Transmission reconstruction--the inference of who infects whom in disease outbreaks--offers critical insights into how pathogens spread and provides opportunities for targeted control measures. We developed JUNIPER (Joint Underlying Network Inference for Phylogenetic and Epidemiological Reconstructions), a highly-scalable pathogen outbreak reconstruction tool that incorporates intrahost variation, incomplete sampling, and algorithmic parallelization. Central to JUNIPER is a statistical model for within-host variant frequencies observed by next generation sequencing, which we validated on a dat
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transmission reconstruction-the inference of who infects whom in disease outbreaks-offers critical insights into how pathogens spread and provides opportunities for targeted control measures. We developed JUNIPER (Joint Underlying Network Inference for Phylogenetic and Epidemiological Reconstructions), a highly-scalable pathogen outbreak reconstruction tool that incorporates intrahost variation, incomplete sampling, and algorithmic parallelization. Central to JUNIPER is a statistical model for within-host variant frequencies observed by next generation sequencing, which we validated on a datas
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colistin, a polymyxin antibiotic considered a last-line treatment for multidrug-resistant Gram-negative infections, has been widely used in livestock, promoting resistance in bacterial populations that can disseminate through the environment. Although rarely used in companion animals, dogs and cats can acquire and spread colistin-resistant strains through shared environments, acting as potential reservoirs of resistance. Reliable detection of resistant strains remains challenging due to technical limitations of routine susceptibility tests. Despite these constraints, epidemiological studies de
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Candida auris was recently listed as a critical priority fungal pathogen by WHO due to its multidrug resistance and enhanced propensity for nosocomial transmission. This study investigated the molecular epidemiology and colonization patterns of C. auris in a tertiary care center in Eastern India.
METHODS: A total of 201 patients from different intensive care units (ICUs) were enrolled, with colonization rates determined through enrichment followed by culture on chromogenic agar and molecular confirmation using Candida auris specific polymerase chain reaction (PCR) and antifungal susc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Contributions of genetic heredity to neurodegenerative diseases have opened avenues of investigations into the interplay between environmental exposures and neurodegeneration. Epidemiological studies have identified some chlorinated solvents as potential modifiers of neurodegenerative disease risk, but not much is known about the molecular mechanisms underlying their neurotoxic potencies. To this end, we investigated how exposure to chlorinated solvents might induce neurotoxicity in wild-type and transgenic zebrafish. Chlorinated solvents were screened for neurotoxicity through a series of ass
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Zika virus (ZIKV) is a flavivirus transmitted primarily by the bite of infected Aedes species mosquitoes. Although typically asymptomatic or causing mild symptoms and infrequent neurological disease in older children and adults, infection during pregnancy can result in severe congenital malformations and neurodevelopmental deficits. We conducted a review of published literature and official data sources to describe recent Zika epidemiological trends, building on WHO updates posted in 2019 and 2022. Globally, cases declined after the height of ZIKV transmission in the Americas in 2015-2016; how
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Avian leukosis is a major neoplastic disease caused by avian leukosis viruses (ALVs), which are classified into 11 subgroups (ALV-A to ALV-K). Among them, ALV subgroup J (ALV-J) has undergone significant epidemiological changes since its introduction into China in 1999. It initially transmitted among broilers and then rapidly spread to commercial layer chickens and local chicken breeds. ALV-J infection typically induces myeloid leukosis in chickens and, in some layers, can also lead to hemangiomas. As a retrovirus, ALV-J exhibits high genetic variability. Compared with the prototype strain HPR
СтатьяОбзорАннотация на английскомПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BackgroundHerpes zoster (HZ) infection may increase the risk of dementia, that causes a heavy socioeconomic burden. However, the epidemiological evidence between HZ vaccination and the risk of dementia remains inconclusive.ObjectiveThis meta-analysis was conducted to investigate the effect of HZ vaccination on the onset of dementia.MethodsWe searched PubMed, EMBASE, Web of Science, Science Direct, and Scopus for cohort studies assessing the association between HZ vaccination and dementia risk up to 20th January 2025. Hazard ratios (HRs) with 95% confidence intervals (CIs) were pooled adopting
СтатьяСистематический обзорМетаанализПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
(1) Background: We aimed to analyze the epidemiological characteristics of hemorrhagic fever with renal syndrome (HFRS) in Longyou County and to provide a basis for the future response to this disease. (2) Methods: Data on hemorrhagic fever and host animals were collected from 2011 to 2023. Descriptive methods were used to analyze the epidemic. The R4.4.1 software was used to show how the host density relates to the virus levels, temperature, and rainfall and to predict the host density. (3) Results: We observed 58 cases of hemorrhagic fever, the majority of which occurred in farmers. There we
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bangladesh is a well-known epidemic zone for dengue fever. Several epidemiological and geographical factors influence the transmission and severity of dengue infection. This study aimed to determine the epidemiological and geographical factors that contributed to the severity of the dengue outbreak in Bangladesh in 2023. This hospital-based cross-sectional study investigated 1,313 dengue patients admitted to public hospitals in Dhaka, Chattogram and Kishoreganj, Bangladesh, between July and December 2023. Multiple logistic regression analyses were conducted to identify the independent risk fac
СтатьяМногоцентровое исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Brucellosis is a reemerging zoonotic infectious disease caused by Brucella spp. and posing significant global health challenges. Focusing on epidemiology, pathophysiology, diagnostic tools, and therapeutic management, the present review synthesizes recent advances in the diagnosis and treatment of brucellosis. Notwithstanding global control efforts, brucellosis remains endemic in various regions, with emerging species and hosts complicating its epidemiology. The mechanisms of Brucella intracellular survival, including evasion of host immune responses and manipulation of cellular processes, con
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Accurate exposure assessment is important for conducting PM10-2.5-related epidemiological studies, which have been limited thus far. In this study, we aimed to develop an ensemble machine learning method to estimate PM10-2.5 concentrations in mainland China during 2013-2020. The study was conducted in two stages. In the first stage, we developed two methods: the indirect method refers to developing models for PM2.5 and PM10 separately and subsequently calculating PM10-2.5 as the difference between them; and the direct method refers to establishing a model between PM10-2.5 measurements and rele
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Depression is common in patients with chronic kidney disease (CKD). Experimental studies suggest the role of urea toxicity in depression. We assessed both the incidence of antidepressant prescriptions and depressive symptoms (measured by CESD (Center for Epidemiologic Depression) scale) in 2505 patients with CKD (Stage 3-4) followed up over 5 years in the Chronic Kidney Disease Renal Epidemiology and Information Network (CKD-REIN) cohort. We used a joint model to assess the association between the serum urea level and incident antidepressant prescriptions, and mixed models for the association
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
While there is a large body of evidence indicating that sexual minority youth experience inequitably high rates of mental health problems (eg, depression, suicidality), we know little about how temporal changes in sexual attractions, identities and behaviour may impact mental health (and other) outcomes. In this essay, we review existing research regarding sexual fluidity and mental health among young adults in order to identify critical knowledge gaps with respect to an epidemiological understanding of the relationship between these factors. We describe three gaps that in turn inform a larger
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Maternal-child health suggests the critical impact of maternal nutrition during the pre-conception and gestational periods, with some genetic variants also playing a significant role. Our systematic review provides an overview of epidemiological studies exploring the interactions between genetic variants, maternal dietary habits, and neonatal and/or maternal pregnancy outcomes.
METHODS: From its inception until June 2023, we conducted a comprehensive literature search on PubMed, Embase, and Web of Science databases.
RESULTS: On a total of 29 epidemiological studies, 11 studies we
Систематический обзорСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As the world still vividly recalls the previous monkeypox (mpox) outbreak that impacted over 120 countries worldwide with more than 99,000 cases in 2022, we are now facing a second wave of infections from the monkeypox virus (MPXV), characterized by an exponential increase in cases. The current 2024 outbreak has already recorded more than 20,000 cases in Africa, marking a dramatic escalation compared to previous outbreaks. The predominance of the newly identified clade Ib variant, first detected in the Democratic Republic of the Congo (DRC) and now identified across multiple African nations an
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mpox, the zoonotic disease caused by Monkeypox virus (MPXV), is currently a global health emergency. This review (Part I) aims to provide insights into the virus life cycle, epidemiology, host immune responses, and immune evasion mechanisms. Mpox symptoms is similar to smallpox but with lower mortality rates and lower transmissibility. In the past, the virus has been endemic in Central (Clade I) and West (Clade II) African countries. The first outbreak in outside Africa is reported in the United States in 2003. A multi-country outbreak across all continents occurred in 2022, predominantly driv
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Rabies is a dreadful zoonotic viral disease that affects animals and humans with a fatality rate of 100%. This report aims to create awareness among the veterinarians and general public about the paralytic form of rabies in order to understand the antemortem clinical diagnosis implications in limited resource settings, so as to follow the post-exposure prophylaxis at the golden hour period of rabies transmission.
CASE PRESENTATION: A one-year-old female dog was presented to the Ambulatory Clinic Unit, Veterinary Clinical Complex, Veterinary College and Research Institute, Theni,
СтатьяКлинический случайПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leptospirosis is a reemerging zoonotic disease of worldwide significance, endemic to the southern region of India, with clinical manifestations similar to other febrile illnesses; hence, it is often misdiagnosed and underreported. Inadequate information about the disease burden and the regional circulating serogroups contributes to its neglected disease status. This study aimed to identify the infecting Leptospira serogroup in the coastal region of Mangaluru and study the clinical symptoms and outcome among leptospirosis patients. Serum samples were collected from 30 patients with confirmed le
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Clinical, epidemiological, and molecular studies have sufficiently highlighted the vitality of vitamin D [25(OH)D and 1,25(OH)2D] in human health and wellbeing. Globally, vitamin D deficiency (VDD) has become a public health concern among all age groups. There is a very high prevalence of VDD per the estimates from several epidemiological studies on different ethnic populations. But, population-specific scales do not support these estimates to define VDD clinically and consistent genetic associations. However, clinical studies have shown the relevance of serum vitamin D screening and oral supp
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования