negative MERS-CoV samples. The aim of this study was to identify the pathogenic agents that might account for bacterial pneumonia, from Hajj and Umrah pneumonia cases.
MATERIALS AND METHODS: We conducted a cross-sectional study, 38 pneumonia clinical samples from suffering of Hajj and Umrah
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, we evaluated the diagnostic accuracy of multiple cross displacement amplification (MCDA) combined with real-time PCR platform in pulmonary tuberculosis (PTB) patients. Total 228 PTB patients and 141 non-TB cases were enrolled. Based on the analysis of the first available sample of all participants, MCDA assay showed a higher overall sensitivity (64.0%), with a difference of more than 10% compared with Xpert MTB/RIF (Xpert) assay (51.8%, P < 0.05) and combined liquid and solid culture (47.8%, P < 0.001) for PTB diagnosis. In particular, MCDA assay detected 31 probable TB patients
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The incidence of invasive fungal infections (IFIs) has recently increased, and early and accurate diagnosis of IFIs is important for the rational selection of antifungal drugs with high efficacy. We developed a method for rapid and accurate clinical diagnosis of IFIs and provide a reference for personalized drug treatment.We designed and screened fungal internal transcribed spacer regions with universal primers and designed 8 TaqMan detection probes to establish a multi-channel real-time fluorescent polymerase chain reaction (PCR) melting curve analysis (MCA) method. The sensitivity, specifici
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Congenital cytomegalovirus (cCMV) infection is the leading infectious cause of mental retardation, developmental delay and senso … n screening for cCMV was performed for 750 infants born at a tertiary care center in Western India. Real-time polymerase chain reaction was directly carried out on saliva samples. Follow-up laboratory testing of saliva, urine and blood was performed for neonates identified as positive. Sequential clinical follow-up was offered to the affected infants.
RESULTS: A birth prevalence of …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, we describe a duplex real-time PCR assay for the simultaneous detection of KIPyV and WUPyV polyomaviruses based on TaqMan probes. This assay detected 500 copies/mL both for KIPyV and WUPyV in 100% of tested positive samples. We assessed this technique on 482 nasopharyngeal aspirate specimens from hospitalized pediatric patients with respiratory symptoms, previously analyzed with commercial multiplex assay for 16 major respiratory viruses. Our assay detected KIPyV genome in 15 out of 482 samples (3.1%) and WUPyV genome in 24 out of 482 samples (4.9%), respectively, and in three s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Dengue fever is caused by four related RNA viruses of the genus Flavivirus, dengue virus (DENV)-1, -2, -3, and -4, which are transmitted to humans by mosquitoes. Although DENV is not endemic in Japan, an autochthonous dengue outbreak occurred in 2014. Several transfusion-transmitted cases have also been reported after the use of blood and plasma products in DENV-endemic countries. The aim of this study was to develop a novel multiplex reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) assay for DENV blood screening.
STUDY DESIGN AND METHODS: Large-scale oligonucleotide scree
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Acute respiratory infection plays an important role in hospitalization of children in developing countries; detection of viral c … ospitalized children with fever and respiratory distress were evaluated for RSV and hMPV RNA by the real-time polymerase chain reaction (PCR) method.
RESULTS: Among the 158 children evaluated in this study, 49 individuals (31.1%) had RSV infection while nine individuals (5.7%) had hMPV infection. Five (55.5%) of the hMPV-infected children were male while four (44.5%) were female an …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The incidence of M. tuberculosis (MTB) and non tuberculous Mycobacterium species (NTMs) like M. avium and M. kansasii has increased due to Human Immunodeficiency Virus (HIV) epidemic. Therefore accurate, rapid and cost effective methods for the identification of these NTMs and MTB are greatly needed for appropriate TB management. Thus in this study we evaluated the performance of Lightcycler(®) Mycobacterium detection assay to detect MTB, M. avium and M. kansasii in sputum specimens.
METHODS: A total of 241 baseline minimally processed sputum specimens from individual adult TB sus
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two real-time, or quantitative, polymerase chain reaction (qPCR) assays were developed to detect Actinobacillus pleuropneumoniae serovars 1-9-11 (highly related serovars with similar virulence potential) and serovar 2, respectively. The specificity of these assays was verified on a collection of 294 strains, which included all 16 reference A. pleuropneumoniae strains (including serovars 5a and 5b), 263 A. pleuropneumoniae field strains isolated between 1992 and 2009 in different countries, and 15 bacterial strains other than A. pleuropneumoniae. The detection levels of both qPCR tests were eva
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A generic two-step lyssavirus real-time reverse transcriptase polymerase chain reaction (qRT-PCR), based on a nested PCR strategy, was validated for the detection of different lyssavirus species. Primers with 17 to 30% of degenerate bases were used in both consecutive steps. The assay could accurately detect RABV, LBV, MOKV, DUVV, EBLV-1, EBLV-2, and ABLV. In silico sequence alignment showed a functional match with the remaining lyssavirus species. The diagnostic specificity was 100% and the sensitivity proved to be superior to that of the fluorescent antigen test. The limit of detection was ≤
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования