Prion diseases or Transmissible Spongiform Encephalopathies (TSEs) are a group of fatal neurodegenerative disorders affecting several mammalian species. Its causative agent, disease-associated prion protein (PrPd), is a self-propagating β-sheet rich aberrant conformation of the cellular prion protein (PrPC) with neurotoxic and aggregation-prone properties, capable of inducing misfolding of PrPC molecules. PrPd is the major constituent of prions and, most importantly, is the first known example of a protein with infectious attributes. It has been suggested that similar molecular mechanisms coul
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent studies have identified phosphoglucomutase 1 (PGM1) deficiency as an inherited metabolic disorder in humans. Affected patients show m … ow dramatic reductions in enzyme activity, with kcat/Km often <1.5% of wild-type. Modest changes in protein conformation and flexibility are also apparent in some of the catalytically impaired variants. In the case of the G291R mutant, severely compromised activity is linked to the inability of a key active site serine to be phosphorylated, a prerequisite for catalysi …
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Yuanhuacine (YHL-14), the major component of daphnane diterpene ester isolated from the flower buds of Daphne genkwa, has been reported to have activity against cell proliferation in various cancer cell lines. Nevertheless, the potential mechanism has not been explored yet. Here we demonstrate that YHL-14 inhibits bladder and colon cancer cell growth through up-regulation of p21 expression in an Sp1-dependent manner. We found that YHL-14 treatment resulted in up-regulation of p21 expression and a significant G2/M phase arrest in T24T and HCT116 cells without affecting p53 protein expression an
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Slug, a Snail-related zinc-finger transcription factor implicated in the increased motility of mesenchymal cells during embryonic development and progression of cancer cells towards an invasive phenotype, plays a specific and critical role in the pathogenesis of Bcr-Abl-associated leukemias. Here we report that Slug over-expression associated with Bcr-Abl is conditional upon the tyrosine kinase (TK) activity of 210 fusion protein. Slug over-expression is driven by transcriptional events eventually integrated by post-transcriptional mechanisms leading to protein stabilization and is at least pa
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alpha-synuclein (alpha-syn), a protein implicated in Parkinson's disease, is structurally diverse. In addition to its random-coil state, alpha-syn can adopt an alpha-helical structure upon lipid membrane binding or a beta-sheet structure upon aggregation. We used yeast biology and in vitro biochemistry to detect how sequence changes alter the structural propensity of alpha-syn. The N-terminus of the protein, which adopts an alpha-helical conformation upon lipid binding, is essential for membrane binding in yeast, and variants that are more prone to forming an alpha-helical structure in vitro a
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinal muscular atrophy (SMA) is caused by deletion or mutation of both copies of the SMN1 gene, which produces an essential protein known as SMN. The severity of SMA is modified by variable copy number of a second gene,SMN2, which produces an mRNA that is incorrectly spliced with deletion of the last exon. We described previously the discovery of potent C5-substituted quinazolines that increase SMN2 gene expression by 2-fold. Discovery of potent SMN2 promoter inducers relied on a cellular assay without knowledge of the molecular target. Using protein microarray scanning with a radiolabeled C5
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A functionally defective protein C (PC)-Mie, detected the plasma of a patient with hereditary thrombophilia, has Lys substituted for gamma-carboxyglutamic acid (Gla)26 residue. The activation rate of PC-Mie by Protac or thrombin in the absence of Ca2+ and that by thrombin with native thrombomodulin (TM), recombinant soluble truncated TM or on cultured endothelial cells in the presence of Ca2+ were all apparently lower than that of normal PC. The anticoagulant activity of Protac-activated PC (APC)-Mie on the plasma clotting time and the rate of inactivation of factor Va by APC-Mie in the presen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To elucidate the molecular basis of band 3 deficiency in a recently defined subset of patients with autosomal dominant hereditary spherocytosis (HS), we screened band 3 cDNA for single-strand conformation polymorphism (SSCP). In 5 of 17 (29%) unrelated HS subjects with band 3 deficiency, we detected substitutions R760W, R760Q, R808C, and R870W that were all coinherited with the HS phenotype. The involved arginines are highly conserved throughout evolution. To examine whether or not the product of the mutant allele is inserted into the membrane, we studied one HS subject who was doubly heterozy
Клиническое исследованиеСравнительное исследованиеКонтролируемое клиническое исследованиеСтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteopetrosis is a genetic bone disease characterized by increased bone density and fragility. The R444L missense mutation in the human V-AT … f osteoclastogenesis. Limited proteolysis studies suggested that the R445L mutation alters mouse a3 protein conformation. Together, these data suggest that Arg-445 plays a role in protein folding, or stability, and that infantile malignant osteopetrosis caused by the R444L mutation in the human V-ATPase a3 subunit is another member of the growing class of protein fold …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aromatic amino acids buried inside folded proteins play a critical role in stabilizing both the folded conformation and anchoring incoming substrate molecules. Moreover, their ring flips serve as sensitive probes of protein breathing motions. In this work, we accurately estimate the ring-flip rates of a phenylalanine residue in cytochrome C from MD simulations using enhanced sampling methods and advanced rate theories, such as the reactive flux formalism and Grote-Hynes theory (GHT). We demonstrate that the combined steric hindrance from the residues adjacent to the ring, along with their dela
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mimotopes selected by phage display have been used for antibody epitope mapping for nearly four decades, but residue-level recovery of functional epitopes has remained unreliable. This is not a problem of algorithms but of assumptions: mimotopes recapitulate native epitope recognition through compensatory interaction networks that preserve binding energetics, without conserving sequence or surface geometry. Predictors trained on sequence similarity or static interface geometry therefore miss the residues that drive recognition. We present a physics-based workflow that refines antibody-bound mi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In phytochromes, photoisomerization of the chromophore and subsequent structural relaxations lead to the functionally essential secondary structure transition of the tongue, a phytochrome-specific protein segment. The coupling mechanism between chromophore and protein structural changes is yet not understood, but electric field changes are discussed to play an important role. In this work, electric field changes in the chromophore binding pocket (CBP) are confirmed to propagate over long distances through the protein and alter the electric field in the tongue region. An experimental-theoretica
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nature's fibrous proteins, such as α-keratin, achieve remarkable mechanical properties by undergoing strain-induced α-to-β conformational transitions. Inspired by these materials, we report a strategy for designing synthetic polypeptides that undergo similar transformations at elevated temperatures far exceeding keratin's operational range. By employing helix-confined ring-opening polymerization (ROP) of N-carboxyanhydrides (NCAs) initiated by a short poly(γ-benzyl-l-glutamate) (PBLG) precursor, we synthesized poly(O-benzyl-l-serine) (PBLS) chains that adopt an α-helical structure yet transiti
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The principle of structure dictating properties is illustrated by the direct correlation between cyclic peptide conformation and their biological efficacy. Plecanatide, a synthetic analog of uroguanylin, has received FDA approval for the treatment of chronic idiopathic constipation and irritable bowel syndrome with constipation. Nevertheless, our investigation has revealed that plecanatide undergoes slow conformational interconversion in slightly acidic conditions. In response, propargylglycine is strategically incorporated at the carboxyl terminal of plecanatide, a modification that not only
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cyclic peptides are an important class of pharmaceutical drugs. We used replica-exchange molecular dynamics (REMD) and simulated tempering (ST) simulations to explore the conformational landscape of a set of nine cyclic peptides. The N-ter to C-ter backbone-cyclized peptides of 7-10 residues were previously designed for high conformational stability with a mixture of l- and d-amino acids. Their experimental NMR structures are available in the protein data bank (PDB). For each peptide, we tested several force fields, namely, Amber96, Amber14, RSFF2C, and Charmm36m in implicit and explicit solve
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The present work reports the results of a computational study aimed at characterizing the conformational profile of Balaram's peptide (Ace-Leu-Val-Val-Aib-Gly-Leu-Val-Val-NHMe) in different solvents, including chloroform, dimethyl sulfoxide, methanol and water. For this purpose, 10 μs molecular dynamics trajectories were computed in explicit solvents for each system, starting from an extended conformation. The results of the present study confirm the former NMR and CD findings and provide further insights that permit fine-tuning of the conclusions previously derived. The present results show t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acyl-coenzyme A-dependent N-acetyltransferases (AACs) catalyze the modification of aminoglycosides rendering the bacteria carrying such enzymes resistant to this class of antibiotics. Here we present the crystal structure of AAC(3)-Ia enzyme from Serratia marcescens in complex with coenzyme A determined to 1.8 Å resolution. This enzyme served as an architype for the AAC enzymes targeting the amino group at Position 3 of aminoglycoside main aminocyclitol ring. The structure of this enzyme has been previously determined only in truncated form and was interpreted as distinct from subsequently cha
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The pseudosymmetric relationship of the bacterial sialic acid, pseudaminic acid, and 3-deoxy-d-manno-oct-2-ulosonic acid (KDO) affords the hypothesis that suitably protected KDO donors will adopt the trans, gauche conformation of their side chain and consequently be highly equatorially selective in their coupling reactions conducted at low temperature. This hypothesis is borne out by the synthesis, conformational analysis, and excellent equatorial selectivity seen on coupling of per-O-acetyl or benzyl-protected KDO donors in dichloromethane at -78 °C. Mechanistic understanding of glycosylation
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We briefly introduce the most common lysosomal storage disorder, Gaucher disease, concisely describe the Food and Drug Administration approved strategies to ameliorate Gaucher disease, and then outline the emerging pharmacologic chaperone strategy that offers the promise to remedy this malady.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The transmissible spongiform encephalopathies (TSE), or prion diseases, are a group of rare, fatal, and transmissible neurodegenerative diseases of mammals for which there are no known viral or bacterial etiological agents. The bovine form of these diseases, bovine spongiform encephalopathy (BSE), has crossed over into humans to cause variant Creutzfeldt-Jakob disease. As a result, BSE and the TSE diseases are now considered a significant threat to human health. Understanding the basic mechanisms of TSE pathogenesis is essential for the development of effective TSE diagnostic tests and anti-TS
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования