Inherited platelet disorders (IPDs) have a diverse spectrum of clinical features, such as bleeding tendencies of varying intensities, and possible extra-organ involvement (ie, syndromic features). The clinical and laboratory diagnosis of IPDs remains challenging primarily due to the absence of highly specific platelet function assays and the overlapping nature of clinical and laboratory characteristics. Recently, genetic testing, using next-generation sequencing, has gradually become pivotal in the laboratory evaluation of patients with suspected IPDs. A comprehensive clinical and laboratory t
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Congenital dyserythropoietic anaemia type I (CDA-I) is a rare inherited bone marrow failure syndrome characterized by ineffective erythropoiesis and distinct morphological abnormalities of erythroblasts. CDA-I is primarily caused by biallelic pathogenic variants in CDAN1, while mutations in C15ORF41 account for a much rarer subtype, classified as CDA-Ib. Reports of C15ORF41-associated CDA-I from the Indian population are extremely limited.
METHODS: We investigated a transfusion-dependent male child presenting with neonatal jaundice and persistent anaemia. Hematological evaluation
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HIV-1 diversified for decades within the Democratic Republic of the Congo (DRC) before spreading globally in the early 1980s. Thus, the DRC is home to some of the most ancestral and diverse HIV-1 strains. Recent serosurveys conducted from 2017 to 2019 in Kinshasa, DRC, indicated high prevalence of HIV-1, yet sequence data is lacking from this period. Given the history of circulating rare HIV-1 subtypes in the DRC, a viral whole-genome sequencing study was conducted to determine current diversity in the greater Kinshasa area. Next-generation sequencing (NGS) through metagenomic and target enric
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This report describes a rare case of lupus vulgaris mimicking psoriasis, undiagnosed for over 40 years. Conventional diagnostics, including histopathology and mycobacterial culture, failed to yield a definitive diagnosis. Ultimately, metagenomic next-generation sequencing (mNGS) of the skin tissue detected the Mycobacterium tuberculosis complex, confirming the infection. The patient showed marked clinical improvement following two months of dual-drug anti-tuberculosis therapy. This case highlights the clinical utility of mNGS for diagnosing atypical, long-standing cutaneous tuberculosis when c
СтатьяКлинический случайПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The journal of maternal-fetal & neonatal medicine : the official journal of the European Association of Perinatal Medicine, the Federation of Asia and Oceania Perinatal Societies, the International Society of Perinatal Obstetricians2026eng
BACKGROUND: Listeriosis during pregnancy is a rare but life-threatening infection that often presents with nonspecific symptoms, making timely diagnosis difficult. This article reports a case in which the clinical presentation and immune profile were highly consistent with Listeria monocytogenes infection, leading to a presumptive clinical diagnosis. The patient was successfully treated following a diagnostic approach that integrated host immune profiling with AI-assisted decision-making, despite dual interference from Ureaplasma urealyticum detected by metagenomic next-generation sequencing (
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Targeted next-generation sequencing (tNGS) offers promise in the rapid detection of drug-resistant tuberculosis (DR-TB) directly from sputum. While pilot studies on tNGS are emerging, there is limited empirical qualitative evidence on tNGS implementation. This study, therefore, aimed to explore the experiences of tNGS programmatic implementation by clinicians, laboratory technicians and policymakers to identify perceived key operational barriers and enablers.
DESIGN: An exploratory qualitative study employing inductive thematic analysis. Data were collected via semi-structured int
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The identification and quantification of Fusobacterium nucleatum subspecies is of paramount importance to researchers investigating fusobacterial composition in clinical specimens of human health and disease. Here, we present two validated methods to identify and/or quantify oral fusobacteria present within clinical specimens. Importantly, both approaches can unambiguously distinguish the four F. nucleatum subspecies and Fusobacterium periodonticum. The first method is a convenient PCR-based approach used for rapid genotyping of individual fusobacterial colonies and mixed cultures. The second
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bloodstream infections (BSIs) represent a significant public health concern. Metagenomic Capture targeted next-generation sequencing technology, as a newly emerging method for pathogen detection, has been applied in the etiological diagnosis of various infectious diseases and demonstrates good diagnostic efficacy. However, there is relatively limited research on the diagnostic value of this technology for the etiological diagnosis of BSIs.
METHODS: A comprehensive retrospective analysis was performed on patients suspected of having BSIs who were admitted to the Affiliated Guangdon
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Since its formal description in 2016, Lawsonella clevelandensis-a strictly anaerobic, partially acid-fast bacterium-has been increasingly recognized as a cause of deep-seated abscesses, yet its fastidious nature and absence from routine diagnostic databases contribute to significant underdiagnosis. This narrative review synthesizes current knowledge on its microbiology, expanding clinical spectrum, diagnostic strategies, and treatment, based on a literature search of PubMed and Web of Science up to April 2026. Analysis of 27 documented publications, comprising 18 clinical cases, reveals a pote
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Next-generation sequencing (NGS) is increasingly integrated into cancer patient management, necessitating cost-effective, reliable tests for companion diagnostics. We present the validation of the Solo-test Driver panel, a custom NGS amplicon-based tool for DNA analysis of 34 oncogenes, addressing key clinical needs.
METHODS: The panel's performance was validated for detecting SNVs, CNVs, and MSI. Analytical validation used 182 samples, while clinical validation involved 130 samples, both encompassing diverse tumor types and specimen formats.
