It has been established that the Hydrazone derivatives have important pharmacological effects. In the first step, hydrazine (NH2NH2) reacts with a compound containing a carbonyl group (C = O) in the presence of ethanol and heat, leading to the formation of hydrazone compound (H1). The second step is the formation of the Schiff base (H2) by the reaction of compound (H1) with indole, ethanol, and acetic acid, which contain a double bond (C = N). In the third step, the (H1) reacts with thiophene, ethanol, and acetic acid to form a compound (H3) containing multiple bonds between the indole and thi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Extracellular vesicles are shed by every cell type and can be found in any biofluid. They contain different molecules that can be utilized as biomarkers, including several RNA species which they protect from degradation. Here, we present a pipeline for the development and analysis of extracellular vesicle-associated transcriptomic biomarkers that our group has successfully applied multiple times. We highlight the key steps of the pipeline and give particular emphasis to the necessary quality control checkpoints, which are linked to numerous available guidelines that should be considered along
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Dry eye disease is the most commonplace multifractional ocular complication, which has already affected millions of people in the world. It is identified by the excessive buildup of reactive oxygen species, leading to substantial corneal epithelial cell demise and ocular surface inflammation attributed to TLR4. In this study, we aimed to identify potential compounds to treat of dry eye syndrome by exploring in silico methods.
METHODS: In this research, molecular docking and dynamics simulation tests were used to examine the effects of selected compounds on TLR4 receptor. Compounds
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Garcinia mangostana fruits are used traditionally for inflammatory skin conditions, including acne. In this study, an in silico approach was employed to predict the interactions of G. mangostana xanthones and benzophenones with three proteins involved in the pathogenicity of acne, namely the human JNK1, Cutibacterium acnes KAS III and exo-β-1,4-mannosidase. Molecular docking analysis was performed using Autodock Vina. The highest docking scores and size-independent ligand efficiency values towards JNK1, C. acnes KAS III and exo-β-1,4-mannosidase were obtained for garcinoxanthone T, gentisein/2
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Peroxisome proliferator-activated receptor-γ (PPARγ) is a critical regulator of adipogenesis and bone metabolism, playing complex roles in osteoporosis. This study investigates the effects of taurine and homocysteine on PPARγ, focusing on their roles in osteoclastogenesis and bone health. In-silico analyses, including molecular docking and molecular dynamic simulations, revealed that both taurine and homocysteine bind competitively to the PPARγ ligand-binding domain, exhibiting distinctive antagonistic modes, including destabilization of PPARγ's key helices H3, H4/5, H11, and H12. In-vitro exp
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cryptococcosis is a lethal mycosis instigated by the pathogenic species Cryptococcus neoformans and Cryptococcus gattii, primarily affects the lungs, manifesting as pneumonia, and the brain, where it presents as meningitis. Mortality rate could reach 100% if infections remain untreated in cryptococcal meningitis. Treatment options for cryptococcosis are limited and and there are no licensed vaccines clinically available to treat or prevent cryptococcosis. Our study utilizes an integrated bioinformatics approaches to develop a polyvalent multiepitope subunit vaccine focusing on the key virulent
СтатьяОтозванная публикацияПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tuberculosis(TB) of the Central nervous system (CNS) is a rare and highly destructive disease. The emergence of drug resistance has increased treatment difficulty, leaving the Bacillus Calmette-Guérin (BCG) vaccine as the only licensed preventative immunization available. This study focused on identifying the epitopes of PknD (Rv0931c) and Rv0986 from Mycobacterium tuberculosis(Mtb) strain H37Rv using an in silico method. The goal was to develop a therapeutic mRNA vaccine for preventing CNS TB. The vaccine was designed to be non-allergenic, non-toxic, and highly antigenic. Codon optimization w
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Borrelia burgdorferi is regarded as an extremely dangerous bacteria causing infectious disease in humans, resulting in musculoskeletal pain, fatigue, fever and cardiac symptom. Because of all alarming concerns, no such prophylaxis setup has been available against Borrelia burgdorferi till now. In fact, vaccine construction using traditional methods is so expensive and time-consuming. Therefore, considering all concerns, we designed a multi-epitope-based vaccine design against Borrelia burgdorferi using in silico approaches.
OBJECTIVE: To design an effective and safe vaccine that c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Viroporins are oligomeric, pore forming, viral proteins that play critical roles in the life cycle of pathogenic viruses. Viroporins like HIV-1 Vpu, Alphavirus 6 K, Influenza M2, HCV p7, and Picornavirus 2B, form discrete aqueous passageways which mediate ion and small molecule transport in infected cells. The alterations in host membrane structures induced by viroporins is essential for key steps in the virus life cycle like entry, replication and egress. Any disruption in viroporin functionality severely compromises viral pathogenesis. The envelope (E) protein encoded by coronaviruses is a v
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Infectious diseases are serious public health problems, affecting a large portion of the world's population. A molecule that plays a key role in pathogenic organisms is trehalose and recently has been an interest in the metabolism of this molecule for drug development. The trehalose-6-phosphate synthase (TPS1) is an enzyme responsible for the biosynthesis of trehalose-6-phosphate (T6P) in the TPS1/TPS2 pathway, which results in the formation of trehalose. Studies carried out by our group demonstrated the inhibitory capacity of T6P in the TPS1 enzyme from Saccharomyces cerevisiae, preventing th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fascioliasis, a serious helminth disease of the livestock population, results from infection with the parasite Fasciola. Despite the alarming increase in drug resistance, a safe and fully effective vaccine for fascioliasis is still not available. In the present study, we employed high-throughput immunoinformatics approaches to design a multi-epitope based subunit vaccine using seven important F. gigantica proteins (cathepsin B, cathepsin L, leucyl aminopeptidase, thioredoxin glutathione reductase, fatty acid binding protein-1, saposin-like protein-2, and 14-3-3 protein epsilon). The CTL, HTL,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Charybdotoxin-C (ChTx-C), from the scorpion Leiurus, quinquestriatus hebraeus blocks the calcium-activated potassium channels and causes hyper excitability of the nervous system. Detailed understanding the structure of ChTx-C, conformational stability, and intermolecular interactions are required to select the potential inhibitors of the toxin.
MATERIALS AND METHODS: The structure of ChTx-C was modeled using Modeller 9v7. The amino acid residues lining the binding site were predicted and used for toxin-ligand docking studies, further, selected toxin-inhibitor complexes were studied
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The prospects of a control for a novel gallium nitride pseudo-halide vapor phase epitaxy (PHVPE) with HCN were thoroughly analyzed for hydrocarbons-NH3-Ga gas phase on the basis of quantum chemical investigation with DFT (B3LYP, B3LYP with D3 empirical correction on dispersion interaction) and ab-initio (CASSCF, coupled clusters, and multireference configuration interaction including MRCI+Q) methods. The computational screening of reactions for different hydrocarbons (CH4, C2H6, C3H8, C2H4, and C2H2) as readily available carbon precursors for HCN formation, potential chemical transport agents,
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) integrase is an emerging target for novel antiviral drugs. Quantitative structure-activity relationship (QSAR) models for HIV-1 integrase inhibitors have been developed to understand the protein-ligand interactions to aid in the design of more effective analogs. This review paper presents a comprehensive overview of the computational modeling methods and results of QSAR models of HIV-1 integrase inhibitors published in 2005-2010. These QSAR models are classified according to the generation of molecular descriptors: 2D-QSAR, 3D-QSAR, and 4D-QSAR.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neisseria meningitidis causes invasive meningococcal disease in infants, toddlers, and adolescents worldwide. DNA sequence-based typing, including multilocus sequence typing, analysis of genetic determinants of antibiotic resistance, and sequence typing of vaccine antigens, has become the standard for molecular epidemiology of the organism. However, PCR of multiple targets and consecutive Sanger sequencing provide logistic constraints to reference laboratories. Taking advantage of the recent development of benchtop next-generation sequencers (NGSs) and of BIGSdb, a database accommodating and a
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The bla(NDM-1) gene has been reported to be often located on broad-host-range plasmids of the IncA/C type in clinical but also environmental bacteria recovered from the New Delhi, India, area. IncA/C-type plasmids are the main vehicles for the spread of the cephalosporinase gene bla(CMY-2), frequently identified in the United States, Canada, and Europe. In this study, we completed the sequence of IncA/C plasmid pNDM-KN carrying the bla(NDM-1) gene, recovered from a Klebsiella pneumoniae isolate from Kenya. This sequence was compared with those of three IncA/C-type reference plasmids from Esche
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent experiments have reported the self-assembly of TGA- and DMAET-stabilized CdTe nanoparticles (NPs) into wires and sheets, respectively, depending upon the stabilizer used. We develop a mesoscale model based on quantum mechanical calculations and perform Monte Carlo simulations of these NPs to elucidate the conditions under which these two structures will form. We show that consideration of NP shape, directional attraction, and electrostatic interactions is key to determining the anisotropy of the NP-NP interaction and final self-assembled structures.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular-dynamics simulations have been used to investigate the mechanism of induction of a mutant (revTetR) of the tetracycline repressor protein (TetR) that shows the reverse phenotype (i.e., it is induced in the absence of tetracyclines and not in their presence). Low-frequency, normal-mode analyses demonstrate that the reverse phenotype is reproduced by the simulations on the basis of criteria established for wild-type TetR. The reverse phenotype is caused by the fact that the DNA-binding heads in revTetR are closer than the ideal distance needed for DNA-binding when no inducer is present
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A B3LYP/6-31G* study has been carried out for the reactions of methacrolein with cyclopentadiene, parent nitrone, 1-pyrroline-1-oxide, and (Z)-C,N-diphenylnitrone, in which the coordination of a Lewis acid (borane) and the solvent polarity (dichloromethane) have been taken into account. Calculated activation parameters, regioselectivities (for 1,3-dipolar cycloaddition reactions), and endo/exo stereoselectivities show good agreement with available experimental data. Gas-phase calculations show a varied behavior of the s-cis/s-trans TS stability for noncatalyzed reactions (from the systematic s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spin-unrestricted zeroth order regular approximation (ZORA) and the scalar relativistic method based on Pauli Hamiltonian implemented in the Amsterdam Density Functional suite were used to calculate the electronic g tensor for isolated covalent {CuNO}(11) and electrostatic {q-NO}(1) species and for various model molecular and nonmolecular {CuNO}(11)-containing systems, epitomizing copper nitrosyl cage adducts in the ZSM-5 zeolite. The predicted g tensor values using the ZORA/VWN scheme were in satisfactory agreement with experimental EPR results. Relativistic, diamagnetic, and paramagnetic con
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования