To ensure efficiency in discovery and development, the application of computational technology is essential. Although virtual screening techniques are widely applied in the early stages of drug discovery research, the computational methods used in lead optimization to improve activity and reduce the toxicity of compounds are still evolving. In this study, we propose a method to construct the residue interaction profile of the chemical structure used in the lead optimization by performing "inverse" mixed-solvent molecular dynamics (MSMD) simulation. Contrary to constructing a protein-based, ato
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dementia with Lewy bodies (DLB) is one of the most common forms of dementia. It can present as neurocognitive decline, visual hallucinations, and concomitant symptoms of rapid eye movement (REM) sleep behavior disorder. Early diagnosis remains one of the cornerstones of managing this form of neurocognitive disorder but, often, making an early and accurate diagnosis can prove to be challenging. For this article, our goal was to review the utility of various neuroimaging modalities in making a swift and accurate diagnosis of DLB. We used PubMed to look for helpful, informative, and peer-reviewed
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sampling potential energy surfaces (PES) is pivotal for understanding chemical structure, energetics and reactivity and is of special importance for complex condensed-phase systems. Until recently such simulations based on electronic structure theory have been performed only by density functional theory and semiempirical methods. Many-body electronic structure methods, almost routinely used for molecules, have been practically unavailable for sampling PES in the condensed-phase. This has changed during the last few years, as efficient algorithms and software implementations for the evaluation
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Patients with considerable maxillomandibular anteroposterior discrepancies and maxillary hypoplasia require corrective treatment through orthognathic surgery. However, in the treatment of severe maxillary retrognathism, it is necessary to reconstruct areas of bone deficiency through grafting techniques in addition to maxillary advancement using only the Le Fort I osteotomy. Treatment in these patients is more challenging and requires high surgical predictability. Alloplastic materials often have been used for the reconstruction of poor bone contours. Ultrahigh-molecular-weight polyethylene (UH
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two methods to correlate and predict experimental redox potentials for cerium complexes were evaluated. Seventeen previously reported cerium complexes were computed using DFT methods in both the CeIII and CeIV oxidation states with a dichloromethane solvent continuum. In the first computational approach, the ΔGo(CeIV/CeIII) was determined for each of the compounds and these values were correlated with the experimental E1/2 values measured in dichloromethane, referenced to the ferrocene/ferrocenium couple. The second method involved correlating the energies of the CeIV LUMOs (lowest unoccupied
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Müllerian agenesis is a congenital malformation characterized by absence of the uterus, cervix, and upper vagina. A positive home pregnancy test in a woman with Müllerian agenesis mandated evaluation for malignancy.
CASE: A woman with Müllerian agenesis presented with elevated levels of human chorionic gonadotropin (hCG), testosterone, and dehydroepiandrosterone sulfate. Pelvic magnetic resonance imaging (MRI), abdominal and pelvic computed tomography scan, chest computed tomography scan, brain MRI, and body positron emission tomography scan did not identify a malignancy. Human ch
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epstein-Barr virus (EBV) infects more than 90% of the world population. Following primary infection, Epstein-Barr virus persists in an asymptomatic latent state. Occasionally, it may switch to lytic infection. Latent EBV infection has been associated with several diseases, such as Burkitt lymphoma (BL). To date, there are no available drugs to target latent EBV, and the existing broad-spectrum antiviral drugs are mainly active against lytic viral infection. Thus, using computational molecular docking, a virtual screen of a library of small molecules, including xanthones and flavonoids (describ
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Diabetic retinopathy (DR) is a leading cause of vision impairment, and current treatments are limited to advanced stages. Cinnamaldehyde (CA), the primary bioactive constituent of cinnamon, has demonstrated anti-apoptotic and anti-diabetic properties, but its role and mechanism in early DR remain unexplored. This study investigated whether CA protects against early DR and whether the effect is associated with phosphoinositide 3-kinase (PI3K)/protein kinase B (AKT) pathway activation.
PURPOSE: This study investigated whether CA exerts anti‑apoptotic effects in early DR and whether
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aspartic proteases from Rhizomucor miehei (RMP; PDB 2ASI) and Mucor pusillus (MPP; PDB 1MPP) are widely used in cheese production for milk coagulation, but their high thermostability and nonspecific proteolytic activity can cause over-hydrolysis of casein, resulting in bitterness and reduced yields. To overcome these limitations, a chimeric aspartic protease was rationally designed by replacing the second C-terminal region of 2ASI (residues 271-361, 91 residues) with the corresponding fragment from 1MPP, sharing 81.3% sequence identity and 94.5% sequence similarity based on amino acid sequence
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Wild-type epidermal growth factor receptor (EGFRwt) is commonly implicated in tumor growth, yet most of the approved EGFR-targeted therapies are against mutant receptor isoforms, and patients with EGFRwt-dependent cancers have limited treatment options. We herein explored the potential to inhibit EGFRwt with five top screened hits retrieved from Food and Drug Administration (FDA)-approved kinase inhibitors library, originally developed for MET-overexpressing cancers for potential drug repurposing approach. Induced-fit docking showed that all five molecules bound the ATP-binding pocket of EGFRw
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: BRAF kinases are involved in cancer cell survival and metastasis. Mutations in BRAF are frequent in several types of cancer, occurring in more than 50% of melanomas, 50-70% of thyroid cancers, 15% of colorectal cancers, and 5-8% of non-small-cell lung cancers. The most prevalent mutation is V600E. Vemurafenib and dabrafenib are two selective BRAF inhibitors approved by the FDA for clinical use. However, due to the increasing resistance to current kinase inhibitors, there is an urgent need to identify new molecular scaffolds with potential BRAF inhibitory activity. In this work, molecu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plastic stabilizers (PSs) are chemical additives that are widely used to inhibit the degradation of plastics. However, their safety concerns and potential carcinogenic risks remain unclear. This study employed network toxicology strategies to elucidate the potential toxic effects and underlying molecular mechanisms of representative PSs, including 2,6-di-tert-butylphenol (2,6-DTB), tert-butylhydroquinone (TBHQ), and 2-(2H-benzotriazol-2-yl)-4,6-di-tert-pentylphenol (UV-328) in breast cancer (BC). Herein, we identified 69 potential genes related to PSs exposure and BC, and optimized five core t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinocerebellar ataxia type 3 (SCA3) is a progressive inherited neurodegenerative disorder characterized by impaired coordination and balance due to cerebellar ataxia. Currently, there are no Food and Drug Administration (FDA)-approved drugs or curative treatments for SCA3. This study aimed to uncover the potential therapeutic mechanism of natural products (NP or NPs) against SCA3 using an integrative computational strategy combining network pharmacology, molecular docking, molecular dynamics (MD) simulation, principal component analysis (PCA), free energy landscape (FEL), dynamic cross-correl
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Breast cancer is one of the prominent reasons of death in women. HER2 is a promising target to counter breast cancer. In the current research, a structure-based pharmacophore model was generated to map and screen CMNPD, a comprehensive database of marine natural products. The two compounds (CMNPD30448 (hit1) and CMNPD7060 (hit2)) displayed better LibDock scores than the reference co-crystallized ligand. These compounds demonstrated stable molecular dynamics results conducted for 500 ns with stable root mean square deviation (RMSD) at 0.3 nm, stable radius of gyration (Rg) and root mean square
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gouteng is a traditional Chinese medicine widely used for the clinical treatment of epilepsy, yet the specific mechanism underlying its antiepileptic has not been elucidated. Network pharmacology, bioinformatics, machine learning, molecular docking, MD simulation, and ADMET druggability analysis were performed to systematically elucidate the molecular regulatory mechanism of Gouteng against epilepsy. The results showed that 29 active components of Gouteng collectively regulated 661 potential antiepileptic targets. Through screening with machine learning-based disease diagnostic model, MDM2 and
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leishmaniasis is a neglected tropical disease caused by Leishmania parasites and is associated with more than 1.3 million cases annually. The current therapeutic options include pentavalent antimonials, miltefosine, and amphotericin B, but their use is limited because of high toxicity, declining efficacy due to drug resistance, high treatment costs, and the absence of rationally designed, target-based antileishmanial therapies. This critical gap necessitates the discovery of novel, safe, and effective anti-leishmanial agents. In the present study, an E-Pharmacophore-based screening strategy wa
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The benzoxazoles and benzothiazoles derivatives have a variety of pharmacological activities, such as antimicrobial activity. Thus, in the present study, the antifungal activity of 13 benzoxazole and benzothiazole derivatives against Candida spp. strains were evaluated. Compound 1 presented strong antimicrobial action for C. krusei with MIC of 15.6 µg/mL, activities against strains of C. albicans (62.5 µg/mL), and C. tropicalis (125.0 µg/mL). In addition, it was evidenced that biological activity occurs in the plasma membrane in C. albicans. The results of the in silico study showed that the p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ubrogepant is a clinically approved migraine drug, and the precise enantioselective synthesis of Ubrogepant Chiral Intermediate (UCI) is critical for its efficacy. Thus, identifying an ω-transaminase (ω-TA) with high activity and enantioselectivity toward UCI is essential. This work adopted a strategy combining computation with experiment. First, an initial ω-TA catalyzing UCI was screened from an enzyme library, termed as wild-type (WT) hereinafter. Molecular docking and dynamics simulations were used to decipher structure-activity relationships at catalytic sites. Subsequently, Rosetta-based
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cyclin-dependent kinase 12 (CDK12) is thought to play an important role in cancer biology pathogenesis and development. Novel, selective, safe, and effective CDK12 inhibitors are actively sought after in drug discovery and clinical development. We report here the structure-based discovery of two novel CDK12 inhibitors using integrated molecular docking, simulation, and molecular mechanics Poisson-Boltzmann surface area methods. We performed a virtual high-throughput screening of potential inhibitors sourced from the ZINC database, which contains ∼90,000 molecules. Various filters were applied
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
LIM kinases (LIMK1 and LIMK2) serve as critical regulators of microtubule dynamics and mitotic progression, positioning them as promising targets for cancer therapy. However, most existing LIMK inhibitors lack specificity and cause toxic side effects due to the high sequence conservation between LIMK isoforms. Notably, no peptide-based inhibitors targeting the conserved ATP-binding pocket of LIMKs have been systematically investigated to date. To address this, an integrative structural bioinformatics approach, such as virtual screening of oligopeptide libraries, molecular dynamics simulations
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования