The WW domain-containing PQBP1 (polyglutamine tract-binding protein 1) protein regulates mRNA processing and gene transcription. Mutations in the PQBP1 gene were reported in several X chromosome-linked intellectual disability (XLID) disorders, including Golabi-Ito-Hall (GIH) syndrome. The missense mutation in the GIH syndrome maps within a functional region of the PQBP1 protein known as the WW domain. The causative mutation of PQBP1 replaces the conserved tyrosine (Y) at position 65 within the aromatic core of the WW domain to cysteine (C), which is a chemically significant change. In this sho
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inhibition of PARPs is a key strategy to treat tumours with defects in homologous recombination (HR), including those with mutations in the tumour suppressor gene BRCA2. PARP inhibitors generate replication stress, creating a dependence on HR to repair the resulting DNA damage. However, the DNA lesions generated upon PARP inhibition that impede replication fork progression and trigger a requirement for BRCA2 in cell survival are poorly defined. Here, we demonstrate that elevated levels of G-quadruplex (G4) DNA structures is a determinant of genome instability and PARP inhibitor toxicity, while
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HDAC11 is a class IV histone deacylase with no crystal structure reported so far. The catalytic domain of HDAC11 shares low sequence identity with other HDAC isoforms, which makes conventional homology modeling less reliable. AlphaFold is a machine learning approach that can predict the 3D structure of proteins with high accuracy even in absence of similar structures. However, the fact that AlphaFold models are predicted in the absence of small molecules and ions/cofactors complicates their utilization for drug design. Previously, we optimized an HDAC11 AlphaFold model by adding the catalytic
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sodium-glucose cotransporters (SGLTs) are responsible for sugar absorption in small intestine and renal tubule epithelial cells. These proteins have attracted clinical attention as a cause of malabsorption and as a target for diabetes drugs. Each SGLT isoform has strict selectivity for its monosaccharide substrate. Few studies have attempted to elucidate the structural basis of sugar selectivity by allowing generating SGLT mutants that bind substrates not normally transported or by reproducing the substrate specificity of other isoforms. In this study, we built a structural homology model for
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vsp surface lipoproteins are serotype-defining antigens of relapsing fever spirochetes that undergo multiphasic antigenic variation to allow bacterial persistence in spite of an immune response. Two isogenic serotypes of Borrelia turicatae strain Oz1 differ in their Vsp sequences and in disease manifestations in infected mice: Vsp1 is associated with the selection of a neurological niche, while Vsp2 is associated with blood and skin infection. We report here crystal structures of the Vsp1 dimer at 2.7 and 2.2 A. The structures confirm that relapsing fever Vsp proteins share a common helical fo
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACE2 is a membrane-bound aspartic protease of the A1 family with a high level of sequence homology to BACE1. While BACE1 is involved in the generation of amyloid plaques in Alzheimer's disease by cleaving Abeta-peptides from the amyloid precursor protein, the physiological function of BACE2 is not well understood. BACE2 appears to be associated with the early onset of dementia in patients with Down's syndrome, and it has been shown to be highly expressed in breast cancers. Further, it may participate in the function of normal and abnormal processes of human muscle biology. Similar to other as
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As important members of the ETS superfamily, the E74-like factor (ELF) transcription factor family regulates gene transcription through a conserved ETS domain and plays critical roles in immune regulation. However, the evolutionary characteristics and functions of this family in lampreys (Lethenteron reissneri) remain unclear. In this study, the ELF gene family of lampreys (Lr-ELF1, Lr-ELF2, Lr-ELF3, and Lr-ELF5) was systematically identified, and their molecular evolutionary features and immune response functions were investigated. Phylogenetic analysis revealed evolutionary characteristics r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cobalamin (Cbl)-dependent Radical S-adenosylmethionine (RS) enzymes are well known for their use of two powerful cofactors to catalyze chemically challenging reactions, such as methylations on unactivated carbons and phosphorus centers, ring contractions, ring formations, and thioether bond formations. Our repertoire of Cbl-dependent RS enzyme structures has grown since the first solved structure of the oxetanocin A biosynthetic enzyme OxsB in 2017, which has provided insight into the structural basis of catalysis. In particular, the Cbl-binding domains of these RS enzymes have been found to h
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
One of the major categories of industrial enzymes, proteases is crucial to the survival of living things. The purpose of this research was to newly thermostable protease from the thermophilum Geobacillus stearothermophilus. With the conserved catalytic tetrad, protease (Protease JJ) is closely related to the serine proteases from the subtilisin S8 peptidase, according to phylogenetic tree analysis. The tertiary structure of Protease JJ was predicted structurally using RoseTTAFold, and it is a sandwich structure overall. Homology modeling validation showed Protease JJ was modeled in X-ray's pro
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Entrenchment - epistasis that locks in amino acid differences between homologous proteins, so each disfavors substitutions toward the other's state - has been demonstrated along individual protein lineages over deep evolutionary time. Antibodies offer a unique system for studying entrenchment: multiple homologous germline V gene paralogs provide diverse starting points, and the rapid somatic evolution of affinity maturation generates dense phylogenies from which selection on germline-encoded residues can be inferred. Using DASM, a deep-learning model that separates selection from mutation in a
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gluten-related disorders (GRDs) are a group of diseases that involve the activation of the immune system triggered by the ingestion of gluten, with a worldwide prevalence of 5%. Among them, Celiac disease (CeD) is a T-cell-mediated autoimmune disease causing a plethora of symptoms from diarrhea and malabsorption to lymphoma. Even though GRDs have been intensively studied, the environmental triggers promoting the diverse reactions to gluten proteins in susceptible individuals remain elusive. It has been proposed that pathogens could act as disease-causing environmental triggers of CeD by molecu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tick and mite infestations pose significant challenges to animal health, agriculture, and public health worldwide. The search for effective and environmentally friendly acaricidal agents has led researchers to explore natural alternatives. In this study, we investigated the acaricidal potential of the Monotheca buxifolia plant extract against Rhipicephalus microplus ticks and Sarcoptes scabiei mites. Additionally, we employed a computational approach to identify phytochemicals from the extract that could serve as drug candidates against these ectoparasites. The contact bioassay results demonst
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
G-protein coupled receptor kinase 2 (GRK2) regulates the activity of many receptors. Because potent inhibitors of GRK2 are thus far limited to polyanionic compounds like heparin, we searched for new inhibitors with the aid of a molecular model of GRK2. We used the available crystal structure of cAMP dependent protein kinase (cAPK) as a template to construct a 3D homology model of GRK2. Known cAPK and GRK2 inhibitors were docked into the active sites of GRK2 and cAPK using DOCK v3.5. H8 docked into the hydrophobic pocket of the adenosine 5'-triphosphate (ATP) binding site of cAPK, consistent wi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Neurodevelopmental disorders associated with periventricular nodular heterotopia (PVNH) are characterized by phenotypic and genetic heterogeneity. NEDD4L mutation can lead to PVNH7. However, at present, only eight NEDD4L pathogenic variants have been identified across 15 cases of PVNH7 worldwide. Given this dearth of evidence, the precise correlations between genetic pathogenesis and phenotypes remain to be determined.
METHODS: This report discusses the case of a 19-month-old male child with cleft palate, seizures, psychomotor retardation, and hypotonia, for whom we verified the g
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diabetic polyneuropathy (DPN) continues to be generally considered as a "microvascular" complication of diabetes mellitus alongside nephropathy and retinopathy. The microvascular hypothesis, however, might be tempered by the concept that diabetes directly targets dorsal root ganglion sensory neurons. This neuron-specific concept, supported by accumulating evidence, might account for important features of DPN, such as its early sensory neuron degeneration. Diabetic sensory neurons develop neuronal atrophy alongside a series of messenger ribonucleic acid (RNA) changes related to declines in stru
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Desmoglein-2, encoded by DSG2, is one of the desmosome proteins that maintain the structural integrity of tissues, including heart. Genetic mutations in DSG2 cause arrhythmogenic cardiomyopathy, mainly in an autosomal dominant manner. Here, we identified a homozygous stop-gain mutations in DSG2 (c.C355T, p.R119X) that led to complete desmoglein-2 deficiency in a patient with severe biventricular heart failure. Histological analysis revealed abnormal deposition of desmosome proteins, disrupted intercalated disk structures in the myocardium. Induced pluripotent stem cells (iPSCs) were generated
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study analyzed the expressed sequence tags (ESTs) of the third-stage larvae of Anisakis simplex, in an attempt to gain further insight into its genomic expression patterns. An A. simplex cDNA library was constructed using the Uni-ZAP XR expression vector. A total of 493 clones (insert DNA>400 bp) were sequenced out of 580 clones selected randomly from a cDNA library of the A. simplex third-stage larva. After BLAST search analyses, 154 (31.2%) ESTs were found to have very low similarity, or no match at all to any of the proteins and gene sequences in the published databases. Most matched c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cyclin-dependent kinases 2, 4 and 6 (Cdk2, Cdk4, Cdk6) are closely structurally homologous proteins which are classically understood to control the transition from the G1 to the S-phases of the cell cycle by combining with their appropriate cyclin D or cyclin E partners to form kinase-active holoenzymes. Deregulation of Cdk4 is widespread in human cancer, CDK4 gene knockout is highly protective against chemical and oncogene-mediated epithelial carcinogenesis, despite the continued presence of CDK2 and CDK6; and overexpresssion of Cdk4 promotes skin carcinogenesis. Surprisingly, how
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Reactive α-oxoaldehydes, such as glyoxal (GO) and methylglyoxal (MGO), are cytotoxic glycolysis byproducts that induce cellular dysfunction by nonenzymatically modifying diverse macromolecules. Although DJ-1 (PARK7), a protein linked to Parkinson's disease, acts as a type-III glyoxalase/methylglyoxalase, the physiological function(s) of its prokaryotic homologs remain poorly understood. Here, we investigated the enzymatic and physiological properties of YhbO, one of four DJ-1 homologs in Escherichia coli. We demonstrate that YhbO has higher catalytic efficiency than DJ-1 and exhibits broad-spe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The LytR-CpsA-Psr (Lcp) family of proteins are highly abundant amongst actinomycetes and Gram-positive bacteria, and known to exist as multiple paralogs in an organism. Several reports demonstrated the essential LcpA to play a crucial role in coupling cell wall teichoic acids (arabinogalactan in mycobacteria) to peptidoglycan, making it an attractive drug target against tuberculosis (TB). However, apart from LcpB that accommodates capsular biosynthesis, role of the non-essential Lcp paralogs in mycobacteria largely remains elusive. Therefore, we made a comprehensive approach in cha
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования