PURPOSE OF REVIEW: The design of novel herpes simplex type I (HSV-1)-derived oncolytic virotherapies is a balancing act between safety, immunogenicity and replicative potential. We have undertaken this review to better understand how these considerations can be incorporated into rational approaches to the design of novel herpesvirus oncolytic virotherapies.
RECENT FINDINGS: Several recent papers have demonstrated that enhancing the potential of HSV-1 oncolytic viruses to combat anti-viral mechanisms present in the tumor microenvironment leads to greater efficacy than their parental viruses.
…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PD-1/L1 and CTLA-4 blockade immunotherapies have been approved for 13 types of cancers and are being studied in diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL), the most common aggressive B-cell lymphoma. However, whether both PD-1 and CTLA-4 checkpoints are active and clinically significant in DLBCL is unknown. Whether PD-1 ligands expressed by tumor cells or by the microenvironment of DLBCL are critical for the PD-1 immune checkpoint is unclear. We performed immunophenotypic profiling for 405 patients with de novo DLBCL using a MultiOmyx immunofluorescence platform and simultaneously quantitated expre
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Macrophages play an important role in regulating the tumor microenvironment (TME). Here we show that classical (M1) macrophage polarization reduced expression of LSD1, nuclear REST corepressor 1 (CoREST), and the zinc finger protein SNAIL. The LSD1 inhibitor phenelzine targeted both the flavin adenine dinucleotide (FAD) and CoREST binding domains of LSD1, unlike the LSD1 inhibitor GSK2879552, which only targeted the FAD domain. Phenelzine treatment reduced nuclear demethylase activity and increased transcription and expression of M1-like signatures both in vitro and in a murine triple-negative…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CXCR1 and CXCR2 chemokine receptors and their ligands (CXCL1/2/3/7/8) play an important role in tumor progression. Tested to date CXCR1/2 antagonists and chemokine-targeted antibodies were reported to affect malignant cells in vitro and in animal models. Yet, redundancy of chemotactic signals and toxicity hinder further clinical development of these approaches. In this pre-clinical study we investigated the capacity of a novel small molecule dual CXCR1/2 inhibitor, Ladarixin (LDX), to attenuate progression of experimental human melanomas. Our data showed that LDX-mediated inhibition of CXCR1/2
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Vonoprazan, a potassium-competitive acid blocker, possesses distinct pharmacokinetic and pharmacodynamic properties, including a high pKa , prolonged systemic exposure, and sustained hypochlorhydria, that may have implications beyond gastric acid suppression for anticancer drug interactions and the tumor microenvironment.
METHODS: We critically reviewed preclinical and clinical literature to evaluate vonoprazan's potential effects across two proposed biological axes: the intracellular/organelle axis, involving potential lysosomal drug sequestration, pH regulation, autophagy, and apop…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Immune checkpoint inhibitors (ICIs) have improved systemic therapy for advanced gastric and gastroesophageal junction cancer, yet primary and acquired resistance remain common and are incompletely explained by established tumor biomarkers. This narrative review evaluates the connected roles of the tumor microenvironment (TME), host immunity, and the gut microbiome in shaping ICI resistance in gastric cancer. We performed a structured PubMed search through 28 August 2026 and prioritized gastric cancer-specific clinical and translational evidence, supplemented by systematic reviews, meta-analyse…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Accurate deconvolution of bulk transcriptomes is essential for characterizing the breast cancer tumor microenvironment (TME), yet existing reference matrices incompletely capture tumor-specific cellular diversity. Here, we developed breast cancer-specific multiresolution CIBERSORTx signature matrices from single-cell RNA sequencing data and systematically evaluated their analytical performance and interpretability. Major-, minor-, and subset-level matrices were constructed and assessed using pseudo-bulk mixtures and pure cell profiles, while biological and clinical coherence were evaluated in …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation deregulation is an essential feature of tumor biology, influencing cancer formation and pathogenesis. Analyses of DNA methylation in bulk cancer specimens are challenging due to the high data dimensionality, noise, and mixture of different cell types. Here, we characterized methylation dynamics in cancer by investigating the variance structure of bulk tumor DNA methylation data through the identification of groups of highly correlated CpGs, termed CpG cassettes. Using triple-negative breast cancer as a model system, our approach identified co-occurring methylation patterns link
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The significance of M2 macrophages in cancer is well established, yet their specific role and the regulatory molecules involved … ytometry.
RESULTS: Macrophages represented a substantial fraction (20%-35% across datasets) of the tumor microenvironment and were associated with upregulated coagulation and KRAS signaling. Consensus M2 macrophage infiltration was linked to 91 upregulated genes, among which CCBE1 emerged as an independent prognostic risk factor (multivariate Cox: HR = 1.305 [95% CI: 1 …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Astragalus polysaccharide (APS), a major bioactive component of Astragalus membranaceus, has shown antitumor potential through modulation of the tumor microenvironment (TME) and immune responses. High mobility group nucleosome binding domain 1 (HMGN1), a natural agonist of TLR4, promotes dendritic cell (DC) maturation, whereas an anti-TNFR2 antibody relieves immunosuppression by targeting regulatory T cells (Tregs). Although immunotherapy holds promise for the treatment of colorectal cancer (CRC), more effective combination strategies are still needed. Here, we investigated the therapeutic eff…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Tumor acidosis is associated with poor therapeutic response. Yet, it remains unclear whether 5-fluorouracil (5-FU) resistance in gastric cancer is driven by low extracellular pH per se or by lactate as a signaling metabolite.
METHODS: The human gastric cancer cell line AGS was exposed to extracellular acidosis (pH 6.6; short-term or chronic) or exogenous lactate at neutral pH. 5-FU sensitivity, apoptosis, and lactate production were assessed. Extracellular pH was buffered with 4-(2-hydroxyethyl)-1-piperazineethanesulfonic acid (HEPES); lactate metabolism/ export was disrupted by
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nanomedicines that perform well in conventional cell cultures often fail to translate into patients, in part due to the inability to reproduce the protein corona, and hence the biological identity, that nanoparticles acquire within the tumor microenvironment (TME). Here, we establish patient-derived colonic organoids (PDCOs) as a platform for profiling nano-bio interactions under physiologically tumor-relevant conditions using graphene quantum dots (GQD) and Silicon Quantum Dots (SiQD) as material-distinct probes. By combining spectral flow cytometry, confocal imaging, dynamic light scattering…
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Immune checkpoint blockade (ICB) targeting PD-1/PD-L1 axis has transformed breast cancer treatment, yet how therapy reshapes the tumor microenvironment (TME) through cell-cell communication (CCC) remains unclear. Existing CCC inference methods relying on correlations have difficulty distinguishing genuine signaling from confounded associations. Here, we present a causal inference framework that uses single-cell data and leverages treatment as an instrumental variable to identify genuine CCC networks, referred to as scIVCCC, which infers causal signal transduction across cell types. Applying sc…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: The ccrcc1-4 transcriptomic subtypes were previously identified in fresh-frozen clear-cell renal cell carcinoma (ccRCC) samples and have proven their prognostic value after nephrectomy/metastasectomy and predictive value for first-line vascular endothelial growth factor receptor-tyrosine kinase inhibitors (VEGFR-TKI). We aimed to create a consensus molecular classification approach called Clearseq1-4 on formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tissues and to evaluate its prognostic and predictive value across the RCC treatment landscape. RNA sequencing of tumoral FFPE tissue was pe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Radix Bupleuri-Radix Paeoniae Alba (RB-RPA) has the potential to ameliorate the immune microenvironment in hepatocellular carcinoma (HCC). The interactions between various cells influence the immune microenvironment. However, the effects of the active components (saikosaponin D (SSD) and paeoniflorin) of RB-RPA on HCC and the cell interactions within its microenvironment warrant further investigations. We established orthotopic mouse models of HCC using Hepa 1–6 cells (a hepatoma cell line) to investigate the infiltration of cancer-associated fibroblasts (CAFs). Following this, we knocked down
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We retrospectively analyzed 116 cases of colorectal cancer (CRC) to evaluate the relationship between nutritional indicators (NIs) and clinicopathological features, including immune cell infiltration in the tumor microenvironment. The geriatric nutritional risk index (GNRI), prognostic nutritional index (PNI), modified Glasgow prognostic score (mGPS), Controlling Nutritional Status (CONUT) score, and neutrophil-to-lymphocyte ratio (NLR) were assessed. Immune cell densities (CD3, CD8, Foxp3, Iba1, CD163) were quantified by immunohistochemistry. Poor NIs were associated with older age, lower bod…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tumor heterogeneity, immunosuppression, and frequent adverse effects present major challenges in colorectal cancer therapy. Although the com … ion and polysaccharide-promoted immunomodulation synergistically reprogrammed the immunosuppressive tumor microenvironment, facilitating an effective anti-tumor immune response. In vivo, the nanoparticles significantly inhibited tumor growth and demonstrated good biosafety, with a hemolysis rate < 5% and no appreciable organ toxicity observed. This work not only validat …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding complex diseases such as cancer requires insight into both the intrinsic properties of individual cells and their interactions within the tumor microenvironment. Integrating single-cell RNA sequencing (scRNA-seq), which captures transcriptional states, with spatial proteomics, which provides spatially resolved protein expression data, offers a powerful opportunity to unravel disease mechanisms. In this protocol, we describe a framework that unifies scRNA-seq and spatial proteomics into a joint graph-based representation. This approach enables accurate prediction of disease pathol…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intraoperative molecular imaging (IMI) has emerged as a valuable tool for the surgical management of non-small cell lung cancer (NSCLC), enabling detection of otherwise imperceptible pulmonary nodules. However, current IMI tracers target tumor-specific receptors that are heterogeneously expressed across different NSCLC subtypes, limiting their universal applicability. This study investigated fibroblast activation protein (FAP), selectively expressed by cancer-associated fibroblasts (CAFs) in the tumor microenvironment but absent in normal lung parenchyma, as a potential universal target for fl…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.