Human T-cell leukemia virus type 1 (HTLV-1) causes adult T-cell leukemia/lymphoma (ATL) and HTLV-1-associated myelopathy, and its viral transactivator Tax is central to disrupting host transcriptional control. Although individual interactions between Tax and host factors have been investigated, their global network and functional impact remain unclear. In this study, we performed proteomic analyses of Tax-associated complexes in HTLV-1-infected T-cells and mapped interactions between host factors and Tax. In addition to known nuclear factor kappa B (NF-κB) regulators, we identified the transcr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neisseria meningitidis serogroup B is a major cause of meningitis and septicemia. Here, we report PacBio HiFi single-molecule real-time (SMRT) methylomics data sets for strains MC58, B6116/77, and M0579. These strains encode the phase-variable DNA methyltransferases ModA11, ModA12, and ModD1, respectively, which are epigenetic regulators pivotal to meningococcal pathogenicity.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autophagy serves as a crucial defense mechanism against Mycobacterium tuberculosis (Mtb) survival within infected macrophages. Transcription factor EB (TFEB) and upstream stimulatory factor 2 (USF2) belong to the bHLH-Zip family and regulate the transcription of autophagy-related genes, thereby modulating host-pathogen interactions. However, the mechanisms by which Mtb regulates these transcriptional regulatory factors to inhibit infection remain largely unexplored. This study demonstrated that PE_PGRS23 protein of Mtb impairs macrophage autophagy by inhibiting the transcription of the autopha
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The AraC-type transcriptional activator ToxT is a central regulator of Vibrio cholerae virulence, directly controlling expression of the major virulence genes ctxAB and tcpA. Although biotype-specific culture conditions have been widely used to study virulence gene regulation, virulence gene expression patterns are not conserved across V. cholerae strains, particularly within the El Tor biotype. In this study, we investigated strain- and allele-dependent control of toxT expression using isogenic derivatives harboring chromosomally encoded His-tagged toxT alleles, enabling direct comparison of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Окисляющий стресс (ОС) в значительной степени связан с возникновением и развитием нейродегенеративных заболеваний (НДД), однако его генетические детерминанты остаются недостаточно ясными. Цель этого исследования заключается в определении предполагаемой причинно-следственной связи между генами, связанными с ОСН (ОСРГ), и НДО наряду с потенциальными регулирующими и патогенными механизмами. С целью изучения предполагаемой причинно-следственной связи 936 ОСРГ с НИЗ была проведена работа по обобщению данных общегеномических исследований ассоциаций (ГВАС) и данных количественного выражения loci (eQT
СтатьяПоиск полного текста в очередиМашинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetic disorders impacting vision affect millions of individuals worldwide, including age-related macular degeneration (common) and inherited retinal disorders (rare). There is incomplete understanding of the impact of genetic variation on gene expression in the human retina, and its role in genetic disorders. Through the generation of whole genome sequencing and bulk RNA-sequencing of neurosensory retina (NSR) and retinal pigment epithelium (RPE) from 201 post-mortem eyes, we uncovered common and rare genetic variants shaping retinal expression profiles. This includes 1,483,595 significant c
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/OBJECTIVES: Retinoic acid (RA) is a transcriptional control agent that regulates several aspects of eye development including invagination of the optic vesicle to form the optic cup, although a target gene for this role has not been previously identified. As loss of RA synthesis in Rdh10 knockout embryos affects the expression levels of thousands of genes, a different approach is needed to identify genes that are directly regulated by RA.
METHODS: Here, we combined ChIP-seq for the H3K27ac epigenetic mark with RNA-seq on optic field tissue from E10 wild-type and Rdh10-/- embryos th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mesenchymal stem cells (MSCs) therapy is a potential treatment strategy for ulcerative colitis (UC). The expression of the Id2 (inhibitor of differentiation factor-2) gene is closely associated with the pathogenesis and prognosis of UC. However, the role of Id2 in the therapeutic efficacy of MSCs for UC remains unclear. In this study, the MSCs that either overexpressed or knocked down the Id2 gene were employed to alleviate dextrose sodium sulfate (DSS) induced UC in mice. The results indicated that MSCs overexpressing Id2 showed no significant therapeutic advantage in MSCs for UC treatment. I
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The cyp19a1 gene is a ubiquitous sex-related gene that encodes aromatase, which catalyzes the conversion of androgen to estrogen. Expression of the cyp19a1 gene is closely tied to female sex differentiation. Therefore, we studied sexual expression differences and the transcriptional regulatory mechanism in a fish that is easily sex-reversible, the Chinese tongue sole (Cynoglossus semilaevis). The results showed that cyp19a1 was expressed in the gonads of males, pseudomales, and females, specifically in the seminiferous lobule cavity and sertoli cells of the testis, as well as within oocytes of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metabolic dysfunction associated steatotic liver disease (MASLD) is a widespread liver disease that progresses from simple steatosis to severe steatohepatitis stage. Despite the recognized importance of carboxylesterase 2 (CES2) in hepatic lipid metabolism, the role of CES2 in hepatic inflammation remains unclear. The rat genome encodes six Ces2 genes and Ces2a shows high expression in the liver and intestine. Lipid metabolism, inflammation, fibrosis, and endoplasmic reticulum (ER) stress were investigated in Ces2a knockout (KO) rats. KO rats showed spontaneous liver lipid accumulation due to
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In order to study the distribution characteristics of intestinal microbiota and antibiotic resistance genes (ARGs) in Duzang pigs after adding stems and leaves of Panax notoginseng to the feed, the characteristics of intestinal microbiota were explored by metagenomic sequencing, and 14 ARGs and 2 integrase genes were detected by qPCR. The results showed that the addition of stems and leaves of P. notoginseng increased the relative abundance of Firmicutes, Lactobacillus and Pediococcus in the cecum of Duzang pigs. A total of 10 ARGs and 2 integrase genes were detected in the cecal contents of p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Individuals with cystic fibrosis (CF; a recessive disorder) have an increased risk of colorectal cancer (CRC). Evidence suggests individuals with a single CFTR variant may also have increased CRC risk.
METHODS: Using population-based studies (GECCO, CORECT, CCFR, and ARIC; 53 785 CRC cases and 58 010 controls), we tested for an association between the most common CFTR variant (Phe508del) and CRC risk. For replication, we used whole exome sequencing data from UK Biobank (UKB; 5126 cases and 20 504 controls matched 4:1 based on genetic distance, age, and sex), and extended our analy
СтатьяМетаанализПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Adenosine-to-inosine (A-to-I) RNA editing is among the most abundant post-transcriptional modifications, whose role in homeostasis and disease of the central nervous system (CNS) has been extensively reported. Regulation of A-to-I editing by cis-acting genetic variants (edQTLs) is understudied, especially in the brain. As a part of the BigBrain Project (n=4,471 individuals), which represents a >10-fold increase in sample size from previous edQTL studies, we harmonized A-to-I sites across datasets to perform a meta-analysis that identified 38,731 edQTLs in 3,554 genes. Integrating other QTL sum
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Triple-negative breast cancer (TNBC) signifies an enormous risk to women's health globally. TNBC is characterized by its aggressive nature, resistance to existing therapies, and poor prognosis. Understanding the molecular pathogenesis of breast cancer is crucial for identifying screening markers and therapeutic targets. In order to find commonly expressed differentially expressed genes (DEGs) in a variety of TNBC cell lines treated with docetaxel (GSE70690), paclitaxel (GSE86839), doxorubicin (GSE202536), and cisplatin (GSE77515), as well as untreated TNBC cell lines (GSE38959), bioinformatics
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autophagy is pivotal for cellular homeostasis and photoreceptor outer segment (POS) phagocytosis by the retinal pigment epithelium (RPE) in retinal degenerative diseases, such as age-related macular degeneration and retinitis pigmentosa (RP). Yet, the mechanism of autophagy in the RPE remains largely unknown. RP is an inherited retinal degenerative condition, whose candidate genes provide avenues for dissecting novel autophagy factors. Here, whole exome sequencing of RP patients identified biallelic variants in TRIM49, a primate-specific gene involved in autophagy, as a novel cause of RP. Amon
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Kostmann syndrome is an autosomal recessive disorder caused by a mutation of the hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1 associated protein X-1 (HAX1) gene, and characterized by low number of neutrophils and increased susceptibility to infections. Additionally, Kostmann syndrome is known to be complicated by periodontitis, though the etiological molecular basis remains unclear. We previously reported findings showing that junctional adhesion molecule 1 (JAM1), a tight junction-associated protein, has an important role to maintain epithelial barrier function in gingival tissues,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dorsal is the nuclear transcription factor in the Toll signaling pathway of invertebrates, which can mediate the production of antimicrobial peptides (AMPs) in response to pathogen invasion and plays an important role in the innate immunity of invertebrates. This study identified and cloned the dorsal homologous gene, Shdorsal, from the freshwater crab Sinopotamon henanense. The total length of the Shdorsal (S. henanense Dorsal) was 2483 bp, of which the open reading frame was 1644 bp, encoding 547 amino acids. Structural prediction of Dorsal proteins revealed that ShDorsal contains conserved
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SAE is a systemic inflammatory response syndrome resulting from severe infection, which can progress to multiorgan dysfunction and mortality. Astrocytic-specific NDRG2, a stress response gene, has been implicated in regulating astrocyte reactivity and glutamate homeostasis in various neurological disorders. In this study, we initially investigated the expression and functional role of NDRG2 in SAE. Our results demonstrated that the upregulation of NDRG2 primarily inhibited Na+/K+-ATPase β1 and EAAT2, subsequently leading to glutamate toxicity and then induced astrocyte activation, neuronal dys
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nitric oxide (NO) and the SQUAMOSA Promoter Binding Protein-Like family both have been shown to be involved in the fruit ripening process. This study explored the function of SlSPL6c gene in tomato (Solanum lycopersicum) fruit color change, as well as its involvement in NO-regulated coloring. The NO donor S-nitrosoglutathione (GSNO) delayed tomato fruit coloring by increasing SlSPL6c expression. The silencing of SlSPL6c accelerated tomato fruit color change, whereas overexpression of the gene delayed fruit coloring. In the SlSPL6c-silenced fruits, GSNO did not exert a significant influence on
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Polycystic Ovary Syndrome (PCOS) is a common endocrine disorder that negatively affects female reproductive capacity. Although the association between autophagy and PCOS is known, there are few detailed studies on the association between autophagy-related genes and PCOS.
METHODS: Publicly available gene expression datasets (GSE102293, GSE138518, GSE34526, GSE114419, GSE137684, GSE155489) were used in a comprehensive analysis to identify a role for autophagy in PCOS. Batch effects were mitigated using the sva package, followed by WGCNA (weighted gene correlation network analysis) a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.