RESULTS: The Solo-test Driver panel h
СтатьяВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diagnostic analysis of mRNA is essential because altered splicing is a frequent cause of genetic diseases. High-throughput splicing studies remain difficult to implement in routine diagnostics. This is why SEALigHTS (splice and expression analyses by ligation and high throughput sequencing), a cost-effective and easy-to-implement technique designed for simultaneous analysis of RNA from multiple patients on a panel of genes, was developed using probes designed at exon extremities. After reverse transcription and probing on cDNA, neighboring probes are ligated and the number of ligations quantif
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Blood culture is the cornerstone of microbiological diagnostics for patients with acute undifferentiated fever and no obvious localization of infection; however, up to 50% of cases remain undiagnosed. Infections caused by arboviruses, fastidious or even uncultivable bacteria, or parasites often go undiagnosed without the use of target-specific molecular methods. These are typically performed in a stepwise manner, increasing cost and delaying results. Metagenomic next-generation sequencing (mNGS) has recently gained recognition as a potential universal pathogen detection tool for
СтатьяОценочное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: To characterize the salivary microbiota in subjects with periodontal health (PH), stage I-II periodontitis (moderate periodontitis, MP), and stage III-IV periodontitis (severe periodontitis, SP) by integrating quantitative microbiome profiling (QMP) and relative microbiome profiling (RMP) approaches.
METHODOLOGY: This cross-sectional study involved the collection of 74 saliva samples, categorized into PH (n = 25), MP (n = 25), and SP (n = 24) groups, based on the 2018 Classification of Periodontal and Peri-Implant Diseases and Conditions. Samples were processed using absolute quantitativ
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to investigate the dissemination of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) in water samples obtained during the coronavirus disease 2019 pandemic period, employing cross-assembly phage (crAssphage) as a fecal contamination biomarker and next-generation sequencing protocols to characterize SARS-CoV-2 variants. Raw wastewater and surface water (stream and sea) samples were collected for over a month in Rio de Janeiro, Brazil. Ultracentrifugation and negatively charged membrane filtration were employed for viral concentration of the wastewater and surface wa
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: This study aimed to evaluate the diagnostic performance of gene-based bioinformatic analysis via next-generation sequencing (NGS) compared to conventional culture and microscopy in identifying microorganisms and antibiotic resistances in odontogenic abscesses. Additionally, the influence of selected clinical indicators including prior antibiotic therapy, in-hospital antibiotic treatment, and detection of antibiotic resistance on length of stay (LOS) was analysed.
MATERIALS AND METHODS: In patients undergoing extraoral incision and drainage of odontogenic abscesses at the Departmen
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objectives: The aim of this study was to assess the taxonomic diversity of the microbiota associated with periapical lesions of endodontic origin and to determine whether microbial profiles vary across different populations and clinical characteristics using a unified in silico analysis of next-generation sequencing (NGS) data. Methods: Raw 16S rRNA sequencing data from three published studies were retrieved from the NCBI Sequence Read Archive and reprocessed using a standardized bioinformatics pipeline. Amplicon sequence variants were inferred using DADA2, and taxonomic assignments were perfo
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Synchronous multiple malignant neoplasms (SMMNs) in gynecology involving the ovary, endometrium, and cervix are rare and pose a significant diagnostic challenge when the primary lesion is unclear.
METHODS: We performed targeted genomic sequencing, immunohistochemical analysis and copy number analysis on multiple samples from one patient with simultaneous cancerous lesions in ovary, endometrium and cervix, to clarify tumor clonal origin and divergent evolutionary relationships.
RESULTS: Using blood-derived genomic DNA as reference, targeted sequencing of 1012 genes across endometr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Metagenomic next-generation sequencing (mNGS) has been reported to improve pathogen identification in infectious diseases. This prospective cohort study aimed to explore the etiological diagnostic value of mNGS in peritoneal dialysis (PD)-related peritonitis.
METHODS: Patients with PD-related peritonitis were consecutively recruited at the Nephrology Department of Nanjing Drum Tower Hospital. PD effluent samples for mNGS and culture were collected simultaneously. The positive rate, detection time, and consistency of mNGS and culture were compared.
RESULTS: From August 1, 2021 to
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Carcinoma of unknown primary (CUP) comprises 2-5% of cancer diagnoses worldwide, with a prevalence that has modestly declined with increased availability of advanced diagnostic tools such as next-generation sequencing (NGS). This case presentation illustrates the possibilities and gaps that remain with improving diagnostic capabilities in identifying and effectively treating CUP. This is the case of a rapidly enlarging right axillary mass without a primary tumour site and histological evaluation demonstrating a poorly differentiated neoplasm. Tumour of origin testing using a clinically validat
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Wastewater-based analysis has emerged as a pivotal method for monitoring SARS-CoV-2 (SC2). Leveraging high-throughput sequencing on wastewater samples facilitates a comprehensive, population-level assessment of circulating and emerging SC2 variants within a community. This study meticulously evaluates the detection performance, variant calling accuracy, and the time taken from sample collection to public data release for wastewater SC2 monitoring. Two different SC2 target enrichment panels were employed, Illumina MiSeq and Oxford Nanopore Technologies (ONT) GridION sequencing platforms for a r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.