Classical population genetics provides a robust, quantitative framework for modeling how natural selection acts on alleles that influence phenotypes with invariant fitness consequences for their carriers, such as running speed or drug resistance. By contrast, modifier theory considers the evolution of alleles that influence population genetic parameter values in their carriers, such as mutation or recombination rates. This is a more complicated problem. First, the fitness effects of modifier alleles reflect independently realized stochastic phenotype perturbations they induce in their carriers
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Replication-initiating HUH-endonucleases (reps) are enzymes that form covalent bonds with single-stranded DNA (ssDNA) in a sequence-specific manner to initiate rolling circle replication in plasmids and viruses. These nucleases have been co-opted for use in biotechnology as sequence-directed protein-ssDNA bioconjugation fusion partners dubbed 'HUH-tags'. Here, we describe the engineering and in vitro characterization of a series of laboratory evolved HUH-tag derivatives of PCV2 called E1 and E2. E2 is capable of forming robust covalent bonds with unmodified RNA substrates in a sequence-specifi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite the plethora of knowledge about the benefits of meiotic recombination and numerous theoretical studies examining how recombination rates evolve, there is a general lack of empirical support and consensus across species. To fill this knowledge gap, we characterized the evolution of recombination landscape in maize during its domestication from teosinte and related the observed changes to established theoretical frameworks. Through examining recombination in experimental populations of maize and teosinte and the population genomics approach of identifying historical recombination events
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The evolution of mitochondria provides crucial insights into the diversification of eukaryotes, with complex events of gene losses revealed through comparative analyses of mitochondrial genomes (mitogenomes) across eukaryotic lineages. However, the mitogenomes of many microbial eukaryotes remain underexplored due to challenges in their isolation and cultivation. Particularly understudied are Foraminifera (Rhizaria, SAR), unicellular calcifiers that are widely distributed across global oceans and important paleoenvironmental proxies. Using single-cell genomic sequencing, we report a 22-kb mitog
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Population divergence is promoted by divergent selection and inhibited by gene flow, but the mechanisms of and relationship between these two processes remain poorly understood. Developing a well-informed hypothesis of the selective pressures underlying divergence in a natural population requires a thorough understanding of both species structure and demographic history. In this study, we assess whole-genome sequences of round-tailed horned lizards (Phrynosoma modestum) from throughout the species range and combine phylogenetic analyses with genomic landscape scans to understand how current ge
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cetaceans tolerate repeated diving bouts. While the extent to which cetaceans experience decompression sickness remains debated, this group of fully aquatic mammals must have evolved a tolerance to damaging nitrogen (N2) gas bubbles that can form during overly rapid ascents or after prolonged dives. Here, we present the first in-depth molecular evolutionary analysis of the nitric oxide synthase gene family across cetaceans and identify cetacean-specific amino acid substitutions in NOS3 (encoding endothelial nitric oxide synthase) that likely arose in a stem cetacean ancestor, coincident with t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Armillaria species hold significant ecological and economic importance and they play a vital role in the growth of traditional Chinese medicine Gastrodia elata (G. elata). In this study, we assembled and compared the mitochondrial genomes (mitogenomes) of six Armillaria mellea (Vahl) P. Kumm. (A. mellea) strains isolated from the main G. elata-producing region of Hanzhong, China. The internal transcribed spacer (ITS) sequencing confirmed that all six strains form a monophyletic clade. Their mitogenomes (120,775 to 120,839 bp) exhibit a highly conserved architecture, each containing 16 protein-
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
It is commonly assumed that naturally protective targets of immunity in influenza are highly variable. Theoretical work suggests, by contrast, that influenza evolution is primarily driven by naturally protective responses against epitopes of limited variability (ELV). At least one ELV has been identified on the head region of haemagglutinin of H1 influenza, opening up the possibility of producing a universal influenza vaccine. Here, for the first time, we provide a comprehensive catalogue of ELVs within the head region of H1 haemagglutinin and explain how they arise within its apparently high
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The porcine interferon (IFN) system is highly diversified, particularly within Type I subfamilies, yet its evolutionary trajectory across domestication and breed formation remains poorly characterized. We performed a comprehensive comparative genomic and structural analysis of 432 IFN sequences spanning all IFN types across 11 Sus scrofa breeds representing commercial, indigenous, and wild/outgroup lineages. Phylogenetic reconstruction, pairwise dN/dS selection pressure analysis, and AlphaFold2-based 3D structure prediction coupled with DALI structural similarity mapping were integrated to res
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The fungal family Ophiocordycipitaceae (Hypocreales, Ascomycota) includes the medicinally important Ophiocordyceps sinensis. However, comparative mitogenomic analyses remain limited. Here, we analyzed mitochondrial genomes from 18 species spanning Ophiocordyceps, Cordyceps sensu stricto, Beauveria, Tolypocladium, and three outgroups, using maximum-likelihood phylogenetics (GTR + F + R3, 1000 ultrafast bootstraps), codon-usage analysis, and site-specific selection pressure estimation. Genome sizes ranged 20.7-272.5 kb (~ 13-fold), with low GC content (mean GC = 27.7%). Codon usage showed modera
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The construction of microbial cell factories frequently encounters bottlenecks due to the complexity of metabolic pathways, insufficient enzyme functionality, and poor environmental tolerance. Directed evolution, as a pivotal technology for overcoming these engineering constraints, can significantly enhance the titer, productivity, and overall robustness of target-producing strains. Its development originated from traditional random mutagenesis, a method that generates genetic diversity through the imposition of artificial growth pressures and is currently in widespread use. However, owing to
СтатьяОбзорАннотация на английскомПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Feline leukemia virus (Gammaretrovirus felleu) causes variable pathologies, partially modulated by its endogenous form (enFeLV). Although enFeLV is found in genomes of all species of the Felis genus, the limitations of transposable element sequencing have hindered a comprehensive characterization. In this study, we examined 17 felid genomes for enFeLV copies, confirming that enFeLV is restricted to the Felis genus. From the long-read genomes of Felis catus, Felis nigripes, and Felis chaus, we identified 73 solo LTRs, 64 copies with genic segments, and 4 atypical copies. These were annotated an
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Recent work has revealed that protein-coding sequences encode regulatory information influencing mRNA stability and translation through a nascent peptide code. However, the evolutionary origin of this regulatory layer remains unclear. This study aims to determine when peptide-mediated translational control emerged during the evolution of the proteome and genetic code. Methods: Dipeptide-specific effects on mRNA stability and translation were integrated with a phylogenetic timeline of dipeptide emergence derived from dipeptide sequences across proteomes. Each of the 400 canonical di
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
NOD-like receptors (NLRs) serve as crucial innate immune sensors in multicellular organisms, recognizing diverse pathogen-associated components and regulating immune responses such as nuclear factor kappa B (NF-κB) signalling and inflammatory pathways. To elucidate the roles of NLRC3, NLRC5 and NLRX1 in the innate immunity of the Mastacembelus armatus, this study first characterized these genes and examined their response to Aeromonas veronii infection. We identified the three NLR genes from the M. armatus transcriptome and analysed their evolutionary relationships through domain architecture
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SARS-CoV-2 continues to cause recurrent waves in the post-pandemic period, yet genomic data from Southeast Asia remain limited for several emerging Omicron lineages, including NB.1.8.1. In this study, routine acute respiratory infection (ARI) surveillance performed in Bangkok, Thailand, from January to December 2025 was integrated with real-time RT-PCR testing and complete spike-gene sequencing for lineage assignment and evolutionary analysis. Among 4756 ARI specimens, 473 (9.9%) tested positive for SARS-CoV-2. Positivity increased in late April, peaked in May (epidemiological week 21; 58.4%),
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mpox virus (MPXV) is a zoonotic Orthopoxvirus that has recently gained attention due to outbreaks. In the presence of these constantly changing global health threats, genomic surveillance of the MPXV is no longer a choice but a necessity. The MPXV has diversified through mutation and adaptation, giving rise to distinct clades. In this study, the Nextclade tool was used to identify amino acid substitutions in immune evasion genes relative to the reference genome NC_063383.1 across the African, European, and Asian continents. Crm-B secreted TNF-alpha receptor-like protein, Bcl-2-like protein, an
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RESEARCH BACKGROUND: Clostridium perfringens (C. perfringens) disease in Bactrian camels is an acute infectious disease with high mortality, causing serious economic losses to the breeding industry. However, studies on its epidemiological patterns and whole-genome characteristics remain limited.
OBJECTIVE: This study aimed to investigate the epidemiological patterns and whole-genome characteristics of C. perfringens disease in Bactrian camels.
METHODS: Epidemiological investigations, physiological parameter measurements, pathological analyses, isolation and identification of C. perfringens,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pre-existing mutations can influence subsequent evolution by constraining or opening evolutionary pathways through epistatic interactions. In some cases, global epistasis allows evolutionary pathways to be predicted from the fitness of the genetic background alone. In other cases, idiosyncratic epistasis makes evolution less predictable. Here, we show that the evolution of antibiotic resistance is highly repeatable, following a common path across most genetic backgrounds. However, a minority of genetic backgrounds exhibit evolutionary trajectories that significantly deviate from this common pa
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The TYK2 P1104A variant has been cast as a textbook example of evolutionary compromise-protecting against autoimmunity whilst increasing susceptibility to tuberculosis (TB). This narrative has been invoked to explain its decline in frequency in European populations since the Bronze Age. However, accumulating evidence suggests that this widely accepted trade-off may be more complex than originally proposed. At the mechanistic level, P1104A reduces TYK2 catalytic activity without abolishing cytokine signalling, owing to compensatory, non-hierarchical JAK activation. Critically, IL-12-dependent i
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Invasive non-typhoidal Salmonella (iNTS) disease, primarily manifesting as bloodstream infections and dominated by Salmonella Typhimurium sequence type 313 (ST313), represents a major global health challenge, particularly in sub-Saharan Africa. However, the transmission landscape and evolutionary driver of ST313 remain incompletely understood. Here, we compile the global dataset to date, comprising 11,361 human-derived iNTS genomes and 3115 ST313 genomes from diverse sources, enabling identification of a highly antimicrobial-resistant sublineage 2.4 and an emerging lineage 4. Phylogenomic anal
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования