Bacteriophage-antibiotic coadministration is increasingly used for refractory infections, yet the in vivo interactions among phages, bacteria, antibiotics, and host immunity remain poorly defined. We report a longitudinal, multiomic case analysis of a male in his seventies with cystic fibrosis (CF) experiencing an acute-on-chronic pulmonary exacerbation caused by multidrug-resistant (MDR) Pseudomonas aeruginosa. After colistin discontinuation due to nephrotoxicity, ciprofloxacin was initiated, with an intravenous two-phage cocktail introduced days later. Distinct mucoid and nonmucoid bacterial
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lactiplantibacillus plantarum is a metabolically versatile lactic acid bacterium found in fermented foods and the human gastrointestinal tract. Its relatively large genome (3.0-3.6 Mb) features an open pan-genome with 1,436-2,100 core genes and over 13,000 cloud genes, enabling remarkable adaptation to diverse environments. This species encodes a diverse repertoire of CAZymes that degrade plant polysaccharides and host glycans, yielding short-chain fatty acids that modulate epithelial barrier integrity, host metabolism, and immune signaling. Pattern-recognition receptors (PRRs, including TLR2,
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microplastics (MPs) have emerged as serious ecological pollutants that harbor diverse microbial communities in their biofilm ecosystem terme … ogical opportunities, this review underlines the plastisphere paradox and highlights the demand for multiomics-driven One Health approaches to bring forth the interconnected challenges of MPs pollution, AMR, and bioremediation. This exploration yields promising avenues for developing integrated strategies that can address both persistent microplastic polluti …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bulk sequencing of relapsed tumors reveals mutations associated with resistance to cancer therapy but is insufficient to fully assess all causes of relapse. Because of inherent tumor heterogeneity, on-treatment tumor evolution may select genetically distinct clones or shifts in malignant transcriptional states not resolvable by bulk sequencing. We performed multiomic single-cell DNA/protein and RNA/protein profiling of a clinical trial cohort of patients with acute myeloid leukemia (AML) treated on the phase 1b clinical trial of the BCL2 inhibitor venetoclax and the FLT3 inhibitor gilteritinib
Клиническое исследование I фазыСтатьяМногоцентровое исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human maternal-fetal interface is characterized by mosaic intermingling of maternal and fetal cells1. Yet the underlying cellular, molecular and spatial programmes remain incompletely defined. Here we generate a comprehensive atlas of the human maternal-fetal interface across normal pregnancies from early gestation to term by integrating large-scale paired single-nucleus transcriptomic and chromatin accessibility profiling with submicrometre-resolution spatial transcriptomics and CODEX multiplex protein imaging2, substantially boosting the spatiotemporal resolution of prior research3. This
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Immune checkpoint blockers (ICB) improve outcomes in metastatic melanoma (MM), but resistance limits benefit. This phase I/II (NCT02706353) study evaluated intratumoral sotigalimab (anti-CD40 agonist) with pembrolizumab in 32 patients with ICB-naïve MM. Primary endpoints were safety and objective response rate (ORR). Sotigalimab was well tolerated. At the recommended phase II dose, the ORR was 50%, and the disease control rate was 92%, with ORRs of 67% in injected and 50% in non-injected tumors. Multiomic analyses of tumor and blood showed that sotigalimab effectively engaged the C
СтатьяКлиническое исследование I фазыКлиническое исследование II фазыПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The pancreatic tissue is composite and plastic. The epigenetic makeup of different cell types is poorly characterized due to the lack of protocols that enable efficient recovery of epithelial cells. Here, we improve the canonical pipeline for single-cell analysis, optimizing the harvesting of nuclei from hard-to-dissociate tissues. We provide an in-depth mapping of the murine pancreas through paired RNA/ATAC multiomic single-nucleus sequencing, documenting the transcriptomic and chromatin accessibility profiles of every cell in the parenchyma. This enables a superior examination of the exocrin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Insulin resistance (IR) and Type 2 diabetes mellitus (DM) are intricately related metabolic conditions that significantly contribute to the … rm studies, adopting standardized definitions, and implementing precision medicine applications via multiomics approaches. Recognition of IR as both a driver and consequence of diabetes emphasizes the urgent necessity for targeted and comprehensive strategies that address its progression and root causes across different populations.
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Multiple myeloma is marked by recurrent cytogenetic abnormalities and mutations that accumulate as the disease progresses. In this study, we sought to elucidate the transitions driving tumorigenesis and therapy resistance in multiple myeloma using a unique cohort of nearly 900 patients spanning premalignant to late-stage refractory multiple myeloma, comprehensively characterized at molecular and clinical levels. Waves of epigenetic dysregulation drove these critical transitions. In this paradigm, genomic and cytogenetic events unlocked epigenetic plasticity, reshaping multiple myel
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Omics technologies enable deep profiling of human atherosclerosis but have mostly been applied in small studies lacking integration with other data modalities. AtherOMICS is a biobanking project linking multiomic atherosclerotic plaque phenotyping with blood biobanking, in vivo imaging, and clinical data. Here, we present the study protocol and show pilot results that demonstrate technical feasibility. Since August 2022, 246 patients scheduled to undergo carotid or femoral endarterectomy at Ludwig-Maximilians-Universität Klinikum (Munich, Germany), have been enrolled (median age, 73 years; 32%
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lineage plasticity, or transdifferentiation, is increasingly recognized as a resistance mechanism to androgen receptor (AR) inhibition in prostate cancer. Lineage plasticity is characterized by loss of AR signaling and epithelial differentiation, along with activation of stemness-associated pathways, epithelial-mesenchymal transition, or alternative differentiation programs such as neuroendocrine prostate cancer (NEPC). Loss of the tumor suppressors TP53 and RB1 is common in tumors exhibiting lineage plasticity; however, the mechanisms by which TP53/RB1 loss promotes this phenotype remain poor
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To identify therapeutic targets limiting glioblastoma invasion, we applied druggable genome CRISPRi screens and multiomic analysis to patient-derived glioblastoma cells in micro-dissectible biomimetic 3D hydrogels that permitted separation and analysis of core versus invasive fractions. Of 2,550 genes screened, 12 encoded druggable targets whose suppression limited invasion, of which AURKB (encoding aurora kinase B) and ACP1 (encoding low molecular weight protein tyrosine phosphatase, LMW-PTP) were validated in neurosphere assays and in vivo. Proximity labeling identified cortactin as a link b
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ETV6::RUNX1 leukemia is the second most common subtype of childhood B cell acute lymphoblastic leukemia (B-ALL). Although it generally has a low relapse risk, a significant proportion of B-ALL relapses occur within this subtype due to its relatively high incidence. Measurable residual disease at the end of induction therapy is a well-established biomarker predicting treatment outcomes, while no genomic biomarkers are routinely applied in clinics. In this study, we used multiomic data from ETV6::RUNX1 leukemias to identify genomic features predictive of therapy response at disease presentation.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteoarthritis (OA) is a joint disease with an etiology partially rooted in metabolic dysfunction, yet the underlying mechanisms in this context are not determined, limiting opportunities to develop therapeutic treatments. In this study, we used a multiomic approach combining RNA sequencing, ATAC-seq, MRE-seq, and metabolomics to reveal that OA articular chondrocytes induced by imbalanced transforming growth factor-β (TGF-β) and bone morphogenetic protein (BMP) signaling have increased fatty acid synthesis and oxidation processes regulated by nuclear factor I A (NFIA) up-regulation. Inhibition
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Twenty percent of patients with follicular lymphoma relapse early with poor outcomes; however, the molecular mechanisms underlying this aggressive behavior are unknown. Using a multiomic approach, we show that patients with follicular lymphoma with elevated IRF4 expression (IRF4hi) have increased transformation risk, dysregulated immune signaling, and a suppressive tumor microenvironment. Loss- and gain-of-function experiments in IRF4hi lymphoma cells, along with chromatin profiling, demonstrate that IRF4 impairs their interaction with T cells by repressing antigen presentation and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Human genetic studies have identified several mitochondrial amidoxime-reducing component 1 (MTARC1) variants as protective against metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease. The MTARC1 variants are associated with decreased plasma lipids and liver enzymes and reduced liver-related mortality. However, the role of mARC1 in fatty liver disease is still unclear.
METHODS: Given that mARC1 is mainly expressed in hepatocytes, we developed an N-acetylgalactosamine-conjugated mouse Mtarc1 siRNA, applying it in multiple in vivo models to investigate the role of mARC1 using mu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Drug targets are specific molecules in biological tissues and body fluids that interact with drugs. Drug target discovery is a key component … covery strategies, including computer-assisted approaches, drug affinity response target stability, multiomics analysis, gene editing, and nonsense-mediated mRNA degradation, and discusses the effectiveness and limitations of the various approaches, as well as their application in real cases. Through the review of the aforementioned contents, a general overv …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Temperature-sensitive male sterility is one of the core components for hybrid rice (Oryza sativa) breeding based on the 2-line system. We pr … d mutant displays normal female fertility but complete male sterility at low temperature. Through a multiomics analysis of small RNA (sRNA), degradome, and transcriptome, we found that 21-nt phasiRNAs account for the greatest proportion of the 21-nt sRNA species in rice anthers and are sensitive to low temperature and markedly downregulated in the ago1d muta …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Development of immunocompetent T cells in the thymus is required for effective defence against all types of pathogens, including viruses, bacteria and fungi. To this end, T cells undergo a very strict educational program in the thymus, during which both non-functional and self-reactive T cell clones are eliminated by means of positive and negative selection1.Thymic epithelial cells (TECs) have an indispensable role in these processes, and previous studies have shown the notable heterogeneity of these cells2-7. Here, using multiomic analysis, we provide further insights into the functional and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
High-dimensional immunoprofiling is essential for studying host response to immunotherapy, infection, and disease in murine model systems. However, the difficulty of multiparameter panel design combined with a lack of existing murine tools has prevented the comprehensive study of all major leukocyte phenotypes in a single assay. Herein, we present a 40-color flow cytometry panel for deep immunophenotyping of murine lymphoid tissues, including the spleen, blood, Peyer's patches, inguinal lymph nodes, bone marrow, and thymus. This panel uses a robust set of surface markers capable of differentia
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования