LINC01615, a long noncoding RNA, plays a pivotal role in the progression of kidney renal clear cell carcinoma (KIRC). This study aimed to assess the prognostic value of LINC01615-associated genes in KIRC by developing a risk model. Differential expression analysis in the The Cancer Genome Atlas-KIRC dataset identified differentially expressed genes between high and low LINC01615 expression groups, as well as between KIRC and control groups. Signature genes were subsequently selected through protein-protein interaction (PPI) network analysis, while prognostic genes were identified via Cox regre
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Circulating miRNAs (c-miRNAs) are promising non-invasive biomarkers for breast cancer detection, but reproducible signatures remain limited. This study aimed to identify a circulating miRNA signature for invasive ductal breast carcinoma, evaluate its discriminatory performance in an independent serum cohort, and explore the biological context of the selected c-miRNAs.
METHODS AND RESULTS: Serum expression of 21 candidate c-miRNAs was analyzed by RT-qPCR in 46 treatment-naive invasive ductal breast carcinoma patients and 46 healthy controls. Whole-blood expression of immune checkpo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Clear cell renal cell carcinoma (ccRCC) exhibits substantial molecular and immune heterogeneity. Mast cells participate in tumor-microenvironment remodeling, but the prognostic relevance of mast cell-associated apoptosis-related transcriptional features remains unclear.
METHODS: Single-cell RNA sequencing was used to identify mast cells in ccRCC. Genes associated with the annotated mast-cell cluster were intersected with the HALLMARK_APOPTOSIS gene set to develop a mast cell-associated apoptosis score (MCAS) using machine-learning survival algorithms. MCAS was evaluated in TCGA-KI
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: This study aims to integrate CT (Computed Tomography) radiomic features, gene expression profiles, and clinical data to identify radiogenomic biomarkers and improve overall survival prediction in gastric cancer (GC) patients.
PROCEDURES: Quantitative radiomic analysis was performed on 37 GC CT images, alongside gene expression and clinical data, to identify biomarkers associated with overall survival. Tumor segmentation and radiomic feature extraction were followed by Pearson correlation for feature selection. Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) identified pathways linking gene expre
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Brain metastasis has a high incidence and poor prognosis in lung adenocarcinoma (LUAD). We sought to identify genes associated with LUAD brain metastasis and with the prognosis of patients with LUAD. Differential gene expression analysis was performed on LUAD patients with and without distant metastasis from the Cancer Genome Atlas (TCGA) database and LUAD patients with and without brain metastasis from the GEO GSE14108 and GSE10072 data sets. Subsequently, a LASSO model was constructed using the genes differentially expressed in both analyses to screen for prognostic genes. A risk model based
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Combined hepatocellular carcinoma-cholangiocarcinoma (HCC-CCA) is a rare liver tumor comprising histologic features of both HCC and CCA. Due to its heterogeneous nature, treatment of combined HCC-CCA is a significant clinical challenge and prognosis remains poor. Therefore, further understanding of the tumor biology underlying the individual subtypes of this mixed tumor is required to improve treatment stratification and optimize treatment strategies. This study sought to identify altered epigenetic regulation and gene expression patterns in the individual components of combined HCC-CCA. Forma
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biological processes intricately intertwine with tumorigenesis, significantly influencing treatment outcomes and prognosis. However, the mechanisms fostering mucoepidermoid carcinoma (MEC) remain inadequately elucidated. This research utilizes expression profiles of lncRNAs from clinical MEC tissues and matched normal glandular tissues, integrating public data to explore the biological mechanisms and immune microenvironment characteristics of tumorigenesis. Gene set enrichment analysis identified key pathways, and a customized epithelial-mesenchymal transition (EMT) score elucidated the relati
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Predicting disease prognosis and the efficacy of immunotherapy presents a significant challenge in the treatment of hepatocellular carcinoma (HCC). By analyzing transcriptome sequencing data from 69 patients and identifying differentially expressed immune genes, a prognostic index named the immune-related gene prognostic index (IRGPI) was established by Lasso-Cox regression. The IRGPI, which consists of six key genes, was found to be a significant predictor of poor prognosis in patients with high IRGPI scores. The model's predictive accuracy was confirmed via receiver operating characteristic
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Multiple myeloma (MM) exhibits significant heterogeneity, leading to variable treatment responses and poor clinical outcomes. Glutamine metabolism-related genes (GMRGs) represent critical regulators of tumor biology, yet their prognostic and therapeutic significance in MM remains unexplored. This study aims to identify GMRG-driven tumor signatures and establish their clinical utility as prognostic biomarkers, therapeutic targets and enhancers of drug sensitivity.
METHODS: Integrated transcriptomic and single-cell sequencing analyses of public multi-omics cohorts enabled systematic
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The adenoma-adenocarcinoma pathway represents a crucial mechanism underlying the development of colorectal precancerous lesions, encompassing approximately 85%-90% of colorectal cancer (CRC). Elucidating the molecular mechanisms underlying colorectal cancer progression is of paramount importance for achieving early and accurate diagnosis as well as effective treatment. We collected peripheral blood mononuclear cells (PBMC) from healthy controls, adenoma patients, and adenocarcinoma patients, and performed transcriptomic profiling to characterize dynamic gene expression during carcinogenesis. D
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Prostate adenocarcinoma (PRAD) is a leading cause of male mortality, with NK/T cell communication being key areas of the research.
METHODS: The Seurat package was utilized to normalize and reduce the dimensionality of the single-cell data, and CellMarker 2.0 was employed for cell annotation. CellChat was utilized to construct the ligand-receptor interaction network of cell subsets. Differentially expressed genes (DEGs) were filtered by the limma package. Univariate Cox and the LASSO regression in the glmnet package were used to obtain biomarkers and develop a risk model. The survm
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Myeloid cell differentiation (MCD) has an important correlation with prostate cancer (PCa), but the mechanism of action of the former in the latter is still under investigation. This study designed to investigate the prognostic genes related to MCD in PCa and the associated mechanisms.
METHODS: The related data were downloaded from public databases. Differentially expressed genes (DEGs) were intersected with MCD related genes (MCDRGs) to acquire candidate genes. Candidate prognostic genes with a causal relationship to PCa were further obtained through Mendelian randomization (MR).
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hepatocellular Carcinoma (HCC) is closely linked to inflammatory reactions, with chronic liver diseases acting as major risk factors. In the inflammatory microenvironment, repeated damage and repair of liver cells lead to genetic mutations, abnormal proliferation, and tumorigenesis.
OBJECTIVE: This study aimed to investigate the expression profile of specific cell clusters under inflammatory stimulation in HCC and identify potential therapeutic drugs.
METHODS: Comprehensive analysis of HCC transcriptome data and single-cell sequencing data from TCGA, ICGC, and GEO databases was c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hederagenin is a triterpenoid compound extracted from ivy leaves and other natural plant sources. Despite the prominent roles that hederagenin assumes in the fight against cancers, its mechanisms in anti-prostate cancer (PCa) remain inadequately comprehended. In this present study, we found that hederagenin effectively inhibited the proliferation and migration of PCa cells by inducing apoptosis in a dose-dependent manner. Transcriptome analysis and metabolic alterations were employed to identify potential molecular targets and pathways of Hederagenin on PCa cells. RNA-seq analysis discerned 74
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
While the development of innovative drugs has improved the outcomes of various cancers in recent years, the number of patients with oral squamous cell carcinoma (OSCC) and mortality rates has not yet decreased significantly. This could be attributed to the prognostic and molecular differences occurring at different locations of cancer development. In this study, we conducted gene expression, DNA methylation, and tumor immunological analyses of gingival squamous cell carcinoma (GSCC) and tongue squamous cell carcinoma (TSCC) to elucidate the characteristic gene expression changes, their mechani
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatocellular carcinoma (HCC) is the primary form of liver cancer that poses a significant global health concern due to its increasing incidence rates and diverse etiology. Chronic infection induced by hepatitis B virus (HBV) is a prominent etiological factor influencing the development of HCC. Although recent advances in multi-omics approaches have facilitated extensive exploration of HCC molecular characteristics, translating the characteristics of subtypes into clinical applications has been challenging due to parameters like limited sample size and complex classifiers for early detection.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cervical cancer (CC) represents a major public health concern, ranking as the fourth most frequently diagnosed cancer and one of the leading causes of cancer-related mortality among middle-aged women worldwide. CC is caused by persistent infection with high-risk human papillomaviruses (HR-HPVs), with HPV 16 being the cause of more than 50% of CC cases. In this study, the exometabolome of the HPV 16-positive cell lines SiHa and Ca Ski, as well as the HPV 16-negative control cell line C-33 A, was evaluated. The exometabolome was validated through molecular signatures using a transcriptomic appro
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding and accurate diagnosis of lymph node metastasis (LNM) for patients with colorectal cancer (CRC) is essential to determine treatment and follow-up strategies. Therefore, in this study, we aimed to elucidate the biological process and identify the potential biomarker for LNM in CRC.A total of 30 patients who received a histologically confirmed diagnosis of CRC with Stage I to III and a curative surgery between November 2020 and July 2021 at Kyung Hee university hospital at Gangdong were included. We performed multi-omics approach integrating the data on somatic mutation, transcript
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To investigate the expression profile, clinical significance, and underlying molecular mechanisms of C1orf112 in endometrial cancer (EC).
METHODS: We performed bioinformatics analyses using data from The Cancer Genome Atlas to evaluate C1orf112 expression and its association with clinicopathological parameters in EC. Gene Ontology and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes enrichment analyses, as well as protein-protein interaction network analysis, were conducted to explore the functional roles and regulatory pathways of C1orf112. A multi-omics integrative approach was used to el
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mixed invasive ductal and lobular carcinoma (MDLC) is a rare histologic subtype of breast cancer displaying both E-cadherin positive ductal and E-cadherin negative lobular morphologies within the same tumor, posing challenges with regard to anticipated clinical management. It remains unclear whether these distinct morphologies also have distinct biology and risk of recurrence. Our spatially resolved transcriptomic, genomic, and single-cell profiling revealed clinically significant differences between ductal and lobular tumor regions including distinct intrinsic subtype heterogeneity - e.g., MD
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования