BACKGROUND AND AIMS: Polycystic ovary syndrome (PCOS) is a prevalent endocrine and metabolic disorder with complex pathogenesis and limited targeted therapeutic options. This study presents a proteomics-informed approach to identify potential plasma protein targets for PCOS intervention using causal inference methods.
METHODS: We conducted a comprehensive proteome-wide Mendelian randomization analysis by integrating 1 Mb plasma cis-acting protein quantitative trait loci datasets with PCOS genome-wide association study summary statistics. To enhance robustness, we applied complementary approac…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In silico methods for predicting the effects of multi-gene perturbations hold great promise for advancing functional genomics, computational … ions in other contexts, such as synthetic lethality prediction and mapping epistatic effects across quantitative trait loci.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Liver cancer remains one of the most prevalent and lethal malignancies worldwide, while autoimmune hepatitis is an immune-mediat … sease risk, including both liver cancer and autoimmune hepatitis. The study incorporated expression quantitative trait loci (eQTL) data from 4,479 druggable genes as exposure variables, with liver cancer genome-wide association study (GWAS) data and autoimmune hepatitis GWAS data serving as outcome variables.
RESULTS: Mendelian randomization analysis revealed significan …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aberrant immune and inflammatory responses are critical in idiopathic pulmonary arterial hypertension (IPAH). Thus, investigating immune-related therapeutic targets of IPAH is imperative. By integrating single-cell RNA sequencing (scRNA-seq), genome-wide association studies (GWAS), expression quantitative trait loci (eQTL), and single-cell eQTL (sc-eQTL) data, we identified a non-classical monocyte (NCM)-specific gene that was causally linked to PAH. NCM were classified into three subgroups based on HLA-DPA1 expression: negative, low, and high expression groups. We analyzed intercellular commu…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Alzheimer's disease (AD) is a progressive neurodegenerative disease characterized by cerebral cortex atrophy. In this study, w … SCCA in Aβ negative (-) and Aβ positive (+) groups. In addition, we performed mediation, expression quantitative trait loci, and pathway analyses to determine the functional role of the SNPs.
RESULTS: We identified SNPs related to cortical thickness using SCCA in Aβ negative and positive groups and identified SNPs that improve the prediction performance of cognitive imp …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polyunsaturated fatty acids (PUFAs) including omega-3 and omega-6 are obtained from diet and can be measured objectively in plasma or red blood cells (RBCs) membrane biomarkers, representing different dietary exposure windows. In vivo conversion of omega-3 and omega-6 PUFAs from short-to long-chain counterparts occurs via a shared metabolic pathway involving fatty acid desaturases and elongase. This analysis leveraged genome-wide association study (GWAS) summary statistics for RBC and plasma PUFAs, along with expression quantitative trait loci (eQTL) to estimate tissue-specific genetically pre…
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation is an important epigenetic mechanism that helps define and maintain cellular functions. It is influenced by many factors, in … type using an Epigenome-wide Association Study (EWAS). Finally, we identified a set of methylation Quantitative Trait Loci (methQTL) in each cell type. Our results show that age-related DNA methylation is largely reset in iPSCs, and each cell type has a unique set of methylation sites that are genetically influenced.
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The nucleotide excision repair (NER) system is one of the main ways to protect organisms from DNA damage caused by endogenous and exogenous … = 1.03-2.09, p = .034; adjusted OR = 2.14, 95% CI = 1.29-3.56, p = .003, respectively). Expression quantitative trait loci (eQTL) analysis revealed that these four polymorphisms may affect the expression of genes that are adjacent to XPD and XPG. Our study provides evidence that XPD and XPG gene polymorphisms are associated with Wilms tumor risk. Nonetheless, these find …
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation (DNAm) is an epigenetic mark with essential roles in disease development and predisposition. Here, we created genome-wide maps of methylation quantitative trait loci (meQTL) in three peripheral tissues and used Mendelian randomization (MR) analyses to assess the potential causal relationships between DNAm and risk for two common neurodegenerative disorders, i.e. Alzheimer's disease (AD) and Parkinson's disease (PD). Genome-wide single nucleotide polymorphism (SNP; ~5.5M sites) and DNAm (~850K CpG sites) data were generated from whole blood (n=1,058), buccal (n=1,527) and saliva…
ПрепринтСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genetic basis of Neurogenic Orthostatic Hypotension (NOH) in Parkinson's disease (PD) has been inadequately explored. In a cross-section … es. Logistic regression was used to relate SNPs to NOH. Linkage-disequilibrium analysis, expression quantitative trait loci, and enrichment analysis were used to assess the effects on gene expression and metabolic/signaling pathways. We included 304 PD patients in the study, 35 of whom had NOH (11.5%). NOH was more frequent in patients with SNPs in SNCA, TMEM175, FAM47E- …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The widespread occurrence of acidic soils presents a major challenge for agriculture, as it hampers productivity via a combination of minera … breeding of acid-tolerant crops. Different tolerance mechanisms are regulated by various genes and quantitative trait loci in various plant species, and molecular markers have been developed to facilitate gene cloning and to support marker-assisted selection for breeding Al-tolerant cultivars. This study provides a comprehensive review of the current developments in und …
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Lamc2jeb junctional epidermolysis bullosa (EB) mouse model has been used to demonstrate that significant genetic modification of EB symptoms is possible, identifying as modifiers Col17a1 and six other quantitative trait loci, several with strong candidate genes including dystonin (Dst/Bpag1). Here, CRISPR/Cas9 was used to alter exon 23 in mouse skin specific isoform Dst-e (Ensembl GRCm38 transcript name Dst-213, transcript ID ENSMUST00000183302.5, protein size 2639AA) and validate a proposed arginine/glutamine difference at amino acid p1226 in B6 versus 129 mice as a modifier of EB. Frame …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Increased map density and transferability of markers are essential for the genetic analysis of fruit quality and stress tolerance in interspecific grapevine populations. We used 1449 GBS and 2000 rhAmpSeq markers to develop a dense map for an interspecific F2 population (VRS-F2) that was derived by selfing a single F1 from a Vitis riparia x 'Seyval blanc' cross. The resultant map contained 2519 markers spanning 1131.3 cM and was highly collinear with the Vitis vinifera 'PN40024' genome. Quantitative trait loci (QTL) for berry skin color and flower type were used to validate the map. Four rhAmp…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: A significant genetic association between rs7078160 in VAX1 and NSCL/P has been established through genome-wide association studi … Five of them were predicted to influence transcriptional factor-biding ability and were expression quantitative trait loci (eQTLs) of nearby genes in multiple tissues.
CONCLUSION: The previously reported association between rs7078160 and NSCL/P was successfully replicated. Moreover, our findings firstly revealed that 5 SNPs in VAX1 are associated with NSCL/P in the Wes …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salicylic acid (SA) is a vital hormone for adaptive responses to biotic and abiotic stresses, which facilitates growth-immunity trade-offs i … coordinating the accumulation of SA. Finally, we identified eight GWAS signals and eight expression quantitative trait loci situated in a selective sweep, and showed the presence of large allele frequency differences among the three geographic populations, revealing that candidate genes subject to selection were involved in SA biosynthesis. This study provides an integra …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oxidative stress would play a role in the pathophysiology of sickle cell anemia (SCA). We tested the impact of common SCA genetic modifiers (alpha-thalassemia, G6PD deficiency, HbF quantitative trait loci; QTL) and pro/antioxidant genes polymorphisms (SOD2 rs4880, XO rs207454, MPO rs233322) on oxidative stress biomarkers (AOPP, MDA, MPO, XO, MnSOD, CAT, GPx) and clinical severity in 301 Senegalese SCA hydroxyurea-free children at steady-state (median age 9.1 years, sex ratio H/F = 1.3). Plasma oxidative stress biomarkers were compared with those of a control group (AA). CAT activity, AOPP, and…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ongoing research suggests that mitochondrial dysfunction is a common hallmark in neurodegenerative diseases, pointing to mitochondrial uncou … -fold in a dose-dependent manner (p=0.013) independently from that conferred by APOE-ε4. Expression quantitative trait loci (eQTL) data of different brain regions suggest that rs9472817 likely exerts its effect by a cis-regulatory mechanism involving modulation of UCP4. If validated, the involvement of UCP4 in both FTD and LOAD might indicate interesting shared etiologic …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ankylosing spondylitis (AS) is a highly heritable chronic inflammatory arthritis characterized by osteoproliferation, fusion of affected joi … t a distance through evidence of physical interactions (chromatin conformation capture), expression quantitative trait loci mapping and single-cell methodologies. Opportunities for mechanistic studies to investigate the function of specific variants, regulatory elements and genes enabled by genome editing using clustered regularly interspaced short palindromic repeats/Ca …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thiopurines are widely used as anticancer and immunosuppressive agents. However, life-threatening myelotoxicity has been noticed and largely … x of NUDT15, which is part of the thiopurine binding pocket. Additionally, we conduct an expression quantitative trait loci (eQTL) analysis for NUDT15, and find a promoter-located eQTL signal (rs554405994), which may act as a potential marker to predict thiopurines-induced myelotoxicity. In conclusion, genetic polymorphisms in NUDT15 are strongly associated with adverse …
СтатьяМетаанализПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Exposure-based cognitive behavioural therapy (eCBT) is an effective treatment for anxiety disorders. Response varies between ind … one and combined in polygenic risk scores. Genotype and expression data were combined in expression quantitative trait loci (eQTL) analyses.
RESULTS: Expression levels were not associated with either treatment phenotype in any analysis. A total of 1,492 eQTLs were identified with q < 0.05, but interactions between genetic variants and treatment response did not affect e …
СтатьяРандомизированное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования