BACKGROUNDS: The BioFire FilmArray RP2.1 plus is a syndromic multiplex PCR panel for qualitative detection of 20 respiratory pathogens. BioMérieux recently introduced FIREWORKS, a software platform providing access to amplification data, including cycle threshold (Ct) values.
OBJECTIVES: This study evaluated the diagnostic performance of the BioFire RP2.1 plus and explored the potential utility of Ct values for semi-quantitative assessment of pathogen load.
METHODS: This retrospectively study included 72 specimens. Some were serially diluted for quantitative analyses, yielding 130 PCR tests.
СтатьяОценочное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute respiratory tract infections (ARTIs) are a major global health burden with high morbidity and mortality, mainly affecting children under 5 years old and people over 60 years old. The majority of ARTIs are caused by respiratory viruses, such as influenza virus (IFV), respiratory syncytial virus (RSV), human rhinovirus (HRV), human parainfluenza virus (HPIV), human adenovirus (HAdV), human coronavirus (HCoV), human bocavirus (HBoV) and human metapneumovirus (HMPV). Accurate and sensitive diagnosis of respiratory viruses is crucial for clinical treatment and management of patients with ARTI
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Accurate quantification of host immune gene expression is essential for elucidating host-pathogen interactions and inflammation regulation in poultry infection studies. However, many existing chicken immune gene-expression assays rely on singleplex reactions or intercalating-dye chemistry, which may limit throughput and target specificity. Here, we developed and validated a probe-based multiplex TaqMan real-time qPCR assay for simultaneous quantification of four selected chicken pro-inflammatory immune-response transcripts: IFN-γ, IL-1β, IL-8L1, and LITAF, with 18S rRNA included as a separatel
СтатьяВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Waterfowl parvoviruses (WPVs), including classical goose parvovirus (cGPV), Muscovy duck parvovirus (MDPV), Muscovy duck-origin goose parvovirus (MDGPV), and short beak and dwarfism syndrome virus (SBDSV), are significant pathogens that affect waterfowl flocks worldwide. Due to their high genetic similarity and frequent coinfections, rapid and accurate differentiation of these viruses remains challenging. In this study, we developed a multiplex TaqMan-minor groove binder (MGB) real-time PCR assay for the simultaneous detection and differentiation of cGPV, MDPV, MDGPV, and SBDSV. Specific prime
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To develop a multiplex RT-quantitative PCR (RT-qPCR) assay to quantify sex-specific Plasmodium falciparum gametocyte transcripts (pfCCp4, pfMGET), for evaluating the impact of drug treatments on gametocyte viability for malaria transmission-blocking drug development.
METHODS: We optimized an RT-qPCR assay incorporating a normalization transcript to use the ΔΔCt method (differences in Cycle threshold) to quantify gametocyte transcript levels. The assay was used on ex vivo gametocytes from P. falciparum natural infections exposed for 24 h to six drugs impairing mosquito transmission
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Rapid and accurate detection of viral infections is crucial in clinical settings, yet traditional quantitative polymerase chain reaction (qPCR) methods, though highly accurate, are typically laboratory-based and require significant time and resources, limiting their effectiveness in point-of-care environments. In this study, we applied a rapid qPCR method, originally developed for severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, to a range of viral infections. The primary aim was to establish a novel diagnostic platform that combines mobile qPCR with multiplex detection for rapid,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Timely identification of respiratory pathogens guides specific treatment, reduces hospital costs and minimizes the excessive use of antibiotics. A new multiplex real-time PCR panel was developed based on an automatic molecular detection and analysis system (AutoMolec system), consisting of three separate internally controlled assays. Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae, adenovirus, human metapneumovirus, influenza B virus, respiratory syncytial virus and human parainfluenza virus 1-3 may be directly detected in original samples. The system's clinical performance was evaluated by compar
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Enteroviruses (EVs) are the leading cause of aseptic meningitis worldwide. Detection of enteroviral RNA in clinical specimens has been demonstrated to improve the management of patient care, especially that of neonates and young children.
FINDINGS: To establish a sensitive and reliable assay for routine laboratory diagnosis, we compared the sensitivity and specificity of the GeneXpert Enterovirus Assay (GXEA) with that of the reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) based assay referred to as real-time one step RT-PCR (RTo-PCR). The sensitivity/specificity produced
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dengue virus (DENV) infection remains to be a serious health problem in Indonesia. Community-based dengue studies to determine circulating DENV serotypes based on the geography and season are limited owing to the expensive cost and significant effort required. Many patients with DENV infection are not hospitalized and many visit the hospital in the later phase of the disease. In this study, we performed active DENV surveillance in a community in Jakarta to study the circulating dengue serotypes; adult febrile patients with fever less than 48 hours were recruited. Disease severity was defined u
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
LP2086 is a lipidated outer membrane protein from Neisseria meningitidis that elicits bactericidal antibodies and represents a promising vaccine candidate against meningococcal infections. Here we report the backbone and side-chain assignment for two forms of LP2086: non-lipidated in aqueous buffer and the lipidated protein in micellar solution.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE/METHODS: After we studied a case of chlamydial and adenoviral coinfection in a 20-year-old woman, we determined the incidence of chlamydial infection in patients with acute adenoviral conjunctivitis. In a randomized retrospective study, we evaluated 100 specimens of patients with culture-proven adenoviral conjunctivitis.
RESULTS/CONCLUSIONS: Three of 100 (3%) specimens tested positive for chlamydial DNA using polymerase chain reaction. Adenoviral and chlamydial coinfection is rare, yet should be considered in patients with prolonged follicular keratoconjunctivitis.
Клиническое исследованиеСтатьяРандомизированное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lipid linked aminosugars have been shown to have significant antimicrobial properties. We report here a solid phase strategy for the rapid synthesis of lipid-aminoglycoside compounds, linked with amino acids. Subsequent screening of the compounds against pathogens known to cause clinical fungal infections is also reported herein. We have screened the library for antifungal activity in eight species of Candida. The lipid-neomycin conjugates show antifungal minimal inhibitory concentrations in the 1.56-3.13 μM range across a broad spectrum of Candida. Generally, conjugates with long chain lipids
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute kidney injury is a crucial prognostic factor for multiple myeloma. The most common cause is light chain cast nephropathy. The primary pathology of light chain-induced acute kidney injury involves obstruction of distal tubules due to the interaction of free light chains (FLCs) with Tamm-Horsfall protein produced there. Based on this pathology, chemotherapy is used to suppress the production of FLCs. Recently, combined blood purification therapies to remove existing FLCs have been used. However, the extent to which FLCs are removed by blood purification therapy remains unclear. We investig
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this paper, we report the synthesis and cell-based anti-prion activity of quinacrine analogs derived by replacing the basic alkyl side chain of quinacrine with 4-(4-methylpiperazin-I-yl)phenyl, (1-benzylpiperidin-4-yl) and their structural variants. Several promising analogs were found that have a more favorable anti-prion profile than quinacrine in terms of potency and activity across different prion-infected murine cell models. They also exhibited greater binding affinities for a human prion protein fragment (hPrP(121-231)) than quinacrine, and had permeabilities on the PAMPA-BBB assay th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
T-cell lymphoma in patients infected with HIV is much less common than B-cell lymphoma. We describe two cases of HIV-associated extranodal lymphoma that showed Toutonlike tumor giant cells and mononuclear large lymphoma cells. Both cell types expressed T-cell-associated antigens, including CD3, CD5, CD43, and CD45RO, and were CD4- and CD30-positive and negative for all B-lineage-associated antigens. Both cases showed T-cell receptor gamma chain gene rearrangements using the polymerase chain reaction and were negative for the Epstein-Barr virus by in situ hybridization. Despite the expression o
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: To study the clinical and histological profile of lung tissue in patients with persistent pulmonary disease, respiratory symptoms and CT findings after SARS-CoV-2 infection.
MATERIALS AND METHODS: The study included 15 patients (7 females and 8 males) with a mean age of 57.7 years. All patients underwent laboratory tests, chest computed tomography, echocardiography, and pulmonary function tests. Pulmonary tissue and bronchoalveolar lavage samples were obtained by fibrobronchoscopy, transbronchial forceps (2 patients), and lung cryobiopsy (11 patients); open biopsy was performed in 2 pati
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We present the case of a 51-year-old man with acute myeloid leukemia who developed fevers with a skin lesion following the first cycle of induction chemotherapy. Skin biopsy showed evidence of invasive fungal infection. Cultures remained negative, but polymerase chain reaction on tissue detected Rhizopus oryzae complex. The patient was started on liposomal amphotericin B and underwent surgical debridement. He was switched to posaconazole, with plans for allogeneic hematopoetic stem cell transplant in the future.
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A 21-year-old Surinam boy suffering from a combined heterozygous sickle-cell beta-thalassaemia presented with an extreme anaemia (haemoglobin concentration 0.7 mmol/l) and severe haemolysis without signs of increased erythropoiesis. An acute B19 parvovirus infection was diagnosed by a transient increase of IgM anti-B19 parvovirus titres and a positive polymerase chain reaction for B19 parvovirus. The patient recovered spontaneously after a short period of supportive care with red cell transfusions and mechanical ventilation.
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to determine the role of asymptomatic bacterial sexually transmitted infections (STIs), such as Chlamydia trachomatis (Ct), Mycoplasma genitalium (Mg), Mycoplasma hominis (Mh), and Ureaplasma urealyticum (Uu) in human papillomavirus (HPV) infection. In total, 264 asymptomatic outpatients aged between 21 and 80 years were prospectively enrolled in this study during routine gynecological screening tests. Specimens collected with a Cervex Brush were routinely analyzed with the Hybrid Capture 2 assay for HPV. Simultaneously, a specimen obtained with an endocervical swab was used t
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To estimate Chlamydia trachomatis (CT) infection prevalence and associated risk factors among a low-income marginalized urban population in Peru.
METHODS: Between April 2003 and April 2005, men and women at high-risk for sexually transmitted infections (STIs) were recruited from low-income urban areas in three coastal cities in Peru (Chiclayo, Lima, and Trujillo). Consenting participants were studied using a sero-epidemiologic survey. Urine and vaginal swabs collected from men and women were evaluated using polymerase chain reaction (PCR) (COBAS AMPLICOR (CT/NG) Test, Roche Molecu
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.