Unraveling the precise mechanisms of protein-ligand recognition remains a cornerstone of structure-based drug discovery. While recent deep learning advances have accelerated computational screening, a critical bottleneck persists: binding pocket characterization is often rigidly disconnected from the querying molecule's properties. Contemporary models frequently enforce a static, unidirectional mapping, which fails to capture the complex biomolecular micro-environment and limits generalization to unseen molecules. To overcome this, we introduce LGBind, a structure-guided deep learning framewor
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ETHNOPHARMACOLOGICAL RELEVANCE: Bupleurum chinense DC. (Radix Bupleuri, Chaihu) has traditionally been applied to "soothe the liver and relieve depression." Contemporary pharmacological evidence indicates that Radix Bupleuri (RB) and its active components exhibit anti-inflammatory, antitumor, and antidepressant effects. Nevertheless, the mechanisms underlying its antidepressant activity remain unclear.
AIM OF THE STUDY: To evaluate the antidepressant-like effects of RB in mouse models and to determine whether modulation of peripheral inflammatory status is associated with changes in the brain
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mosquito-borne diseases remain a major global health challenge, and understanding the molecular mechanisms underlying mosquito physiology and adaptation is essential for developing new vector control strategies. cAMP response element-binding protein (CREB) plays a pivotal role in regulating specific gene expression programs governing cell survival, differentiation, plasticity, and the maintenance of physiological homeostasis. In this study, we aimed to investigate the evolutionary and developmental characteristics, as well as sex-specific expression patterns of CREB transcription factors in mo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella enterica serovar Choleraesuis (S. Choleraesuis) is a highly invasive zoonotic pathogen responsible for severe systemic infections, in which the complement system constitutes a major innate defense against circulating bacteria. However, the molecular basis underlying resistance of S. Choleraesuis to complement-mediated killing remains poorly understood. Here, whole-genome sequencing and pan-genome comparative analyses of S. Choleraesuis isolates exhibiting distinct serum-resistance phenotypes identified five candidate genes associated with enhanced serum survival. Among them, traC em
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The CCAAT/enhancer binding protein β (C/EBPβ) is a key transcription factor regulating immune homeostasis. Although its oncogenic roles are well-established, its context-dependent functions in autoimmune diseases, which affect 5–10% of the global population, remain incompletely understood. This review aims to synthesize current knowledge on C/EBPβ’s paradoxical roles in autoimmunity and evaluate its emerging therapeutic potential. MAIN BODY: We detail how C/EBPβ, through its antagonistic isoforms LAP*/LAP (activator) and LIP (repressor), operates as both a pathogenic driver and a p
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There is a continued need for identification of novel disease drivers of acute myeloid leukemia as many patients experience relapse and have poor clinical outcomes. Analyses from our study and publicly available datasets predicted CEBPD as a novel tumor suppressor gene in acute myeloid leukemia. Consistent with the analyses, CEBPD knockdown experiments showed activation of MAPK signaling with concomitant increase in cell growth rate, while upregulation experiments suggested induction of myeloid differentiation marker CD14 expression in AML cell lines OCI-AML2 and OCI-AML5. Consistent with a pr
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Selenium-binding protein 1 (SELENBP1) has been implicated in cancer development, neurological disorders, tissue injury, metabolic regulation, and cell differentiation. Sepsis is characterized prominently by immunological dysregulation and severe organ damage. However, whether SELENBP1 improves sepsis by regulating immune cell activity remains unknown. Here, we detected an elevation of SELENBP1 levels in the blood of sepsis patients and in the livers of septic mice. Significantly, SELENBP1 knockout (KO) prolonged survival in septic mice. This phenomenon was accompanied by decreased liver damage
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The transplacental transfer of xenobiotics, particularly in an enantioselective manner, is a critical and evolving area of developmental toxicology. Pregnant women, as a highly vulnerable population, are frequently exposed to pervasive chiral chemicals that can cross the placenta, with the placenta serving as an enantioselective barrier. Despite significant research on enantioselective transfer of xenobiotics using various models (in vivo, ex vivo, and in vitro), a comprehensive understanding of the underlying mechanisms of xenobiotics-plasma protein binding remains lacking. This review provid…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objectives: Pancreatic cancer (PC) remains one of the deadliest malignancies, with challenges that hinder early detection and few actionable molecular targets. In this study, we aimed to identify biomarkers predictive of PC to support its diagnosis and treatment. Methods: Proteins from formalin-fixed, paraffin-embedded pooled samples of PC (n = 15; 5 pools) and chronic pancreatitis (n = 10; 5 pools) tissues were analyzed via label-free quantitative proteomics using liquid chromatography-tandem mass spectrometry. Immunohistochemistry (IHC) was performed on PC tissue microarrays to as
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The disruption of transactive response DNA binding protein 43 kDa (TDP-43) shuttling leads to the depletion of nuclear localization and the cytoplasmic accumulation of TDP-43. We aimed to evaluate the mechanism underlying the behavior of TDP-43 in ischemic stroke. Adult male C57BL/6 J mice were subjected to 30 or 60 min of transient middle cerebral artery occlusion (tMCAO), and examined at 1, 6, and 24 h post reperfusion. Immunostaining was used to evaluate the expression of TDP-43, G3BP1, HDAC6, and RAD23B. The total and cytoplasmic number of TDP-43-positive cells increased compared with sham
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Despite numerous studies addressing the molecular mechanisms by which pluripotent stem cells (PSCs) maintain self-renewal and pluripotency under normal culture conditions, the fundamental question of how PSCs manage to survive stressful conditions remains largely unresolved. Post-transcriptional/translational regulation emerges to be vital for PSCs, but how PSCs coordinate and balance their survival and differentiation at translational level under extrinsic and intrinsic stress conditions is unclear.
METHODS: The high-throughput sequencing of cross-linking immunoprecipitation cDNA
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Septic acute kidney injury (AKI) is an important risk factor for developing chronic kidney disease (CKD). Hu antigen R (HuR) is recognized as a crucial modulator in inflammation. We hypothesized that elevated HuR contributes to the transition from septic AKI to CKD by promoting persistent inflammation and fibrosis, and inhibition of HuR may reverse septic kidney injury. Mice subjected to lipopolysaccharide (LPS) injections every other day were concurrently treated without or with either KH39 or niclosamide (NCS) for 7 days. Control mice received saline injections. Repeated LPS injections led t
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The engineered lipocalin Colchicalin binds the clinically relevant plant toxin colchicine with picomolar affinity. X-ray structures revealed major loop rearrangements at the open end of the β-barrel upon ligand binding, suggesting a critical role for protein dynamics. Here, we integrated solution NMR relaxation experiments with molecular dynamics (MD) simulations and Markov modelling to examine conformational dynamics in the free and ligand-bound Colchicalin on the picosecond-to-millisecond timescale. Fast backbone dynamics were comparable in the presence and absence of colchicine, indicating
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The marine pathogen Yersinia ruckeri synthesizes the tri-catecholate siderophore ruckerbactin, Rb, (DHB-LArg-LSer)3, to acquire iron during infection. Its biosynthetic gene cluster encodes a single periplasmic binding protein, RupB, which surprisingly does not bind Fe(III)-Rb nor the Fe(III) complexes of its hydrolysis products, the di- and mono-catecholate siderophores RbDC and RbMC, with biologically relevant affinities. Instead, the periplasmic binding protein YiuA, encoded in a different region of the chromosome, binds the 1 : 2 Fe(III) complex of the mono-catecholate RbMC, Fe(III)-(RbMC)2
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Invasive lung myofibroblasts are the main cause of tissue remodeling in idiopathic pulmonary fibrosis (IPF). A key mechanism contributing to this important feature is aberrant crosstalk between the abnormal/injured lung epithelium and pulmonary fibroblasts. Here, we demonstrate that lungs from patients with IPF and from mice with bleomycin (BLM)-induced pulmonary fibrosis (PF) are characterized by the induction of human epididymis protein 4 (HE4) overexpression in epithelial cells. HE4 knockdown primarily in epithelial cells attenuates BLM-induced PF in mice, whereas the administration of reco
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
mRNA platforms offer a promising strategy to overcome limitations in helminth vaccinology. We used the helminth Fasciola hepatica, which is a major veterinary and zoonotic pathogen for which no licensed vaccine exists, as a test case. We engineered a codon-optimized mRNA encoding the F. hepatica fatty-acid-binding protein (FABP), verified its expression in HEK293T cells, and formulated it in SM-102 lipid nanoparticles (LNPs). BALB/c mice received a prime-boost immunization (3 weeks apart) followed by longitudinal blood and terminal spleen immune profiling by spectral flow cytometry. Immunizati
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Основным источником белка витамина D и его метаболитов в плазме является связующий белок витамина D (VDBP) или групповой компонент (Gc). Два единичных нуклеотидных полиморфизма - rs7041 и rs4588 в гене GC - приводят к трем крупным VDBP/Gc генотипам, GC1F (c.1296T, c.1307C), GC1S (c.1296G, c1307C), GC2 (c.1296T, c1307A) и фенотипам, Gc1F (p.432Asp, p.436Thr), Gc1S (p.432Glu, p.436Thr) и Gc2 (p.432Asp, p.436Lys). В этом исследовании были изучены частоты генотипов и фенотипов GC у кувейтских пациентов с множественным склерозом (МС) и здоровым контролем, а также их связи с 25 уровнями сыворотки ги
СтатьяПолный текст найденМашинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leucine-rich α2-glycoprotein-1 (LRG1) is overexpressed in various cancers, including non-small cell lung cancer (NSCLC), but its role in NSCLC cell metastasis is not well understood. In this study, NSCLC cell exosomes were analyzed using different techniques, and the impact of exosomal LRG1 on NSCLC cell behavior was investigated through various assays both in vitro and in vivo. The study revealed that LRG1, found abundantly in NSCLC cells and exosomes, enhanced cell proliferation, migration, invasion, and epithelial-mesenchymal transition (EMT). Exosomal LRG1 was shown to promote NSCLC cell m
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transmissible spongiform encephalopathies (or prion diseases) such as Creutzfeldt-Jacob disease, mad cow disease, and scrapie are characterized by accumulation in the brain of misfolded prion protein aggregates (PrPSc) that have properties of amyloid fibrils. Given that transition metal ions, such as copper and zinc, appear to be important for physiological functions of cellular PrP (PrPC) as well as for prion disease pathogenesis, exploring their role in the protein aggregation process is of considerable interest. Copper(II) in particular is well-known to bind to the four tandem octapeptide r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amyloidosis is an extraordinarily vigorous and heterogeneous group of disorders that causes numerous organ failures due to the precipitation of misfolded proteins. Many of these damaged proteins are discarded before causing any fatal diseases due to the contribution of the protein quality control (PQC) system and its chaperons, including glucose-regulated protein (GRP78). One of the most important enzymatic proteins inside the body is lysozyme, which is reported to have many mutated variants that may cause amyloid fibrils. This study used structural bioinformatics and molecular dynamics simula
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования