PURPOSE OF REVIEW: The severity of each organ involvement, natural course, and response to therapies are extremely heterogeneous among patients with systemic sclerosis (SSc). The discovery and validation of biomarkers can help identify disease risk, improve early diagnosis and prognosis, better design clinical trials and assess response to treatment, and further elucidate the underlying pathogenic mechanisms of this disease. The goal of this review is to summarize recent advances into the field of SSc biomarker development.
RECENT FINDINGS: The use of both traditional and next-generation tech
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: Mutational inactivation of the succinate dehydrogenase (SDH) complex is a well-described cause of tumor development in pheochromocytomas/paragangliomas (PPGLs) and gastrointestinal stromal tumors (GISTs). Epigenetic inactivation of the SDHC gene is a more recently discovered phenomenon, which so far has only been described in GISTs and PPGLs from patients with Carney triad syndrome.
CASE DESCRIPTION: A 33-year-old patient presented with two abdominal paragangliomas (PGLs) and an adrenocortical adenoma. Both PGLs showed high succinate:fumarate ratios indicative of SDHx mutations; howe
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The etiology of keratoconus (KC) seems to involve genetic and/or environmental factors such as rubbing and/or contact lens trauma and/or exposure to ultraviolet radiation. An examination of the possibility that epigenetic mechanisms could contribute to the tissue changes in KC has been considered in this review. The tissue changes in KC result in thinning and/or other forms of mechanical weakening of the cornea, which cause it to become more susceptible to the distending forces of intraocular pressure with associated development of a cone. Rather than being caused by a single gene mutation, a
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The histone methyltransferase EZH2 is frequently mutated in germinal center-derived diffuse large B-cell lymphoma and follicular lymphoma. To further characterize these EZH2 mutations in lymphomagenesis, we generated a mouse line where EZH2(Y641F) is expressed from a lymphocyte-specific promoter. Spleen cells isolated from the transgenic mice displayed a global increase in trimethylated H3K27, but the mice did not show an increased tendency to develop lymphoma. As EZH2 mutations often coincide with other mutations in lymphoma, we combined the expression of EZH2(Y641F) by crossing these transge
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autosomal dominant polycystic kidney disease (ADPKD) is a common human genetic disease characterized by the formation of multiple fluid-filled cysts in bilateral kidneys. Although mutations in polycystic kidney disease 1 (PKD1) are predominantly responsible for ADPKD, the focal and sporadic property of individual cystogenesis suggests another molecular mechanism such as epigenetic alterations. To determine the epigenomic alterations in ADPKD and their functional relevance, ADPKD and non-ADPKD individuals were analyzed by unbiased methylation profiling genome-wide and compared with their expres
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Folate and methyl-group deficiency has been linked to prostate cancer susceptibility, yet the mechanisms underlying these observations are incompletely understood. The region of the genome containing the imprinted genes insulin-like growth factor 2 (Igf2) and H19, both of which display oncogenic functions, may be particularly sensitive to environmental influences.
METHODS: To determine whether a methyl-deficient diet impacts epigenetic controls at the Igf2-H19 locus, we placed C57BL/6 mice containing a polymorphism at the imprinted Igf2-H19 locus on a choline and methionine defici
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: Salivary microvesicles (MVs) are nanosized extracellular vesicles from the host and microbiota whose cargo may mirror the biological state of their parent cells. This cross-sectional study aimed to explore the diagnostic power of host methylome and microbiome profiles of MVs in various periodontal disease states.
MATERIALS AND METHODS: This exploratory study recruited 20 healthy, 16 gingivitis and 26 stage III/IV periodontitis cases. The origins of salivary host-MVs were identified using a multiplex extracellular vesicle (EV) kit. The microbiome and host methylome profiles of MV DNA were
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Much research into the aetiology of Alzheimer's disease (AD) has focused on neuronal cell types, while studies on the contribution of glial cells, particularly oligodendrocytes (OLGs), are only starting to emerge. Altered brain DNA methylation, an epigenetic modification that provides the interplay between genetics and environmental cues to tightly regulate gene expression, is well documented in AD. Yet, cell-type-specific investigations remain limited. Here, we examine the role of DNA methylation and OLGs in AD, and how such changes may impact gene expression. We performed weighted-gene corre
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Decisions to split two or more phenotypic manifestations related to genetic variations within the same gene can be challenging, especially during the early stages of syndrome discovery. Genotype-based diagnostics with artificial intelligence (AI)-driven approaches using next-generation phenotyping (NGP) and DNA methylation (DNAm) can be utilized to expedite syndrome delineation within a single gene.
METHODS: We utilized an expanded cohort of 56 patients (22 previously unpublished individuals) with truncating variants in the MN1 gene and attempted different methods to assess plausi
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Conduct Disorder (CD) is an impairing psychiatric disorder of childhood and adolescence characterized by aggressive and dissocial behavior. Environmental factors such as maternal smoking during pregnancy, socio-economic status, trauma, or early life stress are associated with CD. Although the number of females with CD is rising in Western societies, CD is under-researched in female cohorts. We aimed at exploring the epigenetic signature of females with CD and its relation to psychosocial and environmental risk factors. We performed HpaII sensitive genome-wide methylation sequencing of 49 CD gi
Клиническое исследованиеСтатьяМногоцентровое исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Distinct histone modifications regulate gene expression in certain diseases, but little is known about histone epigenetics in middle ear cholesteatoma. It is known that histone acetylation destabilizes the nucleosome and chromatin structure and induces gene activation. The association of histone acetylation with chronic inflammatory diseases has been indicated in recent studies. In this study, we examined the localization of variously modified histone H3 acetylation at lysine 9, 14, 18, 23, and 27 in paraffin-embedded sections of human middle ear cholesteatoma (cholesteatoma) tissues and the t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Emerging research suggests associations of physical and psychosocial stressors with epigenetic aging. Although this work has included early-life exposures, data on maternal exposures and epigenetic aging of their children remain sparse. Using longitudinally collected data from the California, Salinas Valley CHAMACOS study, we examined relationships between maternal Adverse Childhood Experiences (ACEs) reported up to 18 years of life, prior to pregnancy, with eight measures (Horvath, Hannum, SkinBloodClock, Intrinsic, Extrinsic, PhenoAge, GrimAge, and DNAm telomere length) of blood leukocyte ep
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Late-onset Alzheimer's disease (AD) is a complex age-related neurodegenerative disorder that likely involves epigenetic factors. To better understand the epigenetic state associated with AD, we surveyed 420,852 DNA methylation (DNAm) sites from neurotypical controls (N = 49) and late-onset AD patients (N = 24) across four brain regions (hippocampus, entorhinal cortex, dorsolateral prefrontal cortex and cerebellum). We identified 858 sites with robust differential methylation collectively annotated to 772 possible genes (FDR < 5%, within 10 kb). These sites were overrepresented in AD genetic ri
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mice with the C3H background show greater behavioral propensity for schizophrenia, including lower prepulse inhibition (PPI), than C57BL/6 (B6) mice. To characterize as-yet-unknown pathophysiologies of schizophrenia, we undertook proteomics analysis of the brain in these strains, and detected elevated levels of Mpst, a hydrogen sulfide (H2 S)/polysulfide-producing enzyme, and greater sulfide deposition in C3H than B6 mice. Mpst-deficient mice exhibited improved PPI with reduced storage sulfide levels, while Mpst-transgenic (Tg) mice showed deteriorated PPI, suggesting that "sulfide stress" may
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Systemic sclerosis (SSc) is an immune-mediated connective tissue disease of which the aetiology is still unclear. Previous genetic studies including candidate-gene studies and genomewide association studies have identified a number of genetic variations that confer risk to SSc. However, these variants, such as single nucleotide polymorphisms, cannot completely explain the SSc susceptibility and the diversity in the clinical symptoms of SSc patients. The contribution of epigenetic mechanisms as a link between genetics and environmental triggers represents promising field in understanding the pa
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cystathionine β-synthase (CBS) deficiency is a recessive inborn error of metabolism in which patients have extremely elevated plasma total homocysteine and have clinical manifestations in the vascular, visual, skeletal, and nervous systems. Homocysteine is an intermediary metabolite produced from the hydrolysis of S-adenosylhomocysteine (SAH), which is a by-product of methylation reactions involving the methyl-donor S-adenosylmethionine (SAM). Here, we have measured SAM, SAH, DNA and histone methylation status in an inducible mouse model of CBS deficiency to test the hypothesis that homocystei
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anxiety disorders are highly prevalent and debilitating psychiatric disorders. Owing to the complex aetiology of anxiety disorders, translational studies involving multiple approaches, including human and animal genetics, molecular, endocrinological and imaging studies, are needed to get a converging picture of function or dysfunction of anxiety-related circuits. An advantage of anxiety disorders is that the neural circuitry of fear is comparatively well understood, with striking analogies between animal and human models, and this article aims to provide a brief overview of current translation
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The International Society of Experimental Hematology holds its annual meeting every northern summer. This year the meeting comprised of eight plenary sessions with distinguished invited speakers on in vivo imaging and tracking of hematopoietic stem cells (HSCs), HSC niches, epigenetic regulations of stem cells and regulation of stem cell fate, leukemogenesis, and mesenchymal stem cells. The small size of the meeting (300 attendees) permitted excellent discussion and face-to-face contacts between students, junior scientists and experts. Owing to the large number of keynote speakers, this report
Conference ProceedingsПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND & AIMS: The importance of maintaining optimal lipid levels across young adulthood in preventing metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease (MASLD) is unclear. This study aimed to evaluate associations of lipid profiles through young adulthood with midlife MASLD risk and assess the mediating effect of epigenomic biomarkers.
METHODS: This study included 2,577 participants from the Coronary Artery Risk Development in Young Adults study using data from baseline (Year 0 [Y0], 1985-1986) to Y25 (2010-2011). Time-weighted average (TWA) lipid exposures during young adulthood
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.