The success rate of nucleic acids/ligands co-crystallization can be significantly improved by performing preliminary biophysical analyses. Among suitable biophysical approaches, isothermal titration calorimetry (ITC) is certainly a method of choice. ITC can be used in a wide range of experimental conditions to monitor in real time the formation of the RNA- or DNA-ligand complex, with the advantage of providing in addition the complete binding profile of the interaction. Following the ITC experiment, the complex is ready to be concentrated for crystallization trials. This chapter describes a de
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Many viruses express noncoding RNAs (ncRNAs). The gammaherpesviruses (γHVs), including Epstein-Barr virus, Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus, and murine γHV68, each contain multiple ncRNA genes, including microRNAs (miRNAs). While these ncRNAs can regulate multiple host and viral processes in vitro, the genetic contribution of these RNAs to infection and pathogenesis remains largely unknown. To study the functional contribution of these RNAs to γHV infection, we have used γHV68, a small-animal model of γHV pathogenesis. γHV68 encodes eight small hybrid ncRNAs that contain bot
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MicroRNAs (miRNAs) have been shown to play important roles in carcinogenesis. However, their underlying mechanisms of action in hepatocellular carcinoma (HCC) are poorly understood. Recent evidence suggests that epigenetic silencing of miRNAs through tumor suppression by CpG island hypermethylation may be a common hallmark of human tumors. Here, we demonstrated that miR-941 was significantly down-regulated in HCC tissues and cell lines and was generally hypermethylated in HCC. The overexpression of miR-941 suppressed in vitro cell proliferation, migration, and invasion and inhibited the metast
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Assisted reproductive technologies (ART) offer revolutionary infertility treatments for millions of childless couples around the world. Currently, ART accounts for 1 to 3% of annual births in industrialized countries and continues to expand rapidly. Except for an increased incidence of premature births, these technologies are considered safe. However, new evidence published during the past decade has suggested an increased incidence of imprinting disorders in children conceived by ART. Specifically, an increased risk was reported for Beckwith-Wiedemann syndrome (BWS), Angelman syndrome (AS), S
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Elastodysplasia and elastodystrophy are two known manifestations in the conjunctival, ie, pinguecular, part of pterygia. But the mechanisms are still not understood. The purpose of this study is to investigate the mechanism of enhanced elastin gene expression in fibroblasts from the pinguecular part of pterygia, which is related to abnormal elastic fiber expression in the pinguecular part of pterygia. Elastin in surgical specimens of normal conjunctiva and the pinguecular part of pterygia from age-matched patients was detected by immunohistochemical staining. Northern hybridization and quantif
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Hepatitis B virus (HBV) replication is tightly controlled by host stress and innate immune pathways. The small noncoding RNA nc886 (vtRNA2-1) is a known endogenous inhibitor of protein kinase R (PKR), but its role in HBV biology remains unclear. This study aimed to define the function of the nc886-PKR-eIF2α axis in HBV-replicating hepatoma cells and to determine whether nc886 depletion suppresses HBV replication via PKR-dependent translational control.
MATERIALS AND METHODS: Huh7 cells and Huh7 cells stably harboring a 1.3-mer HBV replicon were used. Endogenous nc886 and PKR expre
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The influenza A virus (IAV) NS1 protein is one of the major regulators of pathogenicity, being able to suppress innate immune response and host protein synthesis. In this study we identified the human micro RNA hsa-miR-1307-3p as a novel potent suppressor of NS1 expression and influenza virus replication. Transcriptomic analysis indicates that hsa-miR-1307-3p also negatively regulates apoptosis and promotes cell proliferation. In addition, we identified a novel mutation in the NS1 gene of A(H1N1)pdm09 strains circulating in Italy in the 2010-11 season, which enabled the virus to escape the hsa
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To investigate the role and mechanism of micro ribonucleic acid (miR)-298 in myocardial apoptosis after myocardial infarction.
MATERIALS AND METHODS: In vivo experiments, the rat model of myocardial infarction was established, and miR-298 was up-regulated via lentivirus with miR-298 overexpression. Cardiac function of rats was detected via echocardiography, Bcl-2 associated X protein (BAX) expressions in infarction border zone were detected via Real-time Quantitative PCR (qT-PCR) and Western blot, and TUNEL assay was used to detect the myocardial apoptosis. In vitro experiments, my
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The psychotomimetic effects of stimulant drugs including amphetamines and cocaine are known to change during the postnatal development in humans and experimental animals. To obtain an insight into the molecular basis of the onset of stimulant-induced psychosis, we have explored the gene transcripts that differentially respond to methamphetamine (MAP) in the developing rat brains using a differential cloning technique, the RNA arbitrarily-primed PCR. We identified from the rat neocortex a novel and developmentally regulated MAP-inducible gene mrt3 (MAP responsive transcript 3) that is transcrib
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: In this particular case report (in vivo the persistence of HCV intergenotipic recombinant form /2/1b/ peripheral blood mononuclear cells of patient) is an example of optimizing the standard antiviral therapy (PegIntron + Rebetol). In this paper we report a patient infected by HCV 1b and, probably, recombinant 2/1b that is detected in peripheral blood mononuclear cells (PBMC).
CASE DESCRIPTION: Patient S., male, 31 years old admitted in January 2009. HCV viral load in serum before treatment 9,630,000 IU/ml. HCV genotyping by sequencing 5'UTR and NS5A. According to phylogenetic anal
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The overgrowth disorder Beckwith-Wiedemann syndrome (BWS) is associated with dysregulation of imprinted genes at chromosome 11p15.5. The molecular defects are heterogeneous but most of the cases are associated with defective DNA methylation at either one of two Imprinting Control Regions (IC1 and IC2) or Uniparental paternal Disomy (UPD) at 11p15.5. In rare cases, the BWS phenotype has been found associated with maternal transmission of IC1 microdeletions. We describe a family with a novel 1.8 kb deletion that is associated with hypermethylation at IC1. The mutation results from recombination
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: 46,XX-maleness affects 1 in 20 000 live male newborns resulting in infertility and hypergonadotrophic hypogonadism. Although the phenotypes of XX-males have been well described, the molecular nature of the X chromosomes remains elusive. We assessed the X inactivation status by DNA methylation analysis of four informative loci and compared those to Klinefelter syndrome (KS) and Turner syndrome.
DESIGN AND METHODS: Patient cohort consisted of ten sex-determining region of the Y (SRY+) XX-males, two (SRY-) XX-males, ten 47,XXY Klinefelter men, six 45,X Turner females and ten male and
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
cDNA subtraction was employed to uncover differences in gene expression between myeloproliferative polycythaemia vera (PV) and normal haematopoietic precursors. Following cDNA subtraction using mRNAs isolated from PV and normal CD34+/CD33- bone-marrow cells, expression of the tumour suppressor H19 was found to be low or absent in the PV sample. Low levels of H19 expression in PV patients were confirmed by in situ hybridization. Using semi-quantitative reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) to examine expression in the pluripotent haematopoietic cell line FDCP-mix and single b
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HIV-1 reverse transcription initiates at the primer binding site (PBS) in the viral genomic RNA (gRNA). Although the structure of the PBS-segment undergoes substantial rearrangement upon tRNALys3 annealing, the proper folding of the PBS-segment during gRNA packaging is important as it ensures loading of beneficial host factors. DHX9/RNA helicase A (RHA) is recruited to gRNA to enhance the processivity of reverse transcriptase. Because the molecular details of the interactions have yet to be defined, we solved the solution structure of the PBS-segment preferentially bound by RHA. Evidence is pr
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
POLH (DNA polymerase η), a target of p53 tumour suppressor, plays a key role in TLS (translesion DNA synthesis). Loss of POLH is responsible for the human cancer-prone syndrome XPV (xeroderma pigmentosum variant). Owing to its critical role in DNA repair and genome stability, POLH expression and activity are regulated by multiple pathways. In the present study, we found that the levels of both POLH transcript and protein were decreased upon knockdown of the transcript encoding PCBP1 [poly(rC)-binding protein 1]. We also found that the half-life of POLH mRNA was markedly decreased upon knockdow
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS/HYPOTHESIS: Enterovirus (EV) infection of pancreatic islet cells is one possible factor contributing to type 1 diabetes development. We have reported the presence of EV genome by PCR and of EV proteins by immunohistochemistry in pancreatic sections. Here we explore multiple human virus species in the Diabetes Virus Detection (DiViD) study cases using innovative methods, including virus passage in cell cultures.
METHODS: Six recent-onset type 1 diabetes patients (age 24-35) were included in the DiViD study. Minimal pancreatic tail resection was performed under sterile conditions. Eleven l
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Cyclosporine A (CsA) is a widely used immunosuppressive drug, but its long-term use is associated with renal fibrosis. Despite its clinical importance, the molecular mechanisms underlying CsA-induced renal fibrosis remain poorly understood.
METHODS: We used C57BL/6 mice (n = 6 per group) treated with CsA (30 mg/kg/day, gavage) and Boston University mouse proximal tubular (BUMPT) cells (n = 6 per group) exposed to CsA (8 µM). Assessments included Masson's trichrome staining, Western blot, quantitative real-time PCR, immunohistochemistry, and in situ hybridization. Mechanistic stu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Fragile X syndrome (FXS) is a neurodevelopmental disorder caused by loss of fragile X messenger ribonucleoprotein (FMRP). In most cases, this results from a CGG expansion exceeding 200 repeats in the 5' untranslated region of the fragile X messenger ribonucleoprotein 1 (FMR1) gene, known as the "full mutation". While the trinucleotide expansion has long been thought to induce epigenetic silencing of this locus, studies have shown that many males with a full mutation still express FMR1 mRNA. However, these individuals produce little to no FMRP protein, due to mechanisms that remain
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: In the adult mammalian central nervous system (CNS), failure of axon regeneration limits recovery after traumatic injury or in neurodegenerative disease. Local protein translation has been implicated in the regulation of axon growth in highly compartmentalized neurons. 3' untranslated regions (3'UTRs) of mRNAs play critical roles in RNA localization and modification. Here we studied the regulation of 3'UTRs in growth cone and axon regeneration.
METHODS: Using fluorescence recovery after photobleaching (FRAP), we examined dynamic changes of mRNA 3'UTRs-related local translation in
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования