OBJECTIVE: To examine the gene expression profile of laryngeal squamous cell carcinoma (LSCC) by combination of laser capture microdissection (LCM) and microarray and to identify genetic changes in disease pathogenesis.
METHODS: The study analysed 8 matched pairs of specimens of glottic carcinoma of larynx and histologically normal epithelium tissues adjacent to the carcinoma preserved in the RNA later reagent. A genome-wide transcriptome analysis was performed by probing 16 cDNA microarrays with fluorescent-labeled amplified RNA derived from laser capture microdissected cells. Real-time quan
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The practice of clinical medicine and the process of biomedical research have been transformed by the decoding of the human genome. The use of DNA microarrays to find gene expression patterns in disease and biological processes has already begun to have a significant impact on modern medicine. The study of hematological malignancies has particularly benefited from gene expression profiling, including discoveries about prognosis, mechanism and efficacious choice of therapeutic regimens. DNA microarrays have led to the discovery of better prognostic tools, including the use of Zap-70 in B-Cell C
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Refractory thrombocytopenia (RTC) is an unusual subtype of myelodysplastic syndrome (MDS) that initially presents as chronic pure thrombocytopenia. Because of the lack of distinguishable dysplasia, RTC has often been misdiagnosed as idiopathic thrombocytopenic purpura. We describe the case of a patient with RTC and trisomy 8 for whom a bone marrow mononuclear cell (BMNC) gene expression profile was obtained by means of a complementary DNA microarray analysis. Compared with the healthy control subject, the RTC patient differentially expressed 105 genes, of which 88 were down-regulated and 17 we
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The urokinase-receptor (uPAR) exerts multiple functions supporting most cancer hallmarks. Increased uPAR expression is associated with an unfavorable prognosis in several cancer types, including hematologic malignancies. We previously reported that three oncosuppressor microRNAs (miRNAs) can target the 3'untranslated region (3'UTR) of the uPAR mRNA and that uPAR mRNA is a competitive endogenous RNA (ceRNA) able to recruit oncosuppressor miRs, thus impairing their activity. We now show that uPAR mRNA can also be targeted by oncosuppressor members of the let-7 miRNA family in acute myeloid leuke
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The efficiency of cisplatin (CDDP) is significantly hindered by the development of resistance during the treatment course. To gain a detailed understanding of the molecular mechanisms underlying the development of cisplatin resistance, we comparatively analyzed established a CDDP-resistant neuroblastoma cell line (UKF-NB-4CDDP) and its susceptible parental cells (UKF-NB-4). We verified increased chemoresistance of UKF-NB-4CDDP cells by analyzing the viability, induction of apoptosis and clonal efficiency. To shed more light on this phenomenon, we employed custom cDNA microarray (containing 223
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study reports the first use of gene array technology for the identification of a tumor-specific marker in lymphoid neoplasms. The differential gene expression of 31 hematopoietic cell lines, representing most major lymphoma subgroups of B- and T-cell origin, was assessed by hybridizing labeled complementary DNA to Atlas human expression arrays containing 588 genes. Genes known to be specific for B, T, or myelomonocytic lineages were appropriately identified in the arrays, validating the general utility of this approach. One gene, clusterin, not previously known to be expressed in lymphoid
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromobox 4 (CBX4) is a core component of polycomb-repressive complex 1 with important roles in cancer biology and tissue homeostasis. Aberrant expression of CBX4 has been implicated in several human malignancies. However, its role and underlying mechanisms in the tumorigenesis of lung adenocarcinoma (LUAD) have not been defined in vivo. Here, we found that expression of CBX4 was frequently up-regulated in human LUAD samples and correlated with poor patient survival. Importantly, genetic ablation of CBX4 greatly dampened lung tumor formation and improved survival in the KrasG12D/P53L/L (KP) au
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inorganic arsenic is a well-known carcinogen associated with several types of cancer, but the mechanisms involved in arsenic-induced carcinogenesis are not fully understood. Recent evidence points to epigenetic dysregulation as an important mechanism in this process; however, the effects of epigenetic alterations in gene expression have not been explored in depth. Using microarray data and applying a multivariate clustering analysis in a Gaussian mixture model, we describe the alterations in DNA methylation around the promoter region and the impact on gene expression in HaCaT cells during the
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We propose an approach to detection of essential genes/proteins required for cancer cell survival. A gene is considered essential if a mutation with high impact upon the function of encoded protein causes death of the cancer cell. We draw an analogy between essential cancer proteins and well-known Abraham Wald's work on estimating the plane critical areas using data on survivability of aircraft encountering enemy fire. Wald reasoned that parts with no bullet holes on the airplanes returned to the airbase from a combat flight are the most crucial ones for the airplane functioning: a hit in one
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Acute myeloid leukemia (AML) is an aggressive hematological malignancy characterized by the rapid proliferation of immature myeloid cells and poor clinical outcomes. Despite conventional treatments such as chemotherapy and hematopoietic stem cell transplantation, relapse and resistance remain major challenges. Epigenetic alterations-particularly dysregulated DNA methylation and microRNA (miRNA) expression- are crucial in AML pathogenesis.
OBJECTIVE: This study aimed to investigate the synergistic effects of azacitidine, a DNA methyltransferase inhibitor, and oleuropein, a natural
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To profile the metabolic dynamics responding to drugs at the single-cell/organelle resolution, rapid and economical mechanism-revealing methods are required. Here, we introduced D2O-probed Raman microspectroscopy in combination with the multivariate curve resolution-alternating least squares (MCR-ALS or MCR) algorithm. Exploiting MCR to deconvolute each macromolecular component specifically, the method is able to track and distinguish changes in lipid and protein metabolic activities in a human cancer cell line (MCF-7) and in Saccharomyces cerevisiae, in response to the metabolism-inhibitory e
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The programmed death-ligand 1 (PD-L1) expression by tumors results in potent antitumor immune suppression through binding to programmed death-1 (PD-1) on T cells and subsequent inhibition of T cells activity. Although recent pathological studies have shown that PD-L1 is actively expressed in certain ERα-negative breast cancer, little is known about whether ER signaling regulates PD-L1 gene expression. Here, we investigated the relationship between ERα and PD-L1 in breast cancer. Analysis of Comprehensive Cell Line Encyclopedia (CCLE) data showed that the average mRNA level of PD-L1 in ERα-posi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In mammals, the canonical somatic DNA methylation landscape is established upon specification of the embryo proper and subsequently disrupted within many cancer types. However, the underlying mechanisms that direct this genome-scale transformation remain elusive, with no clear model for its systematic acquisition or potential developmental utility. Here, we analysed global remethylation from the mouse preimplantation embryo into the early epiblast and extraembryonic ectoderm. We show that these two states acquire highly divergent genomic distributions with substantial disruption of bimodal, Cp
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mechanisms how colorectal cancer (CRC) cells penetrate blood micro-vessel endothelia and metastasise is poorly understood. To study blood endothelial cell (BEC) barrier breaching by CRC emboli, an in vitro assay measuring BEC-free areas underneath SW620 cell spheroids, so called "circular chemorepellent induced defects" (CCIDs, appearing in consequence of endothelial retraction), was adapted and supported by Western blotting, EIA-, EROD- and luciferase reporter assays. Inhibition of ALOX12 or NF-κB in SW620 cells or BECs, respectively, caused attenuation of CCIDs. The FDA approved drugs vinpoc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Members of the transmembrane emp24 domain (Tmed)/p24 family of proteins are required for transport of proteins between the endoplasmic reticulum and the Golgi. One member of this family, Tmed2/p24β1, is expressed during placental development in mice and its expression is required for normal development of the labyrinth layer. Although TMED2 is conserved in humans, little is known about its expression and function in human placenta. We examined TMED2 expression in human placenta between 5.5 and 40 weeks of gestation and showed that TMED2 is expressed in syncytiotrophoblast, cytotrophoblast, and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Regulation of cell proliferation and apoptosis plays a key role in tumor development. To elucidate mechanisms underlying hepatocarcinogenesis, patterns of gene expression, including apoptosis-related genes, were compared between glutathione S-transferase placental form (GST-P)-positive preneoplastic foci and surrounding tissue in the rat. Lesions were induced with a single intraperitoneal injection of diethylnitrosamine (DEN, 200 mg/kg bw) and then 100 ppm 2-acetylaminofluorene (2-AAF)-containing diet combined with two-thirds partial hepatectomy. Frozen sections of the livers were applied for
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA polymerase mu (pol mu) is a novel error-prone DNA repair enzyme bearing significant structural homology with terminal deoxynucleotidyltransferase. Whereas other human error-prone DNA polymerases identified thus far show no preferential lymphoid tissue distribution, the highest levels of pol mu mRNA have been detected in peripheral lymphoid tissues, particularly germinal center B cells. Conceivably, up-regulation of the pol mu gene may be biologically significant in lymphomagenesis, especially in the development of B-cell non-Hodgkin's lymphomas (B-NHLs), because of enhanced error-prone DNA
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The protein products of the two tumor suppressor genes located on 9p and 13p, p16INK4 and Rb, respectively, play an important role in regulation of the cell cycle and are implicated in tumorigenesis. We examined 49 cases of benign vulvar lesions, vulvar intraepithelial neoplasia (VIN), and squamous cell carcinoma with immunohistochemical staining to determine expression of p16INK4 and Rb. All and 86% of benign lesions expressed Rb and p16INK4, respectively; 40% each of VIN I and VIN III expressed p16INK4 and Rb, respectively; and 37 and 68% of squamous cell carcinomas expressed p16INK4 and Rb,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We investigated the involvement of the inducible nitric oxide synthase (iNOS) gene in tumor promotion and progression. In the first study, 1 week after subcutaneous injection of benzo(a)pyrene into iNOS-deficient (iNOS) and wild-type (iNOS) mice, a foreign body (plastic plate) was subcutaneously inserted into the carcinogen injection site to evoke chronic inflammation. In the second study, primarily cultured tumor cells (PCTc) with different iNOS gene status were prepared from tumors induced in the first study, and they were implanted into the subcutaneous space of iNOS and iNOS mice, making f
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to characterize candidate regulatory networks associated with LINC02365 knockdown using integrative transcriptomic profiling and Huh-7 cells as a model of hepatocellular carcinoma. LINC02365 expression was evaluated in TCGA-LIHC and GEO datasets and validated in Huh-7, SMMC7721, MHCC97-H, and LO2 cell lines by qRT-PCR. Huh-7 cells with stable LINC02365 knockdown were subjected to next-generation RNA sequencing. Differential gene expression analysis, Gene Ontology (GO) enrichment, KEGG and Reactome pathway analysis, protein-protein interaction (PPI) analysis, transcription fact
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования