Seasonal influenza A evolves quickly through mutations in haemagglutinin (HA) and neuraminidase (NA), which can reduce vaccine match and lower protection. Many sequence-only models do not link codon-level mutations to three-dimensional (3D) protein context and long-term evolutionary signals within one scoring framework. This study presents TRIAD-Influenza (TRIAD: Token-Residue-Integrated Architecture for Drift), a multi-view transformer that combines (i) codon- and residue-level sequence representations, (ii) structure-derived residue interaction features from predicted HA/NA models, and (iii)
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Herpes simplex virus type 1 (HSV-1) can establish latency in humans and easily relapse in immunocompromised patients, with significant mortality. Treatment with acyclovir (ACV) can result in the emergence of HSV resistance. A total of 440 frozen HSV-1 isolates collected from 318 patients from January 2014 to July 2019 were obtained from National Cheng Kung University Hospital in southern Taiwan. These 440 isolates were subjected to phenotypic studies for ACV-resistance by initial screening with the plaque reduction assay (PRA) and further validation by the DNA reduction assay (DRA). The ACV-re
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antigen recognition by the B cell receptor (BCR) is a physiological trigger for reactivation of Epstein-Barr virus (EBV) and can be recapitulated in vitro by cross-linking of surface immunoglobulins. Previously, we identified a subset of EBV microRNAs (miRNAs) that attenuate BCR signal transduction and subsequently dampen lytic reactivation in B cells. The roles of host miRNAs in the EBV lytic cycle are not completely understood. Here, we profiled the small RNAs in reactivated Burkitt lymphoma cells and identified several miRNAs, such as miR-141, that are induced upon BCR cross-linking. Notabl
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cell-associated receptor for urokinase plasminogen activator (uPAR) is released as both full-length soluble uPAR (suPAR) and cleaved (c-suPAR) form that maintain ability to bind to integrins and other receptors, thus triggering and modulating cell signaling responses. Concerning HIV-1 infection, plasma levels of suPAR have been correlated with the severity of disease, levels of immune activation and ineffective immune recovery also in individuals receiving combination anti-retroviral therapy (cART). However, it is unknown whether and which suPAR forms might contribute to HIV-1 induced pathogen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Study of the morphological patterns of acquired immunodeficiency syndrome (AIDS)-related lymphadenopathy.
SETTINGS AND DESIGN: We retrospectively selected cases of AIDS-related benign lymphadenopathy. Cases with lymphomas, frank granulomas and necrosis were excluded. We analyzed different morphological patterns and correlated these with immunophenotypic markers along with viral markers human herpesvirus 8-latency-associated nuclear antigen (HHV8-LANA), and Epstein-Barr virus-encoded ribonucleic acid (EBER) studies via in situ hybridization (EBER-ISH).
MATERIALS AND METHODS: We present
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND CONTEXT: The medial prefrontal cortex (mPFC) has been implicated in modulating anxiety and depression. Manipulation of Drd1 neurons in the mPFC resulted in variable neuronal activity and, consequently, strikingly different behaviors. The acute regulation of anxiety- and depression-like behaviors by Drd1 neurons, a major neuronal subtype in the mPFC, has not yet been investigated.
PURPOSE: The purpose of this study was to investigate whether acute manipulation of Drd1 neurons in the mPFC affects anxiety- and depression-like behaviors.
STUDY DESIGN: Male Drd1-Cre mice were injected
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective: Hearing abnormalities frequently occur in Human Immunodeficiency Virus (HIV) infected individuals. Both conductive and uni- or bilateral sensorineural hearing loss (SNHL) have been described along with other audiological and vestibular symptoms such as tinnitus, vertigo and balance disturbances. While frequent middle ear infections may explain impairment of peripheral hearing abilities, the exact etiology of cochlear, and central auditory processing deficits still remains unclear. Direct effects of HIV, opportunistic infections, ototoxic side effects of antiretroviral therapy (ART),
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Despite the success of long-term antiretroviral therapy (ART), immune dysfunction-including incomplete T helper cell recovery, immune activation, and inflammation-persists and may affect the benefits of analytical ART treatment interruption (ATI) trials among people living with human immunodeficiency virus (HIV) (PLHIV) in sub-Saharan Africa (SSA). This narrative review summarizes evidence of incomplete immune function recovery among PLHIV on long-term ART and potential interventions to enhance their ability to participate in ATI trials with immunotherapies in the quest for an HIV
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVES: Epstein-Barr virus (EBV) infection is a prerequisite for the development of multiple sclerosis (MS), yet whether EBV acts merely as a trigger at disease onset or also contributes to immune dysregulation and disease progression remains unclear. To explore potential mechanisms linking EBV to immune alterations, we performed a comprehensive analysis of EBV markers and immune-related gene expression in peripheral blood samples from therapy-naïve persons with MS (PwMS) and healthy donors (HD) and assessed EBV transcripts in CSF cells to explore compartment-specific viral
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dark brooders are often suggested as enrichment for broiler chickens because they promote natural motivated behaviors compared to conventional barren environments in broiler production. Although the use of brooders is thought to convey benefits for animal welfare, it is not well described how they might affect parameters related to production and health. The objective of this study was to investigate if providing dark brooders affects production, health, behavior, and welfare compared to a control group without dark brooders. Six pens of each treatment were used, keeping 60 mixed-sex chickens
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The development of so-called "sickness behaviors" (e.g., anorexia, anhedonia, reduced social interaction, fatigue) during infectious and inflammatory disease has been linked to facets of the immune response. Such problems can be particularly troublesome during chronic latent infection, as the host immune system must employ continual vigilance to maintain viral latency. Epstein-Barr virus (EBV) is a ubiquitous human gamma-herpesvirus that causes acute disease and establishes life-long latency in people. Murine gammaherpesvirus (MuGHV) is a natural pathogen of wild rodents that provides an exper
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Disruption of Epstein-Barr virus (EBV) latency is mediated by ZEBRA, the protein product of the immediate-early EBV gene, BZLF1. In vitro, phorbol 12-myristate 13-acetate (PMA), a potent activator of protein kinase C (PKC), induces reactivation of EBV. However, the physiological stimuli responsible for the disruption of viral latency are not well characterized. Transforming growth factor beta 1 (TGF-beta1) has also been shown to trigger the reactivation of EBV in Burkitt lymphoma cell lines; however, the effect of TGF-beta1 on ZEBRA expression has not been reported. To further understand this
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA damage response (DDR) and selective autophagy both can be activated by reactive oxygen/nitrogen species (ROS/RNS), and both are of paramount importance in cancer development. The selective autophagy receptor and ubiquitin (Ub) sensor p62 plays a key role in their crosstalk. ROS production has been well documented in latent infection of oncogenic viruses including Epstein-Barr Virus (EBV). However, p62-mediated selective autophagy and its interplay with DDR have not been investigated in these settings. In this study, we provide evidence that considerable levels of p62-mediated selective aut
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic active Epstein-Barr virus infection (CAEBV) is characterized by chronic infectious mononucleosis-like symptoms associated with very high viral load, as assessed by quantitative polymerase chain reaction. We present an unusual case in a French woman who was followed up over 25 years with cutaneous and sinus lymphoproliferation. This white woman presented with a long history of recurrent cutaneous necrotic papules of the skin, which started during childhood and healed spontaneously with depressed scars. The lesions spread to the left maxillary sinus and were associated with hepatomegaly
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Digestive and liver disease : official journal of the Italian Society of Gastroenterology and the Italian Association for the Study of the Liver2014eng
BACKGROUND: Occult hepatitis B virus infection is defined as detectable HBV-DNA in liver of HBsAg-negative individuals, with or without detectable serum HBV-DNA. In deceased liver donors, results of tissue analysis cannot be obtained prior to allocation for liver transplantation.
AIMS: we investigated prevalence and predictability of occult hepatitis B using blood markers of viral exposure/infection in deceased liver donors.
METHODS: In 50 consecutive HBsAg-negative/anti-HBc-positive and 20 age-matched HBsAg-negative/anti-HBc-negative donors, a nested-PCR assay was employed in liver biopsies
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Вирусные пептиды представлены I классом HLA на инфицированных клетках для активации CD8(+) T клеток. Ряд иммуногенных пептидов был косвенно выявлен путем прогнозирования эпитопов и проверки реакции Т клеток на оксвирусные векторы, включая модифицированный вирус Vaccinia vanka (MVA), который в настоящее время проверяется как вакцины от рекомбинанта или оспы. Однако для разработки оптимальных стратегий вакцинации и иммуномониторинга крайне важно охарактеризовать фактический вирусный репертуар ВИЧ-инфицированных клеток. Мы использовали новаторский подход для идентификации естественно обработанных
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиМашинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Retroviral activation of the AP-1/ATF super family member Jdp2 was recently reported to be a common event in M-MLV-induced T cell lymphoma in p27-null C57x129 mice as compared to wild type-inoculated mice but has not been found important in other models. On the basis of retroviral tag retrieval from 1190 individual Akv- and SL3-3-induced lymphomas, we here report that insertional mutagenesis into the 250-kb Fos/Jdp2/Batf locus is associated with SL3-3 MLV-induced T but not Akv-induced B cell lymphomas of NMRI and SWR mice. Integration pattern and clonality analyses suggest that Jdp2 participat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HHV-6, the first T-lymphotropic human herpesvirus, is an important novel human pathogen. It is the cause of exanthem subitum in infants and may act as an opportunistic agent in immunocompromised patients. Moreover, several lines of clinical and experimental evidence suggest that HHV-6 may accelerate the progression of HIV infection. Progress in the study of HHV-6 has been rapid, in part as a consequence of the strong current interest in human lymphotropic viruses and their relationship with the immune system. Nonetheless, the full spectrum of diseases linked to this agent is still unknown (Tab
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Current HIV/AIDS treatments effectively reduce viral loads to undetectable levels as measured by conventional clinical assays, but immune recovery remains highly variable among patients. To assess the long-term treatment efficacy, we propose a mathematical model that incorporates latently infected CD4 + T cells and the homeostatic proliferation of CD4 + T cells. We investigate the dynamics of this model both theoretically and numerically, demonstrating that homeostatic proliferation can induce bistability, which implies that steady-state CD4 + T cell count is sensitively affected by i
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antiretroviral therapy (ART) is typically composed of a combination of three antiretroviral drugs and is the treatment of choice for people with human immunodeficiency virus type 1/acquired immune deficiency syndrome (HIV-1/AIDS). However, it is unable to impact on viral reservoirs, which harbour latent HIV-1 genomes that are able to reignite the infection upon treatment suspension. The aim of this study was to provide an estimate of the safety of the disease-modifying antirheumatic agent auranofin and its impact on the HIV-1 reservoir in humans under intensified ART. For this purpose, an inte
СтатьяРандомизированное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования