BACKGROUND: Ovarian granulosa cell tumors are the most common sex-cord stromal tumors and have juvenile (JGCTs) and adult forms. In a previous study we reported the occurrence of activating somatic mutations of Gαs, which transduces mitogenic signals, in 30% of the analyzed JGCTs.
METHODS: We have searched for alterations in other proteins involved in ovarian mitogenic signaling. We focused on the PI3K-AKT axis. As we found mutations in AKT1, we analyzed the subcellular localization of the mutated proteins and performed functional explorations using Western-blot and luciferase assays.
FINDIN
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The constitutively active fusion protein BCR-ABL1 is the major cause of chronic myeloid leukemia (CML), and selective inhibition of ABL1 is a promising approach for the treatment of CML. Reported drugs worked well in clinical practice, such as imatinib, dasatinib, nilotinib and bosutinib. However, resistance arises due to ABL1 mutation in patients, especially the T315I gate-keeper mutation. Thus, wide spectrum drugs targeting ABL1 are urgently needed. In order to screen potential drugs targeting wild-type ABL1 and T315I mutant ABL1, 1408 FDA approved small molecule drugs were subjected to mole
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pentameric ligand-gated ion channels (pLGICs), such as nicotinic acetylcholine, glycine, γ-aminobutyric acid GABA(A/C) receptors, and the Gloeobacter violaceus ligand-gated ion channel (GLIC), are receptors that contain multiple allosteric binding sites for a variety of therapeutics, including general anesthetics. Here, we report the x-ray crystal structure of the Erwinia chrysanthemi ligand-gated ion channel (ELIC) in complex with a derivative of chloroform, which reveals important features of anesthetic recognition, involving multiple binding at three different sites. One site is located in
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Listeria monocytogenes is an opportunistic, food-borne human and animal pathogen. Host cell invasion requires the action of the internalins A (InlA) and B (InlB), which are members of a family of listerial cell-surface proteins. Common to these proteins are three distinctive N-terminal domains that have been shown to direct host cell-specific invasion for InlA and InlB. Here, we present the high-resolution crystal structures of these domains present in InlB and InlH, and show that they constitute a single "internalin domain". In this internalin domain, a central LRR region is flanked contiguou
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many Gram-negative bacterial pathogens employ a contact-dependent (type III) secretion system to deliver effector proteins into the cytosol of animal or plant cells. Collectively, these effectors enable the bacteria to evade the immune response of the infected organism by modulating host-cell functions. YopM, a member of the leucine-rich repeat protein superfamily, is an effector produced by the bubonic plague bacterium, Yersinia pestis, that is essential for virulence. Here, we report crystal structures of YopM at 2.4 and 2.1 A resolution. Among all leucine-rich repeat family members whose at
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: beta-lactam antibiotic therapies are commonly challenged by the hydrolytic activities of beta-lactamases in bacteria. These enzymes have been grouped into four classes: A, B, C, and D. Class B beta-lactamases are zinc dependent, and enzymes of classes A, C, and D are transiently acylated on a serine residue in the course of the turnover chemistry. While class A and C beta-lactamases have been extensively characterized by biochemical and structural methods, class D enzymes remain the least studied despite their increasing importance in the clinic.
RESULTS: The crystal structure of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Arylalkylamine N-acetyltransferase (aaNAT) in Aedes aegypti is primarily involved in cuticle pigmentation and formation. The reported arylalkylamine substrates are all primary amines. In this study, we report a novel substrate, a secondary amine, of Ae. aegypti aaNAT1. The recombinant aaNAT1 protein exhibited high activity to a secondary amine, epinephrine, which has not been reported for any aaNATs previously. Structure-activity relationship study demonstrated that aaNAT1 has an epinephrine-binding site, and molecular docking and dynamic simulation showed that epinephrine is quite stable in t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The bacterium Legionella pneumophila is a causative agent of Legionnaires' disease. It utilizes the Dot/Icm type IV secretion system (T4SS) to deliver over 300 effector proteins into the host cell, leading to modification of cellular processes and creating a safe environment for bacterial proliferation. Dot/Icm is a multi-subunit molecular machine. The effectors are recognized by the inner membrane-embedded coupling complex (T4CC), which then delivers them to the translocation apparatus. This T4CC subcomplex is made up of DotL, DotM, DotN, IcmS, IcmW, LvgA, DotY and DotZ, and its structure was
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Near-infrared Fourier transform Raman spectroscopy is an analytical, nondestructive technique that provides information about the molecular structure of the investigated sample. The molecular structure of proteins and lipids differ between neoplastic and normal tissues and therefore Raman spectroscopy has been considered promising for the diagnosis of cancer. We aimed to compare the molecular structure of normal skin, benign and malignant skin lesions by the near-infrared Fourier transform Raman spectroscopy. Biopsies were obtained from the following skin lesions: skin tag, dermatofibroma, seb
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Owing to its ability to generate extensive fragmentation of proteins, ultraviolet photodissociation (UVPD) mass spectrometry (MS) has emerged as a versatile ion activation technique for the structural characterization of native proteins and protein complexes. Interpreting these fragmentation patterns provides insight into the secondary and tertiary structures of protein ions. However, the inherent complexity and diversity of proteins often pose challenges in resolving their numerous conformations. To address this limitation, we combined UVPD-MS with drift tube ion mobility, offering potential
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human ornithine transcarbamylase is a trimer with 46% amino acid sequence homology to the catalytic subunit of E coli aspartate transcarbamylase. Secondary structure predictions, distributions of hydrophilic and hydrophobic regions, and the pattern of conserved residues suggest that the three dimensional structures of the two proteins are likely to be similar. A three dimensional model of ornithine transcarbamylase was generated from the crystal structure of the catalytic subunit of E coli aspartate transcarbamylase in the holoenzyme, by aligning the sequences, building in gaps, and minimising
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To identify a novel disease-causing mutation of the GJA3 (gap junction alpha-3 protein) gene in a Chinese family with autosomal dominant congenital cataract (ADCC).
METHODS: One family was examined clinically. After informed consent was obtained, genomic DNA was extracted from the venous blood of all participants. Genetic linkage analysis was performed on the known genetic loci for ADCC with a panel of polymorphic markers, and then mutations were screened by direct sequencing. Whenever substitutions were identified in a patient, high-resolution melt curve analysis (HRM) was performed
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: The aim of this study was to investigate the genetic diversity in the stem-loop (SL) IV sub-domain of the human rhinovirus (HRV) internal ribosomal entry site (IRES), which plays key roles in the initiation of viral translation by host protein interaction.
METHODS: The primary SL-IV sequences of 194 HRVs, consisting of 97 reference strains and 97 clinical isolates, including the IRES sub-domains SL-IVa, SL-IVb, SL-IVc, and SL-IVd, were analyzed using Lasergene, MEGA 4, and WebLogo. Additionally, secondary structures of SL-IV were predicted and classified by RNAfold and CentroidHom
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Toxoplasma gondii is an obligate intracellular parasite that causes one of the most common parasitic infections in humans and other warm-blooded animals. Currently, there are no effective treatments for inhibiting the formation of chronic tissue cysts in infected hosts. Thus, the development of a vaccine to protect against toxoplasmosis is an attractive option for avoiding infection. The aim of this study was to design an epitope-based vaccine for T. gondii. In the present study, an in silico approach was used to predict and analyze B-cell and T-cell epitopes and the transmembrane domain of pr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aquaporins are highly selective polytopic transmembrane channel proteins that facilitate the permeation of water across cellular membranes in a large diversity of organisms. Defects in aquaporin function are associated with common diseases, such as nephrogenic diabetes insipidus, congenital cataract and certain types of cancer. In general, aquaporins have a highly conserved structure; from prokaryotes to humans. The conserved structure, together with structural dynamics and the structural framework for substrate selectivity is discussed. The folding pathway of aquaporins has been a topic of se
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Botulinum neurotoxins (BoNTs, serotypes A-G), elaborated by Clostridium botulinum, can induce lethal paralysis and are classified as Category A bioterrorism agents. However, how BoNTs translocate from endosomes into the cytosol of neurons to gain access to their intracellular targets remains enigmatic. We discovered that binding to the ganglioside GT1b, a toxin coreceptor, enables BoNT/B to sense low pH, undergo a significant change in secondary structure, and transform into a hydrophobic oligomeric membrane protein. Imaging of the toxin on lipid bilayers using atomic force microscopy revealed
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Taking all the proteins of four virus genomes as samples, the segments of alpha-helix and beta-strand in proteins of the four viruses were obtained. Linear regression analyses between the average polarities and the folding rates of peptide chains were performed for alpha-helices and beta-strands respectively. The results indicated that the folding rates show significant positive linear correlation for alpha-helices and negative linear correlation for beta-strands with the average polarities. Based on the corresponding protein coding sequences of these amino acid segments, the influences of GC
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Virus capsids find increasing use as nanoparticulate platforms for the surface display of heterologous ligands, including as multivalent vaccine carriers. Presentation on the icosahedral hepatitis B virus capsid (HBcAg) is known to strongly enhance immunogenicity of foreign sequences, most efficiently if they are inserted into the dominant c/e1 B cell epitope, a surface-exposed loop in the center of the constituent core protein primary sequence. Even some complete proteins were successfully inserted but others, e.g. the outer surface protein A (OspA) of the Lyme disease agent Borrelia burgdorf
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To learn about the correlation between allostery and ligand binding of the Tet repressor (TetR) we analyzed the effect of mutations in the DNA reading head-core interface on the effector specific TetR(i2) variant. The same mutations in these subdomains can lead to completely different activities, e.g. the V99G exchange in the wild-type leads to corepression by 4-ddma-atc without altering DNA binding. However, in TetR(i2) it leads to 4-ddma-atc dependent repression in combination with reduced DNA binding in the absence of effector. The thermodynamic analysis of effector binding revealed decreas
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
alpha-Synuclein (alphaS) is a presynaptic terminal protein that is believed to play an important role in the pathogenesis of Parkinson's disease (PD). We have used NMR spectroscopy to characterize the conformational properties of alphaS in solution as a free monomer and when bound to lipid vesicles and lipid-mimetic detergent micelles. Free wild-type alphaS is largely unfolded in solution, but exhibits a region with a preference for helical conformations that may be important in the aggregation of alphaS into fibrils. The N-terminal region of alphaS binds to synthetic lipid vesicles and deterg
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.