Penile cancer is a rare neoplasm that seems to be linked to socio-economic differences. Mitochondrial genome alterations are common in many tumors types and are reported as regulating oxidative metabolism and impacting tumorigenesis. In this study, we evaluate for the first time the mitochondrial genome in penile carcinoma (PeCa), aiming to evaluate heteroplasmy, mitochondrial DNA (mtDNA) mutational load and mtDNA content in Penile tumors. Using next generation sequencing (NGS), we sequenced the mitochondrial genome of 13 penile tumors and 12 non-neoplastic tissue samples, which allowed us to
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Craniosynostosis refers to a condition during early development in which one or more of the fibrous sutures of the skull prematurely fuse by turning into bone, which produces recognizable patterns of cranial shape malformations depending on which suture(s) are affected. In addition to cases with isolated cranial dysmorphologies, craniosynostosis appears in syndromes that include skeletal features of the eyes, nose, palate, hands, and feet as well as impairment of vision, hearing, and intellectual development. Approximately 85% of the cases are nonsyndromic sporadic and emerge after de novo str
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Morphinan-based painkillers are derived from opium poppy (Papaver somniferum L.). We report a draft of the opium poppy genome, with 2.72 gigabases assembled into 11 chromosomes with contig N50 and scaffold N50 of 1.77 and 204 megabases, respectively. Synteny analysis suggests a whole-genome duplication at ~7.8 million years ago and ancient segmental or whole-genome duplication(s) that occurred before the Papaveraceae-Ranunculaceae divergence 110 million years ago. Syntenic blocks representative of phthalideisoquinoline and morphinan components of a benzylisoquinoline alkaloid cluster of 15 gen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Signature-tagged mutagenesis (STM) is a functional genomics approach to identify bacterial virulence determinants and virulence factors by simultaneously screening multiple mutants in a single host animal, and has been utilized extensively for the study of bacterial pathogenesis, host-pathogen interactions, and spirochete and tick biology. The signature-tagged transposon mutagenesis has been developed to investigate virulence determinants and pathogenesis of Borrelia burgdorferi. Mutants in genes important in virulence are identified by negative selection in which the mutants fail to colonize…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thymic carcinoma (TC) is a rare cancer whose genomic features have been examined in only a limited number of patients of European descent. Here, we characterized both genomic and epigenomic aberrations by whole exome sequencing, RNA sequencing, methylation array and copy number analyses in TCs from Asian patients and compared them with those in TCs from USA/European patients. Samples analyzed were 10 pairs of snap-frozen surgical specimens of cancerous and non-cancerous thymic tissue. All 10 cases were Japanese patients treated at the National Cancer Center Hospital, Japan, between 1994 and 20
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Myxomatosis is a recurrent problem on rabbit farms throughout Europe despite the success of vaccines. To identify gene variations of field and vaccine strains that may be responsible for changes in virulence, immunomodulation, and immunoprotection, the genomes of 6 myxoma virus (MYXV) strains were sequenced: German field isolates Munich-1, FLI-H, 2604, and 3207; vaccine strain MAV; and challenge strain ZA. The analyzed genomes ranged from 147.6 kb (strain MAV) to 161.8 kb (strain 3207). All sequences were affected by several mutations, covering 24 to 93 open reading frames (ORFs) a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The massive molecular profiling of thousands of cancer patients has led to the identification of many tumor type specific driver genes. However, only a few (or none) of them are present in each individual tumor and, to enable precision oncology, we need to interpret the alterations found in a single patient. Cancer PanorOmics (http://panoromics.irbbarcelona.org) is a web-based resource to contextualize genomic variations detected in a personal cancer genome within the body of clinical and scientific evidence available for 26 tumor types, offering complementary cohort- and patient-centric views
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Arthritis represents a family of complex joint pathologies responsible for the majority of musculoskeletal conditions. Nearly all diseases w … form for human disease modeling. We summarize new evidence from genome-wide association studies and genomics that substantiates a genetic basis for arthritis pathogenesis. We also review the potential contributions of genome engineering in the development of new arthritis therapeutics.
СтатьяОбзорПоддержка правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fusobacterium nucleatum is considered to be a key oral bacterium in recruiting periodontal pathogens into subgingival dental plaque. Currently F. nucleatum can be subdivided into five subspecies. Our previous genome analysis of F. nucleatum W1481 (referred to hereafter as W1481), isolated from an 8-mm periodontal pocket in a patient with chronic periodontitis, suggested the possibility of a new subspecies. To further investigate the biology and relationships of this possible subspecies with other known subspecies, we performed comparative analysis between W1481 and 35 genome sequences represen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite advances in diagnostics, less than 5% of patients with periampullary tumors experience an overall survival of five years or more. Pe … and 18q21/22 were associated with cell cycle, apoptosis, and p53 and Wnt signaling. By integrating genomics and transcriptomics data from the same patients, we identified CCNE1 and ERBB2 as candidate driver genes. Morphologic subtypes of periampullary adenocarcinomas (i.e., pancreatobiliary or intestinal) harbor many common genomic aberrations. However, g …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Currently, prognostication in primary myelofibrosis (PMF) relies on the International Prognostic Scoring System (IPSS), dynamic IPSS (DIPSS), and DIPSS-plus, which incorporate age, blood counts, constitutional symptoms, circulating blasts, red cell transfusion need, and karyotype. Although the JAK2 V617F mutation was discovered a decade ago and MPL mutations shortly thereafter, it was the recent discovery of CALR mutations in the vast majority of JAK2/MPL-unmutated patients and recognition of the powerful impact of CALR mutations and triple-negative (JAK2/MPL/CALR-negative) status on outcome t
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human genomes are continuously subjected to mutations, which can drive genetic diseases and cancer. An intriguing recent finding has been the discovery of chromothripsis, a spectacular and complex form of chromosome rearrangement that can occur in the genomes of cancer cells and patients with congenital diseases. Chromothripsis has been described in a large array of human cancers and various types of chromothripsis have appeared, which differ in complexity and genomic hallmarks. From the combined genomic data a consensus hypothesis has been inferred, involving aberrant DNA replication and chro
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Influenza epidemics and pandemics have significant impacts on economies, morbidity and mortality worldwide. The ability to rapidly and accurately sequence influenza viruses is instrumental in the prevention and mitigation of influenza. All eight influenza genes from an influenza A virus were amplified by PCR simultaneously and then subjected to sequencing on a MinION nanopore sequencer. A complete influenza virus genome was obtained that shared greater than 99% identity with sequence data obtained from Illumina MiSeq and traditional Sanger-sequencing. The laboratory infrastructure and computin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE OF REVIEW: After the study of the gene code as a trigger for obesity, epigenetic code has appeared as a novel tool in the diagnosis, prognosis and treatment of obesity, and its related comorbidities. This review summarizes the status of the epigenetic field associated with obesity, and the current epigenetic-based approaches for obesity treatment.
RECENT FINDINGS: Thanks to technical advances, novel and key obesity-associated polymorphisms have been described by genome-wide association studies, but there are limitations with their predictive power. Epigenetics is also studied for dise
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The following, from the 12th OESO World Conference: Cancers of the Esophagus, includes commentaries on comparative genomic analysis of esophageal cancers: genomic polymorphisms, the genetic and epigenetic drivers in esophageal cancers, and the collection of data in the UK Barrett's Oesophagus Registry.
Сравнительное исследованиеConference ProceedingsПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pediatric tumors are relatively infrequent, but are often associated with significant lethality and lifelong morbidity. A major goal of pediatric cancer research has been to identify key drivers of tumorigenesis to eventually develop targeted therapies to enhance cure rate and minimize acute and long-term toxic effects. Here, we used genomic approaches to identify biomarkers and candidate drivers for fibrolamellar hepatocellular carcinoma (FL-HCC), a very rare subtype of pediatric liver cancer for which limited therapeutic options exist. In-depth genomic analyses of one tumor followed by immun
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To teach first-year (P1) pharmacy students to apply the principles of pharmacogenomics underlying clinical pharmacotherapeutics to cancer patients.
DESIGN: Using polymerase chain reaction (PCR) and high-resolution melting analysis of deoxyribonucleic acid (DNA) from colorectal cancer cell lines to determine the presence of somatic mutations for an oncogenic marker, students formulated the proper course of treatment for a patient with similar tumor genomics.
ASSESSMENT: In a postintervention survey, students highly rated the effectiveness of the laboratory session for learning pha…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ELG1 is a conserved gene uncovered in a number of genetic screens in yeast aimed at identifying factors important in the maintenance of genome stability. Elg1's activity prevents gross chromosomal rearrangements, maintains proper telomere length regulation, helps repairing DNA damage created by a number of genotoxins and participates in sister chromatid cohesion. Elg1 is evolutionarily conserved, and its mammalian ortholog (also known as ATAD5) is embryonic lethal when lost in mice, acts as a tumor suppressor in mice and humans, exhibits physical interactions with components of the human Fanco
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To identify single-nucleotide polymorphisms (SNPs) and pathways associated with bronchopulmonary dysplasia (BPD) because O2 requirement at 36 weeks' postmenstrual age risk is strongly influenced by heritable factors.
STUDY DESIGN: A genome-wide scan was conducted on 1.2 million genotyped SNPs, and an additional 7 million imputed SNPs, using a DNA repository of extremely low birth weight infants. Genome-wide association and gene set analysis was performed for BPD or death, severe BPD or death, and severe BPD in survivors. Specific targets were validated via the use of gene expressio
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We constructed a 400K WG tiling oligoarray for the horse and applied it for the discovery of copy number variations (CNVs) in 38 normal horses of 16 diverse breeds, and the Przewalski horse. Probes on the array represented 18,763 autosomal and X-linked genes, and intergenic, sub-telomeric and chrY sequences. We identified 258 CNV regions (CNVRs) across all autosomes, chrX and chrUn, but not in chrY. CNVs comprised 1.3% of the horse genome with chr12 being most enriched. American Miniature horses had the highest and American Quarter Horses the lowest number of CNVs in relation to Thoroughbred r
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования